GHKL alanı - GHKL domain

Histidin kinaz-, DNA giraz B- ve HSP90 benzeri ATPaz
PDB 1ah6 EBI.jpg
Maya Hsp90 şaperonunun N-terminal alanının yapısı.[1]
Tanımlayıcılar
SembolHATPase_c
PfamPF02518
InterProIPR003594
AKILLIHATPase_c
SCOP21ei1 / Dürbün / SUPFAM
CDDcd00075

GHKL alanı (Gyrase, Hsp90, Histidin Kinase, MutL ) evrimsel olarak korunmuştur protein alanı.[2]

Bu aile yapısal olarak ilişkili ATPase histidin kinaz, DNA giraz B ve HSP90'ın alanları. Bu alan, çeşitli ATP bağlayıcı proteinlerde bulunur, örneğin: histidin kinaz, DNA giraz B, topoizomerazlar,[3] ısı şoku proteini HSP90,[4][5][6] fitokrom benzeri ATPazlar ve DNA uyuşmazlığı onarım proteinleri. Bu protein hakkında daha fazla bilgi Ayın Proteini: DNA Topoizomeraz'da bulunabilir.[7]

Alt aileler

Üyeler

Referanslar

  1. ^ Prodromou C, Roe SM, Piper PW, Pearl LH (Haziran 1997). "Maya Hsp90 şaperonunun N-terminal alanının kristal yapısında bir moleküler kelepçe". Nat. Struct. Biol. 4 (6): 477–82. doi:10.1038 / nsb0697-477. PMID  9187656. S2CID  38764610.
  2. ^ Dutta R, Inouye M (Ocak 2000). "GHKL, ortaya çıkan bir ATPase / kinaz üst ailesi". Trends Biochem. Sci. 25 (1): 24–8. doi:10.1016 / S0968-0004 (99) 01503-0. PMID  10637609.
  3. ^ Bellon S, Parsons JD, Wei Y, Hayakawa K, Swenson LL, Charifson PS, Lippke JA, Aldape R, Gross CH (Mayıs 2004). "Escherichia coli Topoizomeraz IV ParE Alt Birimi'nin Kristal Yapıları (24 ve 43 Kilodalton): Tek Bir Kalıntı, Novobiocin Potansında Topoizomeraz IV ve DNA Giraza Karşı Farklılıkları Belirler". Antimicrob. Ajanlar Kemoterapi. 48 (5): 1856–64. doi:10.1128 / AAC.48.5.1856-1864.2004. PMC  400558. PMID  15105144.
  4. ^ Immormino RM, Dollins DE, Shaffer PL, Soldano KL, Walker MA, Gewirth DT (Ekim 2004). "Bir Hsp90 şaperonu olan GRP94'ün N-terminal alanında ligand kaynaklı konformasyonel kayma". J. Biol. Kimya. 279 (44): 46162–71. doi:10.1074 / jbc.M405253200. PMID  15292259.
  5. ^ Roe SM, Ali MM, Meyer P, Vaughan CK, Panaretou B, Piper PW, Prodromou C, Pearl LH (Ocak 2004). "Protein kinaza özgü kokaperon p50 (cdc37) tarafından Hsp90 regülasyonunun Mekanizması". Hücre. 116 (1): 87–98. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 01027-4. PMID  14718169. S2CID  797232.
  6. ^ Wright L, Barril X, Dymock B, Sheridan L, Surgenor A, Beswick M, Drysdale M, Collier A, Massey A, Davies N, Fink A, Fromont C, Aherne W, Boxall K, Sharp S, Workman P, Hubbard RE (Haziran 2004). "HSP90 izoformlarına bağlanan purin bazlı inhibitörde yapı-aktivite ilişkileri". Chem. Biol. 11 (6): 775–85. doi:10.1016 / j.chembiol.2004.03.033. PMID  15217611.
  7. ^ McDowall J (2006). "DNA Topoizomeraz". Ayın proteini. InterPro.
Bu makale kamu malı metinleri içermektedir Pfam ve InterPro: IPR003594