PRPF31 - PRPF31 - Wikipedia

PRPF31
Protein PRPF31 PDB 2ozb.png
Mevcut yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Takma adlarPRPF31, mRNA öncesi işleme faktörü 31, NY-BR-99, PRP31, RP11, SNRNP61
Harici kimliklerOMIM: 606419 MGI: 1916238 HomoloGene: 5980 GeneCard'lar: PRPF31
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 19 (insan)
Chr.Kromozom 19 (insan)[1]
Kromozom 19 (insan)
PRPF31 için genomik konum
PRPF31 için genomik konum
Grup19q13.42Başlat54,115,410 bp[1]
Son54,131,719 bp[1]
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_015629

NM_001159714
NM_027328

RefSeq (protein)

NP_056444
NP_056444.3

NP_001153186
NP_081604

Konum (UCSC)Tarih 19: 54.12 - 54.13 MbChr 7: 3,63 - 3,64 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

PRP31 ön mRNA işleme faktörü 31 homolog (S. cerevisiae), Ayrıca şöyle bilinir PRPF31, bir protein insanlarda kodlanan PRPF31 gen.[5]

Fonksiyon

PRPF31, gen kodlamasıdır. ekleme faktörü hPRP31. Oluşumu için esastır. ek yeri hPRP31, U4 /U6 di-snRNP ve başka bir ekleme faktörü ile etkileşime girer, hPRP6, U4 / U6- oluşturmak içinU5 tri-snRNP. HPRP31'in, RNAi, U4 / U6 di-snRNP'ler Cajal organları ve U4 / U6-U5 tri-snRNP oluşamaz.[6]

PRPF31 işe alındı intronlar U4 ve U6 RNA'larının ve 15.5K proteininin eklenmesinin ardından NHP2L1. PRPF31'in eklenmesi, spliceozomal kompleksin aktif duruma geçişi için çok önemlidir.[7]

Klinik önemi

PRPF31'deki bir mutasyon, neden olduğu bilinen ekleme faktörlerinde bilinen 4 mutasyondan biridir. retinitis pigmentosa. PRPF31'deki ilk mutasyon, Vithana ve arkadaşları tarafından keşfedildi. 2001 yılında.[5] Retinitis pigmentosa (RP), klinik ve genetik olarak heterojen bir retina distrofileri grubudur ve progresif bir dejenerasyon ile karakterize edilir. fotoreseptörler, sonunda ciddi görme bozukluğuna neden olur.[8]

Miras

PRPF31'deki mutasyonlar, bir otozomal dominant şekilde, vakaların% 2,5'ini otozomal dominant retinitis pigmentosa (adRP) karma bir BK popülasyonunda.[9] Bununla birlikte, PRPF31 mutasyonlarının kalıtım modeli, baskın kalıtım için atipiktir ve kısmi penetrasyon böylece baskın bir mutasyon nesilleri "atlıyor" gibi görünür. Bunun iki kişinin varlığından kaynaklandığı düşünülmektedir. Vahşi tip aleller, yüksek ifade gücü alel ve düşük ekspresyonlu bir alel. Bir hastanın mutant bir aleli ve yüksek ekspresyonlu bir aleli varsa, bunlar hastalık fenotipini göstermezler. Bir hasta mutant bir alele ve düşük ekspresyonlu bir alele sahipse, kalan protein seviyesi normal işlev eşiğinin altına düşer ve bu nedenle hastalık fenotipini gösterirler. PRPF31'in kalıtım modeli bu nedenle bir varyasyon olarak düşünülebilir. haplo yetmezliği. Haplo yetersizliğinin bu varyantı yalnızca iki diğer insan hastalığında görülür: Eritropoietik protoporfiri, içindeki mutasyonların neden olduğu FECH gen; ve kalıtsal elliptositoz, içindeki mutasyonların neden olduğu spektrin gen.[10][11]

Referanslar

  1. ^ a b c ENSG00000105618 GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000275885, ENSG00000105618 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000008373 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ a b Vithana EN, Abu-Safieh L, Allen MJ, Carey A, Papaioannou M, Chakarova C, Al-Maghtheh M, Ebenezer ND, Willis C, Moore AT, Bird AC, Hunt DM, Bhattacharya SS (Ağustos 2001). "Bir maya pre-mRNA ekleme geni olan PRP31'in bir insan homologu, 19q13.4 kromozomu (RP11) üzerindeki otozomal dominant retinitis pigmentosa'nın temelini oluşturur". Mol. Hücre. 8 (2): 375–81. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00305-7. PMID  11545739.
  6. ^ Schaffert N, Hossbach M, Heintzmann R, Achsel T, Lührmann R (Ağustos 2004). "HPrp31'in RNAi yıkımı, Cajal cisimlerinde U4 / U6 di-snRNP'lerin birikmesine yol açar". EMBO J. 23 (15): 3000–9. doi:10.1038 / sj.emboj.7600296. PMC  514917. PMID  15257298.
  7. ^ Liu S, Li P, Dybkov O, Nottrott S, Hartmuth K, Lührmann R, Carlomagno T, Wahl MC (Nisan 2007). "İnsan Prp31 Nop alanının, U4 snRNP'de bir bileşik RNA-protein platformuna bağlanması". Bilim. 316 (5821): 115–20. doi:10.1126 / bilim.1137924. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-E16C-F. PMID  17412961. S2CID  22091845.
  8. ^ "Entrez Geni: PRPF31 PRP31 ön mRNA işleme faktörü 31 homologu (S. cerevisiae)".
  9. ^ Waseem NH, Vaclavik V, Webster A, Jenkins SA, Bird AC, Bhattacharya SS (Mart 2007). "Otozomal dominant retinitis pigmentosa hastalarında pre-mRNA ekleme faktörü, PRPF31 için gen kodlamasındaki mutasyonlar". Araştırmacı Oftalmoloji ve Görsel Bilimler. 48 (3): 1330–4. doi:10.1167 / iovs.06-0963. PMID  17325180.
  10. ^ Randon J, Boulanger L, Marechal J, Garbarz M, Vallier A, Ribeiro L, Tamagnini G, Dhermy D, Delaunay J (Kasım 1994). "Kodon 28'de kalıtsal bir elliptositoz mutasyonu taşıyan bir spektrin düşük ekspresyonlu alel alel alel LELY varyantı". Br J Haematol. 88 (3): 534–40. doi:10.1111 / j.1365-2141.1994.tb05070.x. PMID  7819065. S2CID  39527747.
  11. ^ Gouya L, Puy H, Lamoril J, Da Silva V, Grandchamp B, Nordmann Y, Deybach JC (Haziran 1998). "Eritropoietik protoporfiride kalıtım: düşük ekspresyonlu yaygın bir vahşi tip ferroşelataz alelik varyantı, klinik tezahürü oluşturur". Am J Hum Genet. 93 (6): 2150–10. PMID  10068685.

daha fazla okuma

Dış bağlantılar