Küçük Cajal gövdesine özgü RNA 20 - Small Cajal body specific RNA 20

Küçük Cajal gövdesine özgü RNA 20
RF00601.jpg
Tahmin edilen ikincil yapı ve dizi koruma SCARNA20
Tanımlayıcılar
SembolSCARNA20
RfamRF00601
Diğer veri
RNA tipGen; snRNA; snoRNA; scaRNA
Alan (lar)Ökaryota
GİTGO terimi GO ile başlamalıdır: GO terimi GO ile başlamalıdır: GO terimi GO ile başlamalıdır:
YANİİşletim Sistemi: 0000275
PDB yapılarPDBe

İçinde moleküler Biyoloji, Küçük Cajal gövdesine özgü RNA 20 (Ayrıca şöyle bilinir scaRNA20 veya ACA66) bir küçük nükleolar RNA içinde bulunan Cajal organları ve karıştığına inanılıyor psödoüridilasyon nın-nin U12 minör spliceozomal RNA.

scaRNA'lar belirli bir sınıftır küçük nükleolar RNA'lar yerelleştiren Cajal organları ve değiştirilmesine rehberlik etmek RNA polimeraz II yazılı ek yeri RNA'lar U1, U2, U4, U5 ve U12.[1]

ACA66 (SCARNA20), H / ACA kutusu üridinlerin psödoüridinlere dönüştürüldüğü yerleri yönlendiren snoRNAs sınıfı. Bu snoRNA, hesaplamalı tarama ile tanımlandı ve farede ifadesi deneysel olarak şu şekilde doğrulandı: Kuzey lekesi ve primer uzatma analizi.[2]ACA66'nın, U12 snRNA'daki U28 kalıntısının psödooridilasyonuna rehberlik ettiği tahmin edilmektedir.[3]

Referanslar

  1. ^ Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (Haziran 2002). "Cajal vücuda özgü küçük nükleer RNA'lar: yeni bir 2′-O-metilasyon sınıfı ve psödoüridilasyon kılavuz RNA'lar". EMBO Dergisi. 21 (11): 2746–2756. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2746. PMC  126017. PMID  12032087.
  2. ^ Schattner P, Barberan-Soler S, Lowe TM (Ocak 2006). "Memeli psödooridilasyon kılavuzu H / ACA RNA'ları için hesaplamalı bir ekran". RNA. 12 (1): 15–25. doi:10.1261 / rna.2210406. PMC  1370881. PMID  16373490.
  3. ^ Lestrade L, Weber MJ (Ocak 2006). "snoRNA-LBME-db, insan H / ACA ve C / D kutusu snoRNA'larının kapsamlı bir veritabanı". Nükleik Asit Araştırması. 34 (Veritabanı sorunu): D158–162. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.

Dış bağlantılar