MED1 - MED1 - Wikipedia

MED1
PDB 1rjk EBI.jpg
Mevcut yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Takma adlarMED1, CRSP1, CRSP200, DRIP205, DRIP230, PBP, PPARBP, PPARGBP, RB18A, TRAP220, TRIP2, arabulucu kompleks alt birimi 1
Harici kimliklerOMIM: 604311 MGI: 1100846 HomoloGene: 21002 GeneCard'lar: MED1
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 17 (insan)
Chr.Kromozom 17 (insan)[1]
Kromozom 17 (insan)
MED1 için genomik konum
MED1 için genomik konum
Grup17q12Başlat39,404,285 bp[1]
Son39,451,272 bp[1]
RNA ifadesi Desen
PBB GE PPARBP 203496 s fs.png'de

PBB GE PPARBP 203497 fs.png'de
Daha fazla referans ifade verisi
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_004774

NM_001080118
NM_013634
NM_134027
NM_001361950
NM_001361951

RefSeq (protein)

NP_004765

NP_001073587
NP_038662
NP_598788
NP_001348879
NP_001348880

Konum (UCSC)Tarih 17: 39.4 - 39.45 MbChr 11: 98.15 - 98.19 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

RNA polimeraz II transkripsiyon alt birimi 1 aracısı Ayrıca şöyle bilinir DRIP205 veya Tuzak220 bir alt birimidir Arabulucu kompleksi ve bir protein insanlarda kodlanır MED1 gen.[5][6][7] MED1 bir nükleer reseptör ortak aktifleştirici.

Med1
Tanımlayıcılar
SembolMed1
PfamPF10744
InterProIPR019680

Fonksiyon

Gen transkripsiyonunun aktivasyonu, içindeki transkripsiyonel güçlendirici bölgeleri tanıyan faktörler tarafından tetiklenen çok adımlı bir süreçtir. DNA. Bu faktörler, transkripsiyonel başlatmayı yönlendirmek için ko-aktivatörlerle çalışır RNA polimeraz II aparat. RNA polimeraz II transkripsiyon alt birimi 1 proteinin aracı, CRSP'nin bir alt birimidir (kofaktör için gerekli SP1 aktivasyon) karmaşık, birlikte TFIID, SP1 tarafından verimli aktivasyon için gereklidir. Bu protein aynı zamanda diğer çok alt birim komplekslerinin bir bileşenidir [ör. tiroid hormonu reseptörü - TR ile etkileşime giren ve başlatma faktörleri ve kofaktörlerle birlikte DNA şablonlarında TR işlevini kolaylaştıran (TR-) ilişkili proteinler]. Ayrıca düzenler s53 bağımlı apoptoz ve için gereklidir adipogenez. Bu proteinin kendi kendine oligomerleşme kabiliyetine sahip olduğu bilinmektedir.[7]

Etkileşimler

MED1 gösterildi etkileşim ile:

Protein ailesi

Bu girdi, Arabulucu kompleksinin Med1 alt birimini temsil eder. Med1, Srb / Med kompleksinin Med9 alt modülünün bir parçasını oluşturur. Üç alt birimden biridir. canlılık bütünün organizma çevreye yönelik hücre kaderi kararlarındaki rolü aracılığıyla.[23]

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl sürüm 89: ENSG00000125686 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000018160 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ Zhu Y, Qi C, Jain S, Rao MS, Reddy JK (Kasım 1997). "Peroksizom proliferatör ile aktive olan reseptör ile etkileşime giren bir protein olan PBP'nin izolasyonu ve karakterizasyonu". J Biol Kimya. 272 (41): 25500–6. doi:10.1074 / jbc.272.41.25500. PMID  9325263.
  6. ^ Zhu Y, Qi C, Jain S, Le Beau MM, Espinosa R, Atkins GB, Lazar MA, Yeldandi AV, Rao MS, Reddy JK (Ekim 1999). "Göğüs kanserinde peroksizom proliferatör ile aktive edilen reseptör bağlayıcı protein (PBP / PPARBP) geninin amplifikasyonu ve aşırı ekspresyonu". Proc Natl Acad Sci U S A. 96 (19): 10848–53. doi:10.1073 / pnas.96.19.10848. PMC  17971. PMID  10485914.
  7. ^ a b "Entrez Geni: PPARBP PPAR bağlayıcı protein".
  8. ^ Wang Q, Sharma D, Ren Y, Fondell JD (Kasım 2002). "Androjen reseptör aracılı gen ekspresyonunda TRAP medyatör kompleksi için ortak düzenleyici bir rol". J. Biol. Kimya. 277 (45): 42852–8. doi:10.1074 / jbc.M206061200. PMID  12218053.
  9. ^ Wada O, Oishi H, Takada I, Yanagisawa J, Yano T, Kato S (Ağustos 2004). "BRCA1 işlevi, TRAP220 ile doğrudan etkileşim yoluyla bir TRAP / DRIP kompleksine aracılık eder". Onkojen. 23 (35): 6000–5. doi:10.1038 / sj.onc.1207786. PMID  15208681.
  10. ^ a b Ito M, Yuan CX, Malik S, Gu W, Fondell JD, Yamamura S, Fu ZY, Zhang X, Qin J, Roeder RG (Mart 1999). "TRAP ve SMCC kompleksleri arasındaki özdeşlik, nükleer reseptörlerin ve çeşitli memeli aktivatörlerinin işlevi için yeni yolları gösterir". Mol. Hücre. 3 (3): 361–70. doi:10.1016 / s1097-2765 (00) 80463-3. PMID  10198638.
  11. ^ a b Kitagawa H, Fujiki R, Yoshimura K, Mezaki Y, Uematsu Y, Matsui D, Ogawa S, Unno K, Okubo M, Tokita A, Nakagawa T, Ito T, Ishimi Y, Nagasawa H, Matsumoto T, Yanagisawa J, Kato S (Haziran 2003). "Kromatin-yeniden modelleme kompleksi WINAC, promotörlere yönelik bir nükleer reseptörü hedefler ve Williams sendromunda bozulmuştur". Hücre. 113 (7): 905–17. doi:10.1016 / s0092-8674 (03) 00436-7. PMID  12837248.
  12. ^ a b Kang YK, Guermah M, Yuan CX, Roeder RG (Mart 2002). "TRAP / Mediator koaktivatör kompleksi, TRAP220 alt birimi aracılığıyla doğrudan östrojen reseptörleri alfa ve beta ile etkileşime girer ve in vitro östrojen reseptörü işlevini doğrudan artırır". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 99 (5): 2642–7. doi:10.1073 / pnas.261715899. PMC  122401. PMID  11867769.
  13. ^ Zilliacus J, Holter E, Wakui H, Tazawa H, Treuter E, Gustafsson JA (Nisan 2001). "Corepressor RIP140'ın 14-3-3'e bağlı hücre içi yeniden lokalizasyonu ile glukokortikoid reseptör aktivitesinin düzenlenmesi". Mol. Endokrinol. 15 (4): 501–11. doi:10.1210 / mend.15.4.0624. PMID  11266503.
  14. ^ Hittelman AB, Burakov D, Iñiguez-Lluhí JA, Freedman LP, Garabedian MJ (Ekim 1999). "Glukokortikoid reseptör transkripsiyonel aktivasyonunun AF-1 ile ilişkili proteinler yoluyla diferansiyel regülasyonu". EMBO J. 18 (19): 5380–8. doi:10.1093 / emboj / 18.19.5380. PMC  1171607. PMID  10508170.
  15. ^ Maeda Y, Rachez C, Hawel L, Byus CV, Freedman LP, Sladek FM (Temmuz 2002). "Poliaminler, nükleer reseptörler ile vitamin D reseptörü ile etkileşen protein 205 arasındaki etkileşimi düzenler". Mol. Endokrinol. 16 (7): 1502–10. doi:10.1210 / mend.16.7.0883. PMID  12089346.
  16. ^ Malik S, Wallberg AE, Kang YK, Roeder RG (Ağustos 2002). "Yetim nükleer reseptör hepatosit nükleer faktör 4 ile DNA ve kromatin şablonlarından TRAP / SMCC / mediatöre bağımlı transkripsiyonel aktivasyon". Mol. Hücre. Biol. 22 (15): 5626–37. doi:10.1128 / mcb.22.15.5626-5637.2002. PMC  133960. PMID  12101254.
  17. ^ Frade R, Balbo M, Barel M (Aralık 2000). "Geni kromozom 17q12-q21.1 üzerinde lokalize olan RB18A, in vivo p53 transaktivasyon aktivitesini düzenler". Kanser Res. 60 (23): 6585–9. PMID  11118038.
  18. ^ Drané P, Barel M, Balbo M, Frade R (Aralık 1997). "P53 ile antijenik ve fonksiyonel özellikleri paylaşan, 205 kDa'lık yeni bir p53 düzenleyici protein olan RB18A'nın tanımlanması". Onkojen. 15 (25): 3013–24. doi:10.1038 / sj.onc.1201492. PMID  9444950.
  19. ^ Wallberg AE, Yamamura S, Malik S, Spiegelman BM, Roeder RG (Kasım 2003). "P300 aracılı kromatin yeniden şekillenmesinin koordinasyonu ve TRAP / mediatör fonksiyonunun, PGC-1alfa koaktivatör aracılığıyla". Mol. Hücre. 12 (5): 1137–49. doi:10.1016 / s1097-2765 (03) 00391-5. PMID  14636573.
  20. ^ Kodera Y, Takeyama K, Murayama A, Suzawa M, Masuhiro Y, Kato S (Ekim 2000). "Peroksizom proliferatörü ile aktive olan reseptör gammanın transkripsiyonel koaktivatörlerle ligand tipine özgü etkileşimleri". J. Biol. Kimya. 275 (43): 33201–4. doi:10.1074 / jbc.C000517200. PMID  10944516.
  21. ^ Misra P, Qi C, Yu S, Shah SH, Cao WQ, Rao MS, Thimmapaya B, Zhu Y, Reddy JK (Mayıs 2002). "PIMT'nin transkripsiyonel koaktivatörler ile etkileşimi CBP, p300 ve transkripsiyonel düzenlemede PBP diferansiyel rolü". J. Biol. Kimya. 277 (22): 20011–9. doi:10.1074 / jbc.M201739200. PMID  11912212.
  22. ^ Yuan CX, Ito M, Fondell JD, Fu ZY, Roeder RG (Temmuz 1998). "Bir tiroid hormonu reseptörü ile ilişkili protein (TRAP) koaktivatör kompleksinin TRAP220 bileşeni, liganda bağlı bir şekilde nükleer reseptörlerle doğrudan etkileşime girer". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 95 (14): 7939–44. doi:10.1073 / pnas.95.14.7939. PMC  20908. PMID  9653119.
  23. ^ Boube M, Joulia L, Cribbs DL, Bourbon HM (Temmuz 2002). "Mayadan insana korunan bir RNA polimeraz II transkripsiyonel regülasyon aracısı için kanıt". Hücre. 110 (2): 143–51. doi:10.1016 / s0092-8674 (02) 00830-9. PMID  12150923. S2CID  771362.

daha fazla okuma

Bu makale kamu malı metinleri içermektedir Pfam ve InterPro: IPR019680