HHV kapsid portal proteini - HHV capsid portal protein

HHV kapsid portal proteini
Tanımlayıcılar
Organizma?
SembolUL6
UniProtP10190

HHV Kapsid Portal Proteiniveya HSV-1 UL-6 protein, protein silindirik bir portal oluşturan kapsid nın-nin Herpes simpleks virüsü (HSV-1). Protein genellikle HSV-1 UL-6 protein çünkü transkripsiyon ürünü Uçuk gen UL-6.

Herpes virüsü DNA kapsid portalı üzerinden kapside girer ve çıkar. Kapsid portalı, bir halka olarak düzenlenmiş on iki portal protein kopyasından oluşur; proteinler bir lösin fermuar dizisi amino asitler birbirlerine yapışmalarına izin veren.[1] Her biri ikosahedral kapsid, bir tepe noktasında bulunan tek bir portal içerir.[2][3]

Portal, ilk kapsid montajı sırasında oluşturulur ve iskele proteinleri procapsid'i oluşturan.[4][5][6] Kapsid neredeyse tamamlandığında, viral DNA kapside girer (yani DNA kapsüllenmiş) portal ve DNA bağlayıcı protein kompleksini içeren bir mekanizma ile bakteriyofaj sona erdirmek.[7] Birden fazla çalışma, bir evrimsel Capsid Portal Protein ile bakteriyofaj portal proteinleri arasındaki ilişki.[2][7]

Bir virüs bir hücreyi enfekte ettiğinde, viral DNA'nın kapsidden salınması gerekir. Herpes virüsü DNA'sı, kapsid portalından çıkar.[8]

HSV-1 gen U'nun genetik dizisiL-6, Herpesviridae familyasında korunur ve bu gen ailesi, "Herpesvirüs UL6 benzeri" gen ailesi olarak bilinir.[9] "UL-6 " isimlendirme yani protein genetik olarak altıncı (6) ile kodlanmıştır açık okuma çerçevesi Viral genom segmentinde bulunan "Unique-Long (UL)".

Çalışmalar

Amino asit dizisi konumuna göre çalışmalar
pUL-6 Amino asit aralığıÖzetReferans
E121, A618, Q621Nokta mutasyonları, portal montaj inhibitörü WAY-150138'e direnç kazandırırvan Zeijl et al., 2000[10]
198-295Delesyon mutantı, portalları olmayan olgunlaşmamış B-kapsidleri oluştururNellissery, et al., 2007[3]
322-416Delesyon mutantları, portallar içeren olgunlaşmamış B-kapsidleri oluştururNellissery, et al., 2007[3]
409-473
L429, L436Mutasyon çalışmaları varsayımsal lösin fermuar portal halka oluşumu için gerekliNellissery, et al., 2007[3]
R676Karboksil (C) -terminal sonuNCBI Dizisi[11]
pUL-26,5 "İskele proteini" Amino asit aralığıÖzetReferans
143-151Silme U'yu engellerL-6 portal montajıŞarkıcı, et al., 2005[6]

Dodekamerik yapı

2004 yılında yapılan araştırma kullanıldı elektron mikroskobu U tahmin etmekL-6, 11, 12, 13 ve 14 üniteli polimerleri oluşturur. dodekamerik form büyük olasılıkla bulundu.[2]

2007'de elektron mikroskopisinde yapılan iyileştirmeler, portalın U yerine on iki kapsid köşesinden birinde bulunan on iki (12) birim polimer olduğunu bulmaya izin verdi.LPortal olmayan köşelerde -19 pentamer bulundu.[1]

Lösin fermuar, proteinler arası yapışma oluşturur

U'nun silinmesini ve mutasyonunu kullanan bir çalışmaL-6 amino asit dizisi, tahmin edilen bir lösin fermuar motifindeki lösin kalıntılarının, dodekamerik halka yapısının oluşumu için gerekli olduğunu gösterdi.[3]

Kapsid montajına erken katılım

Portal birimlerin bir araya getirilmesi, viral döllerin kapsidlerinin oluşturulmasında ilk adımdır. Portalların yokluğunda bir araya getirilen kapsidlerde portallar yoktur.[4]

Kapsid iskele proteini ile etkileşim

2003 yılında jel eletroforez çalışmaları, bozulmamış UL-6 portal ortak laboratuvar ortamında viral protein U ileL-26. Bu ilişki, WAY-150138'in bu tiyoüre HHV inhibitörü kapsülleme.[5]

2006 boyunca daha fazla araştırma, kapsidin portal ile montajının U'nun etkileşimine bağlı olduğunu gösterdi.L-6 "iskele" proteini U ileL-26.5, amino asitler 143 ila 151.[6]

Terminasyon kompleksi ile etkileşim

UL-6 bir U ile ilişkiliL-15 / ULKapsid montajı sırasında -28 protein kompleksi. UL-15 / UL-28'in viral DNA ile bağlandığına ve aynı amaca hizmet ettiğine inanılıyor. sona erdirmek kapsid montajı sırasında viral DNA'yı kapsid içine paketleyerek.[7]

DNA çıkışı sırasındaki işlev

DNA, kapsidden tek bir doğrusal segmentte çıkar. DNA çıkışı U tarafından kontrol edilebilirL-6 ve sıcaklığa veya çevresel proteinlere bağlıdır.[8]

Referanslar

  1. ^ a b Cardone G, Winkler DC, Trus BL, Cheng N, Heuser JE, Newcomb WW, Brown JC, Steven AC (2007-05-10). "Herpes simpleks virüs portalının kriyo-elektron tomografisi ile yerinde görselleştirilmesi". Viroloji. 361 (2): 426–34. doi:10.1016 / j.virol.2006.10.047. PMC  1930166. PMID  17188319.
  2. ^ a b c Trus BL, Cheng N, Newcomb WW, Homa FL, Brown JC, Steven AC (Kasım 2004). "Herpes simplex virüs tip 1'in UL6 portal proteininin yapısı ve polimorfizmi". Journal of Virology. 78 (22): 12668–71. doi:10.1128 / JVI.78.22.12668-12671.2004. PMC  525097. PMID  15507654.(Makale: [1] )
  3. ^ a b c d e Nellissery JK, Szczepaniak R, Lamberti C, Weller SK (2007-06-20). "HSV-1 UL6 proteini içinde varsayılan bir lösin fermuarı, portal halka oluşumu için gereklidir". Journal of Virology. 81 (17): 8868–77. doi:10.1128 / JVI.00739-07. PMC  1951442. PMID  17581990.
  4. ^ a b Newcomb WW, Homa FL, Brown JC (Ağustos 2005). "Herpes simpleks virüs kapsid düzeneğinde erken bir aşamada portalın katılımı". Journal of Virology. 79 (16): 10540–6. doi:10.1128 / JVI.79.16.10540-10546.2005. PMC  1182615. PMID  16051846.
  5. ^ a b Newcomb WW, Thomsen DR, Homa FL, Brown JC (Eylül 2003). "Herpes simpleks virüs kapsidinin montajı: çözünür iskele-portal komplekslerinin tanımlanması ve portal içeren kapsidlerin oluşumundaki rolü". Journal of Virology. 77 (18): 9862–71. doi:10.1128 / JVI.77.18.9862-9871.2003. PMC  224603. PMID  12941896. (Makale: [2] )
  6. ^ a b c Şarkıcı GP, Newcomb WW, Thomsen DR, Homa FL, Brown JC (2005). "Portal ile etkileşim için gerekli olan herpes simpleks virüsü iskele proteinindeki bir bölgenin belirlenmesi". Journal of Virology. 79 (1): 132–9. doi:10.1128 / JVI.79.1.132-139.2005. PMC  538710. PMID  15596809.
  7. ^ a b c White CA, Stow ND, Patel AH, Hughes M, Preston VG (Haziran 2003). "Herpes Simplex Virus Type 1 Portal Protein UL6, Varsayılan Terminaz Alt Birimleri UL15 ve UL28 ile Etkileşir". Journal of Virology. 77 (11): 6351–8. doi:10.1128 / JVI.77.11.6351-6358.2003. PMC  154995. PMID  12743292.
  8. ^ a b Newcomb WW, Booy FP, Brown JC (2007-05-13). "Herpes Simplex Virüs Genomunun Soyulması". Moleküler Biyoloji Dergisi. 370 (4): 633–42. doi:10.1016 / j.jmb.2007.05.023. PMC  1975772. PMID  17540405.
  9. ^ Herpesvirus UL6, NCBI'deki Conserved Domains görünümüne benzer
  10. ^ Marja van Zeijl; Jeanette Fairhurst; Thomas R. Jones; Steven K. Vernon; John Morin; James LaRocque; Boris Feld; Bryan O'Hara; Jonathan D. Bloom; Stephen V. Johann (Ekim 2000). "Herpes Simplex Virüsü Tip 1 DNA Bölünmesini ve Enkapsülasyonunu Önleyen Yeni Tiyoüre Bileşikleri Sınıfı: UL6 Genine Direnç Haritaları". Journal of Virology. 74 (19): 9054–9061. doi:10.1128 / JVI.74.19.9054-9061.2000. PMC  102102. PMID  10982350.
  11. ^ HSV-1 ULNCBI'da -6 amino asit dizisi