Streptomyces sp. miyofore - Streptomyces sp. myrophorea - Wikipedia

Streptomyces sp. miyofore
Streptomyces sp. agar.jpg üzerinde myrophorea
Olgun Streptomyces sp zayıf eşmerkezli halkaları olan tozlu yeşil koloniler gösteren miyrofora
bilimsel sınıflandırma
Alan adı:
Şube:
Sipariş:
Aile:
Cins:
Türler:
Streptomyces Türler
Çeşitlilik:
Streptomyces sp. myrophorea izole McG1

Streptomyces sp. myrophorea, McG1 izole et bir türüdür Streptomyces, bu bir (etnofarmakoloji ) Toneel North kasabasında halk tedavisi Boho, İlçe Fermanagh.[1] Bu alan önceden Druidler (~ 1500 yıl önce) ve bundan önce Neolitik çevreyi kazıyan insanlar (~ 3.700 yıl önce) Reyfad taşlar.[2] Streptomyces sp. myrophorea birçok tür için inhibe edicidir. ESKAPE patojenleri, yüksek pH'da (10.5) büyüyebilir ve nispeten yüksek seviyelerde radyoaktiviteyi tolere edebilir.[1]

Fizyoloji ve morfoloji

Streptomyces sp. myrophorea izolatı McG1, SFM agar üzerinde kültive edildiğinde açık yeşil ila beyaz sporlara ve hiflere sahiptir.[1]

Streptomyces sp. miyrophorea sporları atomik kuvvet mikroskobu altında

Kolonileri Streptomyces sp. myrophorea belirgin şekilde tozlu bir görünüme sahiptir ve olgunlaştığında germaline benzer bir aroma üretir.[1] Bu bakteri, düz zincirler halinde oluşan yaklaşık 0.5-1.0 mikrometre genişliğinde birçok spor üretir.[1]

Ekoloji

Streptomyces sp. myrophorea izolatı McG1 alkali, tür açısından zengin bir ortamda keşfedilmiştir.

Briza çiçek baş, Boho, Co. Fermanagh

Bu bakteri maksimum pH 10.5'te büyür ve bu nedenle alkalifiliktir. Bakteriler daha yüksek seviyelerde alkaliniteyi tolere eder ancak gelişmez.[1]

Streptomyces sp. myrophorea ayrıca nispeten yüksek seviyelerde radyasyona (4kGy'ye kadar) dayanabilir. Bu, yayan altta yatan kireçtaşı ve şeyl substratıyla ilgili olabilir. radon gazı.[1]

Antibiyotik üretimi

Yalnızca antibiyotik gen sentez kümeleri tanımlanmıştır. Streptomyces sp. miyrophorea; aslında yerinde üretilen antibiyotikler henüz tanımlanmamıştır.[1] Streptomyces sp. McG1, hem Gram pozitif hem de Gram negatif bakteriler için geniş ölçüde inhibe edicidir. karbapenem dayanıklı Acinetobacter baumannii, (üzerinde kritik bir patojen Dünya Sağlık Örgütü öncelikli patojenler listesi), vankomisin dayanıklı Enterococcus faecium, metisilin dayanıklı Staphylococcus aureus (yüksek öncelikli olarak listelenmiştir) ve Klebsiella pneumoniae.[1][3] Streptomyces sp. myrophorea'nın suşlarına karşı sınırlı etkileri vardır. Enterococcus faecium ve Pseudomonas aeruginosa.[1]

Alkali tolerans

Streptomyces sp. Myrophorea alkali bir ortamda gelişebilir çünkü diğer bakteri türlerinde alkalin toleransıyla ilişkili olanlara benzer birçok gen içerir.[4][5]

Streptomyces sp. Toprak kürlemesinden, Boho, Co. Fermanagh

Streptomyces sp. alkali tolerans genlerinin miyrofora listesi:[1]

GenProtein
504Alkali şok protein 23
6561Alkali şok protein 23
1049Amonyum / H + antiporter alt birimi amhM
2800Aspartat / alanin antiporter
2801Aspartat / alanin antiporter
6218Aspartat / alanin antiporter
3284Gelişmiş hücre içi hayatta kalma proteini
159K + / H + antiporter nhaP
3788K + / H + antiporter nhaP2
1050K + / H + antiporter yhaU
2193K + / H + antiporter yhaU
1325K + duyarsız pirofosfat enerjili proton pompası
923Çoklu ilaca dirençli protein mdtH
3240Çoklu ilaca dirençli protein mdtH
3252Çoklu ilaca dirençli protein mdtH
6781Çoklu ilaca dirençli protein mdtH
1282Na + / H + antiporter nhaA
4210Na + / H + antiporter alt birimi A
4211Na + / H + antiporter alt birimi C
4212Na + / H + antiporter alt birimi D
4215Na + / H + antiporter alt birimi G
660Na + / (H + veya K +) antiporter gerN
3425Na + / (H + veya K +) antiporter gerN
7210varsayılan Na + / H + değiştirici
1727Sodyum, potasyum, lityum ve rubidyum / H + antiporter

In-vitro antibiyotik direnci

Antibiyotik direnç genlerinin varlığı genellikle antibiyotik üretimi ile bağlantılıdır.[6] Stretpomyces sp. myrophorea bir dizi testte 28 antibiyotiğe dirençli ve sekiz antibiyotiğe duyarlı olarak kaydedilmiştir. Antimikrobiyal duyarlılığı test etmek için antibiyotikler Avrupa Antimikrobiyal Duyarlılık Testi Komitesi - EUCAST tarafından önerilen kırılma noktası konsantrasyonlarında test edilmiştir.[1][7]

Antibiyotik duyarlılığı nın-nin Streptomyces sp. miyrofore:[1]Hassasiyetler şu şekilde kaydedilir: Hassasiyet (S), Dirençli (R) veya Orta (I).

AntibiyotikMiktar (µg)Duyarlılık
Amikasin30S
Ampisilin30R
Ampisilin + sulbaktam20R
Augmentin30R
Apromisin20R
Karbenisilin20R
Sefepim30R
Seftazidim10R
Seftibuten30R
Sefoksitin30R
Seftriakson30R
Sefuroksim30R
Sefurin5R
Siprofloksasin5R
Klavuranik asit10R
Ertapenem10R
Eritromisin15ben
Antibiyotik10S
Imipenem10R
Kanamisin20R
Linezolid10ben
Meropenem10R
Mupirisin200R
Netilmisin10S
Nitrofurantoin100R
Novobiocin5R
Piperacillin + tazobaktam36R
Kinpristin + dalropristin5R
Rifampisin5R
Streptomisin20R
Tigesiklin15R
Tetrasiklin20R
Trimetoprim + sülfametoksazol25R
Vankomisin5R

Tüm genom dizileme

Genom dizisi Streptomyces sp. myrophorea, izolat McG1, NCBI (TaxID 2099643), Biosample erişim numarası SAMN08518548, BioProject erişim numarası PRJNA433829, Gönderim Kimliği: SUB3653175 Locus etiketi öneki: C4625'te saklanmıştır. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/433829.[1]NCBI sekans okuma arşivine (SRA) bağlantı https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra?LinkName=biosample_sra&from_uid=8518548 Bu bakterinin kopyaları Ulusal Tip Kültürler Koleksiyonu (NCTC), İngiltere[8] ve Deutsche Sammlung von Mikroorganismen ve Zellkulturen (DSMZ) GmbH, Almanya.[9]

Referanslar

  1. ^ a b c d e f g h ben j k l m n Terra, L .; et al. (2018). "Yeni Bir Alkalifilik Streptomyces ESKAPE Patojenlerini Engelliyor". Mikrobiyolojide Sınırlar. 9: 2458. doi:10.3389 / fmicb.2018.02458. PMC  6232825. PMID  30459722.
  2. ^ Andrew Halpin; Conor Newman (2006). İrlanda: İlk zamanlardan MS 1600'e kadar olan sit alanları için Oxford arkeolojik rehberi. Oxford University Press. s.8. ISBN  978-0-19-280671-0.
  3. ^ "Yeni antibiyotiklerin araştırılmasına, keşfine ve geliştirilmesine rehberlik edecek antibiyotiğe dirençli bakterilerin küresel öncelik listesi". Dünya Sağlık Örgütü.
  4. ^ Holdsworth, S. R .; Hukuk, C.J. (2013). "Çoklu İlaca Dirençli Protein MdtM Escherichia coli'de Alkali pH Homeostazında Yer Alan Antiportörlerin Repertuarına Katkıda Bulunur". BMC Mikrobiyoloji. 13: 113. doi:10.1186/1471-2180-13-113. PMC  3668916. PMID  23701827.
  5. ^ Krulwich, T. A .; Sachs, G .; Padan, E. (2011). "Bakteriyel pH Algılama ve Homeostazın Moleküler Yönleri". Doğa İncelemeleri Mikrobiyoloji. 9 (5): 330–343. doi:10.1038 / nrmicro2549. PMC  3247762. PMID  21464825.
  6. ^ Nodwell, J.R. (2007). "Antibiyotik Direnci ile Antibiyotik Üretimi Arasındaki Yeni Bağlantılar". Bakteriyoloji Dergisi. 189 (10): 3683–3685. doi:10.1128 / JB.00356-07. PMC  1913332. PMID  17384190.
  7. ^ "Avrupa Antimikrobiyal Duyarlılık Testi Komitesi - EUCAST". Alındı 2018-10-13.
  8. ^ "Ulusal Tip Kültür Koleksiyonu (NCTC)". Halk Sağlığı İngiltere. Alındı 2018-10-13.
  9. ^ "Leibniz Enstitüsü DSMZ-Alman Mikroorganizma ve Hücre Kültürleri Koleksiyonu". Leibniz-Institut DSMZ-Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH. Alındı 2018-10-13.

Dış bağlantılar