PPAP2B - PPAP2B

PLPP3
Tanımlayıcılar
Takma adlarPLPP3, Dri42, LPP3, PAP2B, VCIP, PPAP2B, fosfolipid fosfataz 3
Harici kimliklerOMIM: 607125 MGI: 1915166 HomoloGene: 15410 GeneCard'lar: PLPP3
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 1 (insan)
Chr.Kromozom 1 (insan)[1]
Kromozom 1 (insan)
Genomic location for PLPP3
Genomic location for PLPP3
Grup1p32.2Başlat56,494,761 bp[1]
Son56,645,301 bp[1]
RNA ifadesi Desen
PBB GE PPAP2B 212226 s at fs.png

PBB GE PPAP2B 212230 at fs.png

PBB GE PPAP2B 209355 s at fs.png
Daha fazla referans ifade verisi
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_177414
NM_003713

NM_080555

RefSeq (protein)

NP_003704

NP_542122

Konum (UCSC)Tarih 1: 56.49 - 56.65 MbChr 4: 105.16 - 105.23 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

Lipid fosfat fosfohidrolaz 3 (LPP3), Ayrıca şöyle bilinir fosfolipid fosfataz 3 (PLPP3) ve fosfatidik asit fosfataz tip 2B (PAP-2b veya PPAP2B), bir enzim insanlarda kodlanır PPAP2B gen açık kromozom 1.[5][6][7] Birçok doku ve hücre tipinde her yerde eksprese edilir.[8] LPP3 bir hücre yüzeyi glikoprotein o hidrolizler hücre dışı lizofosfatidik asit (LPA) ve kısa zincirli fosfatidik asit.[9] İşlevi düzenlemesine izin verir vasküler ve embriyonik gelişme dahil olmak üzere çok çeşitli insan hastalıkları ile ilişkili olan LPA sinyalini inhibe ederek kalp-damar hastalığı ve kanser yanı sıra gelişimsel kusurlar.[10] PPAP2B geni ayrıca 27 lokus artan risk ile ilişkili koroner arter hastalığı.[11]

Yapısı

Gen

PPAP2B gen 1p32.2 bandında kromozom 1'de bulunur ve 6'yı içerir Eksonlar.[6]

Protein

LPP3, PAP ile ilişkili fosfoesteraz ailesinin bir üyesidir.[7] Bu, yerelleştirilen bir tip 2 faaliyet PAP'tır. hücre zarı ve bilinen dört LPP'den biridir izoformlar. Bir integral membran proteini LPP3 altı hidrofobik içerir transmembran alanları ve hidrofilik katalitik bölge üç korunmuş alandan oluşur.[12][13] Bir katalitik alan, substrat diğer ikisi katkıda bulunurken defosforilasyon substratın. Katalitik bölge, tipik olarak hücre zarına yerleştirildiğinde hücre dışı matrise bakar ve lümen hücre içi zarlarda bulunduğunda. Bu protein homo- ve hetero- oluşturabiliroligomerler.[13]

Fonksiyon

Bu protein, hücrede lokalize olan bir membran glikoproteindir. hücre zarı. Aktif olarak hücre dışı hidrolize ettiği gösterilmiştir. lizofosfatidik asit (LPA) ve kısa zincir fosfatidik asit. [5] Bir LPA inhibitörü olarak PPAP2B'nin, vasküler ve kan hücrelerinin aktivasyonu ile ilişkili LPA reseptör aracılı hücresel sinyallemeyi baskıladığı bilinmektedir ve epitel hücre göç ve yayılma.[14][15] Dinamik yanıt olarak atero PPAP2B, LPA sinyalinin inhibisyonu yoluyla anti-inflamatuar fenotipi teşvik edebilir ve endotelyal tek tabakanın vasküler bütünlüğünü koruyabilir. Bu akışa duyarlı PPAP2B ifadesi, microRNA-92a ve transkripsiyon faktörü ile aktive edildi KLF2.[16] LPA reseptör aracılı sinyalleşmeye ek olarak, PPAP2B ayrıca Wnt sinyali kemik, kalp ve kas gibi önemli dokuların düzgün oluşumu için embriyonik gelişimde işlev görür. Global olarak PPAP2B'den yoksun farelerde eksen duplikasyonunun fenotipi, Wnt sinyali değişmiş hayvanlarda gözlemlenenlere benzer.[17] Dahası, Wnt sinyali aracılık etti TCF / LEF-transkripsiyonu üzerinden β-katenin PPAP2B null'da yukarı regüle edildi embriyonik kök hücreleri, LPP3'ü Wnt yolunun negatif bir düzenleyicisi olarak ima eder.[18]

Klinik Önem

LPP3'ün vasküler ve damarlarda düzenleyici rolü nedeniyle embriyonik gelişme bu proteinin inaktivasyonu, kardiyovasküler hastalığa ve gelişimsel komplikasyonlara katkıda bulunabilir. Örneğin, hem endotelyal hem de hematopoietik hücrelerde LPP3'ün indüklenebilir inaktivasyonu, insan plaklarında LPA birikiminden dolayı ateroskleroza yol açar.[10][19] Benzer şekilde, plazma LPA seviyeleri, akut koroner sendromlar.[20] Ayrıca düşük seviyelerde endotelyal LPP3, kan damarlarında bozulmuş akış ve mekanik düzenleme ile ilişkilidir.[16] Farelerde embriyonik gelişim sırasında LPP3'ün inaktivasyonu, kısmen embriyonik vasküler gelişimin başarısızlığından dolayı erken ölümle sonuçlanır.[21] LPA sinyalinin anormal aktivasyonu da kanserle ilişkilendirilmiştir. lifli bozukluklar ve metabolik sendrom (dahil insülin direnci ).[22][23]

Klinik Belirteç

İnsanlarda, PPAP2B, koroner arter hastalığı ile ilişkili 13 yeni lokustan 1'i olarak ortaya çıktı. genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS).[24][25] Bu tahmin, yüksek kolesterol seviyeleri, yüksek tansiyon, obezite, sigara kullanımı gibi kardiyovasküler hastalık için geleneksel risk faktörlerinden bağımsız görünmektedir. şeker hastalığı.

Ek olarak, PPAP2B geni dahil 27 lokus kombinasyonuna dayanan çok lokuslu bir genetik risk skoru çalışması, hem olay hem de tekrarlayan koroner arter hastalığı olayları için yüksek risk altında olan bireyleri ve ayrıca statin terapi. Çalışma, bir topluluk kohort çalışmasına (Malmö Diyet ve Kanser çalışması) ve birincil önleme kohortlarının (JUPITER ve ASCOT) ve ikincil önleme kohortlarının (CARE ve PROVE IT-TIMI 22) dört ilave randomize kontrollü çalışmasına dayanıyordu.[11]

Birlikte ele alındığında, bu bulgular ayrıca, PPAP2B ve LPA'nın, erken önleme için koroner arter hastalığının öngörülmesinde ve taranmasında bir rol oynayabileceğini göstermektedir.[14]

Etkileşimler

Etkileşimli Yol Haritası

LPP3 içinde etkileşimlere katılır triasilgliserid sentezi ve sfingolipid metabolizma yolları.

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000162407 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000028517 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ Kai M, Wada I, Imai Si, Sakane F, Kanoh H (Eylül 1997). "Mg2 + -bağımsız fosfatidik asit fosfatazın iki insan izoziminin klonlanması ve karakterizasyonu". Biyolojik Kimya Dergisi. 272 (39): 24572–8. doi:10.1074 / jbc.272.39.24572. PMID  9305923.
  6. ^ a b "Entrez Geni: PPAP2B fosfatidik asit fosfataz tip 2B".
  7. ^ a b "PLPP3 - Fosfolipid fosfataz 3 - Homo sapiens (İnsan) - PLPP3 geni ve proteini". www.uniprot.org. Alındı 2016-08-17.
  8. ^ "BioGPS - Gene Portal Sisteminiz". biogps.org. Alındı 2016-08-17.
  9. ^ Ishikawa T, Kai M, Wada I, Kanoh H (Nisan 2000). "İnsan tipi 2b fosfatidik asit fosfatazın hücre yüzey aktiviteleri". Biyokimya Dergisi. 127 (4): 645–51. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022652. PMID  10739957.
  10. ^ a b Yung YC, Stoddard NC, Chun J (Temmuz 2014). "LPA reseptör sinyali: farmakoloji, fizyoloji ve patofizyoloji". Lipid Araştırma Dergisi. 55 (7): 1192–214. doi:10.1194 / jlr.R046458. PMC  4076099. PMID  24643338.
  11. ^ a b Mega JL, Stitziel NO, Smith JG, Chasman DI, Caulfield MJ, Devlin JJ, Nordio F, Hyde CL, Cannon CP, Sacks FM, Poulter NR, Sever PS, Ridker PM, Braunwald E, Melander O, Kathiresan S, Sabatine MS (Haziran 2015). "Genetik risk, koroner kalp hastalığı olayları ve statin tedavisinin klinik faydası: birincil ve ikincil önleme çalışmalarının analizi". Lancet. 385 (9984): 2264–71. doi:10.1016 / S0140-6736 (14) 61730-X. PMC  4608367. PMID  25748612.
  12. ^ Roberts R, Sciorra VA, Morris AJ (Ağustos 1998). "İnsan tipi 2 fosfatidik asit fosfohidrolazlar. Tip 2a, 2b ve 2c enzimlerinin substrat özgüllüğü ve 2a izoformunun hücre yüzey aktivitesi". Biyolojik Kimya Dergisi. 273 (34): 22059–67. doi:10.1074 / jbc.273.34.22059. PMID  9705349.
  13. ^ a b Long JS, Pyne NJ, Pyne S (Nisan 2008). "Lipid fosfat fosfatazlar homo- ve hetero-oligomerleri oluşturur: katalitik yeterlilik, hücre altı dağılımı ve işlevi" (PDF). Biyokimyasal Dergi. 411 (2): 371–7. doi:10.1042 / BJ20071607. PMID  18215144.
  14. ^ a b Ren H, Panchatcharam M, Mueller P, Escalante-Alcalde D, Morris AJ, Smyth SS (Ocak 2013). "Lipid fosfat fosfataz (LPP3) ve vasküler gelişim". Biochimica et Biophysica Açta (BBA) - Lipitlerin Moleküler ve Hücre Biyolojisi. 1831 (1): 126–32. doi:10.1016 / j.bbalip.2012.07.012. PMC  3683602. PMID  22835522.
  15. ^ İngilizce D, Kovala AT, Welch Z, Harvey KA, Siddiqui RA, Brindley DN, Garcia JG (Aralık 1999). "Sfingosin 1-fosfat ile endotelyal hücre kemotaksisinin indüksiyonu ve endotelyal tek tabakalı bariyer fonksiyonunun lizofosfatidik asit, hematopoietik anjiyojenezin potansiyel aracıları tarafından stabilizasyonu". Hematoterapi ve Kök Hücre Araştırmaları Dergisi. 8 (6): 627–34. doi:10.1089/152581699319795. PMID  10645770.
  16. ^ a b Wu C, Huang RT, Kuo CH, Kumar S, Kim CW, Lin YC, Chen YJ, Birukova A, Birukov KG, Dulin NO, Civelek M, Lusis AJ, Loyer X, Tedgui A, Dai G, Jo H, Fang Y (Temmuz 2015). "Mekanosensitif PPAP2B, Atherorel İlgili Hemodinamik Kuvvetlere Endotel Yanıtlarını Düzenler". Dolaşım Araştırması. 117 (4): e41–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.117.306457. PMC  4522239. PMID  26034042.
  17. ^ Escalante-Alcalde D, Hernandez L, Le Stunff H, Maeda R, Lee HS, Sciorra VA, Daar I, Spiegel S, Morris AJ, Stewart CL (Ekim 2003). "Lipid fosfataz LPP3, ekstra embriyonik vaskülogenezi ve eksen modellemesini düzenler". Geliştirme. 130 (19): 4623–37. doi:10.1242 / dev.00635. PMID  12925589.
  18. ^ Arnold SJ, Stappert J, Bauer A, Kispert A, Herrmann BG, Kemler R (Mart 2000). "Brachyury, Wnt / beta-katenin sinyal yolağının bir hedef genidir". Gelişim Mekanizmaları. 91 (1–2): 249–58. doi:10.1016 / s0925-4773 (99) 00309-3. PMID  10704849.
  19. ^ Siess W, Zangl KJ, Essler M, Bauer M, Brandl R, Corrinth C, Bittman R, Tigyi G, Aepfelbacher M (Haziran 1999). "Lizofosfatidik asit, trombositlerin ve endotel hücrelerinin hafif oksitlenmiş düşük yoğunluklu lipoprotein tarafından hızlı aktivasyonuna aracılık eder ve insan aterosklerotik lezyonlarında birikir". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 96 (12): 6931–6. doi:10.1073 / pnas.96.12.6931. PMC  22019. PMID  10359816.
  20. ^ Kurano M, Suzuki A, Inoue A, Tokuhara Y, Kano K, Matsumoto H, Igarashi K, Ohkawa R, Nakamura K, Dohi T, Miyauchi K, Daida H, Tsukamoto K, Ikeda H, Aoki J, Yatomi Y (Şubat 2015 ). "Akut koroner sendromda plazma lizofosfatidik asit artışında minör lizofosfolipidlerin olası rolü". Arterioskleroz, Tromboz ve Vasküler Biyoloji. 35 (2): 463–70. doi:10.1161 / ATVBAHA.114.304748. PMID  25425621.
  21. ^ Escalante-Alcalde D, Hernandez L, Le Stunff H, Maeda R, Lee HS, Sciorra VA, Daar I, Spiegel S, Morris AJ, Stewart CL (Ekim 2003). "Lipid fosfataz LPP3, ekstra embriyonik vaskülogenezi ve eksen modellemesini düzenler". Geliştirme. 130 (19): 4623–37. doi:10.1242 / dev.00635. PMID  12925589.
  22. ^ Evans JF, Hutchinson JH (Temmuz 2010). "Biyoaktif lipid ilaç hedeflerinin geleceğini görmek". Doğa Kimyasal Biyoloji. 6 (7): 476–9. doi:10.1038 / nchembio.394. PMID  20559310.
  23. ^ Schober A, Siess W (Ekim 2012). "Aterosklerotik hastalıklarda lizofosfatidik asit". İngiliz Farmakoloji Dergisi. 167 (3): 465–82. doi:10.1111 / j.1476-5381.2012.02021.x. PMC  3449253. PMID  22568609.
  24. ^ Schunkert H, König IR, Kathiresan S, Reilly MP, Assimes TL, Holm H, ve diğerleri. (Nisan 2011). "Büyük ölçekli ilişki analizi, koroner arter hastalığı için 13 yeni duyarlılık lokusunu tanımlar". Doğa Genetiği. 43 (4): 333–8. doi:10.1038 / ng.784. PMC  3119261. PMID  21378990.
  25. ^ Erbilgin A, Civelek M, Romanoski CE, Pan C, Hagopian R, Berliner JA, Lusis AJ (Temmuz 2013). "GWAS lokuslarında CAD aday genlerinin belirlenmesi ve bunların vasküler hücrelerde ekspresyonu". Lipid Araştırma Dergisi. 54 (7): 1894–905. doi:10.1194 / jlr.M037085. PMC  3679391. PMID  23667179.

daha fazla okuma