Hayalet nüfus - Ghost population

Bir hayalet nüfus istatistiksel teknikler kullanılarak elde edilen bir popülasyondur.[1]

Nüfus çalışmaları

2004 yılında önerildi Maksimum olasılık veya Bayes kullanarak göç oranlarını ve nüfus boyutlarını tahmin eden yaklaşımlar birleşik teori verisi olmayan bir popülasyon içeren veri kümelerini kullanabilir. Buna "hayalet nüfus" adı verilir. Manipülasyon, eksik popülasyonların iki spesifik popülasyon arasındaki nüfus büyüklükleri ve göç oranlarının tahmini üzerindeki etkilerinin araştırılmasına olanak tanır. Çıkarılan nüfus parametrelerinin önyargıları, bilinmeyen popülasyonlardan gelen göç hızının büyüklüğüne bağlıdır.[1] Hayalet popülasyonları türetme tekniği eleştiriyi çekti çünkü hayalet popülasyonlar, sınırlamaları ile birlikte istatistiksel modellerin sonucuydu.[2]

Popülasyon genetiği

Daha fazla bilgi: Arkaik ve modern insanlar arasında melezleşme

2012 yılında DNA analizi ve İstatistiksel teknikler Kuzey Avrasya'da nesli tükenmiş bir insan nüfusunun hem Avrupalıların ataları hem de daha sonra Amerika'ya göç eden bir Sibirya grubuyla melezlendiği sonucuna varmak için kullanıldı. Grup hayalet popülasyon olarak adlandırıldı çünkü kemikler veya antik DNA ile değil, genomlarda bıraktıkları yankılar tarafından tanımlandılar.[3] 2013 yılında, başka bir araştırma, bu hayalet grubun bir üyesinin kalıntılarını buldu ve var olduklarına dair önceki öngörüyü yerine getirdi.[4][5]

Xu vd. (2017), Müsin 7 modern insanların tükürüğündeki protein ve arkaik Afrika insanlarının tanımlanamayan bir hayalet popülasyonunun, modern Afrikalıların (örneğin Afrika- Amerikan, Afrika-Karayip, Esan, Gambiya, Luhya, Mende ve Yoruba halkı).[6]

2020'de yayınlanan bir araştırmaya göre, dört Batı Afrika popülasyonunun DNA'sının% 2 ila% 19'unun (veya yaklaşık 6.6 ve ≃% 7.0), insanların atalarından ayrılan bilinmeyen bir arkaik hominininden gelmiş olabileceğine dair göstergeler var. ve Neandertaller 360 kya ile 1.02 mya arasındadır. Bununla birlikte, çalışma aynı zamanda bu arkaik karışımın en azından bir kısmının Avrasyalılarda / Afrikalı olmayanlarda da mevcut olduğunu ve karışım olayının veya olaylarının 0 ila 124 ka BP arasında değiştiğini ve Afrika Dışından önceki dönemi de içerdiğini göstermektedir. göç ve Afrika / Avrasya bölünmesinden önce (dolayısıyla hem Afrikalıların hem de Avrasyalıların / Afrikalı olmayanların ortak atalarını kısmen etkilemektedir).[7][8][9] Daha önce tanımlanmamış insan genetik varyasyonunun önemli miktarlarını keşfeden yeni bir başka çalışma, Afrikalılarda modern insanlardan önce gelen ve Afrikalı olmayanların çoğunda kaybolan atalara ait genetik varyasyon buldu.[10]

2015 yılında, evcil domuzların soyları ve erken göçleri üzerine yapılan bir araştırma, verilere uyan en iyi modelin, Pleistosen artık nesli tükendi.[11]

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ a b Beerli, P (2004). "Örneklenmemiş popülasyonların, örneklenen popülasyonlar arasındaki nüfus büyüklükleri ve göç oranlarının tahmini üzerindeki etkisi". Moleküler Ekoloji. 13 (4): 827–836. doi:10.1111 / j.1365-294x.2004.02101.x. PMID  15012758.
  2. ^ Skatkin, M (2005). "Hayaletleri görmek: örneklenmemiş popülasyonların örneklenen popülasyonlar için tahmin edilen göç oranları üzerindeki etkisi". Moleküler Ekoloji. 14 (1): 67–73. doi:10.1111 / j.1365-294X.2004.02393.x. PMID  15643951.
  3. ^ Patterson, N (2012). "İnsanlık tarihindeki kadim katkı". Genetik. 192 (3): 1065–93. doi:10.1534 / genetik.112.145037. PMC  3522152. PMID  22960212.
  4. ^ Raghavan, M (2013). "Üst Paleolitik Sibirya genomu, Yerli Amerikalıların ikili soyunu ortaya çıkarıyor". Doğa. 505 (7481): 87–91. doi:10.1038 / nature12736. PMC  4105016. PMID  24256729.
  5. ^ Callaway, E (2015). ""Hayalet nüfus, "Amerika'ya uzun zamandır kayıp olan göçü işaret ediyor". Doğa. doi:10.1038 / doğa.2015.18029.
  6. ^ Xu, D .; Pavlidis, P .; Taşkent, O.R .; Alachiotis, N .; Flanagan, C .; DeGiorgio, M .; et al. (2017). "Afrika'daki Arkaik Hominin İngresyonu, Fonksiyonel Tükürük MUC7 Genetik Varyasyonuna Katkıda Bulunur". Moleküler Biyoloji ve Evrim. 34 (10): 2704–15. doi:10.1093 / molbev / msx206. PMC  5850612. PMID  28957509.
  7. ^ Arun Durvasula; Sriram Sankararaman (2020). "Afrika popülasyonlarında hayalet arkaik iç içe geçme sinyallerini kurtarma". Bilim Gelişmeleri. 6 (7): eaax5097. doi:10.1126 / sciadv.aax5097. PMC  7015685. PMID  32095519. "Afrikalı olmayan popülasyonlar (Pekin'deki Han Çinlileri ve kuzey ve batı Avrupa kökenli Utah sakinleri) de CSFS'de benzer modeller gösteriyor, bu da arkaik soyun bir bileşeninin Afrikalı ve Afrikalı olmayan nüfusların bölünmesinden önce paylaşıldığını gösteriyor ... Belgelediğimiz yakın zamana ait introgresyon zamanının bir yorumu, Afrika'da arkaik formların oldukça yakın zamana kadar devam ettiğidir. Alternatif olarak, arkaik nüfus daha önce modern bir insan popülasyonuna girebilir ve daha sonra sahip olduğumuz popülasyonların atalarıyla melezlenebilirdi. Burada incelediğimiz modeller birbirini dışlamıyor ve Afrika popülasyonlarının tarihinin, içe dönük arkaik popülasyonla ilişkili büyük etkili popülasyon büyüklüğünün kanıtladığı gibi, çok sayıda farklı popülasyondan gelen genetik katkıları içermesi makul. İç içe geçme zamanına ilişkin tahminlerimizdeki belirsizlik göz önüne alındığında, j Hem CEU'dan (Kuzey ve Batı Avrupa kökenli Utah sakinleri) hem de YRI genomlarından CSFS'yi merhametli bir şekilde analiz etmek ek çözüm sağlayabilir. C modeli altında, Afrikalı ve Afrikalı olmayan popülasyonlar arasındaki bölünmeden önce ve sonra introgresyonu simüle ettik ve Afrika ve Afrikalı olmayan popülasyonlarda CSFS'nin yüksek frekanslı türetilmiş alel kutularındaki iki model arasında niteliksel farklılıklar gözlemledik (Şekil S40. ). CEU ve YRI'de CSFS'nin yüksek frekanslı türetilmiş alel kutularına birlikte uyması için ABC'yi kullanarak (% 50'den fazla frekans olarak tanımlanır), introgresyon süresinin% 95 inandırıcı aralığının alt sınırının, CEU ve YRI arasında simüle edilmiş ayrım (2800'e karşı 2155 nesil BP), YRI'de görülen arkaik soyların en azından bir kısmının CEU ile paylaşıldığını gösterir ... "
  8. ^ [1] İçin Tamamlayıcı Malzemeler Afrika popülasyonlarında hayalet arkaik introgresyon sinyallerini kurtarma ", bölüm" S8.2 "" Bölüm S5.2'deki aynı öncülleri kullanarak verileri simüle ettik, ancak hem YRI [West African Yoruba] hem de CEU [bir Avrupa popülasyonu] için spektrumu hesapladık. Menşei] . En iyi uydurma parametrelerinin 27.000 nesil önceki arkaik ayrılma süresi (% 95 HPD: 26.000-28.000), karışım oranı 0.09 (% 95 HPD: 0.04-0.17), 3.000 nesil önceki karışım süresi (% 95 HPD) olduğunu bulduk. : 2,800-3,400) ve 19,700 kişiden oluşan etkili bir nüfus büyüklüğü (% 95 HPD: 19,300-20,200). Karışım süresinin alt sınırının, CEU ve YRI (2155 kuşak önce) arasındaki simüle edilmiş ayrımdan daha geride olduğunu ve Afrika'dan Çıkış öncesi bir olay lehine bazı kanıtlar sağladığını görüyoruz. Bu model, Afrika dışındaki birçok popülasyonun da bu introgresyon olayından alınan haplotipleri içermesi gerektiğini öne sürüyor, ancak tespit zor çünkü birçok yöntem introgressed haplotipleri tespit etmek için karıştırılmamış dış gruplar kullanıyor [Browning ve diğerleri, 2018, Skov ve diğerleri, 2018, Durvasula ve Sankararaman , 2019] (5, 53, 22). Bu haplotiplerden bazılarının Afrika dışı darboğaz sırasında kaybolmuş olması da mümkündür. "
  9. ^ https://advances.sciencemag.org/content/advances/suppl/2020/02/10/6.7.eaax5097.DC1/aax5097_SM.pdf
  10. ^ Bergström, A; McCarthy, S; Hui, R; Almarri, M; Ayub, Q (2020). "929 farklı genomdan insan genetik varyasyonu ve popülasyon geçmişi hakkında içgörüler". Bilim. 367 (6484): eaay5012. doi:10.1126 / science.aay5012. PMC  7115999. PMID  32193295. "Modern popülasyonlardaki arkaik sekansların analizi, Afrika popülasyonlarında muhtemelen modern insanlardan önce gelen ve Afrikalı olmayan popülasyonların çoğunda kaybolan atalara ait genetik varyasyonu tespit ediyor ... Batı Afrika genomlarında küçük miktarlarda Neandertal soyları bulduk, büyük olasılıkla Avrasyayı yansıtıyor Çok düşük seviyelerine veya arkaik ataların yokluğuna rağmen, Afrika popülasyonları, Avrasya'da bulunmayan birçok Neandertal ve Denisovan varyantını paylaşıyor, bu da Afrika'da atalara ait insan varyasyonunun daha büyük bir oranının nasıl korunduğunu yansıtıyor. "
  11. ^ Frantz, L (2015). "Avrasya yabani ve evcil domuz genomlarının analizlerinden evcilleştirme sırasında uzun vadeli gen akışı ve seçilimi kanıtı". Doğa Genetiği. 47 (10): 1141–1148. doi:10.1038 / ng.3394. PMID  26323058.