Actinin alpha 1 - Actinin alpha 1

ACTN1
Mevcut yapılar
PDB	Ortolog araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	2EYI, 2EYN, 2N8Z, 2A8Y
Tanımlayıcılar
Takma adlar	ACTN1, BDPLT15, aktinin alfa 1
Harici kimlikler	OMIM: 102575 MGI: 2137706 HomoloGene: 55553 GeneCard'lar: ACTN1
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 14 (insan)
Son	68,979,440 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 12 (fare)
Son	80,260,371 bp
RNA ifadesi Desen
	; ; ; ;
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• kalsiyum iyonu bağlama; • protein homodimerizasyon aktivitesi; • iyon kanalı bağlama; • vinculin bağlama; • metal iyon bağlama; • integrin bağlama; • aktin filament bağlama; • GO: 0001948 protein bağlama; • liganda bağımlı nükleer reseptör transkripsiyon koaktivatör aktivitesi; • çift sarmallı RNA bağlanması; • aktin bağlama; • postynapse yapısal bileşeni;
Hücresel bileşen	• sitoplazma; • sitozol; • hücre projeksiyonu; • psödopodi; • zar; • hücreler arası bağlantı; • fokal yapışma; • karıştırmak; • hücre zarı; • hücre içi; • stres lifi; • hücre dışı bölge; • hücre birleşimi; • Z disk; • Fırça sınır; • aktin filamenti; • fasya yapışır; • hücre dışı eksozom; • hücre iskeleti; • trombosit alfa granül lümeni; • sarkomer; • hücre dışı; • glutamaterjik sinaps;
Biyolojik süreç	• apoptotik sürecin düzenlenmesi; • hücresel bileşen hareketinin negatif düzenlenmesi; • aktin filament organizasyonu; • aktin filament ağı oluşumu; • trombosit degranülasyonu; • trombosit oluşumu; • aktin filament demeti montajı; • odak yapışma montajı; • aktin çapraz bağ oluşumu; • trombosit morfogenezi; • trombosit agregasyonu; • trombosit aktivasyonu; • nükleik asit şablonlu transkripsiyonun düzenlenmesi; • postynapse organizasyonu; • nükleik asit şablonlu transkripsiyonun pozitif düzenlenmesi;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	87
	109711
	ENSG00000072110
	ENSMUSG00000015143
	P12814
	Q7TPR4
	NM_001102; NM_001130004; NM_001130005
	NM_134156; NM_001346669; NM_001379075; NM_001379076
	NP_001093; NP_001123476; NP_001123477; NP_001093.1
	NP_001333598; NP_598917; NP_001366004; NP_001366005
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

Alfa-aktin-1 bir protein insanlarda kodlanır ACTN1 gen.^[5]

Fonksiyon

Alfa aktininler, spektrin çeşitli bir grubu temsil eden gen süper ailesi hücre iskeleti proteinleri alfa ve beta spektrinleri dahil ve distrofinler. Alfa aktinin bir aktin farklı hücre tiplerinde çoklu rollere sahip bağlayıcı protein. Kas dışı hücrelerde, hücre iskeleti izoformu birlikte bulunur. mikrofilament demetler ve adherens tipi bağlantılar aktin membrana bağlanmasında rol oynadığı yer. Aksine, iskelet, kalp ve düz kas izoformları, Z-disk ve miyofibriler aktin iplikçiklerini tutturmaya yardımcı oldukları benzer yoğun cisimler. Bu gen, kas olmayan, hücre iskeleti, alfa aktinin izoformunu kodlar ve yapısal olarak benzer eritroid beta spektrin geni ile aynı bölgeye eşlenir.^[6]

Etkileşimler

Actinin, alfa 1'in etkileşim ile:

Ayrıca bakınız

Aktin

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000072110 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000015143 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ Youssoufian H, McAfee M, Kwiatkowski DJ (Temmuz 1990). "İnsan sitoskeletal alfa-aktinin geninin klonlanması ve kromozomal lokalizasyonu, beta-spektrin geniyle bağlantıyı ortaya çıkarır". Am J Hum Genet. 47 (1): 62–72. PMC 1683765. PMID 2349951.
^ "Entrez Geni: ACTN1 aktinin, alfa 1".
^ ^a ^b Dhavan R, Greer PL, Morabito MA, Orlando LR, Tsai LH (Eylül 2002). "Sikline bağımlı kinaz 5 aktivatörleri p35 ve p39, kalsiyum bağımlı bir şekilde Ca2 + / kalmodüline bağımlı protein kinaz II ve alfa-aktin-1'in alfa alt birimi ile etkileşime girer". J. Neurosci. 22 (18): 7879–91. doi:10.1523 / JNEUROSCI.22-18-07879.2002. PMC 6758084. PMID 12223541.
^ Gonzalez AM, Otey C, Edlund M, Jones JC (Aralık 2001). "Hemidesmozom bileşeni ile aktinin aile üyelerinin etkileşimleri". J. Cell Sci. 114 (Pt 23): 4197–206. PMID 11739652.
^ Bunn RC, Jensen MA, Reed BC (Nisan 1999). "GLUT1 ve hücre iskeleti arasında bir bağlantı sağlayan glikoz taşıyıcı bağlayıcı protein GLUT1CBP ile protein etkileşimleri". Mol. Biol. Hücre. 10 (4): 819–32. doi:10.1091 / mbc.10.4.819. PMC 25204. PMID 10198040.
^ Vallenius T, Luukko K, Mäkelä TP (Nisan 2000). "CLP-36 PDZ-LIM proteini, kas olmayan alfa-aktin-1 ve alfa-aktinin-4 ile birleşir". J. Biol. Kimya. 275 (15): 11100–5. doi:10.1074 / jbc.275.15.11100. PMID 10753915.
^ Bauer K, Kratzer M, Otte M, de Quintana KL, Hagmann J, Arnold GJ, Eckerskorn C, Lottspeich F, Siess W (Aralık 2000). "Bir PDZ-alanı ve LIM-alanı proteini olan İnsan CLP36, alfa-aktin-1'e bağlanır ve aktive trombositler ve endotel hücrelerinde aktin filamentleri ve stres lifleri ile birleşir". Kan. 96 (13): 4236–45. PMID 11110697.
^ Feng S, Reséndiz JC, Christodoulides N, Lu X, Arboleda D, Berndt MC, Kroll MH (Ocak 2002). "Patolojik kayma stresi, glikoprotein Ib-IX kompleksi ile ilişkili alfa-aktinin tirozin fosforilasyonunu uyarır". Biyokimya. 41 (4): 1100–8. doi:10.1021 / bi0156005. PMID 11802708.
^ Asada M, Irie K, Morimoto K, Yamada A, Ikeda W, Takeuchi M, Takai Y (Şubat 2003). "ADIP, hücre-hücre yapışma bağlantılarında lokalize edilmiş yeni bir Afadin- ve alfa-aktin bağlayıcı protein". J. Biol. Kimya. 278 (6): 4103–11. doi:10.1074 / jbc.M209832200. PMID 12446711.
^ Reinhard M, Zumbrunn J, Jaquemar D, Kuhn M, Walter U, Trueb B (Mayıs 1999). "Zyxinin alfa-aktinin bağlanma bölgesi, hücre altı ziksin lokalizasyonu ve alfa-aktinin alımı için gereklidir.". J. Biol. Kimya. 274 (19): 13410–8. doi:10.1074 / jbc.274.19.13410. PMID 10224105.
^ Li B, Trueb B (Eylül 2001). "Alfa-aktin / ziksin etkileşiminin analizi". J. Biol. Kimya. 276 (36): 33328–35. doi:10.1074 / jbc.M100789200. PMID 11423549.
^ Besco JA, Hooft van Huijsduijnen R, Frostholm A, Entertain A (2006). "Beyin açısından zenginleştirilmiş reseptör protein tirozin fosfataz rho'nun (RPTPrho / PTPRT) hücre içi substratları". Beyin Res. 1116 (1): 50–7. doi:10.1016 / j.brainres.2006.07.122. PMID 16973135.

daha fazla okuma

Snásel J, Pichová I (1997). "Konakçı hücre proteinlerinin HIV-1 proteaz tarafından bölünmesi". Folia Biol. (Praha). 42 (5): 227–30. doi:10.1007 / BF02818986. PMID 8997639.
Menko S, Philp N, Veneziale B, Walker J (1998). "İntegrinler ve geliştirme: bu reseptörler merceğin farklılaşmasını nasıl düzenleyebilir?" Ann. N. Y. Acad. Sci. 842: 36–41. doi:10.1111 / j.1749-6632.1998.tb09629.x. PMID 9599291.
Yürüker B, Niggli V (1992). "İnsan nötrofillerinde alfa-aktin ve vinculin: yapışma sırasında yeniden organizasyon ve aktin ağı ile ilişki". J. Cell Sci. 101 (2): 403–14. PMID 1629252.
Tokuue Y, Goto S, Imamura M, vd. (1992). "Tavuk iskelet kası alfa-aktin cDNA'sının kas dışı ve miyojenik hücrelere transfeksiyonu: dimerizasyon, alfa-aktininin mikrofilamentlere bağlanması için gerekli değildir". Tecrübe. Hücre Res. 197 (2): 158–67. doi:10.1016 / 0014-4827 (91) 90418-T. PMID 1720388.
Shoeman RL, Kesselmier C, Mothes E, vd. (1991). "İnsan immün yetmezlik virüsü tip 1 proteaz için viral olmayan hücresel substratlar". FEBS Lett. 278 (2): 199–203. doi:10.1016 / 0014-5793 (91) 80116-K. PMID 1991513.
Nishiyama M, Ozturk M, Frohlich M, vd. (1990). "İnsan hepatoselüler karsinomunda insan alfa-aktininin ifadesi". Kanser Res. 50 (19): 6291–4. PMID 2169343.
Millake DB, Blanchard AD, Patel B, Critchley DR (1989). "Bir insan plasental alfa-aktininin cDNA dizisi". Nükleik Asitler Res. 17 (16): 6725. doi:10.1093 / nar / 17.16.6725. PMC 318366. PMID 2780298.
Dubernard V, Faucher D, Launay JM, Legrand C (1995). "Sitoskeletal protein alfa-aktininin trombosit trombospondin bağlayıcı protein olarak belirlenmesi". FEBS Lett. 364 (2): 109–14. doi:10.1016 / 0014-5793 (95) 00362-D. PMID 7750553.
Knudsen KA, Soler AP, Johnson KR, Wheelock MJ (1995). "Alfa-aktininin kaderin / katenin hücre-hücre yapışma kompleksi ile alfa-katenin yoluyla etkileşimi". J. Hücre Biol. 130 (1): 67–77. doi:10.1083 / jcb.130.1.67. PMC 2120515. PMID 7790378.
Glück U, Ben-Ze'ev A (1995). "Alfa-aktin seviyelerinin modülasyonu, hücre hareketliliğini etkiler ve 3T3 hücrelerinde tümör oluşumunu sağlar". J. Cell Sci. 107 (7): 1773–82. PMID 7983147.
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo kapaklama: ökaryotik mRNA'ların kapak yapısını oligoribonükleotidlerle değiştirmek için basit bir yöntem". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Egerton M, Moritz RL, Druker B, vd. (1996). "70kD ısı şoku akraba proteini (Hsc70) ve alfa-aktin-1'in T lenfositlerinde yeni fosfotirozin içeren proteinler olarak tanımlanması". Biochem. Biophys. Res. Commun. 224 (3): 666–74. doi:10.1006 / bbrc.1996.1082. PMID 8713105.
Mukai H, Toshimori M, Shibata H, vd. (1997). "PKN'nin alfa-aktinin ile etkileşimi". J. Biol. Kimya. 272 (8): 4740–6. doi:10.1074 / jbc.272.8.4740. PMID 9030526.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, vd. (1997). "Tam uzunlukta zenginleştirilmiş ve 5'-uçta zenginleştirilmiş bir cDNA kitaplığının yapımı ve karakterizasyonu". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Hazan RB, Norton L (1998). "Epidermal büyüme faktörü reseptörü, E-kadherinin aktin hücre iskeleti ile etkileşimini düzenler". J. Biol. Kimya. 273 (15): 9078–84. doi:10.1074 / jbc.273.15.9078. PMID 9535896.
Bunn RC, Jensen MA, Reed BC (1999). "GLUT1 ve hücre iskeleti arasında bir bağlantı sağlayan glikoz taşıyıcı bağlayıcı protein GLUT1CBP ile protein etkileşimleri". Mol. Biol. Hücre. 10 (4): 819–32. doi:10.1091 / mbc.10.4.819. PMC 25204. PMID 10198040.
Reinhard M, Zumbrunn J, Jaquemar D, vd. (1999). "Zyxinin alfa-aktinin bağlanma bölgesi, hücre altı ziksin lokalizasyonu ve alfa-aktinin alımı için gereklidir.". J. Biol. Kimya. 274 (19): 13410–8. doi:10.1074 / jbc.274.19.13410. PMID 10224105.

Dış bağlantılar

Actinin, alfa 1 Bağlantıları olan bilgi Hücre Geçiş Ağ Geçidi
İnsan ACTN1 genom konumu ve ACTN1 gen ayrıntıları sayfası UCSC Genom Tarayıcısı.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000072110 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000015143 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid2349951-5] Youssoufian H, McAfee M, Kwiatkowski DJ (Temmuz 1990). "İnsan sitoskeletal alfa-aktinin geninin klonlanması ve kromozomal lokalizasyonu, beta-spektrin geniyle bağlantıyı ortaya çıkarır". Am J Hum Genet. 47 (1): 62–72. PMC 1683765. PMID 2349951.

[6] "Entrez Geni: ACTN1 aktinin, alfa 1".

[pmid12223541-7] Dhavan R, Greer PL, Morabito MA, Orlando LR, Tsai LH (Eylül 2002). "Sikline bağımlı kinaz 5 aktivatörleri p35 ve p39, kalsiyum bağımlı bir şekilde Ca2 + / kalmodüline bağımlı protein kinaz II ve alfa-aktin-1'in alfa alt birimi ile etkileşime girer". J. Neurosci. 22 (18): 7879–91. doi:10.1523 / JNEUROSCI.22-18-07879.2002. PMC 6758084. PMID 12223541.

[pmid11739652-8] Gonzalez AM, Otey C, Edlund M, Jones JC (Aralık 2001). "Hemidesmozom bileşeni ile aktinin aile üyelerinin etkileşimleri". J. Cell Sci. 114 (Pt 23): 4197–206. PMID 11739652.

[pmid10198040-9] Bunn RC, Jensen MA, Reed BC (Nisan 1999). "GLUT1 ve hücre iskeleti arasında bir bağlantı sağlayan glikoz taşıyıcı bağlayıcı protein GLUT1CBP ile protein etkileşimleri". Mol. Biol. Hücre. 10 (4): 819–32. doi:10.1091 / mbc.10.4.819. PMC 25204. PMID 10198040.

[pmid10753915-10] Vallenius T, Luukko K, Mäkelä TP (Nisan 2000). "CLP-36 PDZ-LIM proteini, kas olmayan alfa-aktin-1 ve alfa-aktinin-4 ile birleşir". J. Biol. Kimya. 275 (15): 11100–5. doi:10.1074 / jbc.275.15.11100. PMID 10753915.

[pmid11110697-11] Bauer K, Kratzer M, Otte M, de Quintana KL, Hagmann J, Arnold GJ, Eckerskorn C, Lottspeich F, Siess W (Aralık 2000). "Bir PDZ-alanı ve LIM-alanı proteini olan İnsan CLP36, alfa-aktin-1'e bağlanır ve aktive trombositler ve endotel hücrelerinde aktin filamentleri ve stres lifleri ile birleşir". Kan. 96 (13): 4236–45. PMID 11110697.

[pmid11802708-12] Feng S, Reséndiz JC, Christodoulides N, Lu X, Arboleda D, Berndt MC, Kroll MH (Ocak 2002). "Patolojik kayma stresi, glikoprotein Ib-IX kompleksi ile ilişkili alfa-aktinin tirozin fosforilasyonunu uyarır". Biyokimya. 41 (4): 1100–8. doi:10.1021 / bi0156005. PMID 11802708.

[pmid12446711-13] Asada M, Irie K, Morimoto K, Yamada A, Ikeda W, Takeuchi M, Takai Y (Şubat 2003). "ADIP, hücre-hücre yapışma bağlantılarında lokalize edilmiş yeni bir Afadin- ve alfa-aktin bağlayıcı protein". J. Biol. Kimya. 278 (6): 4103–11. doi:10.1074 / jbc.M209832200. PMID 12446711.

[pmid10224105-14] Reinhard M, Zumbrunn J, Jaquemar D, Kuhn M, Walter U, Trueb B (Mayıs 1999). "Zyxinin alfa-aktinin bağlanma bölgesi, hücre altı ziksin lokalizasyonu ve alfa-aktinin alımı için gereklidir.". J. Biol. Kimya. 274 (19): 13410–8. doi:10.1074 / jbc.274.19.13410. PMID 10224105.

[pmid11423549-15] Li B, Trueb B (Eylül 2001). "Alfa-aktin / ziksin etkileşiminin analizi". J. Biol. Kimya. 276 (36): 33328–35. doi:10.1074 / jbc.M100789200. PMID 11423549.

[pmid16973135-16] Besco JA, Hooft van Huijsduijnen R, Frostholm A, Entertain A (2006). "Beyin açısından zenginleştirilmiş reseptör protein tirozin fosfataz rho'nun (RPTPrho / PTPRT) hücre içi substratları". Beyin Res. 1116 (1): 50–7. doi:10.1016 / j.brainres.2006.07.122. PMID 16973135.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]