AIFM1 - AIFM1 - Wikipedia

AIFM1
Protein AIFM1 PDB 1gv4.png
Mevcut yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Takma adlarAIFM1, AIF, CMT2D, CMTX4, COWCK, ​​COXPD6, NADMR, NAMSD, PDCD8, DFNX5, apoptozu indükleyen faktör, mitokondri ile ilişkili 1, apoptoz indükleyen faktör mitokondri ile ilişkili 1, AUNX1, SEMDHL
Harici kimliklerOMIM: 300169 MGI: 1349419 HomoloGene: 3100 GeneCard'lar: AIFM1
Gen konumu (İnsan)
X kromozomu (insan)
Chr.X kromozomu (insan)[1]
X kromozomu (insan)
AIFM1 için genomik konum
AIFM1 için genomik konum
GrupXq26.1Başlat130,129,362 bp[1]
Son130,165,887 bp[1]
RNA ifadesi Desen
PBB GE AIFM1 205512 s fs.png'de
Daha fazla referans ifade verisi
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001130846
NM_001130847
NM_004208
NM_145812
NM_145813

NM_001290364
NM_012019

RefSeq (protein)

NP_001124318
NP_001124319
NP_004199
NP_665811

NP_001277293
NP_036149

Konum (UCSC)Chr X: 130.13 - 130.17 MbChr X: 48.47 - 48.51 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

Apoptozu indükleyen faktör 1, mitokondriyal bir protein insanlarda kodlanır AIFM1 gen X kromozomunda.[5][6] Bu protein, mitokondri yanı sıra çekirdek, nükleer parçalanmayı bir parçası olarak gerçekleştirdiği kaspaz -bağımsız apoptoz.[7]

Yapısı

AIFM1, 613- olarak ifade edilirkalıntı mitokondriyal hedefleme dizisi (MTS) içeren öncü protein N terminali ve iki nükleer öncü dizi (NLS). Mitokondriye ithal edildikten sonra, N-terminalinin ilk 54 kalıntısı, olgun proteini üretmek için bölünür ve iç mitokondriyal zar. Olgun protein şunları içerir: HEVES kofaktör ve üç yapısal alana katlanır: FAD bağlayıcı alan, NAD bağlayıcı alan ve C terminali. C-terminali, AIFM1'in proapoptotik aktivitesinden sorumluyken, FAD-bağlanma ve NAD -bağlayıcı alanlar, klasik Rossmann topolojisini diğer flavoproteinlerle ve NAD (P) H'ye bağlı redüktaz aktivitesiyle paylaşır.[7]

Üç alternatif farklı kodlayan transkriptler izoformlar bu gen için tanımlanmıştır.[6] Alternatif olarak eklenmiş iki mRNA izoformu, C-terminali ve redüktaz alanlarının dahil edilmesine / dışlanmasına karşılık gelir.[7] Bu genle ilişkili olduğu düşünülen bir psödogen, kromozom 10'da tanımlanmıştır.[6]

Fonksiyon

Bu gen, mitokondriyal hücrelerde bulunan apoptotik hücrelerde nükleer parçalanma için gerekli olan bir flavoproteini kodlar. zarlar arası boşluk sağlıklı hücrelerde. Apoptozun indüksiyonu, bu proteinin 102. kalıntıda şu şekilde bölünmesine neden olur: kalpainleri ve / veya katepsinler çözünür ve proapoptojenik bir forma dönüşür ve çekirdeğe translokasyon yapar, burada kromozom yoğunlaşmasını ve parçalanmasını etkiler.[6][7] Ek olarak, bu gen ürünü mitokondriyi apoptojenik proteinler sitokrom c ve kaspaz-9'u serbest bırakmak için uyarır.[6] AIFM1 ayrıca katkıda bulunur redüktaz aktivite redoks metabolizma.[7]

Klinik önemi

AIFM1'deki mutasyonlar gen ile ilişkili Charcot-Marie-Tooth hastalığı (Cowchock sendromu).[7][8] Hücresel düzeyde, AIFM1 mutasyonları, oksidatif fosforilasyon, şiddetli mitokondriyal ensefalomiyopatiye yol açar.[6] Bu mutasyonun klinik belirtileri şu şekilde karakterize edilir: kas atrofisi nöropati ataksi, psikomotor gerileme, işitme kaybı ve nöbetler.[9]

Etkileşimler

AIFM1'in etkileşim ile HSPA1A.[10][11]

Evrim

Filogenetik analiz, AIFM1 ve diğer insan AIF'lerinin (AIFM2a ve AIFM3) ıraksamasının ökaryotların sapmasından önce gerçekleştiğini gösterir. Bu sonuç, bu proteinlerin alan mimarisi tarafından desteklenmektedir. Hem ökaryotik hem de öbakteriyel AIFM1 proteinleri ek alan AIF_C içerir.[12]

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl sürüm 89: ENSG00000156709 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000036932 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ Susin SA, Lorenzo HK, Zamzami N, Marzo I, Snow BE, Brothers GM, Mangion J, Jacotot E, Costantini P, Loeffler M, Larochette N, Goodlett DR, Aebersold R, Siderovski DP, Penninger JM, Kroemer G (Şubat 1999 ). "Mitokondriyal apoptoz indükleyici faktörün moleküler karakterizasyonu". Doğa. 397 (6718): 441–6. Bibcode:1999Natur.397..441S. doi:10.1038/17135. PMID  9989411. S2CID  204991081.
  6. ^ a b c d e f "Entrez Geni: AIFM1 apoptozu indükleyen faktör, mitokondri ile ilişkili, 1".
  7. ^ a b c d e f Ferreira P, Villanueva R, Martínez-Júlvez M, Herguedas B, Marcuello C, Fernandez-Silva P, Cabon L, Hermoso JA, Lostao A, Susin SA, Medina M (Temmuz 2014). "Pro-apoptotik apoptoz indükleyici faktörün koenzim aracılı monomer-dimer geçişine yapısal anlayış". Biyokimya. 53 (25): 4204–15. doi:10.1021 / bi500343r. PMID  24914854.
  8. ^ Rinaldi C, Grunseich C, Sevrioukova IF, Schindler A, Horkayne-Szakaly I, Lamperti C, Landouré G, Kennerson ML, Burnett BG, Bönnemann C, Biesecker LG, Ghezzi D, Zeviani M, Fischbeck KH (Aralık 2012). "Cowchock sendromu, apoptozu tetikleyen faktördeki bir mutasyonla ilişkilidir". Amerikan İnsan Genetiği Dergisi. 91 (6): 1095–102. doi:10.1016 / j.ajhg.2012.10.008. PMC  3516602. PMID  23217327.
  9. ^ Kettwig M, Schubach M, Zimmermann FA, Klinge L, Mayr JA, Biskup S, Sperl W, Gärtner J, Huppke P (Mart 2015). "Ventrikülomegaliden şiddetli musküler atrofiye: AIFM1'deki mutasyonlarla ilişkili klinik spektrumun genişlemesi". Mitokondri. 21: 12–8. doi:10.1016 / j.mito.2015.01.001. PMID  25583628.
  10. ^ Ruchalski K, Mao H, Singh SK, Wang Y, Mosser DD, Li F, Schwartz JH, Borkan SC (Aralık 2003). "HSP72, ATP-tükenmiş renal epitel hücrelerinde apoptozu indükleyen faktör salımını inhibe eder". Amerikan Fizyoloji Dergisi. Hücre Fizyolojisi. 285 (6): C1483–93. doi:10.1152 / ajpcell.00049.2003. PMID  12930708.
  11. ^ Ravagnan L, Gurbuxani S, Susin SA, Maisse C, Daugas E, Zamzami N, Mak T, Jäättelä M, Penninger JM, Garrido C, Kroemer G (Eylül 2001). "Isı şoku proteini 70, apoptozu indükleyen faktörü antagonize eder". Doğa Hücre Biyolojisi. 3 (9): 839–43. doi:10.1038 / ncb0901-839. PMID  11533664. S2CID  21164493.
  12. ^ Klim J, Gładki A, Kucharczyk R, Zielenkiewicz U, Kaczanowski S (Mayıs 2018). "Ökaryotların Ortak Atasında Apoptoz Mekanizmasının Atalara Göre Yeniden İnşası". G3. 8 (6): 2121–2134. doi:10.1534 / g3.118.200295. PMC  5982838. PMID  29703784.

daha fazla okuma

Dış bağlantılar