Yerel kişi - Native contact - Wikipedia

İçinde protein katlanması, bir yerel iletişim arasında bir bağlantıdır yan zincirler iki amino asitler komşu olmayanlar amino asit dizisi (yani, alfa sarmalları boyunca önemsiz i ila i + 4 temaslarını kaldırmak için birincil dizide dörtten fazla kalıntıdırlar) ancak uzamsal olarak proteinin yerel eyalet üçüncül yapı. Belirli bir yapıda yeniden üretilen yerel temasların oranı genellikle bir reaksiyon koordinatı sırasında üretilen yapıların doğal durumundan sapmayı ölçmek için moleküler dinamik simülasyonlarda veya karşılaştırmalı değerlendirmelerde protein yapısı tahmini yöntemler.

iletişim siparişi bir proteinin doğal temaslarının yerelliğinin bir ölçüsüdür; yani, temasları oluşturan amino asitler arasındaki dizi mesafesi. Düşük temas düzenine sahip proteinlerin daha hızlı katlandığı düşünülmektedir ve bazıları için aday olabilir. yokuş aşağı kıvrım.