ANTXR1 - ANTXR1

ANTXR1
Mevcut yapılar
PDB	Ortolog araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	3N2N
Tanımlayıcılar
Takma adlar	ANTXR1, ATR, GAPO, TEM8, şarbon toksin reseptörü 1, ANTXR hücre yapışma molekülü 1
Harici kimlikler	OMIM: 606410 MGI: 1916788 HomoloGene: 12976 GeneCard'lar: ANTXR1
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 2 (insan)
Son	69,249,327 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 6 (fare)
Son	87,335,821 bp
RNA ifadesi Desen
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• aktin filament bağlama; • GO: 0001948 protein bağlama; • kolajen bağlama; • transmembran sinyal reseptör aktivitesi; • metal iyon bağlama; • sinyal reseptörü aktivitesi;
Hücresel bileşen	• zarın ayrılmaz bileşeni; • hücre yüzeyi; • hücre zarı; • hücre projeksiyonu; • endozom zarı; • lamellipodyum membran; • hücre dışı eksozom; • zar; • filopodyum membran; • plazma zarının dış tarafı;
Biyolojik süreç	• aktin hücre iskeleti yeniden düzenlenmesi; • üreme süreci; • substrat yapışmasına bağlı hücre yayılması; • sinyal iletimi; • metalopeptidaz aktivitesinin pozitif düzenlenmesi; • hücre dışı matris düzeneğinin negatif düzenlenmesi; • kan damarı gelişimi; • toksin nakli;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	84168
	69538
	ENSG00000169604
	ENSMUSG00000033420
	Q9H6X2; Q96EC6
	Q9CZ52
	NM_018153; NM_032208; NM_053034
	NM_054041
	NP_060623; NP_115584; NP_444262; NP_060623.2
	NP_473382
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

Şarbon toksin reseptörü 1 (ANTXR1 veya aynı zamanda TEM8 olarak da bilinir) bir protein insanlarda kodlanır ANTXR1 gen.^[5]^[6]^[7] Moleküler ağırlığı yaklaşık 63 kDa olarak tahmin edilmektedir.

Bu gen tarafından kodlanan protein, bir tip I transmembran proteinidir ve kolorektal kanserde rol oynayan tümöre özgü bir endotelyal markördür. Bu proteinin aynı zamanda, şarbon hastalığına neden olan Bacillus anthracis toksini için bir kenetlenme proteini veya reseptörü olduğu da gösterilmiştir. Üç parçalı şarbon toksininin koruyucu antijen (PA) bileşeninin bu reseptör proteinine bağlanması, toksin bileşenlerinin hücrelerin sitozolüne verilmesine aracılık eder. Hücrenin içine girdikten sonra, şarbon toksininin diğer iki bileşeni olan ödem faktörü (EF) ve ölümcül faktör (LF) normal hücresel süreçleri bozar. Alternatif olarak birbirine eklenmiş üç varyant tarif edilmiştir.^[7]

Ayrıca bakınız

Şarbon toksini

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl sürüm 89: ENSG00000169604 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000033420 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ St Croix B, Rago C, Velculescu V, Traverso G, Romans KE, Montgomery E, Lal A, Riggins GJ, Lengauer C, Vogelstein B, Kinzler KW (Ağustos 2000). "İnsan tümör endotelyumunda ifade edilen genler". Bilim. 289 (5482): 1197–202. doi:10.1126 / science.289.5482.1197. PMID 10947988.
^ Carson-Walter EB, Watkins DN, Nanda A, Vogelstein B, Kinzler KW, St Croix B (Eylül 2001). "Hücre yüzeyi tümörü endotelyal markörleri, farelerde ve insanlarda korunur". Kanser Res. 61 (18): 6649–55. PMID 11559528.
^ ^a ^b "Entrez Geni: ANTXR1 şarbon toksin reseptörü 1".

Dış bağlantılar

İnsan ANTXR1 genom konumu ve ANTXR1 gen ayrıntıları sayfası UCSC Genom Tarayıcısı.
İnsan ATR genom konumu ve ATR gen ayrıntıları sayfası UCSC Genom Tarayıcısı.

daha fazla okuma

Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo kapaklama: ökaryotik mRNA'ların kapak yapısını oligoribonükleotidlerle değiştirmek için basit bir yöntem". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, vd. (1997). "Tam uzunlukta zenginleştirilmiş ve 5'-uçta zenginleştirilmiş bir cDNA kitaplığının yapımı ve karakterizasyonu". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Schmidt DR, Schreiber SL (1999). "ATR ile nükleozom yeniden şekillenme ve deasetile edici kompleksinin iki bileşeni, HDAC2 ve CHD4 arasındaki moleküler ilişki". Biyokimya. 38 (44): 14711–7. CiteSeerX 10.1.1.559.7745. doi:10.1021 / bi991614n. PMID 10545197.
Liu XH, Collier RJ, Youle RJ (2002). "Bir Bcl-XL füzyon proteininin hücre dışı iletimi ile aksotominin neden olduğu nöronal apoptozun inhibisyonu". J. Biol. Kimya. 276 (49): 46326–32. doi:10.1074 / jbc.M108930200. PMID 11574549.
Bradley KA, Mogridge J, Mourez M, vd. (2001). "Şarbon toksini için hücresel reseptörün belirlenmesi". Doğa. 414 (6860): 225–9. doi:10.1038 / n35101999. PMID 11700562. S2CID 4373278.
Latonen L, Taya Y, Laiho M (2001). "UV radyasyonu, p53 yanıtının doza bağlı olarak düzenlenmesini indükler ve insan fibroblastlarında p53-HDM2 etkileşimini modüle eder". Onkojen. 20 (46): 6784–93. doi:10.1038 / sj.onc.1204883. PMID 11709713.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, vd. (2003). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin üretimi ve ilk analizi". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Scobie HM, Rainey GJ, Bradley KA, Young JA (2003). "İnsan kılcal morfogenez proteini 2, bir şarbon toksin reseptörü olarak işlev görür". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 100 (9): 5170–4. doi:10.1073 / pnas.0431098100. PMC 154317. PMID 12700348.
Bradley KA, Mogridge J, Jonah G, vd. (2004). "Şarbon toksininin reseptörüne bağlanması, alfa integrin-ligand etkileşimlerine benzerdir". J. Biol. Kimya. 278 (49): 49342–7. doi:10.1074 / jbc.M307900200. PMID 14507921.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, vd. (2004). "21.243 tam uzunlukta insan cDNA'sının eksiksiz dizilemesi ve karakterizasyonu". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Jones GG, Biçici PM, Pettitt AR, Sherrington PD (2004). "ATR-p53 yolu, döngüsel olmayan normal ve habis lenfositlerde bastırılır". Onkojen. 23 (10): 1911–21. doi:10.1038 / sj.onc.1207318. PMID 14755251. S2CID 31825072.
Hillman RT, Yeşil RE, Brenner SE (2005). "RNA gözetimi için takdir edilmeyen bir rol". Genom Biol. 5 (2): R8. doi:10.1186 / gb-2004-5-2-r8. PMC 395752. PMID 14759258.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA ve diğerleri. (2004). "NIH Tam Boy cDNA Projesinin Durumu, Kalitesi ve Genişlemesi: Memeli Gen Koleksiyonu (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Bonuccelli G, Sotgia F, Frank PG, vd. (2005). "ATR / TEM8, Bacillus anthracis'in üç giriş bölgesini kaplayan epitel hücrelerinde yüksek oranda eksprese edilir: şarbon enfeksiyonunun patogenezine ilişkin çıkarımlar". Am. J. Physiol., Celi Physiol. 288 (6): C1402–10. doi:10.1152 / ajpcell.00582.2004. PMID 15689409.
Hotchkiss KA, Basile CM, Spring SC, ve diğerleri. (2005). "TEM8 ifadesi, kolajen üzerindeki hücre-matris etkileşimlerini düzenleyerek endotelyal hücre yapışmasını ve göçünü uyarır". Tecrübe. Hücre Res. 305 (1): 133–44. doi:10.1016 / j.yexcr.2004.12.025. PMID 15777794.
Rmali KA, Puntis MC, Jiang WG (2005). "Endotel hücrelerinde TEM-8 ve tübül oluşumu, vW / TM alanlarının potansiyel rolü". Biochem. Biophys. Res. Commun. 334 (1): 231–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.06.085. PMID 15993844.
Rainey GJ, Wigelsworth DJ, Ryan PL, ve diğerleri. (2005). "Hücrelere şarbon toksini verilmesi için reseptöre özgü gereksinimler". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 102 (37): 13278–83. doi:10.1073 / pnas.0505865102. PMC 1201603. PMID 16141341.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, vd. (2005). "İnsan protein-protein etkileşim ağının proteom ölçekli bir haritasına doğru". Doğa. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 2 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl sürüm 89: ENSG00000169604 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000033420 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid10947988-5] St Croix B, Rago C, Velculescu V, Traverso G, Romans KE, Montgomery E, Lal A, Riggins GJ, Lengauer C, Vogelstein B, Kinzler KW (Ağustos 2000). "İnsan tümör endotelyumunda ifade edilen genler". Bilim. 289 (5482): 1197–202. doi:10.1126 / science.289.5482.1197. PMID 10947988.

[pmid11559528-6] Carson-Walter EB, Watkins DN, Nanda A, Vogelstein B, Kinzler KW, St Croix B (Eylül 2001). "Hücre yüzeyi tümörü endotelyal markörleri, farelerde ve insanlarda korunur". Kanser Res. 61 (18): 6649–55. PMID 11559528.

[entrez-7] "Entrez Geni: ANTXR1 şarbon toksin reseptörü 1".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]