Acireductone dioxygenase (demir (II) -gerekli) - Acireductone dioxygenase (iron(II)-requiring) - Wikipedia
| akiredükton dioksijenaz [demir (II) -gerekli] | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tanımlayıcılar | |||||||||
| EC numarası | 1.13.11.54 | ||||||||
| Veritabanları | |||||||||
| IntEnz | IntEnz görünümü | ||||||||
| BRENDA | BRENDA girişi | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme görünümü | ||||||||
| KEGG | KEGG girişi | ||||||||
| MetaCyc | metabolik yol | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB yapılar | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Gen ontolojisi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Acireductone dioxygenase [demir (II) -gerekli] (EC 1.13.11.54 ) bir enzim o katalizler Kimyasal reaksiyon
- 1,2-dihidroksi-5- (metiltio) pent-1-en-3-on + O2 4- (metiltio) -2-oksobutanoat + format
Böylece ikisi substratlar bu enzimin 1,2-dihidroksi-5- (metiltio) pent-1-en-3-on ve oksijen oysa iki Ürün:% s vardır 4-metiltio-2-oksobütanoat ve format.
Bu enzim ailesine aittir. oksidoredüktazlar, özellikle O ile tek donörler üzerinde hareket edenler2 oksidan olarak ve substrata (oksijenazlar) iki oksijen atomunun dahil edilmesi. Dahil edilen oksijenin O'dan türetilmesi gerekmez2. sistematik isim bu enzim sınıfının 1,2-dihidroksi-5- (metiltio) pent-1-en-3-on: oksijen oksidoredüktaz (format oluşturan). Yaygın olarak kullanılan diğer isimler şunlardır ARD ', 2-hidroksi-3-keto-5-tiometilpent-1-ene dioksijenaz (belirsiz), akiredükton dioksijenaz (belirsiz), E-2 ', ve E-3 dioksijenaz. Bu enzim katılır metiyonin metabolizması.
Yapısal çalışmalar
2007'nin sonlarından itibaren yalnızca bir yapı bu sınıf enzimler için çözülmüştür. PDB erişim kodu 2HJI.
Referanslar
- Wray JW, Abeles RH (1993). "Karbon monoksit oluşumunu katalize eden bakteriyel bir enzim". J. Biol. Kimya. 268 (29): 21466–9. PMID 8407993.
- Wray JW, Abeles RH (1995). "Klebsiella pneumoniae ve sıçan karaciğerindeki metiyonin kurtarma yolu. İki yeni dioksijenazın tanımlanması ve karakterizasyonu". J. Biol. Kimya. 270 (7): 3147–53. doi:10.1074 / jbc.270.7.3147. PMID 7852397.
- Furfine ES, Abeles RH (1988). "Klebsiella pneumoniae'de 5'-S-metiltioadenozinin metiyonine dönüştürülmesinde ara maddeler". J. Biol. Kimya. 263 (20): 9598–606. PMID 2838472.
- Dai Y, Wensink PC, Abeles RH (1999). "Bir protein, iki enzim". J. Biol. Kimya. 274 (3): 1193–5. doi:10.1074 / jbc.274.3.1193. PMID 9880484.
- Mo H, Dai Y, Pochapsky SS, Pochapsky TC (1999). "Klebsiella pneumoniae'den bir karbon monoksit üreten metaloenzim için 1H, 13C ve 15N NMR atamaları". J. Biomol. NMR. 14 (3): 287–8. doi:10.1023 / A: 1008396624784. PMID 10481280. S2CID 36731035.
- Dai Y, Pochapsky TC, Abeles RH (2001). "Klebsiella pneumoniae'nin metiyonin kurtarma yolundaki iki dioksijenazın mekanik çalışmaları". Biyokimya. 40 (21): 6379–87. doi:10.1021 / bi010110y. PMID 11371200.
- Al-Mjeni F, Ju T, Pochapsky TC, Maroney MJ (2002). "Akiredükton dioksijenazda Ni'nin yapısı ve işlevinin XAS araştırması". Biyokimya. 41 (21): 6761–9. doi:10.1021 / bi012209a. PMID 12022880.
- Pochapsky TC, Pochapsky SS, Ju T, Mo H, Al-Mjeni F, Maroney MJ (2002). "Modelleme ve deney, Klebsiella pneumoniae'den akiredukton dioksijenazın yapısını verir". Nat. Struct. Biol. 9 (12): 966–72. doi:10.1038 / nsb863. PMID 12402029. S2CID 38098047.
