CARD9 - CARD9 - Wikipedia

CARD9
Tanımlayıcılar
Takma adlarCARD9, CANDF2, hcaspase işe alım etki alanı aile üyesi 9
Harici kimliklerOMIM: 607212 MGI: 2685628 HomoloGene: 14150 GeneCard'lar: CARD9
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 9 (insan)
Chr.Kromozom 9 (insan)[1]
Kromozom 9 (insan)
CARD9 için genomik konum
CARD9 için genomik konum
Grup9q34.3Başlat136,361,903 bp[1]
Son136,373,681 bp[1]
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_052814
NM_052813

NM_001037747

RefSeq (protein)

NP_434700
NP_434701

NP_001032836

Konum (UCSC)Chr 9: 136.36 - 136.37 MbChr 2: 26.35 - 26.36 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

Kaspaz yetiştirme alanı içeren protein 9 bir adaptör proteini of CARD-CC protein ailesi, insanlarda kodlanan CARD9 gen.[5][6] Proinflamatuar ve antiinflamatuar sitokinleri aktive etmek için patern tanıma reseptörlerinden gelen sinyallere aracılık eder, inflamasyonu ve hücreyi düzenler apoptoz. CARD9'daki homozigot mutasyonlar, Candida ve dermatofitler gibi mayalara karşı kusurlu doğal bağışıklık ile ilişkilidir.

Fonksiyon

CARD9, CARD protein ailesinin bir üyesidir ve karakteristik bir kaspaz ile ilişkili işe alım alanının (KART ). CARD, CARD'ın aktivasyonuna veya bastırılmasına katıldığı bilinen bir protein etkileşim alanıdır. kaspaz aile ve bu nedenle hücrede önemli bir düzenleyici rol oynar apoptoz. Bu protein, CARD alanıyla seçici ilişkisi ile tanımlanmıştır. BCL10 pozitif bir apoptoz düzenleyicisi ve NF-κB aktivasyon.[7] NF-κB'yi aktive eden bir BCL10 sinyalizasyon kompleksinin montajı için moleküler bir yapı iskelesi olarak işlev gördüğü düşünülmektedir. Çeşitli alternatif olarak eklenmiş transkript varyantları gözlenmiştir, ancak bunların tam uzunluktaki doğası açıkça tanımlanmamıştır.[6]

Klinik önemi

2006 yılında, Card9'un mayalara karşı doğuştan gelen bağışıklık tepkisinde önemli roller oynadığı ortaya çıktı. Card9, örüntü tanıma reseptörlerinden gelen sinyallere aracılık eder (Dektin-1 ) aşağı akış sinyal yollarına, örneğin NF-κB ve bu sayede proinflamatuar sitokinleri aktive eder (TNF, IL-23, IL-6, IL-2 ) ve bir anti-enflamatuar sitokin (IL-10 ) ve daha sonra bir enfeksiyonu temizlemek için uygun bir doğuştan ve adaptif bağışıklık tepkisi.[8]Kronik mukokutanöze otozomal resesif bir yatkınlık formu kandidiyaz 2009 yılında CARD9'daki homozigot mutasyonlarla ilişkili olduğu bulundu.[9]İranlı bir ailede bildirilen derin dermatofitoz ve Card9 eksikliği, Tunuslu, Cezayirli ve Faslı ailelerden 17 kişide keşfedilmesine yol açtı. derin dermatofitoz.[10]

CARD9 mutasyonları, aşağıdaki gibi enflamatuar hastalıklarla ilişkilendirilmiştir. Ankilozan spondilit ve enflamatuar barsak hastalığı (Crohn Hastalığı ve Ülseratif Kolit).[11] Manuel Rivas, Mark Daly ve meslektaşları tarafından genetik bir varyant olan c.IVS11 + 1G> C'nin crohn hastalığı, ülseratif kolit ve ankilozan spondilite karşı koruyucu olduğu bulundu.[12] CARD9 S12NΔ11, ekson 11'in CARD9 silindi. GWAS lokuslarının derin sekanslamasıyla tanımlanan bu alel, C-terminal kesilmiş bir protein ile sonuçlanır. Fonksiyonel bir takip çalışmasında, kemirgenlerde yeniden ifade edilen insan CARD9 izoformlarının kullanılması Kart9- / - kemik iliğinden türetilen dendritik hücreler (BMDC'ler) sitokin üretimi için değerlendirildi. Predispozan varyant CARD9 S12N'yi eksprese eden BMDC'ler, vahşi tip CARD9 eksprese eden BMDC'lere kıyasla artmış TNFa ve IL-6 üretimi gösterdi. Bunun aksine, CARD9 11 ve CARD9 S12NΔ11'in yanı sıra C-terminal kesik varyantı CARD9 V6, TNFa ve IL-6 üretiminde önemli bozulma gösterdi. CARD9 A11'in, insan ve fare dendritik hücrelerinde vahşi tip CARD9 ile birlikte ifade edildiğinde CARD9 işlevi üzerinde baskın bir negatif etkiye sahip olduğu bulunmuştur.[13]

Model organizmalar

Model organizmalar CARD9 işlevi çalışmasında kullanılmıştır. Bir koşullu nakavt fare hat aradı Kart9tm1a (EUCOMM) Hmgu üretildi Wellcome Trust Sanger Enstitüsü.[14] Erkek ve dişi hayvanlar standartlaştırılmış fenotipik ekran[15] silme işleminin etkilerini belirlemek için.[16][17][18][19] Ek taramalar gerçekleştirildi: - Derinlemesine immünolojik fenotipleme[20] - derinlemesine kemik ve kıkırdak fenotiplemesi[21]

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000187796 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000026928 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ Bertin J, Guo Y, Wang L, Srinivasula SM, Jacobson MD, Poyet JL, Merriam S, Du MQ, Dyer MJ, Robison KE, DiStefano PS, Alnemri ES (Ocak 2001). "CARD9, BCL10 / CLAP ile etkileşime giren ve NF-kappa B'yi etkinleştiren yeni bir kaspaz yetiştirme alanı içeren proteindir". J. Biol. Kimya. 275 (52): 41082–6. doi:10.1074 / jbc.C000726200. PMID  11053425.
  6. ^ a b "Entrez Gene: CARD9 kaspaz işe alım etki alanı ailesi, üye 9".
  7. ^ Bertin J, Guo Y, Wang L, Srinivasula SM, Jacobson MD, Poyet JL, Merriam S, Du MQ, Dyer MJ, Robison KE, DiStefano PS, Alnemri ES (Aralık 2000). "CARD9, BCL10 / CLAP ile etkileşime giren ve NF-kappa B'yi etkinleştiren yeni bir kaspaz yetiştirme alanı içeren proteindir". J. Biol. Kimya. 275 (52): 41082–6. doi:10.1074 / jbc.C000726200. PMID  11053425.
  8. ^ Gross O, Gewies A, Finger K, Schäfer M, Sparwasser T, Peschel C, Förster I, Ruland J (Ağu 2006). "Card9, doğuştan gelen anti-fungal bağışıklık için TLR olmayan bir sinyal yolunu kontrol eder". Doğa. 442 (7103): 651–6. Bibcode:2006Natur.442..651G. doi:10.1038 / nature04926. PMID  16862125. S2CID  4405404.
  9. ^ Glocker EO, ​​Hennigs A, Nabavi M, Schäffer AA, Woellner C, Salzer U, Pfeifer D, Veelken H, Warnatz K, Tahami F, Jamal S, Manguiat A, Rezaei N, Amirzargar AA, Plebani A, Hannesschläger N, Gross O , Ruland J, Grimbacher B (Ekim 2009). "Mantar enfeksiyonlarına yatkınlığı olan bir ailede homozigot CARD9 mutasyonu". N. Engl. J. Med. 361 (18): 1727–35. doi:10.1056 / NEJMoa0810719. PMC  2793117. PMID  19864672.
  10. ^ Lanternier F, Pathan S, Vincent QB, Liu L, Cypowyj S, Prando C, Migaud M, Taibi L, Ammar-Khodja A, Boudghene Stambouli O, Guellil B, Jacobs F, Goffard JC, Schepers K, del Marmol V, Boussofara L, Denguezli M, Larif M, Bachelez H, Michel L, Lefranc G, Hay R, Jouvion G, Chretien F, Fraitag S, Bougnoux ME, Boudia M, Abel L, Lortholary O, Casanova JL, Picard C, Grimbacher B, Puel A (2013). "Derin dermatofitoz ve kalıtsal CARD9 eksikliği". N Engl J Med. 369 (18): 1704–14. doi:10.1056 / NEJMoa1208487. PMC  4084693. PMID  24131138.
  11. ^ Evans DM, Spencer CC, Pointon JJ, Su Z, Harvey D, Kochan G, ve diğerleri. (Ağustos 2011). "Ankilozan spondilitte ERAP1 ve HLA-B27 arasındaki etkileşim, hastalığa duyarlılıkta HLA-B27 mekanizmasında peptid kullanımını ima eder". Nat. Genet. 43 (8): 761–7. doi:10.1038 / ng.873. PMC  3640413. PMID  21743469.
  12. ^ Rivas MA, Beaudoin M, Gardet A, Stevens C, Sharma Y, Zhang CK, vd. (Ekim 2011). "GWAS lokuslarının derinlemesine yeniden sıralaması, enflamatuar bağırsak hastalığı ile ilişkili bağımsız nadir varyantları tanımlar". Doğa Genetiği. 43 (11): 1066–73. doi:10.1038 / ng.952. PMC  3378381. PMID  21983784.
  13. ^ Cao Z, Conway KL, Heath RJ, Rush JS, Leshchiner ES, Ramirez-Ortiz ZG, ve diğerleri. (Ekim 2015). "Ubikitin Ligaz TRIM62, CARD9 Aracılı Anti-fungal Bağışıklığı ve Bağırsak Enflamasyonunu Düzenler". Bağışıklık. 43 (4): 715–26. doi:10.1016 / j.immuni.2015.10.005. PMC  4672733. PMID  26488816.
  14. ^ Gerdin AK (2010). "Sanger Fare Genetiği Programı: nakavt farelerin yüksek verimli karakterizasyonu". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  15. ^ a b "Uluslararası Fare Fenotipleme Konsorsiyumu".
  16. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (Haziran 2011). "Fare gen işlevinin genom çapında incelenmesi için koşullu bir nakavt kaynağı". Doğa. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / nature10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  17. ^ Dolgin E (Haziran 2011). "Fare kitaplığı nakavt edilecek". Doğa. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  18. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (Ocak 2007). "Her neden için bir fare". Hücre. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  19. ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Sanger Institute Fare Genetiği Projesi, Tannahill D, Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (2013) . "Nakavt farelerin genom çapında üretimi ve sistematik fenotiplemesi, birçok gen için yeni roller ortaya koyuyor". Hücre. 154 (2): 452–64. doi:10.1016 / j.cell.2013.06.022. PMC  3717207. PMID  23870131.
  20. ^ a b "Enfeksiyon ve Bağışıklık İmmünofenotipleme (3i) Konsorsiyumu".
  21. ^ "OBCD Konsorsiyumu".

Dış bağlantılar

daha fazla okuma