Ribozomal protein s6 - Ribosomal protein s6

RPS6
Mevcut yapılar
PDB	Ortolog araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4D5L, 4UJE, 5FLX, 4UJC, 3J7P, 4KZZ, 4UJD, 4KZY, 4D61, 3J7R, 4KZX
Tanımlayıcılar
Takma adlar	RPS6, S6, ribozomal protein S6
Harici kimlikler	OMIM: 180460 MGI: 98159 HomoloGene: 85949 GeneCard'lar: RPS6
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 9 (insan)
Son	19,380,236 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 4 (fare)
Son	86,857,412 bp
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• ribozomun yapısal bileşeni; • GO: 0001948 protein bağlama; • protein kinaz bağlanması; • RNA bağlanması;
Hücresel bileşen	• vücut hücresi; • sitozol; • ribozom; • zar; • hücre içi; • çekirdekçik; • küçük ribozomal alt birim; • sitoplazmik ribonükleoprotein granülü; • hücre çekirdeği; • nükleoplazma; • sitoplazma; • polisom; • sitozolik küçük ribozomal alt birim; • dendrit; • sitoplazmanın perinükleer bölgesi; • endoplazmik retikulum; • ribonükleoprotein;
Biyolojik süreç	• viral transkripsiyon; • SRP'ye bağımlı ortak dönüşümsel protein membranı hedefliyor; • TOR sinyali; • apoptotik sürecin pozitif düzenlenmesi; • çeviri başlatma; • nükleer-transkripsiyonlu mRNA katabolik süreç, anlamsız aracılı bozunma; • protein biyosentezi; • G1 fazı; • GO: 0007067 mitotik hücre döngüsü; • yerleştirme; • Bağışıklık tepkisine dahil olan T hücre çoğalması; • rRNA işleme; • T hücrelerinin aktivasyon kaynaklı hücre ölümü; • mitotik hücre döngüsü kontrol noktası; • gastrulasyon; • oogenez aşaması; • Timusta T hücre farklılaşması; • ribozomal küçük alt birim biyogenezi; • glikoz homeostazı; • apoptotik sürecin olumsuz düzenlenmesi; • eritrosit gelişimi; • Mitotik hücre döngüsünün G1 / S geçişi;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	6194
	20104
	ENSG00000137154
	ENSMUSG00000028495
	P62753
	P62754
	NM_001010
	NM_009096
	NP_001001
	NP_033122
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

Ribozomal protein S6 (rpS6 veya eS6) bir bileşenidir 40S ribozomal alt birim ve bu nedenle tercüme. Fare modeli çalışmaları, eS6'nın fosforilasyonunun, hücre boyutu, hücre çoğalması, ve glikoz homeostazı.^[5]^[6]^[7]

Çalışmalar, p70 ribozomal protein S6 kinazlarının (S6K1 ve S6K2 ) ve p90 ribozomal protein S6 kinazları (RSK ) hem fosforilat eS6, hem de S6K1 ve S6K2 bu fonksiyona hakimdir.

İnsan eS6 fosforasyonunun indüksiyonuna yol açan yolların, IL-8 protein sentezi. Bu mekanizma, durdurma kodonundan hemen sonra IL-8'in 3'UTR'sinde bulunan A / U açısından zengin proksimal dizilere (APS) bağlıdır.^[8]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl sürüm 89: ENSG00000137154 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000028495 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ Ruvinsky I, Sharon N, Lerer T, Cohen H, Stolovich-Rain M, Nir T, vd. (Eylül 2005). "Ribozomal protein S6 fosforilasyonu, hücre boyutu ve glikoz homeostazının bir belirleyicisidir". Genler ve Gelişim. 19 (18): 2199–211. doi:10.1101 / gad.351605. PMC 1221890. PMID 16166381.
^ Ruvinsky I, Meyuhas O (Haziran 2006). "Ribozomal protein S6 fosforilasyonu: protein sentezinden hücre boyutuna". Biyokimyasal Bilimlerdeki Eğilimler. 31 (6): 342–8. doi:10.1016 / j.tibs.2006.04.003. PMID 16679021.
^ Ruvinsky I, Katz M, Dreazen A, Gielchinsky Y, Saada A, Freedman N, ve diğerleri. (Mayıs 2009). "Ribozomal protein S6 fosforilasyonunda eksik olan fareler, bir büyüme kusuru ve enerji eksikliğini yansıtan kas zayıflığından muzdariptir". PLOS ONE. 4 (5): e5618. Bibcode:2009PLoSO ... 4,5618R. doi:10.1371 / journal.pone.0005618. PMC 2682700. PMID 19479038.
^ Ang Z, Abdi Gunawan Koen R, Er JZ, Lee LT, Tam Kit Chung J, Guo H, Ding JL (2019). "Yeni AU açısından zengin proksimal UTR dizileri (APS), rpS6 fosforilasyonunun indüksiyonu üzerine CXCL8 sentezini geliştirir". PLOS Genet. 15 (4): e1008077. doi:10.1371 / journal.pgen.1008077. PMC 6476525. PMID 30969964.

Dış bağlantılar

Ribozomal + Protein + S6 ABD Ulusal Tıp Kütüphanesinde Tıbbi Konu Başlıkları (MeSH)
Mevcut tüm yapısal bilgilere genel bakış PDB için UniProt: P62753 (İnsan 40S ribozomal proteini S6) PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl sürüm 89: ENSG00000137154 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000028495 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid16166381-5] Ruvinsky I, Sharon N, Lerer T, Cohen H, Stolovich-Rain M, Nir T, vd. (Eylül 2005). "Ribozomal protein S6 fosforilasyonu, hücre boyutu ve glikoz homeostazının bir belirleyicisidir". Genler ve Gelişim. 19 (18): 2199–211. doi:10.1101 / gad.351605. PMC 1221890. PMID 16166381.

[6] Ruvinsky I, Meyuhas O (Haziran 2006). "Ribozomal protein S6 fosforilasyonu: protein sentezinden hücre boyutuna". Biyokimyasal Bilimlerdeki Eğilimler. 31 (6): 342–8. doi:10.1016 / j.tibs.2006.04.003. PMID 16679021.

[7] Ruvinsky I, Katz M, Dreazen A, Gielchinsky Y, Saada A, Freedman N, ve diğerleri. (Mayıs 2009). "Ribozomal protein S6 fosforilasyonunda eksik olan fareler, bir büyüme kusuru ve enerji eksikliğini yansıtan kas zayıflığından muzdariptir". PLOS ONE. 4 (5): e5618. Bibcode:2009PLoSO ... 4,5618R. doi:10.1371 / journal.pone.0005618. PMC 2682700. PMID 19479038.

[pmid25633224-8] Ang Z, Abdi Gunawan Koen R, Er JZ, Lee LT, Tam Kit Chung J, Guo H, Ding JL (2019). "Yeni AU açısından zengin proksimal UTR dizileri (APS), rpS6 fosforilasyonunun indüksiyonu üzerine CXCL8 sentezini geliştirir". PLOS Genet. 15 (4): e1008077. doi:10.1371 / journal.pgen.1008077. PMC 6476525. PMID 30969964.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]