Roxan (protein) - Roxan (protein) - Wikipedia

ZC3H7B
Tanımlayıcılar
Takma adlarZC3H7B, RoXaN, 7B içeren çinko parmak CCCH tipi, ROXAN1
Harici kimliklerOMIM: 618206 MGI: 1328310 HomoloGene: 9735 GeneCard'lar: ZC3H7B
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 22 (insan)
Chr.Kromozom 22 (insan)[1]
Kromozom 22 (insan)
ZC3H7B için genomik konum
ZC3H7B için genomik konum
Grup22q13.2Başlat41,301,525 bp[1]
Son41,360,147 bp[1]
RNA ifadesi Desen
PBB GE ZC3H7B 205877 s fs.png'de

PBB GE ZC3H7B 213323 s fs.png'de
Daha fazla referans ifade verisi
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_017590

NM_001081016

RefSeq (protein)

NP_060060

NP_001074485

Konum (UCSC)Tarih 22: 41.3 - 41.36 MbChr 15: 81.75 - 81.8 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

RoXaN (Rotavirüs 'X' ile ilişkili yapısal olmayan protein) olarak da bilinir ZC3H7B (7B içeren çinko parmak CCCH tipi), protein insanlarda ZC3H7B gen.[5] RoXaN, aşağıdakileri içeren bir proteindir: tetratricopeptide tekrarı ve lösin-aspartat aynı zamanda çinko parmak alanlar. Bu protein aynı zamanda rotavirüs yapısal olmayan protein NSP3.[5]

Fonksiyon

Rotavirüs mRNA'lar vardır şapkalı Ama değil poliadenile ve viral proteinler tercüme hücresel çeviri makinesi tarafından. Bu, virüsün etkisiyle gerçekleştirilir. Yapısal Olmayan Protein NSP3 spesifik olarak viral mRNA'ların 3 'konsensüs dizisini bağlayan ve etkileşim ökaryotik çeviri başlatma faktörü ile eIF4G BEN.[6]

RoXaN (rotavirüs X proteini ile ilişkili NSP3 ), protein-protein veya nükleik asit-protein etkileşimlerinde yer alacağı tahmin edilen minimum üç bölgeyi içeren 110 kDa'lık hücresel proteindir. Bir tetratrikopeptid Çoğunlukla multiprotein komplekslerinde bulunan bir protein-protein etkileşim alanı olan tekrar bölgesi, amino-terminal bölgesinde mevcuttur. Karboksi terminalinde en az beş çinko parmak ayrıca RoXaN'nin diğer proteinleri veya nükleik asitleri bağlama kapasitesini düşündüren motifler gözlemlenmiştir. Bu iki bölge arasında bir paxillin protein-protein etkileşimlerinde yer alan lösin-aspartat tekrar (LD) motifi.[6]

Klinik önemi

RoXaN, in vivo ve rotavirüs enfeksiyonu sırasında NSP3 ile etkileşime girebilir. Etkileşim alanları, NSP3'ün dimerizasyon alanına (amino asitler 163 ila 237) ve RoXaN'nin LD alanına (amino asitler 244 ila 341) karşılık gelir. NSP3 ve RoXaN arasındaki etkileşim, NSP3 ve eIF4G I arasındaki etkileşimi bozmaz ve NSP3, RoXaN ve eIF4G I'den oluşan üçlü bir kompleks rotavirüs bulaşmış hücrelerde tespit edilebilir ve bu da RoXaN'ı tercüme düzenleme.[6]

RoXaN ekspresyonunun GIST'te daha yüksek bir tümör derecesi ile ilişkili olduğu bulundu (gastrointestinal stromal tümörler ).[7]

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000100403 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000022390 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ a b "Entrez Geni: 7B içeren ZC3H7B çinko parmak CCCH tipi".
  6. ^ a b c Vitour D, Lindenbaum P, Vende P, Becker MM, Poncet D (Nisan 2004). "TPR, LD ve çinko parmak motifleri içeren yeni bir hücresel protein olan RoXaN, ökaryotik başlatma faktörü 4G ve rotavirüs NSP3 ile üçlü bir kompleks oluşturur". J. Virol. 78 (8): 3851–62. doi:10.1128 / JVI.78.8.3851-3862.2004. PMC  374268. PMID  15047801.
  7. ^ Kang HJ, Koh KH, Yang E, You KT, Kim HJ, Paik YK, Kim H (Şubat 2006). "KIT ve PDGFRA mutasyonları olan gastrointestinal stromal tümörlerde farklı şekilde eksprese edilen proteinler". Proteomik. 6 (4): 1151–7. doi:10.1002 / pmic.200500372. PMID  16402362.

daha fazla okuma