TRNT1 - TRNT1

TRNT1
Mevcut yapılar
PDB	Ortolog araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	1OU5, 4X4W
Tanımlayıcılar
Takma adlar	TRNT1, CCA1, MtCCA, CGI-47, SIFD, tRNA nükleotidil transferaz 1, RPEM
Harici kimlikler	OMIM: 612907 MGI: 1917297 HomoloGene: 9333 GeneCard'lar: TRNT1
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 3 (insan)
Son	3,150,879 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 6 (fare)
Son	106,782,474 bp
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• CTP: 3'-sitidin-tRNA sitidililtransferaz aktivitesi; • transferaz aktivitesi; • nükleotid bağlanması; • tRNA bağlanması; • nükleotidiltransferaz aktivitesi; • ATP bağlama; • CTP: tRNA cytidylyltransferase aktivitesi; • RNA bağlanması; • 5'-3 'RNA polimeraz aktivitesi; • ATP: 3'-sitidin-sitidin-tRNA adenililtransferaz aktivitesi;
Hücresel bileşen	• Mitokondriyal matriks; • hücre içi; • mitokondri; • nükleoplazma;
Biyolojik süreç	• RNA işleme; • tRNA 3'-terminal CCA ilavesi; • tRNA işleme; • tRNA 3'-uç işleme; • mitokondriyal tRNA 3'-uç işleme;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	51095
	70047
	ENSG00000072756
	ENSMUSG00000013736
	Q96Q11
	Q8K1J6
	NM_001302946; NM_016000; NM_182916
	NM_001242358; NM_001242360; NM_027296
	NP_001289875; NP_886552; NP_001354250; NP_001354251; NP_001354252
	NP_001229287; NP_001229289; NP_081572
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

tRNA-nükleotidiltransferaz 1, bir enzim insanlarda kodlanır TRNT1 gen.^[5]^[6]^[7]Bu enzim, CCA nükleotid dizisini 3 'ucuna ekler. tRNA, kullanma ATP ve CTP substratlar olarak. Sekans, bir amino asit için bağlanma bölgesini oluşturur.^[8]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000072756 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000013736 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (Ağu 2000). "Caenorhabditis elegans'ta evrimsel olarak korunan yeni insan genlerinin karşılaştırmalı proteomiklerle tanımlanması". Genom Res. 10 (5): 703–13. doi:10.1101 / gr.10.5.703. PMC 310876. PMID 10810093.
^ Nagaike T, Suzuki T, Tomari Y, Takemoto-Hori C, Negayama F, Watanabe K, Ueda T (Ekim 2001). "Memeli mitokondriyal tRNA nükleotidiltransferazlarının tanımlanması ve karakterizasyonu". J Biol Kimya. 276 (43): 40041–9. doi:10.1074 / jbc.M106202200. PMID 11504732.
^ "Entrez Geni: TRNT1 tRNA nükleotidil transferaz, CCA-eklenmesi, 1".
^ Lizano E, Scheibe M, Rammelt C, Betat H, Mörl M (Mayıs 2008). "İnsan ve E. coli'den CCA ekleyen enzimlerin karşılaştırmalı bir analizi: CCA ilavesi ve tRNA 3'-uç onarımındaki farklılıklar". Biochimie. 90 (5): 762–72. doi:10.1016 / j.biochi.2007.12.007. PMID 18226598.

daha fazla okuma

Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "In vitro bölgeye özgü rekombinasyon kullanılarak DNA klonlaması". Genom Res. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101 / gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, vd. (2001). "İnsan genleri ve proteinleri kataloğuna doğru: insan cDNA'larını kodlayan 500 yeni tam proteinin dizilemesi ve analizi". Genom Res. 11 (3): 422–35. doi:10.1101 / gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, vd. (2001). "Büyük ölçekli cDNA dizilemesi ile tanımlanan yeni proteinlerin sistematik hücre altı lokalizasyonu". EMBO Temsilcisi. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-raporları / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Reichert AS, Thurlow DL, Mörl M (2002). "İnsan tRNA nükleotidiltransferaz için bir öbakteriyel kaynak?". Biol. Kimya. 382 (10): 1431–8. CiteSeerX 10.1.1.657.1235. doi:10.1515 / BC.2001.176. PMID 11727826. S2CID 230616.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, vd. (2003). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin üretimi ve ilk analizi". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Augustin MA, Reichert AS, Betat H, vd. (2003). "İnsan CCA ekleme enziminin kristal yapısı: şablondan bağımsız polimerizasyona ilişkin bilgiler". J. Mol. Biol. 328 (5): 985–94. doi:10.1016 / S0022-2836 (03) 00381-4. PMID 12729736.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA ve diğerleri. (2004). "NIH tam uzunlukta cDNA projesinin durumu, kalitesi ve genişlemesi: Memeli Gen Koleksiyonu (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, vd. (2004). "ORFeome'dan biyolojiye: işlevsel bir genomik boru hattı". Genom Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10.1101 / gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, vd. (2006). "Transkripsiyonel modülasyonun çeşitlendirilmesi: insan genlerinin varsayılan alternatif promotörlerinin büyük ölçekli tanımlanması ve karakterizasyonu". Genom Res. 16 (1): 55–65. doi:10.1101 / gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, vd. (2006). "2006'daki LIFEdb veritabanı". Nükleik Asitler Res. 34 (Veritabanı sorunu): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Lizano E, Schuster J, Müller M, vd. (2007). "Değiştirilmiş aktiviteye sahip insan CCA ekleyen enzimin bir ek varyantı". J. Mol. Biol. 366 (4): 1258–65. doi:10.1016 / j.jmb.2006.12.016. PMID 17204286.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 3 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000072756 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000013736 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid10810093-5] Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (Ağu 2000). "Caenorhabditis elegans'ta evrimsel olarak korunan yeni insan genlerinin karşılaştırmalı proteomiklerle tanımlanması". Genom Res. 10 (5): 703–13. doi:10.1101 / gr.10.5.703. PMC 310876. PMID 10810093.

[pmid11504732-6] Nagaike T, Suzuki T, Tomari Y, Takemoto-Hori C, Negayama F, Watanabe K, Ueda T (Ekim 2001). "Memeli mitokondriyal tRNA nükleotidiltransferazlarının tanımlanması ve karakterizasyonu". J Biol Kimya. 276 (43): 40041–9. doi:10.1074 / jbc.M106202200. PMID 11504732.

[entrez-7] "Entrez Geni: TRNT1 tRNA nükleotidil transferaz, CCA-eklenmesi, 1".

[8] Lizano E, Scheibe M, Rammelt C, Betat H, Mörl M (Mayıs 2008). "İnsan ve E. coli'den CCA ekleyen enzimlerin karşılaştırmalı bir analizi: CCA ilavesi ve tRNA 3'-uç onarımındaki farklılıklar". Biochimie. 90 (5): 762–72. doi:10.1016 / j.biochi.2007.12.007. PMID 18226598.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]