SDHAF2 - SDHAF2
Süksinat dehidrojenaz kompleksi montaj faktörü 2, daha önce ... olarak bilinen SDH5 ve aynı zamanda SDH montaj faktörü 2 veya SDHAF2 bir protein insanlarda SDHAF2 tarafından kodlanır gen. Bu gen bir mitokondriyal bir tanesinin flavinasyonu için gerekli protein süksinat dehidrojenaz kompleksi kompleksin aktivitesi için gerekli alt birim. Mutasyonlar bu gende feokromositoma ve Paraganglioma.[5]
Yapısı
SDHAF2 üzerinde bulunur q kol nın-nin Kromozom 11 12.2 konumunda ve 16.642 baz çiftini kapsar.[5] SDHAF2 gen, 65 amino asitten oluşan 6.7 kDa protein üretir.[6][7] Bu yüksek oranda korunmuş protein, bir kofaktördür. flavin adenin dinükleotid (HEVES).[8] Yapı, iyi tanımlanmış korunmuş yüzey kalıntıları bölgesine sahip beş sarmallı bir demeti temsil eder. Bu korunmuş bölge, negatif yüklü bir çevre ve pozitif yüklü bir yüzey ve bir yama içerir. hidrofobik. Bölge yer almaktadır α-helisler I, II ve bağlantı bandı.[9]
Fonksiyon
SDHAF2 gen mitokondriyi kodlar protein Ile ilişkili süksinat dehidrojenaz (SDH) kompleksi (mitokondriyal kompleks II) içinde mitokondriyal solunum zinciri, hem elektron taşıma zincirinde hem de Krebs (trikarboksilik asit) döngüsü. SDHAF2, doğru işlevinin ayrılmaz bir parçasıdır. SDH kompleksi, esas olarak SDH'ye bağlı solunumda ve kompleksin katalitik alt birimi ile etkileşime giriyor. SDHAF2, şunların flavinasyonuna katılıyor SDH1 (SDHA), başka bir alt birim SDH kompleksi. Bunu, flavin adenin dinükleotid (FAD) kofaktör içine SDHA. Bu tür bir flavinasyon, tamamen işlevsel bir SDH kompleksi. SDHAF2'nin devreden çıkarılması, işlev kaybına yol açar. SDH kompleksi enzim kompleksi stabilitesinde bir azalma ve tüm alt birimlerde önemli bir azalma. SDHAF2'nin ayrıca bir Tümör süpresörü.[10][11][12][13]
Klinik önemi
SDHAF2 bir tümör baskılayıcı gen. Anayasal mutasyonlar bu gende neden kalıtsal Paraganglioma, önceden SDH alt birim mutasyonlarına bağlı olduğu bilinen bir nöroendokrin tümör. Paraganglioma bir nöral krest tümörüdür genellikle kemoreseptör bir doku Paraganglion ve baş, boyun dahil olmak üzere çeşitli vücut bölgelerinde gelişebilir. göğüs ve karın. En yaygın olarak baş ve boyun bölgesinde, özellikle de karotis bifurkasyonu, juguler foramen, vagus siniri, Ve içinde orta kulak.[14] Fenotipler arasında aşırı katekolamin indüklenmiş hipertansiyon, büyük kan damarlarının disfonksiyonu ve kafatası sinirleri, önemli hastalık, terlemek, ve çarpıntı. Böbrek üstü bezi dışı lokalizasyon durumlarında tümör dönebilir metastatik ve agresif. Kaybı SDH kompleksi işlevin sorumlu olduğu bilinmektedir Paraganglioma.[12][11][10] Bu gendeki mutasyonlar, DNA hastalığı olan hastaların sadece küçük bir kısmının.[11]
Etkileşimler
SDHAF2 ile etkileşime girer SDHA SDH katalitik dimer içinde. Ek olarak SDHA SDHAF2'de 17 protein-protein etkileşimleri gibi proteinlerle etkileşimler dahil IMMT, SUCLG2, UBINEDDSUMO1, SSX2IP, ve diğerleri.[15]
Referanslar
- ^ a b c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000167985 - Topluluk, Mayıs 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000024668 - Topluluk, Mayıs 2017
- ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
- ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
- ^ a b "Entrez Geni: Süksinat dehidrojenaz kompleksi montaj faktörü 2".
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (Ekim 2013). "Kardiyak proteom biyolojisi ve tıbbın uzmanlaşmış bir bilgi bankası tarafından entegrasyonu". Dolaşım Araştırması. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ^ Yao, Daniel. "Kardiyak Organellar Protein Atlas Bilgi Bankası (COPaKB) —— Protein Bilgileri". amino.heartproteome.org. Alındı 2018-07-23.
- ^ Starker LF, Delgado-Verdugo A, Udelsman R, Björklund P, Carling T (Aralık 2010). "Birincil hiperparatiroidizmin paratiroid tümörlerinde yeni bir endokrin tümör baskılayıcı gen olan SDHAF2'nin (SDH5) ifadesi ve somatik mutasyonları". Endokrin. 38 (3): 397–401. doi:10.1007 / s12020-010-9399-0. PMID 20972721. S2CID 25914943.
- ^ Eletsky A, Jeong MY, Kim H, Lee HW, Xiao R, Pagliarini DJ, Prestegard JH, Winge DR, Montelione GT, Szyperski T (Ekim 2012). "Maya süksinat dehidrojenaz flavinilasyon faktörü Sdh5'in solüsyon NMR yapısı, varsayılan bir Sdh1 bağlanma bölgesini ortaya çıkarır". Biyokimya. 51 (43): 8475–7. doi:10.1021 / bi301171u. PMC 3667956. PMID 23062074.
- ^ a b Hao HX, Khalimonchuk O, Schraders M, Dephoure N, Bayley JP, Kunst H, Devilee P, Cremers CW, Schiffman JD, Bentz BG, Gygi SP, Winge DR, Kremer H, Rutter J (Ağustos 2009). "Süksinat dehidrojenazın flavinasyonu için gerekli bir gen olan SDH5, paragangliomada mutasyona uğradı". Bilim. 325 (5944): 1139–42. Bibcode:2009Sci ... 325.1139H. doi:10.1126 / science.1175689. PMC 3881419. PMID 19628817.
- ^ a b c Bayley JP, Kunst HP, Cascon A, Sampietro ML, Gaal J, Korpershoek E, Hinojar-Gutierrez A, Timmers HJ, Hoefsloot LH, Hermsen MA, Suárez C, Hussain AK, Vriends AH, Hes FJ, Jansen JC, Tops CM, Corssmit EP, de Knijff P, Lenders JW, Cremers CW, Devilee P, Dinjens WN, de Krijger RR, Robledo M (Nisan 2010). "Ailesel ve sporadik paraganglioma ve feokromositomada SDHAF2 mutasyonları". Neşter. Onkoloji. 11 (4): 366–72. doi:10.1016 / S1470-2045 (10) 70007-3. PMID 20071235.
- ^ a b Kugelberg J, Welander J, Schiavi F, Fassina A, Bäckdahl M, Larsson C, Opocher G, Söderkvist P, Dahia PL, Neumann HP, Gimm O (Mart 2014). "Von Hippel-Lindau ile ilişkili feokromositomalarda SDHAF2 ve SDHD'nin rolü". Dünya Cerrahi Dergisi. 38 (3): 724–32. doi:10.1007 / s00268-013-2373-2. PMID 24322175. S2CID 11895429.
- ^ Pagon RA, Adam MP, Ardinger HH, vd. (1993). "Kalıtsal Paraganglioma-Feokromositoma Sendromları". PMID 20301715. Alıntı dergisi gerektirir
| günlük =(Yardım) - ^ "SDHAF2 - Süksinat dehidrojenaz montaj faktörü 2, mitokondriyal". www.uniprot.org. Alındı 2018-07-18.
- ^ Kerrien S, Alam-Faruque Y, Aranda B, Bancarz I, Bridge A, Derow C, Dimmer E, Feuermann M, Friedrichsen A, Huntley R, Kohler C, Khadake J, Leroy C, Liban A, Lieftink C, Montecchi-Palazzi L, Orchard S, Risse J, Robbe K, Roechert B, Thorneycroft D, Zhang Y, Apweiler R, Hermjakob H (Ocak 2007). "IntAct - moleküler etkileşim verileri için açık kaynaklı kaynak". Nükleik Asit Araştırması. 35 (Veritabanı sorunu): D561-5. CiteSeerX 10.1.1.279.8196. doi:10.1093 / nar / gkl958. PMC 1751531. PMID 17145710.
daha fazla okuma
- Baysal BE, Farr JE, Rubinstein WS, Galus RA, Johnson KA, Aston CE, Myers EN, Johnson JT, Carrau R, Kirkpatrick SJ, Myssiorek D, Singh D, Saha S, Gollin SM, Evans GA, James MR, Richard CW (Ocak 1997). "Kromozom 11q23 üzerinde ailesel nonchromaffin paragangliomalar için imprinted bir genin ince haritalaması". Amerikan İnsan Genetiği Dergisi. 60 (1): 121–32. PMC 1712548. PMID 8981955.
- Gaal J, Burnichon N, Korpershoek E, Roncelin I, Bertherat J, Plouin PF, de Krijger RR, Gimenez-Roqueplo AP, Dinjens WN (Mart 2010). "İzositrat dehidrojenaz mutasyonları feokromositomalarda ve paragangliomalarda nadirdir". Klinik Endokrinoloji ve Metabolizma Dergisi. 95 (3): 1274–8. doi:10.1210 / jc.2009-2170. PMID 19915015.
- Mariman EC, van Beersum SE, Cremers CW, Struycken PM, Ropers HH (Ocak 1995). "Ailesel kromaffin olmayan paragangliomalar için varsayılan olarak damgalanmış bir genin kromozom 11q13.1'e ince haritalaması: genetik heterojenliğin kanıtı". İnsan Genetiği. 95 (1): 56–62. doi:10.1007 / bf00225075. hdl:2066/22047. PMID 7814027. S2CID 2324475.
- Kunst HP, Rutten MH, de Mönnink JP, Hoefsloot LH, Timmers HJ, Marres HA, Jansen JC, Kremer H, Bayley JP, Cremers CW (Ocak 2011). "SDHAF2 (PGL2-SDH5) ve kalıtsal baş ve boyun paraganglioması". Klinik Kanser Araştırmaları. 17 (2): 247–54. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-10-0420. PMID 21224366.
Bu makale, Birleşik Devletler Ulusal Tıp Kütüphanesi içinde olan kamu malı.