Strongylocentrotus purpuratus - Strongylocentrotus purpuratus - Wikipedia

Strongylocentrotus purpuratus
Strongylocentrotus purpuratus 1.jpg
bilimsel sınıflandırma
Krallık:
Şube:
Sınıf:
Alt sınıf:
Üst sipariş:
Sipariş:
Aile:
Cins:
Türler:
S. purpuratus
Binom adı
Strongylocentrotus purpuratus
(Stimpson, 1857)
Strongylocentrotus purpuratus range.png
Ağız yüzeyi Strongylocentrotus purpuratus Aristoteles'in Fenerinin dişlerini, dikenlerini ve tüp ayaklarını gösteriyor.
Strongylocentrotus purpuratus

mor deniz kestanesi, Strongylocentrotus purpuratus, doğu kenarı boyunca yaşıyor Pasifik Okyanusu -den uzanan Ensenada, Meksika, için Britanya Kolumbiyası, Kanada.[1] Bu Deniz kestanesi türler koyu mor renktedir ve daha düşük gelgitler arası ve yakın kıyı altı gelgit topluluklarında yaşar. Suya salgılandığında yumurtaları turuncudur.[2] Ocak, Şubat ve Mart türler için tipik aktif üreme ayları olarak işlev görür. Cinsel olgunluğa yaklaşık iki yıl ulaşılır.[3]

Normalde yaklaşık 10 cm (4 inç) çapa kadar büyür ve 70 yıla kadar yaşayabilir.[4]

Biyomedikal araştırmalardaki rolü

Süre embriyonik gelişme hala deniz kestanesi kullanımının önemli bir parçası olduğundan, kestanenin evrimsel bir mucize olarak konumu üzerine çalışmalar giderek daha sık hale geldi. İnsan hastalıklarına ortologlar, bilim adamlarını, içinde bulunan diziler için potansiyel terapötik kullanımları araştırmaya yöneltmiştir. Strongylocentrotus purpuratus. Örneğin, 2012'de, St Andrews Üniversitesi bölgedeki "2A" viral bölgesini araştırmaya başladı S. purpuratus genetik şifre[5][6] hangisi için yararlı olabilir Alzheimer hastalığı ve kanser araştırması. Çalışma, hücreleri 'kök hücre' benzeri bir duruma döndürebilen ve daha iyi tedavi seçenekleri sağlayan bir dizi tanımladı.[5] Bu tür, özellikle hasar görmüş veya yaşlanan dokuyu yenileme kabiliyeti nedeniyle uzun ömür araştırmalarında da aday olmuştur. 'Genç' ile 'yaşlı'yı karşılaştıran başka bir çalışma, farklı yaşam sürelerine sahip türlerde bile, gençlere kıyasla önemli dezavantajlara sahip olmadıkları için daha yaşlı örneklerde' rejeneratif potansiyelin 'korunduğunu öne sürdü.[7]

Genetik şifre

Mor deniz kestanesinin genomu, 2006 yılında, aralarında aşağıdakilerin de bulunduğu 70'den fazla kurumdan bilim insanı ekipleri tarafından tamamen sıralandı ve açıklandı Kerckhoff Deniz Laboratuvarı -de Kaliforniya Teknoloji Enstitüsü yanı sıra İnsan Genom Dizileme Merkezi -de Baylor Tıp Fakültesi.[8] Mor deniz kestanesinin yeni geliştirilmiş versiyonu, Strongylocentrotus purpuratus v5.0 artık şurada mevcut: Ekinobaz. S. purpuratus hücre ve gelişim biyolojisindeki çeşitli biyomedikal araştırma modeli organizmalarından biridir.[9] Deniz kestanesi, (1) serbest yaşayan, hareketli bir deniz olan sekanslanmış bir genoma sahip ilk hayvandır. omurgasız; (2) iki taraflı olarak düzenlenmiş bir embriyoya sahiptir, ancak radyal bir yetişkin vücut planına sahiptir; (3) iç iskelet ve su damar sistemi sadece ekinodermler; ve (4) uyumsuz bağışıklık sistemi bu, reseptör repertuarının muazzam karmaşıklığında benzersizdir.[10]

Deniz kestanesi genomunun yaklaşık 23.500 geni kodladığı tahmin edilmektedir. S. purpuratus insan kinaz alt familyalarının% 97'sini içeren 353 protein kinaza sahiptir.[11] Bu genlerin çoğunun daha önce omurgalı yenilikleri olduğu düşünülüyordu veya yalnızca döterostomlar. Türleri sıralayan ekip, bazı genlerin omurgalı daha önce düşünüldüğü gibi spesifik, diğer genler hala kestanede bulundu ancak kordatta bulunmuyordu.

Genom büyük ölçüde gereksizdir, bu da onu omurgalılarla çok karşılaştırılabilir hale getirir, ancak karmaşıklığı yoktur. Örneğin, eksik olan 200 ila 700 kemosensör gen bulundu. intronlar, omurgalılara özgü bir özellik.[11] Böylece deniz kestanesi genomu, bizim ve diğerlerininkiyle bir karşılaştırma sağlar. döterostomlar, her ikisinin de ekinodermler ve insanlar aittir.[10] Deniz kestaneleri aynı zamanda kordalılara en yakın yaşayan akrabadır.[11] En katı ölçüyü kullanarak, mor deniz kestanesi ve insanlar 7.700 geni paylaşıyor.[12] Bu genlerin çoğu çevreyi algılamakla ilgilidir.[13] kafa yapısı olmayan bir hayvan için şaşırtıcı bir gerçek.

Deniz kestanesinin de bir kimyasalı vardır. 'savunucu' potansiyel olarak toksik kimyasalları ortadan kaldırmak için stres algılandığında tepki verir.[11] S. purpuratusesBağışıklık sistemleri doğal patojen reseptörlerini içerir. Toll benzeri reseptörler ve kodlayan genler LRR . İçin tanımlanan genler vardı Biyomineralizasyon tipik insan omurgalı çeşitlerinin muadilleri değildi SCCP'ler ve kodlamak için zar ötesi gibi proteinler S16. Birçok ortologlar insan hastalıklarıyla ilişkili genler için mevcuttur, örneğin Reelin (kimden Norman-Roberts lisensefali sendromu ) ve birçok hücre iskeleti proteini Usher sendromu ağı usherin gibi ve VLGR1.[11]

Ekoloji ve ekonomi

Mor deniz kestanesi ile birlikte su samuru ve abalonlar, önde gelen bir üyesidir Yosun Ormanı topluluk.[14] Deniz kestaneleri, Kaliforniya'nın yerli halkları, sarı yumurta kütlesini çiğ yiyen.[15][16] Mor deniz kestanesi, iklim değişikliği nedeniyle halihazırda meydana gelen yosun ormanlarının ortadan kalkmasında da önemli bir rol oynamaktadır.[17]

Kaliforniya'da, en yüksek gonad büyüme mevsimi (ve dolayısıyla yenilebilirliğin zirvesi) Eylül-Ekim'dir. [18] Sezonun başlarında, gonadlar hala büyüyor ve verim daha az olacak. Kasım ayından itibaren gonadlar geliştirilir, ancak hasat stresi yumurtlamayı tetikleyerek kaliteyi düşürür.

Yakın çekim Strongylocentrotus purpuratus açıkça gösteren tüp ayaklar.

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ Ricketts EF, Calvin J. Between Pacific Tides. 3. Rev. edn. 1962, J.W. Hedgpeth. XII 516. Stanford University Press, Stanford, CA. 1939
  2. ^ "Deniz Kestanesi Araştırması | ASU - Bir Biyologa Sorun". askabiologist.asu.edu. 2010-04-16. Alındı 2016-12-05.
  3. ^ "Strongylocentrotus purpuratus". Hayvan Çeşitliliği Web. Alındı 2016-12-05.
  4. ^ T.A. Ebert, J. R. Southon, 2003. Fish. Boğa. 101, 915
  5. ^ a b "Deniz kestaneleri bazı hastalıkları iyileştirmek için genetik anahtarı içerebilir". Alındı 2016-12-05.
  6. ^ Ryan, Dr Martin. "M. Ryan". www.st-andrews.ac.uk. Arşivlenen orijinal 2016-12-30 tarihinde. Alındı 2016-12-12.
  7. ^ Bodnar, Andrea G .; Coffman, James A. (2016/08/01). "Kısa ve uzun ömürlü deniz kestanesi türlerinde yaşla birlikte somatik doku yenilenmesinin sürdürülmesi". Yaşlanma Hücresi. 15 (4): 778–787. doi:10.1111 / acel.12487. ISSN  1474-9726. PMC  4933669. PMID  27095483.
  8. ^ "Uluslararası Ekip Tarafından Sıralanmış Kaliforniya Mor Deniz Kestanesi Genomu | Caltech". California Teknoloji Enstitüsü. Alındı 2016-12-05.
  9. ^ "SU White Paper" (PDF). Arşivlenen orijinal (PDF) 2016-03-03 tarihinde. Alındı 2009-10-31.
  10. ^ a b Sodergren, E .; Sodergren, G. M .; Weinstock, E. H .; Davidson, R. A .; Cameron, R. A .; Gibbs, R. C .; Angerer, L. M .; Angerer, M. I .; Arnone, D.R .; Burgess, R. D .; Burke, J. A .; Coffman, M .; Dean, M.R .; Elphick, C. A .; Ettensohn, K. R .; Foltz, A .; Hamdoun, R. O .; Hynes, W. H .; Klein, W .; Marzluff, D. R .; McClay, R. L .; Morris, A .; Mushegian, J. P .; Rast, L. C .; Smith, M. C .; Thorndyke, V. D .; Vacquier, G. M .; Wessel, G .; Wray, L .; et al. (2006). "Deniz Kestanesi Strongylocentrotus purpuratus Genomu". Bilim. 314 (5801): 941–952. Bibcode:2006Sci ... 314..941S. doi:10.1126 / science.1133609. PMC  3159423. PMID  17095691.
  11. ^ a b c d e Sodergren, E; Weinstock, GM; Davidson, EH; et al. (2006-11-10). "Deniz Kestanesi Strongylocentrotus purpuratus Genomu". Bilim. 314 (5801): 941–952. Bibcode:2006Sci ... 314..941S. doi:10.1126 / science.1133609. ISSN  0036-8075. PMC  3159423. PMID  17095691.
  12. ^ Materna, S.C., K. Berney ve R.A. Cameron. 2006a. S. purpuratus genom: Karşılaştırmalı bir bakış açısı " Dev. Biol. 300: 485-495.
  13. ^ Burke, R.D .; Angerer, L.M .; Elphick, M.R .; Humphrey, G.W .; Yaguchi, S .; Kiyama, T .; Liang, S .; Mu, X .; Ağca, C .; Klein, W.H .; Brandhorst, B.P .; Rowe, M .; Wilson, K .; Churcher, A.M .; Taylor, J.S .; Chen, N .; Murray, G .; Wang, D .; Mellott, D .; Olinski, R .; Hallböök, F .; Thorndyke, M.C. (2006). "Deniz kestanesi sinir sisteminin genomik görünümü". Dev. Biol. 300 (1): 434–460. doi:10.1016 / j.ydbio.2006.08.007. PMC  1950334. PMID  16965768.
  14. ^ Pearse, J. S. (2006). "Mor deniz kestanelerinin ekolojik rolü". Bilim. 314 (5801): 940–941. Bibcode:2006Sci ... 314..940P. doi:10.1126 / science.1131888. PMID  17095690.
  15. ^ D. Sweetnam ve diğerleri, Calif. Coop. Oceanic Balık. Invest. Rep. 46: 10 (2005).
  16. ^ Heizer, Robert Fleming; Elsasser, Albert B. (1980-01-01). Kaliforniya Kızılderililerinin Doğal Dünyası. California Üniversitesi Yayınları. ISBN  9780520038967.
  17. ^ Provost, Euan J .; Kelaher, Brendan P. (2017). "Ekolojik etkileşimler arasındaki iklim kaynaklı eşitsizlikler, yosun ormanının kalıcılığını tehdit ediyor". Küresel Değişim Biyolojisi. 23 (1): 353–361. Bibcode:2017GCBio..23..353P. doi:10.1111 / gcb.13414. PMID  27392308.
  18. ^ "Mor Deniz Kestanesi | Kaliforniya Deniz Fonu". caseagrant.ucsd.edu. Alındı 2020-12-14.

Dış bağlantılar