COPG - COPG

COPG1
Mevcut yapılar
PDB	Ortolog araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	1R4X
Tanımlayıcılar
Takma adlar	COPG1, COPG, koatomer protein kompleksi alt birim gama 1, COPI kaplama kompleksi alt birim gama 1
Harici kimlikler	OMIM: 615525 MGI: 1858696 HomoloGene: 56745 GeneCard'lar: COPG1
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 3 (insan)
Son	129,277,773 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 6 (fare)
Son	87,913,595 bp
RNA ifadesi Desen
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• GO: 0001948 protein bağlama; • yapısal molekül aktivitesi;
Hücresel bileşen	• sitoplazma; • membran kaplama; • COPI kaplı vezikül membranı; • zar; • taşıma kesesi; • sitozol; • sitoplazmik vezikül; • Golgi cihazı; • Golgi zarı; • COPI vezikül kaplama; • endoplazmik retikulum zarı; • endoplazmik retikulum; • endoplazmik retikulum-Golgi ara bölmesi;
Biyolojik süreç	• retrograd vezikül aracılı nakil, Golgi'den ER'ye; • protein taşınması; • mikrotübül boyunca organel taşınması; • hücre içi protein taşınması; • Golgi yerelleştirmesinin kurulması; • ER'den Golgi vezikül aracılı nakil; • vezikül aracılı nakil; • Golgi içi vezikül aracılı nakil; • protein salgısı;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	22820
	54161
	ENSG00000181789
	ENSMUSG00000030058
	Q9Y678
	Q9QZE5
	NM_016128
	NM_017477; NM_201244
	NP_057212
	NP_059505; NP_957696
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

Koatomer alt birimi gama bir protein insanlarda kodlanır COPG gen.^[5]^[6] İçerisindeki yedi proteinden biridir. COPI vezikülleri kaplayan koatomer kompleksi Golgi karmaşık.^[5]

Etkileşimler

COPG'nin etkileşim ile Dopamin reseptörü D1,^[7] COPZ1^[5]^[8] ve COPB1.^[5]^[9]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000181789 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000030058 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ ^a ^b ^c ^d Futatsumori M, Kasai K, Takatsu H, Shin HW, Nakayama K (Şubat 2001). "COP I alt birimlerinin yeni izoformlarının tanımlanması ve karakterizasyonu". J Biochem. 128 (5): 793–801. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022817. PMID 11056392.
^ "Entrez Geni: COPG koatomer protein kompleksi, alt birim gama".
^ Bermak, Jason C; Li Ming; Bullock Clayton; Weingarten Paul; Zhou Qun-Yong (Şubat 2002). "Gamma-COP'nin D1 reseptör C-terminalindeki bir taşıma motifi ile etkileşimi". Avro. J. Hücre Biol. Almanya. 81 (2): 77–85. doi:10.1078/0171-9335-00222. ISSN 0171-9335. PMID 11893085.
^ Faulstich, D; Auerbach S; Orci L; Ravazzola M; Wegchingel S; Lottspeich F; Stenbeck G; Harter C; Wieland F T; Tschochner H (Ekim 1996). "Coatomer mimarisi: kompleks içindeki delta-COP ve protein etkileşimlerinin moleküler karakterizasyonu" (PDF). J. Hücre Biol. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 135 (1): 53–61. doi:10.1083 / jcb.135.1.53. ISSN 0021-9525. PMC 2121028. PMID 8858162.
^ Lowe, M; Kreis T E (Kasım 1996). "COP-I kaplama öncüsü olan koatomerin in vivo montajı". J. Biol. Kimya. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 271 (48): 30725–30. doi:10.1074 / jbc.271.48.30725. ISSN 0021-9258. PMID 8940050.

Dış bağlantılar

İnsan COPG1 genom konumu ve COPG1 gen ayrıntıları sayfası UCSC Genom Tarayıcısı.

daha fazla okuma

Lowe M, Kreis TE (1997). "COP-I kaplama öncüsü olan koatomerin in vivo montajı". J. Biol. Kimya. 271 (48): 30725–30. doi:10.1074 / jbc.271.48.30725. PMID 8940050.
Pavel J, Harter C, Wieland FT (1998). "Koatomerin tersinir ayrışması: bir beta / delta-kaplama protein alt kompleksinin fonksiyonel karakterizasyonu". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 95 (5): 2140–5. Bibcode:1998PNAS ... 95.2140P. doi:10.1073 / pnas.95.5.2140. PMC 19276. PMID 9482852.
Fischer KD, Helms JB, Zhao L, Wieland FT (2000). "Arf1'in COPI veziküllerinin tomurcuklanmasında rol oynayan proteinlerle etkileşimlerini araştırmak için bölgeye özgü foto çapraz bağlama". Yöntemler. 20 (4): 455–64. doi:10.1006 / meth.2000.0958. PMID 10720466.
Eugster A, Frigerio G, Dale M, Duden R (2000). "Koatomer bütünlüğü için gerekli COP I alanları ve ARF ve ARF-GAP ile yeni etkileşimler". EMBO J. 19 (15): 3905–17. doi:10.1093 / emboj / 19.15.3905. PMC 306616. PMID 10921873.
Hu RM, Han ZG, Song HD, ve diğerleri. (2000). "İnsan hipotalamus-hipofiz-adrenal ekseninde gen ekspresyon profili ve tam uzunlukta cDNA klonlaması". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 97 (17): 9543–8. Bibcode:2000PNAS ... 97.9543H. doi:10.1073 / pnas.160270997. PMC 16901. PMID 10931946.
Sullivan BM, Harrison-Lavoie KJ, Marshansky V, ve diğerleri. (2000). "RGS4 ve RGS2, koatomeri bağlar ve Golgi membranları ve hücre içi taşıma ile COPI ilişkisini inhibe eder". Mol. Biol. Hücre. 11 (9): 3155–68. doi:10.1091 / mbc.11.9.3155. PMC 14982. PMID 10982407.
Hahn Y, Lee YJ, Yun JH, ve diğerleri. (2000). "Omurgalı, böcek ve bitki evriminde klatrin olmayan kaplama proteini gama-COP'yi kodlayan genlerin kopyalanması". FEBS Lett. 482 (1–2): 31–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 02033-0. PMID 11018518. S2CID 36356269.
Paulsson KM, Kleijmeer MJ, Griffith J, vd. (2002). "Tapasin ve COPI birleşmesi, Golgi kompleksinden endoplazmik retikuluma majör histo-uyumluluk kompleksi (MHC) sınıf I moleküllerin retrograd taşınması için bir mekanizma sağlar". J. Biol. Kimya. 277 (21): 18266–71. doi:10.1074 / jbc.M201388200. PMID 11884415.
Bermak JC, Li M, Bullock C, ve diğerleri. (2002). "Gamma-COP'nin D1 reseptör C-terminalindeki bir taşıma motifi ile etkileşimi". Avro. J. Hücre Biol. 81 (2): 77–85. doi:10.1078/0171-9335-00222. PMID 11893085.
Kanzaki M, Watson RT, Hou JC, vd. (2003). "Küçük GTP bağlayıcı protein TC10, 3T3L1 adipositlerinde iki farklı filamentli aktin popülasyonunu farklı şekilde düzenler". Mol. Biol. Hücre. 13 (7): 2334–46. doi:10.1091 / mbc.01-10-0490. PMC 117317. PMID 12134073.
Xu Y, Martin S, James DE, Hong W (2003). "GS15, sözdizimi 5, GS28 ve Ykt6 ile bir SNARE kompleksi oluşturur ve Golgi cihazının erken sarnıçlarındaki trafikte rol oynar". Mol. Biol. Hücre. 13 (10): 3493–507. doi:10.1091 / mbc.E02-01-0004. PMC 129961. PMID 12388752.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, vd. (2003). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin üretimi ve ilk analizi". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Rohde HM, Cheong FY, Konrad G ve diğerleri. (2004). "İnsan fosfatidilinositol fosfataz SAC1, koatomer I kompleksi ile etkileşime girer". J. Biol. Kimya. 278 (52): 52689–99. doi:10.1074 / jbc.M307983200. PMID 14527956.
Watson PJ, Frigerio G, Collins BM ve diğerleri. (2004). "Gama-COP eklenti alanı - yapısı ve işlevi". Trafik. 5 (2): 79–88. doi:10.1111 / j.1600-0854.2004.00158.x. PMID 14690497. S2CID 24249308.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, vd. (2004). "21.243 tam uzunlukta insan cDNA'sının eksiksiz dizilemesi ve karakterizasyonu". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA ve diğerleri. (2004). "NIH tam uzunlukta cDNA projesinin durumu, kalitesi ve genişlemesi: Memeli Gen Koleksiyonu (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, vd. (2007). "İnsan protein-protein etkileşimlerinin kütle spektrometresi ile büyük ölçekli haritalanması". Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 3 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000181789 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000030058 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid11056392-5] Futatsumori M, Kasai K, Takatsu H, Shin HW, Nakayama K (Şubat 2001). "COP I alt birimlerinin yeni izoformlarının tanımlanması ve karakterizasyonu". J Biochem. 128 (5): 793–801. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022817. PMID 11056392.

[entrez-6] "Entrez Geni: COPG koatomer protein kompleksi, alt birim gama".

[pmid11893085-7] Bermak, Jason C; Li Ming; Bullock Clayton; Weingarten Paul; Zhou Qun-Yong (Şubat 2002). "Gamma-COP'nin D1 reseptör C-terminalindeki bir taşıma motifi ile etkileşimi". Avro. J. Hücre Biol. Almanya. 81 (2): 77–85. doi:10.1078/0171-9335-00222. ISSN 0171-9335. PMID 11893085.

[pmid8858162-8] Faulstich, D; Auerbach S; Orci L; Ravazzola M; Wegchingel S; Lottspeich F; Stenbeck G; Harter C; Wieland F T; Tschochner H (Ekim 1996). "Coatomer mimarisi: kompleks içindeki delta-COP ve protein etkileşimlerinin moleküler karakterizasyonu" (PDF). J. Hücre Biol. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 135 (1): 53–61. doi:10.1083 / jcb.135.1.53. ISSN 0021-9525. PMC 2121028. PMID 8858162.

[pmid8940050-9] Lowe, M; Kreis T E (Kasım 1996). "COP-I kaplama öncüsü olan koatomerin in vivo montajı". J. Biol. Kimya. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 271 (48): 30725–30. doi:10.1074 / jbc.271.48.30725. ISSN 0021-9258. PMID 8940050.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]