CARD alanı - CARD domain

Kaspaz işe alım alanı
PDB 3crd EBI.jpg
RAIDD CARD'ın Yapısı.[1]
Tanımlayıcılar
SembolKART
PfamPF00619
InterProIPR001315
AKILLISM00114
PROSITEPS50209
SCOP23crd / Dürbün / SUPFAM
CDDcd01671
Kaspaz işe alım alanı, IPS1 / RIG-I
Tanımlayıcılar
SembolCARD_2
PfamPF00619
InterProIPR031964
SCOP22lwd / Dürbün / SUPFAM
CDDcd08789

Kaspaz işe alım alanlarıveya kaspaz aktivasyonu ve işe alım alanları (KARTLAR), vardır etkileşim motifleri geniş bir dizi içinde bulundu proteinler, tipik olarak ilgili süreçlerde yer alanlar iltihap ve apoptoz. Bu alanlar, tek tek CARD'lar arasındaki doğrudan etkileşimler yoluyla daha büyük protein komplekslerinin oluşumuna aracılık eder. CARD alanları, helikazlar, kinazlar, mitokondriyal proteinler, kaspazlar ve diğer sitoplazmik faktörler dahil olmak üzere çarpıcı şekilde geniş bir protein yelpazesinde bulunur.

Temel özellikler

CARD alanları olarak bilinen bir protein motifi alt sınıfıdır. ölüm kıvrımı, hidrofobik bir çekirdek ve yüklü artıklardan oluşan bir dış yüz ile altı ila yedi antiparalel alfa sarmalından oluşan bir düzenlemeyi içerir. Bu sınıftaki diğer motifler şunları içerir: pyrin alanı (PYD), ölüm alanı (DD) ve ölüm efektör alanı (DED), bunların tümü aynı zamanda birincil olarak apoptoz ve enflamatuar yanıtların düzenlenmesinde de işlev görür.

Apoptozda

CARD alanları başlangıçta, kaspaz aktivasyonu ve apoptozun düzenlenmesindeki rollerine dayalı olarak karakterize edildi.[2] Alanın temel altı sarmal yapısı, en eskiye kadar korunmuş gibi görünmektedir. ced-3 ve ced-4 içindeki genler C. elegansapoptotik mekanizmanın birkaç bileşeninin ilk olarak karakterize edildiği organizma. CARD motifleri, başta apoptozu teşvik eden bir dizi protein üzerinde mevcuttur. kaspazlar Memelilerde 1,2,4,5,9 ve 15.

Memeli bağışıklık tepkisinde

IL-1 ve IL-18 işleme

Bakteriyel ve viral patojenlerin yanı sıra çeşitli endojen stres sinyallerine yanıt olarak iltihaplanmanın düzenlenmesinde bir dizi CARD proteininin rol oynadığı gösterilmiştir. Son zamanlarda, NLR proteini Ipaf-1 üzerine yapılan çalışmalar, CARD proteinlerinin bağışıklık tepkisine nasıl katıldığına dair bilgi sağlamıştır. Ipaf-1, bir N-terminal CARD alanı, bir nükleotid bağlanma alanı ve C-terminal lösin açısından zengin tekrarlar (LRR'ler) içerir ve burada bulunanlara benzer şekilde işlev gördüğü düşünülür. Toll benzeri reseptörler. Bu molekülün birincil rolü, pro-IL-1p ve pro-IL-18'in, inflammasom olarak bilinen büyük bir kompleks içinde birleşme yoluyla olgun formlarına proteolitik işlenmesinin düzenlenmesi gibi görünmektedir. Ipaf-1'in hücre içi bakteri tarafından aktivasyonu üzerine S. typhimurium veya diğer stres sinyalleri, Ipaf-1, CARD-CARD ilişkilendirmesi yoluyla bilinmeyen stokiyometride ASC ve kaspaz-1 olarak adlandırılan KART içeren bir adaptörü işe alır. Bu kompleks sırayla kaspaz-1'in otoproteolitik aktivasyonuna ve ardından IL-1-ve IL-18 olgunlaşmasına yol açar.

Antiviral sinyalleşme

Son zamanlarda, CARD proteinlerinin bir alt kümesinin, hücre içi çift sarmallıların tanınmasına katkıda bulunduğu gösterilmiştir. RNA para- ve ortomiksoviridae ve rhabdoviridae dahil olmak üzere bir dizi viral genomun ortak bir bileşeni. NLR'lerin aksine, bu proteinler RIG-I ve MDA5, ikiz N-terminali CARD alanları ve C-terminali içerir RNA helikaz çift ​​sarmallı viral RNA ile doğrudan etkileşime giren ve işleyen alanlar. Bu işlem, CARD alanlarını IPS-1 / MAVS / CARD motifiyle etkileşim için kullanılabilir hale getirir.VİZE / Cardif, mitokondriye sabitlenmiş bir aşağı akış adaptörü. IPS-1 ve RIG-I / MDA-5 arasındaki etkileşimler gösterilmesine rağmen laboratuvar ortamındaviral saptama üzerine oluşan kompleksin doğası karakterize edilmemiştir.

Adaptör protein VISA ayrıca nükleer faktör kappa-B kinaz (IKK) -protein-kinaz ailesi üyelerinin inhibitörünü aktive eder. Kanonik IKK ailesi üyeleri IKKa ve IKKb virüsle tetiklenenler için gereklidir NF-κB aktivasyon, kanonik olmayan IKK ailesi üyeleri TBK1 ve IKBKE IRF3 ve IRF7'nin fosforile edilmesinden ve etkinleştirilmesinden sorumludur (Fitzgerald ve diğerleri, 2003; Hemmi ve diğerleri, 2004; Matsui ve diğerleri, 2006). Çeşitli çalışmalar, TRAF3, TRAF6, TANK, NEMO (IKKg), TRADD, FADD ve RIP dahil olmak üzere NF-κB ve / veya IRF3'ün virüs kaynaklı aktivasyonunda başka birkaç sinyal bileşeninin rol oynadığını da göstermiştir (Kawai ve diğerleri, 2005; Michallet ve diğerleri, 2008; Oganesyan ve diğerleri, 2006; Saha ve diğerleri, 2006; Xu ve diğerleri, 2005; Zhao ve diğerleri, 2007).

Otoimmünite

Enflamasyon düzenleyicileri olarak oynadıkları rol nedeniyle, belirli CARD proteinlerinin yapısal aktivasyonunun, mutasyonla veya stres sinyallerinin sürekli mevcudiyetiyle sağlandığı, birçok enflamatuar sendromda nedensel bir rol oynadığı ileri sürülmüştür. Hücre içi NOD2 proteinindeki işlev kazanımı mutasyonları, artmış risk ile ilişkilendirilmiştir. Crohn hastalığı. En az iki ilişkili PYD içeren proteinde mutasyonları aktive etmek, kriyopirin /CIAS-1 ve pyrin / MEFV ile bağlantılı Muckle-Wells Sendromu ve ailesel Akdeniz ateşi, sırasıyla.

KART içeren proteinlerin listesi

Bu liste eksik; yardım edebilirsin eksik öğeleri eklemek ile güvenilir kaynaklar.

Referanslar

  1. ^ Chou JJ, Matsuo H, Duan H, Wagner G (Temmuz 1998). "RAIDD CARD'ın çözüm yapısı ve kaspaz-2 ve kaspaz-9 işe alımında CARD / CARD etkileşimi modeli". Hücre. 94 (2): 171–80. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81417-8. PMID  9695946. S2CID  16499945.
  2. ^ Hofmann K, Bucher P, Tschopp J (1997). "CARD alanı: yeni bir apoptotik sinyalleşme motifi". Trendler Biyokimya Bilimi. 22 (5): 155–6. doi:10.1016 / S0968-0004 (97) 01043-8. PMID  9175472.