Armadillo tekrarı - Armadillo repeat
| Armadillo yineleme alanı | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Beta-katenin'in 5armadillo bölgesinin yapısı.[1] | |||||||||
| Tanımlayıcılar | |||||||||
| Sembol | Kol | ||||||||
| Pfam | PF00514 | ||||||||
| Pfam klan | CL0020 | ||||||||
| InterPro | IPR000225 | ||||||||
| AKILLI | SM00185 | ||||||||
| PROSITE | PS50176 | ||||||||
| SCOP2 | 3bct / Dürbün / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd00020 | ||||||||
| Membranom | 350 | ||||||||
| |||||||||
Bir armadillo tekrarı tekrarlayan bir karakteristiğin adıdır amino asit sıra yaklaşık 40 kalıntılar birçok proteinde bulunan uzunluktadır. Armadillo tekrarları içeren proteinler tipik olarak birkaç art arda tekrarlanan kopyalar.[2][3] Her armadillo tekrarı, bir toka yapısı oluşturan bir çift alfa sarmalından oluşur. Tekrar formunun birden çok kopyası alfa solenoidi yapı.
Armadillo tekrarları içeren protein örnekleri şunları içerir: β-katenin, α-ithalat,[4] Plakoglobin,[5] adenomatöz polipoz koli (APC),[6] Ve bircok digerleri.
Armadillo terimi, armadillo'nun tarihi isminden türemiştir. β-katenin meyve sineğindeki gen Meyve sineği armadillo tekrarının ilk keşfedildiği yer. olmasına rağmen β-katenin önceden bağlanmada rol oynayan bir protein olduğuna inanılıyordu kadherin hücre yapışma proteinleri hücre iskeleti, son çalışma gösteriyor ki β-katenin alfa-katenin homodimerizasyonunu düzenler, bu da kontroller dallanma ve demetleme işlevi görür.[7] Ancak, armadillo tekrarı, diğer işlevlere sahip çok çeşitli proteinlerde bulunur. Bu tip protein alanı, dönüştürmede önemlidir WNT sinyalleri sırasında embriyonik gelişme.
Yapısı
Bir armadillo tekrarının 3 boyutlu katlanması ilk olarak beta-katenin kristal yapısında gözlendi, burada 12 tandem tekrarlar süper sarmal oluşturmak alfa sarmalları birim başına üç sarmal ile.[1] Silindirik yapı, muhtemelen beta-katenin'in bilinen etkileşim partnerlerinin asidik yüzeyleri ile etkileşime giren pozitif yüklü bir oluğa sahiptir.[8]
Referanslar
- ^ a b Huber AH, Nelson WJ, Weis WI (Eylül 1997). "Beta-katenin armadillo tekrar bölgesinin üç boyutlu yapısı". Hücre. 90 (5): 871–82. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80352-9. PMID 9298899. S2CID 18612343.
- ^ Peifer M, Berg S, Reynolds AB (1994). "Çeşitli hücresel rollere sahip proteinler tarafından paylaşılan tekrar eden bir amino asit motifi". Hücre. 76 (5): 789–91. doi:10.1016/0092-8674(94)90353-0. PMID 7907279. S2CID 26528190.
- ^ Groves MR, Barford D (1999). "Sarmal tekrar proteinlerinin topolojik özellikleri". Yapısal Biyolojide Güncel Görüş. 9 (3): 383–9. doi:10.1016 / S0959-440X (99) 80052-9. PMID 10361086.
- ^ Herold A, Truant R, Wiegand H, Cullen BR (Ekim 1998). "İthal alfa nükleer ithalat faktörünün işlevsel alan organizasyonunun belirlenmesi". J. Hücre Biol. 143 (2): 309–18. doi:10.1083 / jcb.143.2.309. PMC 2132842. PMID 9786944.
- ^ McCrea PD, Turck CW, Gumbiner B (Kasım 1991). "E-cadherin ile ilişkili Drosophila'daki (plakoglobin) armadillo proteininin bir homologu". Bilim. 254 (5036): 1359–61. Bibcode:1991Sci ... 254.1359M. doi:10.1126 / science.1962194. PMID 1962194.
- ^ Hirschl D, Bayer P, Müller O (Mart 1996). "APC proteininden bir armadillo tekli tekrarının ikincil yapısı". FEBS Lett. 383 (1–2): 31–6. doi:10.1016/0014-5793(96)00215-3. PMID 8612785. S2CID 36190869.
- ^ Nusse, Roel ve Hans Clevers. "Wnt / β-Catenin Sinyali, Hastalık ve Ortaya Çıkan Terapötik Modaliteler." Hücre, cilt. 169, hayır. 6, 1 Haziran 2017, s. 985–999., Doi: 10.1016 / j.cell.2017.05.016.
- ^ "Armadillo (IPR000225)". InterPro. EMBL-EBI.
Dış bağlantılar
- Ökaryotik Doğrusal Motif kaynağı motif sınıfı TRG_NLS_Bipartite_1
- Ökaryotik Doğrusal Motif kaynağı motif sınıfı TRG_NLS_MonoCore_2
- Ökaryotik Doğrusal Motif kaynağı motif sınıfı TRG_NLS_MonoExtC_3
- Ökaryotik Doğrusal Motif kaynağı motif sınıfı TRG_NLS_MonoExtN_4
- Armadillo + Etki Alanı + Proteinler ABD Ulusal Tıp Kütüphanesinde Tıbbi Konu Başlıkları (MeSH)
- Armadillo / plakoglobin ARM tekrarı içinde PROSITE
 | Bu moleküler Biyoloji makale bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek. |