Küçük nükleolar RNA SNORD88 - Small nucleolar RNA SNORD88

Küçük nükleolar RNA SNORD88
RF00604.jpg
Tahmin edilen ikincil yapı ve dizi koruma SNORD88'de
Tanımlayıcılar
SembolSNORD88
RfamRF00604
Diğer veri
RNA tipGen; snRNA; snoRNA; C / D-kutusu
Alan (lar)Ökaryota
GİTGO terimi GO ile başlamalıdır: GO terimi GO ile başlamalıdır:
YANİİşletim Sistemi: 0000593
PDB yapılarPDBe

Küçük Nükleolar RNA SNORD88 (HBII-180 olarak da bilinir) bir kodlamayan RNA (ncRNA) molekülü, diğerlerinin biyogenezinde (modifikasyonunda) işlev görür. küçük nükleer RNA'lar (snRNA'lar). Bu tip değiştirici RNA, çekirdekçik SnRNA biyogenezinin ana bölgesi olan ökaryotik hücrenin Olarak bilinir küçük nükleolar RNA (snoRNA) ve sıklıkla kılavuz RNA olarak da anılır.

SNORD88, C / D kutusu C (UGAUGA) ve D (CUGA) kutu motiflerini içeren snoRNA sınıfı. C / D kutusu ailesinin üyelerinin çoğu, bölgeye özgü 2′-O-metilasyon substrat RNA'larının[1]Bu snoRNA insandır ortolog fare snoRNA MBII-180.[2] SNORD88 ayrıca fare snoRNA MBII-211 ile de ilgilidir. SNORD88'in 28S'nin 2′O-riboz metilasyonuna rehberlik ettiği tahmin edilmektedir. ribozomal RNA (rRNA) kalıntı C3680.[3]

SNORD88'in, benzer bir şekilde daha küçük parçalara işlendiğine dair kanıt vardır. mikroRNA ve protein ekspresyonunu baskılayabilir.[4][5]

Referanslar

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (Ekim 2002). "Saflaştırılmış kutu C / D snoRNP'ler, in vitro hedef RNA'nın bölgeye özgü 2′-O-metilasyonunu yeniden üretebilir". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (Haziran 2001). "RNomics: farede yeni, küçük, haberci olmayan RNA'lar için 201 aday belirleyen deneysel bir yaklaşım". EMBO Dergisi. 20 (11): 2943–2953. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2943. PMC  125495. PMID  11387227.
  3. ^ Lestrade L, Weber MJ (Ocak 2006). "snoRNA-LBME-db, insan H / ACA ve C / D kutusu snoRNA'larının kapsamlı bir veritabanı". Nükleik Asit Araştırması. 34 (Veritabanı sorunu): D158–162. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.
  4. ^ Ono M, Yamada K, Avolio F, Scott MS, van Koningsbruggen S, Barton GJ, Lamond AI (Mayıs 2010). "İnsan küçük nükleolar RNA'larının (snoRNA) analizi ve gen ekspresyon vektörlerinin snoRNA modülatörünün geliştirilmesi". Hücrenin moleküler biyolojisi. 21 (9): 1569–1584. doi:10.1091 / mbc.E10-01-0078. PMC  2861615. PMID  20219969.
  5. ^ Ono M, Scott MS, Yamada K, Avolio F, Barton GJ, Lamond AI (Mayıs 2011). "Kutu C / D snoRNA'lara benzeyen insan miRNA öncüllerinin tanımlanması". Nükleik Asit Araştırması. 39 (9): 3879–3891. doi:10.1093 / nar / gkq1355. PMC  3089480. PMID  21247878.

Dış bağlantılar