APOBEC3F - APOBEC3F
DNA dC-> dU düzenleme enzimi APOBEC-3F bir protein insanlarda kodlanır APOBEC3F gen.[3][4][5]
Bu gen, sitidin deaminaz gen ailesi. Yedi ilgili genden biridir veya sözde genler içinde bulundu küme, kaynaklandığı düşünülüyor gen duplikasyonu, üzerinde kromozom 22. Küme üyeleri yapısal ve işlevsel olarak C'den U'ya bağlı olan proteinleri kodlar. RNA sitidin deaminazın düzenlenmesi APOBEC1. Proteinlerin RNA düzenleme olabileceği düşünülüyor enzimler ve büyümede rolleri var veya hücre döngüsü kontrolü. Alternatif olarak eklenmiş Transcript farklı kodlayan varyantlar izoformlar tespit edilmiştir.[5]
Referanslar
- ^ a b c GRCh38: Ensembl sürüm 89: ENSG00000128394 - Topluluk, Mayıs 2017
- ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
- ^ Jarmuz A, Chester A, Bayliss J, Gisbourne J, Dunham I, Scott J, Navaratnam N (Şubat 2002). "Kromozom 22 üzerindeki öksüz C ila U RNA düzenleyici enzimlerin antropoide özgü lokusu". Genomik. 79 (3): 285–96. doi:10.1006 / geno.2002.6718. PMID 11863358.
- ^ Holmes RK, Koning FA, Bishop KN, Malim MH (Ocak 2007). "APOBEC3F, hipermutasyon yokluğunda HIV-1 ters transkripsiyon ürünlerinin birikmesini inhibe edebilir. APOBEC3G ile karşılaştırmalar". J Biol Kimya. 282 (4): 2587–95. doi:10.1074 / jbc.M607298200. PMID 17121840.
- ^ a b "Entrez Geni: APOBEC3F apolipoprotein B mRNA düzenleme enzimi, katalitik polipeptit benzeri 3F".
Dış bağlantılar
- İnsan APOBEC3F genom konumu ve APOBEC3F gen ayrıntıları sayfası UCSC Genom Tarayıcısı.
daha fazla okuma
- Wedekind JE, Dance GS, Sowden MP, Smith HC (2003). "Memelilerde Messenger RNA düzenleme: APOBEC ailesinin aile şirketinde roller arayan yeni üyeleri". Trendler Genet. 19 (4): 207–16. doi:10.1016 / S0168-9525 (03) 00054-4. PMID 12683974.
- Franca R, Spadari S, Maga G (2006). "APOBEC hücresel antiviral faktörler olarak deaminazlar: yeni bir doğal konak savunma mekanizması". Med. Sci. Monit. 12 (5): RA92–8. PMID 16641889.
- Prashar Y, Weissman SM (1996). "CDNA'ların 3 'uç kısıtlama fragmanlarının gösterilmesiyle diferansiyel gen ekspresyonunun analizi". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 93 (2): 659–63. Bibcode:1996PNAS ... 93..659P. doi:10.1073 / pnas.93.2.659. PMC 40108. PMID 8570611.
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). "Normalleştirme ve çıkarma: gen keşfini kolaylaştırmak için iki yaklaşım". Genom Res. 6 (9): 791–806. doi:10.1101 / gr.6.9.791. PMID 8889548.
- Dunham I, Shimizu N, Roe BA, vd. (1999). "İnsan kromozomu 22'nin DNA dizisi". Doğa. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999Natur.402..489D. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, vd. (2003). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin üretimi ve ilk analizi". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Zheng YH, Irwin D, Kurosu T, vd. (2004). "İnsan APOBEC3F, insan immün yetmezlik virüsü tip 1 replikasyonunu engelleyen başka bir konak faktörüdür". J. Virol. 78 (11): 6073–6. doi:10.1128 / JVI.78.11.6073-6076.2004. PMC 415831. PMID 15141007.
- Wiegand HL, Doehle BP, Bogerd HP, Cullen BR (2004). "İkinci bir insan antiretroviral faktör olan APOBEC3F, HIV-1 ve HIV-2 Vif proteinleri tarafından bastırılır". EMBO J. 23 (12): 2451–8. doi:10.1038 / sj.emboj.7600246. PMC 423288. PMID 15152192.
- Liddament MT, Brown WL, Schumacher AJ, Harris RS (2004). "APOBEC3F özellikleri ve hipermutasyon tercihleri, in vivo HIV-1'e karşı aktiviteyi gösterir". Curr. Biol. 14 (15): 1385–91. doi:10.1016 / j.cub.2004.06.050. PMID 15296757.
- Collins JE, Wright CL, Edwards CA, ve diğerleri. (2005). "İnsan ORFeomunu klonlamak için genom açıklamasına dayalı bir yaklaşım". Genom Biol. 5 (10): R84. doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA ve diğerleri. (2004). "NIH tam uzunlukta cDNA projesinin durumu, kalitesi ve genişlemesi: Memeli Gen Koleksiyonu (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Haché G, Liddament MT, Harris RS (2005). "APOBEC3F ve APOBEC3G'nin retroviral hipermutasyon özgüllüğü, C-terminal DNA sitozin deaminaz alanı tarafından yönetilir". J. Biol. Kimya. 280 (12): 10920–4. doi:10.1074 / jbc.M500382200. PMID 15647250.
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, vd. (2006). "Transkripsiyonel modülasyonun çeşitlendirilmesi: insan genlerinin varsayılan alternatif promotörlerinin büyük ölçekli tanımlanması ve karakterizasyonu". Genom Res. 16 (1): 55–65. doi:10.1101 / gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
- Zennou V, Bieniasz PD (2006). "Primatlardan APOBEC3G ve APOBEC3F'nin antiretroviral aktivitesinin karşılaştırmalı analizi". Viroloji. 349 (1): 31–40. doi:10.1016 / j.virol.2005.12.035. PMID 16460778.
- Tian C, Yu X, Zhang W, vd. (2006). "APOBEC3G ve APOBEC3F'nin seçici baskılanması için insan immün yetmezlik virüsü tip 1 Vif'de korunmuş triptofanlar için diferansiyel gereksinim". J. Virol. 80 (6): 3112–5. doi:10.1128 / JVI.80.6.3112-3115.2006. PMC 1395459. PMID 16501124.
- Stenglein MD, Harris RS (2006). "APOBEC3B ve APOBEC3F, DNA deaminasyonundan bağımsız bir mekanizma ile L1 retrotranspozisyonunu inhibe eder". J. Biol. Kimya. 281 (25): 16837–41. doi:10.1074 / jbc.M602367200. PMID 16648136.
- Wichroski MJ, Robb GB, Rana TM (2006). "İnsan retroviral konak kısıtlama faktörleri APOBEC3G ve APOBEC3F, mRNA işleme gövdelerine lokalize olur". PLoS Pathog. 2 (5): e41. doi:10.1371 / journal.ppat.0020041. PMC 1458959. PMID 16699599.
 | Bu makale bir gen açık insan kromozomu 22 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek. |