Küçük nükleolar RNA SNORD16 - Small nucleolar RNA SNORD16

Küçük nükleolar RNA SNORD16
RF00138.jpg
Tahmin edilen ikincil yapı ve dizi koruma SNORD16'nın
Tanımlayıcılar
SembolSNORD16
Alt. SembollerU16
RfamRF00138
Diğer veri
RNA tipGen; snRNA; snoRNA; C / D-kutusu
Alan (lar)Ökaryota
GİTGO terimi GO ile başlamalıdır: GO terimi GO ile başlamalıdır:
YANİİşletim Sistemi: 0000593
PDB yapılarPDBe

snoRNA U16 (Ayrıca şöyle bilinir SNORD16) bir kodlamayan RNA (ncRNA) molekülü diğerlerinin modifikasyonunda işlev görür. küçük nükleer RNA'lar (snRNA'lar). Bu tip modifiye edici RNA, genellikle çekirdekçik SnRNA biyogenezinin ana bölgesi olan ökaryotik hücrenin Olarak bilinir küçük nükleolar RNA (snoRNA) ve sıklıkla kılavuz RNA olarak da anılır.

snoRNA U16, C / D kutusu C kutusu (UGAUGA) ve D kutusu (CUGA) olarak bilinen korunmuş sekans motiflerini içeren snoRNA sınıfı. Kutu C / D ailesinin üyelerinin çoğu, bölgeye özgü 2'-O-metilasyon substrat RNA'ları.[1]

U16'nın 18S ribozomal RNA (rRNA) kalıntısı A484'ün 2'O-riboz metilasyonuna rehberlik ettiği tahmin edilmektedir. [2] ve bir intron için genin ribozomal proteinler Hayvanlarda L1.[3] Bu snoRNA, farede bağımsız olarak MBII-98 olarak adlandırılmıştır.[4]

Referanslar

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (Ekim 2002). "Saflaştırılmış kutu C / D snoRNP'ler, in vitro hedef RNA'nın bölgeye özgü 2'-O-metilasyonunu yeniden üretebilir". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Kiss-László Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T (Haziran 1996). "Preribosomal RNA'nın bölgeye özgü riboz metilasyonu: küçük nükleolar RNA'lar için yeni bir işlev". Hücre. 85 (7): 1077–88. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81308-2. PMID  8674114.
  3. ^ Fragapane P, Prislei S, Michienzi A, Caffarelli E, Bozzoni I (Temmuz 1993). "Yeni bir küçük nükleolar RNA (U16), bir ribozomal protein intronu içinde kodlanır ve pre-mRNA'nın işlenmesiyle ortaya çıkar". EMBO Dergisi. 12 (7): 2921–8. PMC  413545. PMID  8335006.
  4. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (Haziran 2001). "RNomics: farede yeni, küçük, haberci olmayan RNA'lar için 201 aday belirleyen deneysel bir yaklaşım". EMBO Dergisi. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2943. PMC  125495. PMID  11387227.

Dış bağlantılar