PPIE (gen) - PPIE (gene)

PPIE
Protein PPIE PDB 1zcx.png
Mevcut yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Takma adlarPPIE, CYP-33, CYP33, peptidilprolil izomeraz E
Harici kimliklerOMIM: 602435 MGI: 1917118 HomoloGene: 38142 GeneCard'lar: PPIE
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 1 (insan)
Chr.Kromozom 1 (insan)[1]
Kromozom 1 (insan)
PPIE için genomik konum
PPIE için genomik konum
Grup1p34.2Başlat39,692,182 bp[1]
Son39,763,914 bp[1]
RNA ifadesi Desen
PBB GE PPIE 210502 s fs.png'de

PBB GE PPIE 202494, fs.png'de
Daha fazla referans ifade verisi
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001195007
NM_006112
NM_203456
NM_203457
NM_001319293

NM_019489

RefSeq (protein)

NP_001181936
NP_001306222
NP_006103
NP_982281

NP_062362

Konum (UCSC)Tarih 1: 39.69 - 39.76 MbChr 4: 123.13 - 123.14 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

Peptidilprolil izomeraz E (siklofilin E), Ayrıca şöyle bilinir PPIE, bir enzim insanlarda kodlanan PPIE gen 1. kromozomda. Peptidil-prolil cis-trans izomeraz (PPIase) ailesinin bir üyesi olarak bu protein, cis-trans izomerleştirme prolin imidik peptid bağları, proteinlerin katlanmasını veya onarımını kolaylaştırmasına izin verir.[5] Ek olarak, PPIE mitokondriyal dahil olmak üzere birçok biyolojik sürece katılır. metabolizma, apoptoz, ve iltihap gibi ilgili hastalıklar ve durumların yanı sıra iskemik reperfüzyon hasarı, AIDS, grip, ve kanser.[6][7][8]

Yapısı

Diğer siklofilinler gibi, PPIE de hidrofobik çekirdekli bir β-fıçı yapısı oluşturur. Bu β-namlu, sekiz anti-paralel β-ipliğinden oluşur ve üstte ve altta iki α-helis ile kapatılır. Ek olarak, tellerdeki β dönüşleri ve ilmekler namlunun esnekliğine katkıda bulunur. Özellikle, PPIE, N-terminalinde iki RNA bağlama alanı ve C-terminalinde 165-baz uzunluğunda bir PPIaz alanı içerir. PPIase alanı, PPIA'ya homologdur ve CsA tarafından bağlanabilir ve inhibe edilebilir.[8]

Fonksiyon

Bu gen tarafından kodlanan protein, peptidil-prolil cis-trans izomerazın (ÜFE ) aile. ÜFE'ler, cis-trans izomerizasyonu nın-nin prolin imidik peptid bağları oligopeptitler ve hızlandırın katlama proteinler.[5] Genel olarak, PPIazlar tüm öbakteriler ve ökaryotlarda ve ayrıca birkaç arkaebakteride bulunur ve bu nedenle yüksek oranda korunur.[6][9] PPIase ailesi ayrıca yapısal olarak farklı üç alt aileye ayrılmıştır: siklofilin (CyP), FK506 bağlayıcı protein (FKBP ), ve parvulin (Pvn).[6][8] Bir siklofilin olarak, ÜFE bağlanır siklosporin A (CsA) ve hücre içinde bulunabilir veya hücre tarafından salgılanabilir.[7] Ökaryotlarda, siklofilinler birçok hücre ve doku tipinde her yerde bulunur.[7][8] PPIaz ve protein şaperon aktivitelerine ek olarak, siklofiller mitokondriyal metabolizma, apoptoz, immünolojik yanıt, enflamasyon ve hücre büyümesi ve proliferasyonunda işlev görür.[6][7][8] Özellikle PPIE ayrıca RNA bağlama aktivitesi sergiler.[5]

Klinik önemi

PPIase etki alanındaki yakın homoloji nedeniyle, PPIE ve PPIA PPIE, aynı zamanda HIV.[8] Ayrıca, PPIE enfeksiyonların önlenmesine yardımcı olur. influenza A virüsü.[10] Bir siklofilin olarak, PPIE ayrıca bir CsA-siklofilin kompleksi oluşturmak için immünosüpresif ilaç CsA'yı bağlar ve daha sonra T hücresi aktivasyonu için sinyal yolunu inhibe etmek için kalsinörini hedefler.[7]

Kardiyak miyojenik hücrelerde, siklofilinlerin ısı şoku ve hipoksi-reoksijenasyon ile aktive olduğu ve ayrıca ısı şoku proteinleri ile kompleks oluşturduğu gözlenmiştir. Bu nedenle siklofiller, iskemi-reperfüzyon hasarı sırasında kalp korumada işlev görebilir.

Halen, siklofilin ekspresyonu, kanser patogenezi ile oldukça ilişkilidir, ancak spesifik mekanizmalar açıklanmayı beklemektedir.[7]

Etkileşimler

PPIE'nin (gen) etkileşim ile CsA ve MLL.[7][11]

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl sürüm 89: ENSG00000084072 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000028651 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ a b c "Entrez Geni: PPID peptidilprolil izomeraz E (siklofilin E)".
  6. ^ a b c d Kazui T, Inoue N, Yamada O, Komatsu S (Ocak 1992). "Aortik ark anevrizmaları için operasyon sırasında seçici serebral perfüzyon: yeniden değerlendirme". Göğüs Cerrahisi Yıllıkları. 53 (1): 109–14. doi:10.1016 / 0003-4975 (92) 90767-x. PMID  1530810.
  7. ^ a b c d e f g Yao Q, Li M, Yang H, Chai H, Fisher W, Chen C (Mart 2005). "Kanserlerdeki ve diğer organ sistemlerindeki siklofilin rolleri". Dünya Cerrahi Dergisi. 29 (3): 276–80. doi:10.1007 / s00268-004-7812-7. PMID  15706440.
  8. ^ a b c d e f Wang T, Yun CH, Gu SY, Chang WR, Liang DC (Ağu 2005). "1.88 hCyP33'ün C alanının kristal yapısı: peptidil-prolil cis-trans izomerazın yeni bir alanı". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi. 333 (3): 845–9. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.06.006. PMID  15963461.
  9. ^ Hoffmann H, Schiene-Fischer C (Temmuz 2014). "Hücre dışı siklofilinlerin işlevsel yönleri". Biyolojik Kimya. 395 (7–8): 721–35. doi:10.1515 / hsz-2014-0125. PMID  24713575.
  10. ^ Wang Z, Liu X, Zhao Z, Xu C, Zhang K, Chen C, Sun L, Gao GF, Ye X, Liu W (2011). "Siklofilin E, viral ribonükleoprotein kompleksinin oluşumunu bozarak influenza virüsü replikasyonuna negatif bir düzenleyici olarak işlev görür". PLOS ONE. 6 (8): e22625. doi:10.1371 / journal.pone.0022625. PMC  3160840. PMID  21887220.
  11. ^ Fair K, Anderson M, Bulanova E, Mi H, Tropschug M, Diaz MO (Mayıs 2001). "MLL PHD parmaklarının protein etkileşimleri, insan hücrelerinde MLL hedef gen düzenlemesini modüle eder". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 21 (10): 3589–97. doi:10.1128 / MCB.21.10.3589-3597.2001. PMC  100280. PMID  11313484.

daha fazla okuma