TRIM28 - TRIM28 - Wikipedia

TRIM28
PDB 1fp0 EBI.jpg
Mevcut yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Takma adlarTRIM28, KAP1, PPP1R157, RNF96, TF1B, TIF1B, 28 içeren üçlü motif
Harici kimliklerOMIM: 601742 MGI: 109274 HomoloGene: 21175 GeneCard'lar: TRIM28
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 19 (insan)
Chr.Kromozom 19 (insan)[1]
Kromozom 19 (insan)
Genomic location for TRIM28
Genomic location for TRIM28
Grup19q13.43Başlat58,544,064 bp[1]
Son58,550,722 bp[1]
RNA ifadesi Desen
PBB GE TRIM28 200990 at fs.png
Daha fazla referans ifade verisi
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_005762

NM_011588

RefSeq (protein)

NP_005753

NP_035718

Konum (UCSC)Tarih 19: 58.54 - 58.55 MbChr 7: 13 - 13.03 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

Üçlü motif içeren 28 (TRIM28), Ayrıca şöyle bilinir transkripsiyonel aracı faktör 1β (TIF1β) ve KAP1 (KRAB ile ilişkili protein-1), bir protein insanlarda kodlanır TRIM28 gen.[5][6]

Fonksiyon

Bu gen tarafından kodlanan protein ile etkileşim yoluyla transkripsiyonel kontrole aracılık eder. Krüppel - ilişkili kutu bastırma alanı birçok Transkripsiyon faktörleri. Protein, çekirdek ve belirli bir kromatin bölgeler. Protein, aşağıdakilerin bir üyesidir: üçlü motif ailesi. Bu üçlü motif, üç çinko bağlama alanı, bir HALKA, bir B-kutusu tip 1 ve bir B-kutusu tip 2 ve bir sarmal bobin bölge.[7]

KAP1, transkripsiyonel düzenleme, hücresel farklılaşma ve proliferasyon, DNA hasarı onarımı, viral baskılama ve apoptoz dahil olmak üzere birçok kritik işlevde yer alan, her yerde bulunabilen bir proteindir. İşlevselliği, çeviri sonrası değişikliklere bağlıdır. KAP1'in fosforilasyonu, birçok mekanizmasında proteinin deaktivatörü olarak hareket ederken, sumoilasyon bir aktivatör görevi görür.[8]

Hücresel farklılaşma ve çoğalma

Çalışmalar, gastrulasyondan önce farelerde KAP1'in silinmesinin ölümle sonuçlandığını (proliferasyon için gerekli bir protein olarak ima ederken), yetişkin farelerde silinmenin öğrenme ve bellekte artan anksiyete ve stres kaynaklı değişikliklerle sonuçlandığını göstermiştir. KAP1'in, embriyonik kök hücrelerin pluripotensinin sürdürülmesine ve yetişkin hücre hatlarının hücresel farklılaşmasını teşvik edip engellediği gösterilmiştir. Karaciğer, mide, meme, akciğer ve prostat kanserlerinde yüksek KAP1 seviyeleri bulunmuştur, bu da tümör hücresi çoğalmasında (muhtemelen apoptozu inhibe ederek) önemli bir rol oynayabileceğini göstermektedir.[8]

Transkripsiyonel düzenleme

KAP1, genomik transkripsiyonu, birçoğu biraz belirsiz kalan çeşitli mekanizmalar yoluyla düzenleyebilir. Çalışmalar, KAP1'in doğrudan genoma bağlanarak (kendi başına yeterli olabilir) veya Mi2α-SETB1-HP1 makromoleküler kompleksi yoluyla heterokromatin oluşumunun indüksiyonu yoluyla transkripsiyonu baskılayabildiğini göstermiştir.[9][10] KAP1 ayrıca, epigenetik olarak transkripsiyonu kontrol etmek için C-terminal PHD ve Bromodomain aracılığıyla histon metiltransferazlar ve deasetilazlarla etkileşime girebilir.[8]

DNA hasarı onarım yanıtı

ATM'nin, hasar görmüş veya kırılmış DNA'nın bulunması üzerine KAP1'i fosforile ettiği gösterilmiştir. Fosforile KAP1, diğer birçok DNA hasarı proteinleri ile birlikte, hızla DNA hasarı bölgesine göç eder. Bu yoldaki kesin rolü biraz belirsizdir, ancak hasarlı DNA'nın onarılmasına izin vererek hücre tutuklamasını tetiklemede rol oynadı.[8]

Apoptoz

KAP1, p53'e bağlanan MDM2 (bir ubikitin E3 ligaz) ile bir kompleks oluşturur. Kompleks, bozulma için bağlı p53'ü işaretler. p53, hücre ölümü için gerekli proteinlerin sentezini kolaylaştıran apoptozun bilinen bir öncüsüdür, bu nedenle degradasyonu apoptoz inhibisyonu ile sonuçlanır.[8]

Klinik önemi

Viral gecikmenin oluşmasında rol

KAP1, İnsan Sitomegalovirüs (HCMV) ve diğer endojen retrovirüsler için belirli hücre türlerinde viral gecikmenin kurulmasını kolaylaştırır[8][9]. KAP1, viral genomun transkripsiyonel bir corepressörü olarak işlev görür. Protein, viral kromatinin histonlarına bağlanır ve ardından Mi2α ve SETB1'i toplar. SETB1, HP1'i toplayan ve böylece heterokromatin oluşumunu indükleyen bir histon metiltransferazdır. Bu heterokromatin oluşumu, viral genomun transkripsiyonunu engeller. mTOR, KAP1'in fosforilasyonunda rol oynadı ve bu da gecikmeden litik döngüye geçişle sonuçlandı.[9]

Manipülasyonlar ve gelecekteki tedavi potansiyeli

Ataksi telenjiektazi mutasyona uğramış (ATM), (mTOR'a benzer) KAP1'i fosforile edebilen ve viral gecikmeden litik döngüye geçişe neden olan bir kinazdır. Klorokin (bir ATM) aktivatörünün, HCMV genomunun transkripsiyonunda artışlara neden olduğu gösterilmiştir. Bu etki, tümör nekroz faktörünün kullanılmasıyla artar. Bu tedavinin (antiretroviral tedavinin eşlik ettiği) virüsü enfekte bireylerden arındırma potansiyeline sahip olduğu öne sürülmüştür.[9]

Etkileşimler

TRIM28'in gösterdiği etkileşim ile:

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000130726 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000005566 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (Mayıs 2001). "Üçlü motif ailesi hücre bölmelerini tanımlar". EMBO Dergisi. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC  125245. PMID  11331580.
  6. ^ Capili AD, Schultz DC, RauscherIII FJ, Borden KL (Ocak 2001). "KAP-1 corepressor'den PHD alanının çözüm yapısı: PHD, RING ve LIM çinko bağlama alanları için yapısal belirleyiciler". EMBO Dergisi. 20 (1–2): 165–77. doi:10.1093 / emboj / 20.1.165. PMC  140198. PMID  11226167.
  7. ^ "Entrez Gene: TRIM28 üçlü motif içeren 28".
  8. ^ a b c d e f İyengar, Sushma; Farnham, Peggy (2011-07-29). "KAP1 Proteini: Genomun Gizemli Ana Düzenleyicisi". Biyolojik Kimya Dergisi. 286 (30): 26267–26276. doi:10.1074 / jbc.r111.252569. PMC  3143589. PMID  21652716.
  9. ^ a b c d Rauwel Benjamin (2015/04/07). "İnsan sitomegalovirüsünün KAP1 / TRIM28 fosforilasyon anahtarı tarafından gecikmeden salınması". eLife. 4. doi:10.7554 / eLife.06068. PMC  4384640. PMID  25846574.
  10. ^ Sripathy, Smitha (2006-03-20). "KAP1 Corepressor, KRAB Çinko Parmak Proteini Aracılı Transkripsiyonel Baskı için Gerekli De Novo HP1-Sınırlandırılmış Heterokromatin Mikro Ortamlarının Birleştirilmesini Koordine Etmek İçin İşlevler". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 26 (22): 8623–8638. doi:10.1128 / mcb.00487-06. PMC  1636786. PMID  16954381.
  11. ^ Nielsen AL, Sanchez C, Ichinose H, Cerviño M, Lerouge T, Chambon P, Losson R (Kasım 2002). "Kromatin-yeniden modelleme faktörü BRG1 ile heterokromatin ile ilişkili protein HP1alfa arasındaki seçici etkileşim". EMBO Dergisi. 21 (21): 5797–806. doi:10.1093 / emboj / cdf560. PMC  131057. PMID  12411497.
  12. ^ Cammas F, Oulad-Abdelghani M, Vonesch JL, Huss-Garcia Y, Chambon P, Losson R (Eylül 2002). "Hücre farklılaşması, bir HP1 etkileşimi yoluyla sentromerik heterokromatin ile TIF1beta ilişkisini indükler". Hücre Bilimi Dergisi. 115 (Kısım 17): 3439–48. PMID  12154074.
  13. ^ Nielsen AL, Oulad-Abdelghani M, Ortiz JA, Remboutsika E, Chambon P, Losson R (Nisan 2001). "Memeli hücrelerinde heterokromatin oluşumu: histonlar ve HP1 proteinleri arasındaki etkileşim". Moleküler Hücre. 7 (4): 729–39. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00218-0. PMID  11336697.
  14. ^ Lechner MS, Begg GE, Speicher DW, Rauscher FJ (Eylül 2000). "Heterokromatin protein 1 aracılı gen susturmayı hedeflemek için moleküler belirleyiciler: doğrudan kromo-gölge alanı-KAP-1 corepressor etkileşimi önemlidir". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 20 (17): 6449–65. doi:10.1128 / mcb.20.17.6449-6465.2000. PMC  86120. PMID  10938122.
  15. ^ a b Chang CJ, Chen YL, Lee SC (Ekim 1998). "Koaktivatör TIF1beta, alfa1-asit glikoprotein gen ekspresyonunu indüklemek için transkripsiyon faktörü C / EBPbeta ve glukokortikoid reseptörü ile etkileşime girer". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 18 (10): 5880–7. doi:10.1128 / mcb.18.10.5880. PMC  109174. PMID  9742105.
  16. ^ Schultz DC, Ayyanathan K, Negorev D, Maul GG, Rauscher FJ (Nisan 2002). "SETDB1: KRAB çinko parmak proteinleri tarafından ökromatik genlerin HP1 aracılı susturulmasına katkıda bulunan yeni bir KAP-1 ilişkili histon H3, lizin 9'a özgü metiltransferaz". Genler ve Gelişim. 16 (8): 919–32. doi:10.1101 / gad.973302. PMC  152359. PMID  11959841.
  17. ^ Moosmann P, Georgiev O, Le Douarin B, Bourquin JP, Schaffner W (Aralık 1996). "KOX1'in KRAB baskılayıcı alanıyla etkileşime giren RING parmak proteini TIF1 beta tarafından transkripsiyonel bastırma". Nükleik Asit Araştırması. 24 (24): 4859–67. doi:10.1093 / nar / 24.24.4859. PMC  146346. PMID  9016654.
  18. ^ Peng H, Begg GE, Harper SL, Friedman JR, Speicher DW, Rauscher FJ (Haziran 2000). "Kruppel ile ilişkili kutu (KRAB) transkripsiyonel bastırma alanının biyokimyasal analizi". Biyolojik Kimya Dergisi. 275 (24): 18000–10. doi:10.1074 / jbc.M001499200. PMID  10748030.

daha fazla okuma

Dış bağlantılar

Bu makale, Birleşik Devletler Ulusal Tıp Kütüphanesi içinde olan kamu malı.