Squamosa promoter bağlayıcı protein - Squamosa promoter binding protein - Wikipedia

SBP
PDB 1ul4 EBI.jpg
Squamosa promoter bağlayıcı protein benzeri 4'ün DNA bağlanma bölgesinin çözüm yapısı
Tanımlayıcılar
SembolSBP
PfamPF03110
InterProIPR004333
PROSITEPDOC00798
SCOP22lao / Dürbün / SUPFAM
TCDB3.A.1

SQUAMOSA promotörü bağlayıcı protein benzeri (SBP veya SPL) ailesinin Transkripsiyon faktörleri tesise özgü olarak tanımlanır DNA bağlama alanı. Ailenin kurucu üyesi, kendi özel durumuna göre belirlendi. laboratuvar ortamında bağlayıcı organizatör aslanağzı SQUAMOSA geninin.[1] SBP proteinlerinin transkripsiyonel aktivatörler olduğu düşünülmektedir.

Fonksiyon

SPB proteinlerinin yaprak gelişiminde rolü vardır, bitkisel faz değişimi, çiçek ve meyve gelişimi, bitki yapısı, sporojenez, Gibberelik asit sinyalleşmesi ve toksin tepkisi.[2]

Yapısı

Etki alanı 10 içerir korunmuş sistein ve histidin kalıntılar bu muhtemelen çinko ligandlar SBP alanı, oldukça korunmuş bir DNA bağlama alanıdır. Yaklaşık 80 amino asitler uzunluğundadır ve bir çinko parmak motif iki çinko bağlama bölgesi ile: Cys-Cys-His-Cys ve Cys-Cys-Cys-His. Üç telli antiparalel beta sayfası.[3]

Referanslar

  1. ^ Klein J, Saedler H, Huijser P (Ocak 1996). "Yeni bir DNA bağlayıcı protein ailesi, Antirrhinum majus floral meristem kimlik geni SQUAMOSA'nın varsayılan transkripsiyonel düzenleyicilerini içerir". Mol. Gen. Genet. 250 (1): 7–16. doi:10.1007 / bf02191820. PMID  8569690. S2CID  20915344.
  2. ^ Chen X, Zhang Z, Liu D, Zhang K, Li A, Mao L (2010). "SQUAMOSA promoter bağlayıcı protein benzeri transkripsiyon faktörleri: bitki büyümesi ve gelişimi için yıldız oyuncular". J Entegre Tesis Biol. 52 (11): 946–51. doi:10.1111 / j.1744-7909.2010.00987.x. PMID  20977652.
  3. ^ Yamasaki K, Kigawa T, Inoue M, Tateno M, Yamasaki T, Yabuki T, ve diğerleri. (2004). "Arabidopsis SBP ailesi transkripsiyon faktörlerinin DNA bağlama alanlarının çözelti yapıları tarafından ortaya çıkan yeni bir çinko bağlama motifi". J Mol Biol. 337 (1): 49–63. doi:10.1016 / j.jmb.2004.01.015. PMID  15001351.

Dış bağlantılar

Bu makale kamu malı metinleri içermektedir Pfam ve InterPro: IPR004333