ZCCHC6 - ZCCHC6

TUT7
Tanımlayıcılar
Takma adlar	TUT7, PAPD6, çinko parmak CCHC tipi içeren 6, TENT3B, ZCCHC6, terminal uridil transferaz 7
Harici kimlikler	OMIM: 613467 MGI: 2387179 HomoloGene: 51941 GeneCard'lar: TUT7
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 9 (insan)
Son	86,354,454 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 13 (fare)
Son	59,823,147 bp
RNA ifadesi Desen
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• transferaz aktivitesi; • nükleotidiltransferaz aktivitesi; • çinko iyonu bağlama; • metal iyon bağlama; • nükleik asit bağlanması; • RNA bağlanması; • RNA üridyiltransferaz aktivitesi; • GO: 0001948 protein bağlama; • miRNA bağlanması; • üridyiltransferaz aktivitesi;
Hücresel bileşen	• sitoplazma; • nükleoplazma; • sitozol;
Biyolojik süreç	• histon mRNA katabolik süreci; • RNA 3'-uç işleme; • nükleer transkripsiyonlu mRNA poli (A) kuyruk kısaltması; • oosit olgunlaşması; • transpozisyonun negatif düzenlenmesi, RNA aracılı; • miRNA metabolik süreci; • ön miRNA işleme; • RNA 3 'üridilasyon; • poliuridilasyona bağlı mRNA katabolik süreç;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	79670
	214290
	ENSG00000083223
	ENSMUSG00000035248
	Q5VYS8
	Q5BLK4
	NM_001185059; NM_001185074; NM_024617; NM_001330718
	NM_153538; NM_001373962; NM_001373963; NM_001373964
	NP_001171988; NP_001172003; NP_001317647; NP_078893
	NP_705766; NP_001360891; NP_001360892; NP_001360893
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

Terminal üridyiltransferaz 7 (TUT7), "çinko parmak, 6 içeren CCHC alanı" olarak da bilinen bir enzim insanlarda kodlanır ZCCHC6 gen bulunan kromozom 9.^[5]^[6] ZCCHC6 proteini, terminalin üridilasyon nın-nin RNA transkriptler kısaca poli-A kuyrukları ve mRNA ve mikroRNA bozulmasında rol oynar

Yapısı

ZCCHC6 geni 33 Eksonlar en az altı bilinen izoform nedeniyle alternatif ekleme. ZCCHC6 geni, bir protein yani 171 kDa moleküler ağırlık ve sitoplazmada lokalizedir.

Fonksiyon

Aşağıdaki reaksiyonu katalize eder. Mg2 + ve Mn2 + ortak faktörler olarak.

UTP + RNA (n) = difosfat + RNA (n + 1) ^[7]

Üridilasyon ZCCHC6 tarafından katalize edilen, hemen yer alır Deadenylated mRNA'lar hücrelerin içinde.^[8] Saflaştırılmış ZZHC6, in vitro olarak kısa poli (A) kuyruklara (25 nükleotidden az) sahip RNA moleküllerini seçici olarak tanır ve üridile eder. ZCCHC6'dan yoksun hücrelerde, mRNA'ların çoğu, ZCCHC6 reaktivitesinin özelliği olan imza oligo (U) kuyruklarını kaybeder ve mRNA moleküllerinin yarı ömrü buna göre uzar.^[8]

MRNA bozunmasına ek olarak, üridilasyonun aynı zamandamikroRNA olgunlaşma, bazı grup II pre-microRNA için 3 'mono-üridilasyon gerektiren Dicer işleme.^[9] ZCCHC6'nın let-7'nin biyogenezine aracılık etmek için ZCCHC11 ile fazlalık içinde çalıştığı düşünülmektedir. mikroRNA uridilasyon yoluyla.^[10]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000083223 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000035248 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ Nagase T, Kikuno R, Hattori A, Kondo Y, Okumura K, Ohara O (Aralık 2000). "Tanımlanamayan insan genlerinin kodlama dizilerinin tahmini. XIX. İn vitro büyük proteinleri kodlayan beyinden 100 yeni cDNA klonunun tam dizileri". DNA Araştırması. 7 (6): 347–55. doi:10.1093 / dnares / 7.6.347. PMID 11214970.
^ "Entrez Geni: ZCCHC6 çinko parmak, 6 içeren CCHC alanı".
^ Rissland OS, Mikulasova A, Norbury CJ (2007). "Kanonik olmayan poli (A) polimerazlarla verimli RNA poliuridilasyonu". Mol. Hücre. Biol. 27 (10): 3612–24. doi:10.1128 / MCB.02209-06. PMC 1899984. PMID 17353264.
^ ^a ^b Lim J, Ha M, Chang H, Kwon SC, Simanshu DK, Patel DJ, Kim VN (2014). "TUT4 ve TUT7 ile üridilasyon, degradasyon için mRNA'yı işaretler". Hücre. 159 (6): 1365–76. doi:10.1016 / j.cell.2014.10.055. PMC 4720960. PMID 25480299.
^ Heo I, Ha M, Lim J, Yoon MJ, Park JE, Kwon SC, Chang H, Kim VN (2012). "Grup II let-7 mikroRNA'ların biyogenezinde önemli bir adım olarak pre-mikroRNA'nın mono-üridilasyonu". Hücre. 151 (3): 521–32. doi:10.1016 / j.cell.2012.09.022. PMID 23063654.
^ Thornton JE, Chang HM, Piskounova E, Gregory RI (2012). "Alternatif TUTases Zcchc11 (TUT4) ve Zcchc6 (TUT7) tarafından let-7 mikroRNA ifadesinin Lin28 aracılı kontrolü". RNA. 18 (10): 1875–85. doi:10.1261 / rna.034538.112. PMC 3446710. PMID 22898984.

daha fazla okuma

Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (Kasım 2000). "In vitro bölgeye özgü rekombinasyon kullanılarak DNA klonlaması". Genom Araştırması. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101 / gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (Mart 2001). "İnsan genleri ve proteinleri kataloğuna doğru: insan cDNA'larını kodlayan 500 yeni tam proteinin dizilenmesi ve analizi". Genom Araştırması. 11 (3): 422–35. doi:10.1101 / gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (Ekim 2004). "ORFeome'dan biyolojiye: işlevsel bir genomik boru hattı". Genom Araştırması. 14 (10B): 2136–44. doi:10.1101 / gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (Ocak 2006). "2006'daki LIFEdb veritabanı". Nükleik Asit Araştırması. 34 (Veritabanı sorunu): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 9 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000083223 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000035248 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid11214970-5] Nagase T, Kikuno R, Hattori A, Kondo Y, Okumura K, Ohara O (Aralık 2000). "Tanımlanamayan insan genlerinin kodlama dizilerinin tahmini. XIX. İn vitro büyük proteinleri kodlayan beyinden 100 yeni cDNA klonunun tam dizileri". DNA Araştırması. 7 (6): 347–55. doi:10.1093 / dnares / 7.6.347. PMID 11214970.

[entrez-6] "Entrez Geni: ZCCHC6 çinko parmak, 6 içeren CCHC alanı".

[7] Rissland OS, Mikulasova A, Norbury CJ (2007). "Kanonik olmayan poli (A) polimerazlarla verimli RNA poliuridilasyonu". Mol. Hücre. Biol. 27 (10): 3612–24. doi:10.1128 / MCB.02209-06. PMC 1899984. PMID 17353264.

[Lim-2014-8] Lim J, Ha M, Chang H, Kwon SC, Simanshu DK, Patel DJ, Kim VN (2014). "TUT4 ve TUT7 ile üridilasyon, degradasyon için mRNA'yı işaretler". Hücre. 159 (6): 1365–76. doi:10.1016 / j.cell.2014.10.055. PMC 4720960. PMID 25480299.

[9] Heo I, Ha M, Lim J, Yoon MJ, Park JE, Kwon SC, Chang H, Kim VN (2012). "Grup II let-7 mikroRNA'ların biyogenezinde önemli bir adım olarak pre-mikroRNA'nın mono-üridilasyonu". Hücre. 151 (3): 521–32. doi:10.1016 / j.cell.2012.09.022. PMID 23063654.

[10] Thornton JE, Chang HM, Piskounova E, Gregory RI (2012). "Alternatif TUTases Zcchc11 (TUT4) ve Zcchc6 (TUT7) tarafından let-7 mikroRNA ifadesinin Lin28 aracılı kontrolü". RNA. 18 (10): 1875–85. doi:10.1261 / rna.034538.112. PMC 3446710. PMID 22898984.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]