Hiperbolastik fonksiyonlar - Hyperbolastic functions - Wikipedia

Değişen parametre değerleriyle Hiperbolastik Tip I işlevini açıklayan grafik.
Çeşitli parametre değerleriyle Hiperbolastik Tip I işlevini açıklayan grafik.
Değişen parametre değerleriyle Hiperbolastik Tip II işlevini açıklayan grafik.
Değişen parametre değerleriyle Hiperbolastik Tip II işlevini açıklayan grafik.
Değişen parametre değerleriyle Hiperbolastik Tip III işlevini açıklayan grafik.
Tip III'ün Hiperbolastik kümülatif dağılım fonksiyonunu değişen parametre değerleriyle açıklayan grafik.
Tip III'ün Hiperbolastik olasılık yoğunluğu fonksiyonunu değişen parametre değerleriyle açıklayan grafik.

hiperbolastik fonksiyonlar, Ayrıca şöyle bilinir hiperbolastik büyüme modelleri, vardır matematiksel fonksiyonlar tıpta kullanılan istatistiksel modelleme. Bu modeller başlangıçta çok hücreli tümör kürelerinin büyüme dinamiklerini yakalamak için geliştirilmiş ve 2005 yılında Mohammad Tabatabai, David Williams ve Zoran Bursac tarafından tanıtılmıştır.[1] Gerçek dünya problemlerini modellemede hiperbolastik fonksiyonların hassasiyeti, bir şekilde bükülme noktasındaki esnekliklerinden kaynaklanmaktadır.[1] Bu fonksiyonlar, tümör büyümesi gibi çok çeşitli modelleme problemlerinde kullanılabilir, kök hücre proliferasyon, farmakinetik, kanser büyümesi, sigmoid aktivasyon fonksiyonu nöral ağlar ve epidemiyolojik hastalık ilerlemesi veya gerilemesi.[1][2][3]

hiperbolastik fonksiyonlar ulaşana kadar hem büyüme hem de bozulma eğrilerini modelleyebilir Taşıma kapasitesi. Esnekliklerinden dolayı, bu modeller tıbbi alanda çeşitli uygulamalara sahiptir ve müdahaleci bir tedavi ile hastalığın ilerlemesini yakalama becerisine sahiptir. Rakamların gösterdiği gibi, hiperbolastik fonksiyonlar sığabilir sigmoidal eğri en yavaş hızın erken ve geç aşamalarda gerçekleştiğini gösterir. Mevcut sigmoidal şekillere ek olarak, tıbbi müdahalelerin hastalığın ilerlemesini yavaşlattığı veya tersine çevirdiği iki fazlı durumları da barındırabilir; ancak tedavinin etkisi ortadan kalktığında hastalık, yatay asimptotuna ulaşıncaya kadar ilerlemesinin ikinci aşamasına başlayacaktır.

Bu fonksiyonların sahip olduğu temel özelliklerden biri, sadece sigmoidal şekillere uymamaları, aynı zamanda diğer klasik sigmoidal eğrilerin yeterince modelleyemeyeceği iki fazlı büyüme modellerini de modelleyebilmeleridir. Bu ayırt edici özelliğin tıp, biyoloji, ekonomi, mühendislik gibi çeşitli alanlarda avantajlı uygulamaları vardır. tarım bilimi ve bilgisayar destekli sistem teorisi.[4][5][6][7][8]

Fonksiyon H1

tip I hiperbolastik hız denklemiH1 olarak gösterilen, şu şekilde verilir:

nerede herhangi bir gerçek sayıdır ve popülasyon büyüklüğü . Parametre taşıma kapasitesini ve parametreleri temsil eder ve birlikte büyüme oranını temsil eder. Parametre simetrik sigmoidal bir eğriden uzaklığı verir. Tip I'in hiperbolastik hız denklemini çözme verir:

nerede ... ters hiperbolik sinüs işlevi. Biri başlangıç ​​koşulunu kullanmak isterse , sonra şu şekilde ifade edilebilir:

.

Eğer , sonra azaltır:

.

tip I hiperbolastik fonksiyon genelleştirir lojistik fonksiyon. Parametreler o zaman lojistik bir işlev haline gelir. Bu işlev bir tip I hiperbolastik fonksiyon. tip I'in standart hiperbolastik işlevi dır-dir

.

Fonksiyon H2

tip II hiperbolastik oran denklemiH2 ile gösterilen, şu şekilde tanımlanır:

nerede ... hiperbolik tanjant fonksiyon taşıma kapasitesi ve her ikisi ve büyüme oranını birlikte belirler. Ek olarak, parametre zaman sürecinde ivmeyi temsil eder. Tip II'nin hiperbolastik hız fonksiyonunu çözme verir:

.

Biri başlangıç ​​koşulunu kullanmak isterse sonra şu şekilde ifade edilebilir:

.

Eğer , sonra azaltır:

.

tip II'nin standart hiperbolastik işlevi olarak tanımlanır:

.

Fonksiyon H3

Tip III'ün hiperbolastik hız denklemi H3 ile gösterilir ve şu şekle sahiptir:

,

nerede > 0. Parametre taşıma kapasitesini ve parametreleri temsil eder ve büyüme oranını birlikte belirler. Parametre zaman ölçeğinin ivmesini temsil ederken, simetrik sigmoidal bir eğriden uzaklığı temsil eder. Tip III diferansiyel denklemin çözümü:

,

başlangıç ​​koşuluyla ifade edebiliriz gibi:

.

Tip III'ün hiperbolastik dağılımı, üç parametreli bir sürekli olasılık dağılımları ölçek parametreleri ile > 0 ve ≥ 0 ve parametre olarak şekil parametresi. Parametre ne zaman = 0, tip III'ün hiperbolastik dağılımı, Weibull dağılımı.[9] Hiperbolastik kümülatif dağılım fonksiyonu Tip III'ün verilmesi:

,

ve karşılık gelen olasılık yoğunluk fonksiyonu dır-dir:

.

tehlike işlevi (veya başarısızlık oranı) şu şekilde verilir:

hayatta kalma işlevi tarafından verilir:

Tip III'ün standart hiperbolastik kümülatif dağılım işlevi şu şekilde tanımlanır:

,

ve karşılık gelen olasılık yoğunluk işlevi:

.

Özellikleri

Biri noktayı hesaplamak isterse nüfusun taşıma kapasitesinin bir yüzdesine ulaştığı yer , sonra denklem çözülebilir:

için , nerede . Örneğin, yarım nokta ayarlanarak bulunabilir .

Başvurular

Besin konsantrasyonu ve zamanın bir fonksiyonu olarak fitoplankton biyokütlesinin 3B Hiperbolastik grafiği

Pittsburgh Üniversitesi'ndeki McGowan Rejeneratif Tıp Enstitüsü'ndeki kök hücre araştırmacılarına göre "daha yeni bir model [hiperbolastik tip III veya] H3, diferansiyel denklem bu aynı zamanda hücre büyümesini de tanımlar. Bu model çok daha fazla çeşitliliğe izin veriyor ve büyümeyi daha iyi tahmin ettiği kanıtlandı. "[10]

Katının büyümesini analiz etmek için hiperbolastik büyüme modelleri H1, H2 ve H3 uygulanmıştır. Ehrlich karsinomu çeşitli tedaviler kullanarak.[11]

Hayvan biliminde,[12] hiperbolastik fonksiyonlar, etlik piliç büyümesini modellemek için kullanılmıştır.[13] İyileşen yaranın boyutunu belirlemek için tip III hiperbolastik modeli kullanıldı.[14]

Yara iyileşmesi alanında, iyileşmenin zaman sürecini doğru bir şekilde temsil eden hiperbolastik modeller. Bu tür işlevler, eser element alanları, büyüme faktörleri, diyabetik yaralar ve beslenme dikkate alınarak, farklı yara türleri arasında ve iyileşme sürecinin farklı aşamalarında iyileşme hızındaki farklılıkları araştırmak için kullanılmıştır.[15][16]

Hiperbolastik fonksiyonların başka bir uygulaması, stokastik yayılma ortalama işlevi tip I hiperbolastik eğri olan süreç. Sürecin temel özellikleri incelenir ve maksimum olasılık tahmini sürecin parametreleri için dikkate alınır.[17]Bu amaçla, parametrik uzay aşama bazlı bir prosedürle sınırlandıktan sonra ateşböceği metasüristik optimizasyon algoritması uygulanır. Simüle edilmiş örnek yollara ve gerçek verilere dayalı bazı örnekler bu gelişmeyi göstermektedir. Bir örnek yolu difüzyon süreci Akan bir sıvıya gömülü olan ve diğer parçacıklarla çarpışmalar nedeniyle rastgele yer değiştirmelere maruz kalan bir parçacığın yörüngesini modeller. Brown hareketi.[18][19][20][21] Tip III'ün hiperbolastik fonksiyonu, her iki yetişkinin proliferasyonunu modellemek için kullanıldı. mezenkimal ve embriyonik kök hücreleri;[22][23][24][25] ve tip II'nin hiperbolastik karma modeli modellemede kullanılmıştır Rahim ağzı kanseri veri.[26] Hiperbolastik eğriler, hücresel büyümeyi, biyolojik eğrileri uydurmayı ve büyümeyi analiz etmede önemli bir araç olabilir. fitoplankton.[27][28]

İçinde orman ekolojisi ve yönetimde, DBH ve yükseklik arasındaki ilişkiyi modellemek için hiperbolastik modeller uygulanmıştır.[29]

Çok değişkenli hiperbolastik model tip III besin konsantrasyonu dikkate alınarak fitoplankton büyüme dinamiklerini analiz etmek için kullanılmıştır.[30]

Hiperbolastik regresyonlar

Hiperbolastik Tip I, Lojistik ve Hiperbolastik Tip II'nin Kümülatif Dağıtım Fonksiyonu
H1, Lojistik ve H2 PDF dosyası

Hiperbolastik regresyonlar vardır istatistiksel modeller standart kullanan hiperbolatik fonksiyonlar modellemek ikili sonuç değişkeni. İkili regresyonun amacı, bir dizi açıklayıcı (bağımsız) değişken kullanarak ikili bir sonuç (bağımlı) değişkeni tahmin etmektir. İkili regresyon, tıp, halk sağlığı, dişçilik ve biyomedikal bilimler dahil olmak üzere birçok alanda rutin olarak kullanılmaktadır. Tahmin etmek için ikili regresyon analizi kullanıldı endoskopik demir eksikliğinde lezyonlar anemi.[31] Ek olarak, malign ve benign arasında ayrım yapmak için ikili regresyon uygulandı. adneksiyal kitle ameliyattan önce.[32]

Tip I'in hiperbolastik regresyonu

İzin Vermek birbirini dışlayan iki değerden birini, başarı veya başarısızlık varsayabilen ikili bir sonuç değişkeni olabilir. Başarıyı şu şekilde kodlarsak ve başarısızlık olarak tip I'in hiperbolastik başarı olasılığı açıklayıcı değişkenler tarafından verilir:

,

nerede model parametreleridir. Başarı olasılığı, başarı olasılığının başarısızlık olasılığına oranıdır. Tip I hiperbolastik regresyon için, başarı şansı şu şekilde gösterilir: ve denklemle ifade edilir:

.

Logaritması denir logit Tip I Hiperbolastik'in Logit dönüşümü şu şekilde gösterilir: ve şu şekilde yazılabilir:

.

Tip II'nin hiperbolastik regresyonu

İkili sonuç değişkeni için Tip II'nin hiperbolastik başarı olasılığı açıklayıcı değişkenler dır-dir:

,

Tip II'nin hiperbolastik regresyonu için başarı şansı şu şekilde gösterilir: ve tarafından verilir:

Logit dönüşümü şu şekilde gösterilir: ve tarafından verilir:

Referanslar

  1. ^ a b c Tabatabai, Mohammad; Williams, David; Bursac, Zoran (2005). "Hiperbolastik büyüme modelleri: Teori ve uygulama". Teorik Biyoloji ve Tıbbi Modelleme. 2: 14. doi:10.1186/1742-4682-2-14. PMC  1084364. PMID  15799781.
  2. ^ Q. Ashton Acton P. Cells-Advances in Research and Application. [İnternet]. Atlanta: ScholarlyMedia LLC; 2012 [27 Nisan 2020'de alıntılanmıştır]. Şuradan temin edilebilir: https://public.ebookcentral.proquest.com/choice/publicfullrecord.aspx?p=4973379
  3. ^ Wadkin, L. E .; Orozco-Fuentes, S .; Neganova, I .; Lako, M .; Parker, N. G .; Shukurov, A. (2020). "İPSC'lerin matematiksel modellemesine giriş". İPSC Teknolojisindeki Son Gelişmeler. 5.
  4. ^ Neysens, Patricia; Messens, Winy; Gevers, Dirk; Salıncak, Jean; De Vuyst, Luc (2003). "Lactobacillus amylovorus DCE 471 ile büyüme ve bakteriyosin üretiminin iki fazlı kinetiği, stres koşulları altında meydana gelir". Mikrobiyoloji. 149 (4): 1073–1082. doi:10.1099 / mic.0.25880-0. PMID  12686649.
  5. ^ Chu, Charlene; Han, Christina; Shimizu, Hiromi; Wong, Bonnie (2002). "Fruktoz, Galaktoz ve Glikozun-Galaktosidaz İndüksiyonu Üzerindeki Etkisi Escherichia coli" (PDF). Deneysel Mikrobiyoloji ve İmmünoloji Dergisi. 2: 1–5.
  6. ^ Tabatabai, M. A .; Eby, W. M .; Singh, K. P .; Bae, S. (2013). "Büyüme T modeli ve tümör-immünedinamik sistemlerindeki uygulaması". Matematiksel Biyolojik Bilimler ve Mühendislik. 10 (3): 925–938. doi:10.3934 / mbe.2013.10.925. PMC  4476034. PMID  23906156.
  7. ^ Parmoon, Ghasem; Moosavi, Seyed; Poshtdar, Adel; Siadat, Seyed (2020). "Kadmiyum toksisitesinin susam tohumu çimlenmesi üzerindeki etkileri, çeşitli doğrusal olmayan büyüme modelleri ile açıklanmıştır". Yağlı Tohumlar ve Katı Yağlar Bitkileri ve Lipitler. 27 (57). doi:10.1051 / ocl / 2020053.
  8. ^ Bilgisayar Destekli Sistemler Teorisi - EUROCAST 2019. Bilgisayar Bilimlerinde Ders Notları. 12013. 2020. doi:10.1007/978-3-030-45093-9. ISBN  978-3-030-45092-2.
  9. ^ Kamar SH, Msallam BS. Dört Parametreli Weibull Büyüme Modelini Tahmin Etmek İçin Genelleştirilmiş Maksimum Entropi ve Bayes Yöntemleri Arasında Karşılaştırmalı Çalışma. Olasılık ve İstatistik Dergisi. 14 Ocak 2020; 2020: 1-7.
  10. ^ Roehrs T, Bogdan P, Gharaibeh B, vd. (tarih yok). "Kök hücre popülasyonlarında proliferatif heterojenlik". Canlı Hücre Görüntüleme Laboratuvarı, McGowan Rejeneratif Tıp Enstitüsü. Alıntı dergisi gerektirir | günlük = (Yardım)
  11. ^ Eby, Wayne M .; Tabatabai, Mohammad A .; Bursac, Zoran (2010). "İyodoasetat ve dimetilsülfoksidin birleşik tedavisi ile tümör büyümesinin hiperbolastik modellemesi". BMC Kanseri. 10: 509. doi:10.1186/1471-2407-10-509. PMC  2955040. PMID  20863400.
  12. ^ Fransa, James; Kebreab, Ermias, eds. (2008). Hayvan Beslemesinde Matematiksel Modelleme. Wallingford: CABI. ISBN  9781845933548.
  13. ^ Ahmedi, H .; Mottaghitalab, M. (2007). "Broyler Büyüme Kinetiğini Tanımlamak için Yeni ve Güçlü Bir Araç Olarak Hiperbolastik Modeller". Kümes Hayvanları Bilimi. 86 (11): 2461–2465. doi:10.3382 / ps.2007-00086. PMID  17954598.
  14. ^ Choi, Taeyoung; Çene, Seongah (2014). "Yeraltı Saçılımını Kullanan Yeni Gerçek Zamanlı Yüz Yara İyileştirme Sentezi". Bilimsel Dünya Dergisi. 2014: 1–8. doi:10.1155/2014/965036. PMC  4146479. PMID  25197721.
  15. ^ Tabatabai, M.A .; Eby, W.M .; Singh, K.P. (2011). "Yara iyileşmesinin hiperbolastik modellemesi". Matematiksel ve Bilgisayar Modelleme. 53 (5–6): 755–768. doi:10.1016 / j.mcm.2010.10.013.
  16. ^ Ko, Ung Hyun; Choi, Jongjin; Choung, Jinseung; Ay, Sunghwan; Shin, Jennifer H. (2019). "Yara İyileştirme Stratejisi için Fizikokimyasal Olarak Ayarlanmış Miyofibroblastlar". Bilimsel Raporlar. 9 (1): 16070. Bibcode:2019NatSR ... 916070K. doi:10.1038 / s41598-019-52523-9. PMC  6831678. PMID  31690789.
  17. ^ Barrera, Antonio; Román-Román, Patricia; Torres-Ruiz, Francisco (2020). "Weibull Tabanlı Modeller için Difüzyon İşlemleri". Bilgisayar Destekli Sistemler Teorisi - EUROCAST 2019. Bilgisayar Bilimlerinde Ders Notları. 12013. s. 204–210. doi:10.1007/978-3-030-45093-9_25. ISBN  978-3-030-45092-2.
  18. ^ Barrera, Antonio; Román-Román, Patricia; Torres-Ruiz, Francisco (2018). "Bir hiperbolastik tip-I difüzyon süreci: ateş böceği algoritması aracılığıyla parametre tahmini". Biyosistemler. 163: 11–22. doi:10.1016 / j.biosystems.2017.11.001. PMID  29129822.
  19. ^ Barrera, Antonio; Román-Roán, Patricia; Torres-Ruiz, Francisco (2020). "Hiperbolastik tip-III difüzyon süreci: Genelleştirilmiş Weibull difüzyon sürecinden elde etme". Matematiksel Biyolojik Bilimler ve Mühendislik. 17 (1): 814–833. doi:10.3934 / mbe.2020043. PMID  31731379.
  20. ^ Barrera, Antonio; Román-Román, Patricia; Torres-Ruiz, Francisco (2020). "Osilabolastik Tip Davranışı Modellemek İçin İki Stokastik Diferansiyel Denklem". Matematik. 8 (2): 155. doi:10.3390 / math8020155.
  21. ^ Uygulamalı Stokastik Süreçler. 2019. doi:10.3390 / kitaplar978-3-03921-729-8. ISBN  978-3-03921-729-8.
  22. ^ Tabatabai, Mohammad A .; Bursac, Zoran; Eby, Wayne M .; Singh, Karan P. (2011). "Kök hücre çoğalmasının matematiksel modellemesi". Tıp ve Biyoloji Mühendisliği ve Bilgisayar. 49 (3): 253–262. doi:10.1007 / s11517-010-0686-y. PMID  20953843.
  23. ^ Eby, Wayne M .; Tabatabai, Mohammad A. (2014). "Kök Hücreler için Matematiksel Modellemede Yöntemler". Hastalık ve Yaralanmada Tedavi Uygulamaları. Kök Hücreler ve Kanser Kök Hücreleri. 12. s. 201–217. doi:10.1007/978-94-017-8032-2_18. ISBN  978-94-017-8031-5.
  24. ^ Wadkin, L. E .; Orozco-Fuentes, S .; Neganova, I .; Lako, M .; Shukurov, A .; Parker, N.G. (2020). "İnsan pluripotent kök hücrelerinin matematiksel modellemesindeki son gelişmeler". SN Uygulamalı Bilimler. 2 (2). doi:10.1007 / s42452-020-2070-3.
  25. ^ Kök Hücreler ve Kanser Kök Hücreleri, Cilt 12. Kök Hücreler ve Kanser Kök Hücreleri. 12. 2014. doi:10.1007/978-94-017-8032-2. ISBN  978-94-017-8031-5.
  26. ^ Tabatabai, Mohammad A .; Kengwoung-Keumo, Jean-Jacques; Eby, Wayne M .; Bae, Sejong; Guemmegne, Juliette T .; Manne, Upender; Fouad, Mona; Partridge, Edward E .; Singh, Karan P. (2014). "Boyuna Hiperbolastik Karma Etkiler Tip II Modeli ile Belirlenen Rahim Ağzı Kanseri Ölüm Oranlarındaki Eşitsizlikler". PLOS ONE. 9 (9): e107242. Bibcode:2014PLoSO ... 9j7242T. doi:10.1371 / journal.pone.0107242. PMC  4167327. PMID  25226583.
  27. ^ Veríssimo, André; Paixão, Laura; Neves, Ana; Vinga Susana (2013). "BGFit: Biyolojik büyüme eğrilerinin yönetimi ve otomatik montajı". BMC Biyoinformatik. 14: 283. doi:10.1186/1471-2105-14-283. PMC  3848918. PMID  24067087.
  28. ^ Tabatabai, M. A .; Eby, W. M .; Bae, S .; Singh, K.P. (2013). "Fitoplankton büyümesi için esnek çok değişkenli bir model". Matematiksel Biyolojik Bilimler ve Mühendislik. 10 (3): 913–923. doi:10.3934 / mbe.2013.10.913. PMID  23906155.
  29. ^ Eby, Wayne M .; Oyamakin, Samuel O .; Chukwu, Angela U. (2017). "Gmelina arborea'da yükseklik-DBH ilişkisine uygulanan yeni bir doğrusal olmayan model". Orman Ekolojisi ve Yönetimi. 397: 139–149. doi:10.1016 / j.foreco.2017.04.015.
  30. ^ Tabatabai, M. A .; Eby, W. M .; Bae, S .; Singh, K.P. (2013). "Fitoplankton büyümesi için esnek çok değişkenli bir model". Matematiksel Biyolojik Bilimler ve Mühendislik. 10 (3): 913–923. doi:10.3934 / mbe.2013.10.913. PMID  23906155.
  31. ^ Majid, Shahid; Salih, Mohammad; Wasaya, Rozina; Jafri, Wasim (2008). "Gastrointestinal semptomlar olmaksızın demir eksikliği anemisinde endoskopide gastrointestinal lezyonların belirleyicileri". BMC Gastroenteroloji. 8: 52. doi:10.1186 / 1471-230X-8-52. PMC  2613391. PMID  18992171.
  32. ^ Timmerman, Dirk; Testa, Antonia C .; Bourne, Tom; Ferrazzi, Enrico; Ameye, Lieveke; Konstantinovic, Maja L .; Van Calster, Ben; Collins, William P .; Vergote, Ignace; Van Huffel, Sabine; Valentin Lil (2005). "Ameliyat Öncesi İyi Huylu ve Kötü Huylu Adneksiyal Kitleyi Ayırt Etmek İçin Lojistik Regresyon Modeli: Uluslararası Yumurtalık Tümörü Analiz Grubu Tarafından Çok Merkezli Bir Çalışma". Klinik Onkoloji Dergisi. 23 (34): 8794–8801. doi:10.1200 / JCO.2005.01.7632. PMID  16314639.