BRD4 - BRD4 - Wikipedia

BRD4
Protein BRD4 PDB 2oss.png
Mevcut yapılar
PDBİnsan UniProt araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Takma adlarBRD4, CAP, HUNK1, HUNKI, MCAP, bromodomain içeren 4
Harici kimliklerOMIM: 608749 HomoloGene: 137685 GeneCard'lar: BRD4
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 19 (insan)
Chr.Kromozom 19 (insan)[1]
Kromozom 19 (insan)
Genomic location for BRD4
Genomic location for BRD4
Grup19p13.12Başlat15,235,519 bp[1]
Son15,332,545 bp[1]
RNA ifadesi Desen
PBB GE BRD4 gnf1h03325 at fs.png

PBB GE BRD4 202102 s at fs.png
Daha fazla referans ifade verisi
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_014299
NM_058243
NM_001330384
NM_001379291
NM_001379292

n / a

RefSeq (protein)

NP_001317313
NP_055114
NP_490597
NP_001366220
NP_001366221

n / a

Konum (UCSC)Tarih 19: 15.24 - 15.33 Mbn / a
PubMed arama[2]n / a
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle

Bromodomain içeren protein 4 bir protein insanlarda BRD4 gen.[3][4]

BRD4, BET (bromodomain ve extra terminal domain) ailesinin bir üyesidir ve şunları da içerir: BRD2, BRD3, ve BRDT.[5] BRD4, diğer BET ailesi üyelerine benzer, iki Bromodomains tanıyan asetillenmiş lizin kalıntılar.[6] BRD4 ayrıca, diğer BET ailesi üyelerine küçük dizi homolojisi olan genişletilmiş bir C-terminal alanına sahiptir.[5]

Yapısı

BRD4'te BD1 ve BD2 olarak adlandırılan iki bromodomain, 4 alfa sarmalları 2 ile bağlantılı döngüler.[7] ET alanı yapısı, 3 alfa-helis ve bir döngüden oluşur.[8] BRD4'ün C-terminal alanı, gen transkripsiyonu transkripsiyon uzama faktörü ile etkileşim yoluyla P-TEFb ve RNA polimeraz II.[9][10][11]

Fonksiyon

Bu gen tarafından kodlanan protein, mitoz sırasında kromozomlarla birleşen murin proteini MCAP ve insana homologdur. BRD2 (RING3) proteini, bir serin / treonin kinaz. Bu proteinlerin her biri, korunmuş iki bromodomain içerir. dizi motifi dahil olabilir kromatin hedefleme. Bu genin, kromozom 19'un hedefi olduğu belirtilmiştir. yer değiştirme t (15; 19) (q13; p13.1), NUT orta hat karsinomu. Alternatif olarak eklenmiş iki transkript varyantı tarif edilmiştir.[4]

Kanserdeki rolü

Çoğu durumda NUT orta hat karsinomu BRD4'ün NUT genleri ile translokasyonunu içerir.[12] BRD4 genellikle ifade için gereklidir Benim C ve dahil olmak üzere hematolojik kanserlerde diğer "tümöre yol açan" onkojenler multipil myeloma, akut miyelojenöz lösemi ve akut lenfoblastik lösemi.[13]

BRD4 büyük bir hedeftir BET inhibitörleri,[14][13] Şu anda klinik deneylerde değerlendirilmekte olan bir farmasötik ilaç sınıfı.

Etkileşimler

Özellikle BRD4, P-TEFb P-TEFb etkileşim alanı (PID) yoluyla, böylece kinaz aktivitesini uyarır ve karboksi terminal alanının (CTD) fosforilasyonunu uyarır. RNA polimeraz II.[15] Son inceleme.[16]

BRD4 gösterildi etkileşim ile GATA1,[17] JMJD6,[18] RFC2,[19] RFC3,[19] RFC1,[19] RFC4[19] ve RFC5.[19]

BRD4 ayrıca diasetillenmiş ile bağlanmada da rol oynamıştır. Büküm protein ve bu etkileşimin bozulmasının bazal benzeri meme kanserinde tümör oluşumunu baskıladığı gösterilmiştir.[20]

BRD4'ün ayrıca MS417 gibi çeşitli inhibitörlerle etkileştiği de gösterilmiştir; BRD4'ün MS417 ile inhibisyonunun, HIV ile ilişkili böbrek hastalığında görülen NF-κB aktivitesini aşağı regüle ettiği gösterilmiştir.[21] BRD4 ayrıca apabetalone (RVX-208),[22] tedavisi için değerlendiriliyor ateroskleroz ve kalp-damar hastalığı.

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000141867 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  3. ^ Dey A, Ellenberg J, Farina A, Coleman AE, Maruyama T, Sciortino S, Lippincott-Schwartz J, Ozato K (Eylül 2000). "Bir bromodomain proteini, MCAP, mitotik kromozomlarla birleşir ve G (2) -M geçişini etkiler". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 20 (17): 6537–49. doi:10.1128 / MCB.20.17.6537-6549.2000. PMC  86127. PMID  10938129.
  4. ^ a b "Entrez Geni: BRD4 bromodomain içeren 4".
  5. ^ a b Zeng L, Zhou MM (Şubat 2002). "Bromodomain: bir asetil-lizin bağlanma alanı". FEBS Mektupları. 513 (1): 124–8. doi:10.1016 / s0014-5793 (01) 03309-9. PMID  11911891. S2CID  29706103.
  6. ^ Shi J, Vakoc CR (Haziran 2014). "BET bromodomain inhibisyonunun terapötik aktivitesinin arkasındaki mekanizmalar". Moleküler Hücre. 54 (5): 728–736. doi:10.1016 / j.molcel.2014.05.016. PMC  4236231. PMID  24905006.
  7. ^ Devaiah BN, Singer DS (1 Ocak 2013). "Brd4'ün iki yüzü: mitotik yer imi ve transkripsiyonel lynchpin". Transkripsiyon. 4 (1): 13–17. doi:10.4161 / trns.22542. PMC  3644036. PMID  23131666.
  8. ^ Wu SY, Chiang CM (Mayıs 2007). "Çift bromodomain içeren kromatin adaptörü Brd4 ve transkripsiyonel düzenleme". Biyolojik Kimya Dergisi. 282 (18): 13141–5. doi:10.1074 / jbc.r700001200. PMID  17329240.
  9. ^ Itzen, F; Greifenberg, A. K .; Bösken, C. A .; Geyer, M (2014). "Brd4, RNA polimeraz II CTD fosforilasyonu için P-TEFb'yi etkinleştirir". Nükleik Asit Araştırması. 42 (12): 7577–90. doi:10.1093 / nar / gku449. PMC  4081074. PMID  24860166.
  10. ^ Jonkers, ben; Lis, J.T. (2015). "RNA polimeraz II ile transkripsiyon uzaması hızına yetişme". Doğa İncelemeleri Moleküler Hücre Biyolojisi. 16 (3): 167–77. doi:10.1038 / nrm3953. PMC  4782187. PMID  25693130.
  11. ^ Yang, Z; Yik, J. H .; Chen, R; Tavuk; Jang, M. K .; Ozato, K; Zhou, Q (2005). "Bromodomain proteini Brd4 tarafından transkripsiyonel uzamanın uyarılması için P-TEFb'nin görevlendirilmesi". Moleküler Hücre. 19 (4): 535–45. doi:10.1016 / j.molcel.2005.06.029. PMID  16109377.
  12. ^ French CA (Haz 2010). "NUT orta hat karsinomlarının demistifiye moleküler patolojisi" Klinik Patoloji Dergisi. 63 (6): 492–6. doi:10.1136 / jcp.2007.052902. PMID  18552174. S2CID  2200842.
  13. ^ a b Da Costa, D .; Agathanggelou, A .; Perry, T .; Weston, V .; Petermann, E .; Zlatanou, A .; Oldreive, C .; Wei, W .; Stewart, G. (2013-07-19). "Birincil pediyatrik B öncülü akut lenfoblastik lösemide tekli veya kombine bir terapötik yaklaşım olarak BET inhibisyonu". Kan Kanseri Dergisi. 3 (7): e126. doi:10.1038 / bcj.2013.24. PMC  3730202. PMID  23872705.
  14. ^ Shi J, Vakoc CR (Haziran 2014). "BET bromodomain inhibisyonunun terapötik aktivitesinin arkasındaki mekanizmalar". Moleküler Hücre. 54 (5): 728–36. doi:10.1016 / j.molcel.2014.05.016. PMC  4236231. PMID  24905006.
  15. ^ Itzen F, Greifenberg AK, Bösken CA, Geyer M (Tem 2014). "Brd4, RNA polimeraz II CTD fosforilasyonu için P-TEFb'yi etkinleştirir". Nükleik Asit Araştırması. 42 (12): 7577–7590. doi:10.1093 / nar / gku449. PMC  4081074. PMID  24860166.
  16. ^ Quaresma, AJ; Bugai A; Barboric M. (2016). "RNA polimeraz II uzamasının 7SK snRNP ve P-TEFb ile kontrolünü kırmak". Nükleik Asit Araştırması. 44 (8): 7527–7539. doi:10.1093 / nar / gkw585. PMC  5027500. PMID  27369380.
  17. ^ Lamonica JM, Deng W, Kadauke S, Campbell AE, Gamsjaeger R, Wang H, Cheng Y, Billin AN, Hardison RC, Mackay JP, Blobel GA (Mayıs 2011). "Bromodomain proteini Brd3, eritroid hedef genlerde kromatin işgalini desteklemek için asetillenmiş GATA1 ile birleşir". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 108 (22): E159–68. doi:10.1073 / pnas.1102140108. PMC  3107332. PMID  21536911.
  18. ^ Liu W, Ma Q, Wong K, Li W, Ohgi K, Zhang J, Aggarwal AK, Rosenfeld MG (Aralık 2013). "Transkripsiyonel duraklatma salınımının düzenlenmesinde Brd4 ve JMJD6 ile ilişkili duraklamayı önleyici geliştiriciler". Hücre. 155 (7): 1581–95. doi:10.1016 / j.cell.2013.10.056. PMC  3886918. PMID  24360279.
  19. ^ a b c d e Maruyama T, Farina A, Dey A, Cheong J, Bermudez VP, Tamura T, Sciortino S, Shuman J, Hurwitz J, Ozato K (Eylül 2002). "Bir Memeli bromodomain proteini, brd4, replikasyon faktörü C ile etkileşir ve S fazına ilerlemeyi inhibe eder". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 22 (18): 6509–20. doi:10.1128 / MCB.22.18.6509-6520.2002. PMC  135621. PMID  12192049.
  20. ^ Shi J, Wang Y, Zeng L, Wu Y, Deng J, Zhang Q, Lin Y, Li J, Kang T, Tao M, Rusinova E, Zhang G, Wang C, Zhu H, Yao J, Zeng YX, Evers BM , Zhou MM, Zhou BP (Şubat 2014). "BRD4'ün diasetile Twist ile etkileşimini bozmak, bazal benzeri meme kanserinde tümör oluşumunu baskılar". Kanser hücresi. 25 (2): 210–225. doi:10.1016 / j.ccr.2014.01.028. PMC  4004960. PMID  24525235.
  21. ^ Zhang G, Liu R, Zhong Y, Plotnikov AN, Zhang W, Zeng L, Rusinova E, Gerona-Nevarro G, Moshkina N, Joshua J, Chuang PY, Ohlmeyer M, He JC, Zhou MM (Ağu 2012). "HIV ile ilişkili böbrek hastalığında NF-κB transkripsiyonel aktivitesinin BRD4 inhibisyonu ile aşağı regülasyonu". Biyolojik Kimya Dergisi. 287 (34): 28840–28851. doi:10.1074 / jbc.M112.359505. PMC  3436579. PMID  22645123.
  22. ^ McLure KG, Gesner EM, Tsujikawa L, Kharenko OA, Attwell S, Campeau E, Wasiak S, Stein A, White A, Fontano E, Suto RK, Wong NC, Wagner GS, Hansen HC, Young PR (31 Aralık 2013). "İnsanlarda bir ApoA-I indükleyicisi olan RVX-208, bir BET bromodomain antagonistidir". PLOS ONE. 8 (12): e83190. Bibcode:2013PLoSO ... 883190M. doi:10.1371 / journal.pone.0083190. PMC  3877016. PMID  24391744.

Dış bağlantılar

daha fazla okuma