EIF4A3 - EIF4A3

EIF4A3
Mevcut yapılar
PDB	Ortolog araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	2HXY, 2HYI, 2J0Q, 2J0S, 2J0U, 2XB2, 3EX7, 4C9B
Tanımlayıcılar
Takma adlar	EIF4A3, DDX48, MUK34, NMP265, NUK34, RCPS, eIF4AIII, ökaryotik çeviri başlatma faktörü 4A3, Fal1, eIF4A-III, eIF-4A-III
Harici kimlikler	OMIM: 608546 MGI: 1923731 HomoloGene: 5602 GeneCard'lar: EIF4A3
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 17 (insan)
Son	80,147,151 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 11 (fare)
Son	119,300,089 bp
RNA ifadesi Desen
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• nükleotid bağlanması; • selenosistein ekleme dizisi bağlama; • GO: 0008026 helikaz aktivitesi; • poli (A) bağlama; • RNA kök-döngü bağlama; • GO: 0001948 protein bağlama; • nükleik asit bağlanması; • ribonükleoprotein kompleks bağlanması; • hidrolaz aktivitesi; • ATP bağlama; • mRNA bağlanması; • RNA bağlanması; • çeviri düzenleyici faaliyeti;
Hücresel bileşen	• sitoplazma; • sitozol; • nükleer benek; • katalitik adım 2 spliceosome; • zar; • ekson-ekson bağlantı kompleksi; • nöronal hücre gövdesi; • dendrit; • spliceozomal kompleks; • hücre çekirdeği; • nükleoplazma; • çekirdekçik; • glutamaterjik sinaps; • postsinaptik sitozol; • ribonükleoprotein; • U2 tipi katalitik adım 1 spliceozom;
Biyolojik süreç	• nükleer transkripsiyonlu mRNA poli (A) kuyruk kısaltması; • mRNA aktarımı; • olumsuz çeviri düzenlemesi; • Asosyal öğrenme; • organik siklik bileşiğe yanıt; • mRNA bağlanmasının düzenlenmesi; • mRNA işleme; • çevirinin olumlu düzenlemesi; • gen ifadesinin negatif düzenlenmesi; • uyarıcı postsinaptik potansiyelin negatif düzenlenmesi; • beyin kaynaklı nörotrofik faktör uyarısına hücresel yanıt; • selenit iyonuna hücresel yanıt; • keşif davranışı; • RNA ikincil yapısı çözülüyor; • RNA ekleme; • rRNA işleme; • embriyonik kafatası iskeleti morfogenezi; • selenosistein ekleme dizisi bağlanmasının negatif düzenlenmesi; • nükleer-transkripsiyonlu mRNA katabolik süreç, anlamsız aracılı bozunma; • çeviri düzenlemesi; • selenosistein birleşmesinin negatif düzenlenmesi; • spliceozom yoluyla mRNA ekleme; • Çekirdekten RNA ihracatı; • RNA polimeraz II transkripsiyonunun sonlandırılması; • Çekirdekten mRNA ihracatı; • mRNA 3'-uç işleme; • RNA polimeraz II promotöründen transkripsiyonun pozitif düzenlenmesi; • spliceozom yoluyla mRNA eklemesinin pozitif düzenlenmesi; • Ulaşım; • postynapse'da çevirinin düzenlenmesi, sinaptik iletimin modüle edilmesi;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	9775
	192170
	ENSG00000141543
	ENSMUSG00000025580
	P38919
	Q91VC3
	NM_014740
	NM_138669
	NP_055555
	NP_619610
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

Ökaryotik başlangıç faktörü 4A-III bir protein insanlarda kodlanır EIF4A3 gen.^[5]^[6]^[7]

Fonksiyon

Bu genin bir üyesini kodlar ÖLÜ kutusu protein ailesi. Konserve motifi Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD) ile karakterize edilen DEAD kutu proteinleri varsayımsaldır. RNA helikazları. Translasyon başlatma, nükleer ve mitokondriyal ekleme gibi RNA ikincil yapısının değiştirilmesini içeren bir dizi hücresel işlemde rol oynarlar ve ribozom ve ek yeri montaj. Dağıtım modellerine göre, bu ailenin bazı üyelerinin embriyojenez, spermatogenez ve hücresel büyüme ve bölünme. Bu gen tarafından kodlanan protein, bir nükleer matris proteinidir. Amino asit dizisi, çeviri başlatma faktörlerinin amino asit dizilerine oldukça benzerdir. eIF4A-I ve eIF4A-II, DEAD box protein ailesinin diğer iki üyesi.^[7]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000141543 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000025580 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ Holzmann K, Gerner C, Poltl A, Schafer R, Obrist P, Ensinger C, Grimm R, Sauermann G (Şubat 2000). "Ökaryotik çeviri başlatma faktörü 4A'ya homolog bir insan ortak nükleer matris proteini". Biochem Biophys Res Commun. 267 (1): 339–44. doi:10.1006 / bbrc.1999.1973. PMID 10623621.
^ Chan CC, Dostie J, Diem MD, Feng W, Mann M, Rappsilber J, Dreyfuss G (Ocak 2004). "eIF4A3, ekson bağlantı kompleksinin yeni bir bileşenidir". RNA. 10 (2): 200–9. doi:10.1261 / rna.5230104. PMC 1370532. PMID 14730019.
^ ^a ^b "Entrez Geni: EIF4A3 ökaryotik çeviri başlatma faktörü 4A, izoform 3".

daha fazla okuma

Nagase T, Miyajima N, Tanaka A, vd. (1995). "Tanımlanamayan insan genlerinin kodlama dizilerinin tahmini. III. İnsan hücre hattı KG-1'den cDNA klonlarının analizi ile çıkarılan 40 yeni genin (KIAA0081-KIAA0120) kodlama dizileri". DNA Res. 2 (1): 37–43. doi:10.1093 / dnares / 2.1.37. PMID 7788527.
Li Q, Imataka H, Morino S, vd. (1999). "Ökaryotik Çeviri Başlatma Faktörü 4AIII (eIF4AIII) İşlevsel Olarak eIF4AI ve eIF4AII'den Farklıdır". Mol. Hücre. Biol. 19 (11): 7336–46. doi:10.1128 / mcb.19.11.7336. PMC 84727. PMID 10523622.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, ve diğerleri. (2002). "Üç boyutlu yapısal analize uygun doğal spliceozomların saflaştırılması ve karakterizasyonu". RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Lee S, Baek M, Yang H, vd. (2002). "Mide kanserleri ve normal mide mukozası arasında farklı şekilde ifade edilen genlerin cDNA mikrodizileri ile tanımlanması". Yengeç Harfi. 184 (2): 197–206. doi:10.1016 / S0304-3835 (02) 00197-0. PMID 12127692.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, vd. (2003). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin üretimi ve ilk analizi". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Palacios IM, Gatfield D, St Johnston D, Izaurralde E (2004). "MRNA lokalizasyonu ve anlamsız aracılı mRNA bozulması için gerekli bir eIF4AIII içeren kompleks". Doğa. 427 (6976): 753–7. doi:10.1038 / nature02351. PMID 14973490. S2CID 4400243.
Ferraiuolo MA, Lee CS, Ler LW, vd. (2004). "Bir nükleer çeviri benzeri faktör eIF4AIII, ekleme sırasında mRNA'ya görevlendirilir ve anlamsız aracılı bozunma işlevi görür". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 101 (12): 4118–23. doi:10.1073 / pnas.0400933101. PMC 384704. PMID 15024115.
Shibuya T, Tange TØ, Sonenberg N, Moore MJ (2004). "eIF4AIII, ekson bağlantı kompleksinde eklenmiş mRNA'yı bağlar ve anlamsız aracılı bozunma için gereklidir". Nat. Struct. Mol. Biol. 11 (4): 346–51. doi:10.1038 / nsmb750. PMID 15034551. S2CID 30171314.
Jin J, Smith FD, Stark C, vd. (2004). "Sitoskeletal regülasyon ve hücresel organizasyonda yer alan in vivo 14-3-3 bağlayıcı proteinlerin proteomik, fonksiyonel ve alan bazlı analizi". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660. S2CID 2371325.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA ve diğerleri. (2004). "NIH Tam Boy cDNA Projesinin Durumu, Kalitesi ve Genişlemesi: Memeli Gen Koleksiyonu (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, vd. (2005). "Nükleolar proteom dinamikleri". Doğa. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Xia Q, Kong XT, Zhang GA, vd. (2005). "DEAD-box protein 48'in yeni bir otoantijen, pankreas kanseri için prospektif bir serum markörü olarak proteomik temelli tanımlanması". Biochem. Biophys. Res. Commun. 330 (2): 526–32. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.02.181. PMID 15796914.
Ballut L, Marchadier B, Baguet A, vd. (2005). "Ekson bağlantı çekirdek kompleksi, eIF4AIII ATPase aktivitesinin inhibisyonu ile RNA'ya kilitlenir". Nat. Struct. Mol. Biol. 12 (10): 861–9. doi:10.1038 / nsmb990. PMID 16170325. S2CID 1359792.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, vd. (2005). "İnsan protein-protein etkileşim ağının proteom ölçekli bir haritasına doğru". Doğa. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Gehring NH, Kunz JB, Neu-Yilik G, vd. (2005). "Ekson-bağlantı kompleks bileşenleri, farklı kofaktör gereksinimleri ile anlamsız aracılı mRNA bozunmasının farklı yollarını belirtir". Mol. Hücre. 20 (1): 65–75. doi:10.1016 / j.molcel.2005.08.012. PMID 16209946.
Andersen CB, Ballut L, Johansen JS, vd. (2006). "RNA'ya bağlı bir sıkışmış DEAD-box ATPase ile ekson bağlantı çekirdek kompleksinin yapısı". Bilim. 313 (5795): 1968–72. doi:10.1126 / science.1131981. PMID 16931718. S2CID 26409491.
You KT, Li LS, Kim NG, ve diğerleri. (2007). "Tümörlerde Çerçeve Kayması Mutasyonundan Türetilmiş mRNA'lardan Kesik Proteinlerin Seçici Translasyonel Bastırılması". PLOS Biol. 5 (5): e109. doi:10.1371 / journal.pbio.0050109. PMC 1854916. PMID 17456004.
Zhang Z, Krainer AR (2007). "Ekleme, eIF4A3'e bağlı ve ekson bağlantı kompleksi bileşenlerinin bağımsız olarak görevlendirilmesi yoluyla haberci ribonükleoprotein mimarisini yeniden şekillendiriyor". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 104 (28): 11574–9. doi:10.1073 / pnas.0704946104. PMC 1913901. PMID 17606899.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000141543 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000025580 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid10623621-5] Holzmann K, Gerner C, Poltl A, Schafer R, Obrist P, Ensinger C, Grimm R, Sauermann G (Şubat 2000). "Ökaryotik çeviri başlatma faktörü 4A'ya homolog bir insan ortak nükleer matris proteini". Biochem Biophys Res Commun. 267 (1): 339–44. doi:10.1006 / bbrc.1999.1973. PMID 10623621.

[pmid14730019-6] Chan CC, Dostie J, Diem MD, Feng W, Mann M, Rappsilber J, Dreyfuss G (Ocak 2004). "eIF4A3, ekson bağlantı kompleksinin yeni bir bileşenidir". RNA. 10 (2): 200–9. doi:10.1261 / rna.5230104. PMC 1370532. PMID 14730019.

[entrez-7] "Entrez Geni: EIF4A3 ökaryotik çeviri başlatma faktörü 4A, izoform 3".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]