Joseph DeRisi - Joseph DeRisi - Wikipedia

Joseph DeRisi
MilliyetAmerikan
gidilen okulStanford Üniversitesi, Kaliforniya Üniversitesi, Santa Cruz
BilinenViroChip, tanımlamaya çalışın SARS virüs, gen ekspresyonu Plasmodium falciparum
Bilimsel kariyer
AlanlarBiyoloji
KurumlarCalifornia Üniversitesi, San Francisco Howard Hughes Tıp Enstitüsü
Doktora danışmanıPatrick O. Brown

Joseph DeRisi bir Amerikan biyokimyacı uzmanlaşan moleküler Biyoloji, parazitoloji, genomik, viroloji, ve hesaplamalı biyoloji.

Hayat

B.A. aldı. Biyokimya ve Moleküler Biyoloji dalında (1992) Kaliforniya Üniversitesi, Santa Cruz ve Ph.D. Biyokimyada (1999) Stanford Üniversitesi.

Joseph DeRisi şu anda bir Howard Hughes Tıp Enstitüsü (HHMI) Araştırmacı ve bir Profesör ve Bölüm Başkanı Biyokimya ve Biyofizik -de California Üniversitesi, San Francisco (UCSF) ile ortak bir randevu ile California Kantitatif Biyolojik Bilimler Enstitüsü (QB3).

DeRisi'nin en bilinen başarıları ilk bütünü basmaktır genom ifade dizisi (DeRisi, JL; Iyer, VR; Brown, PO (1997). "Genomik bir ölçekte gen ifadesinin metabolik ve genetik kontrolünü keşfetmek". Bilim. 278 (5338): 680–6. Bibcode:1997Sci ... 278..680D. CiteSeerX  10.1.1.335.7937. doi:10.1126 / science.278.5338.680. PMID  9381177.), kanser hücrelerinde diferansiyel gen ekspresyonunun ilk geniş analizini gerçekleştirerek (DeRisi, J; Penland, L; Brown, PO; Bittner, ML; Meltzer, PS; Ray, M; Chen, Y; Su, YA; Trent, JM (1996). "İnsan kanserinde gen ekspresyon modellerini analiz etmek için bir cDNA mikrodizisinin kullanımı". Nat Genet. 14 (4): 457–60. doi:10.1038 / ng1296-457. PMID  8944026. S2CID  23091561.), yaşam döngüsü boyunca gen ifadesini profilleme sıtma -tek hücrelere neden olan Plasmodium falciparum,[1] onun keşfi SARS virüs,[2] ve gen hibridizasyon dizisi ve DNA dizileme teknolojilerini kullanarak öncü virüs keşfi (Wang, D; Coscoy, L; Zylberberg, M; Avila, PC; Boushey, HA; Ganem, D; DeRisi, JL (2002). "Viral patojenlerin mikro dizi temelli tespiti ve genotiplemesi". Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (24): 15687–92. Bibcode:2002PNAS ... 9915687W. doi:10.1073 / pnas.242579699. PMC  137777. PMID  12429852.). Joe ayrıca, genellikle yeni protokoller ve teknikler icat edilmeden üstesinden gelinemeyen engellerle karmaşıklaşan biyolojik sorular şeklinde ortaya çıkan herhangi bir "harika problem" ile başa çıkmasıyla da bilinir.

DeRisi kullanır mikro diziler çalışmalarında yoğun bir şekilde ve mikrodiziler için hem donanım hem de yazılım tasarladı ve inşa etti. O bir taraftarıdır açık Erişim mikroarray teknolojisine,[kaynak belirtilmeli ] ve mikrodizi işlemleri için yazılım ve protokoller içeren bir web sitesi bulundurur.[kaynak belirtilmeli ] O da bir taraftarıdır açık erişim yayınlama,[kaynak belirtilmeli ] ve içinde yayınları var Halk Kütüphanesi dergiler.[3]

DeRisi, insanlarda hastalığa neden olduğu varsayılan virüsleri (kanser, SARS, diğer solunum yolu enfeksiyonları, vb.) ve papağan ve papağanlardan bal arılarına ve boa yılanlarına kadar değişen hayvanlar. O ve bir araştırma ortağı, Don Ganem, bir parazit belirlediyseniz, Nosema ceranae, bal arıları arasındaki koloni çöküşünden sorumlu gibi görünüyor.[4] Ayrıca virüslerin insan kanserinin belirli alt kümeleriyle olan ilişkisini de ortadan kaldırdı.

Belki de en çok çağdaş küresel sağlıkla ilgili, sıtma - patojene neden olan, Plasmodium falciparum DeRisi'nin grubu, sıtmayı tedavi etmek için son derece umut verici aday ilaçlar ve sıtmayı önlemek için bir aşı modeli geliştirdi.

2004 yılında DeRisi, MacArthur adamı ("Genius" ödülü), 2008 yılında 14. Yıllık Heinz Ödülü Teknoloji, Ekonomi ve İstihdam alanında ve 2014'te Ulusal Bilimler Akademisi'nden John J. Carty Bilim İlerleme Ödülü'nü aldı. 2016 yılında Ulusal Bilimler Akademisi.[5]

O, geliştirilmesinde yer aldı ViroChip, vücut sıvılarındaki virüsleri hızlı bir şekilde tanımlamak için kullanılır. Tanımlamaya yardımcı olmak için kullanıldı Ağır akut solunum sendromu Virüs 2003 yılında. O ayrıca çevrimiçi bir platformun geliştirilmesinde yer aldı. IDseq,[6] tarafından desteklenen Chan Zuckerberg Girişimi virüsleri tanımlamak için kullanılan metagenomik sıralama veri.[7]

Ödüller

Referanslar

  1. ^ Llinas, Manuel; Bozdech, Zbynek; Wong, Edith D .; Adai, Alex T .; Derisi, Joseph L. (2006), "Üç Plasmodium falciparum suşunun karşılaştırmalı tam genom transkriptom analizi", Nükleik Asit Araştırması, 34 (4): 1166, doi:10.1093 / nar / gkj517, PMC  1380255, PMID  16493140
  2. ^ Rota, Paul A .; Oberste, M. Steven; Monroe, Stephan S .; Nix, W. Allan; Campagnoli, Ray; Icenogle, Joseph P .; Penaranda, Silvia; Bankamp, ​​Bettina; Maher, Kaija; Bellini, William J. (2003), "Şiddetli Akut Solunum Sendromu ile İlişkili Yeni Bir Koronavirüsün Karakterizasyonu", Bilim, 300 (5624): 1394, Bibcode:2003Sci ... 300.1394R, doi:10.1126 / science.1085952, PMID  12730500
  3. ^ Bozdech, Zbynek; Llinás, Manuel; Pulliam, Brian Lee; Wong, Edith D .; Zhu, Jingchun; Derisi, Joseph L. (2003), "The Transcriptome of the Intraerythrostic Developmental Cycle of Plasmodium falciparum", PLOS Biyolojisi, 1 (1): e5, doi:10.1371 / journal.pbio.0000005, PMC  176545, PMID  12929205 açık Erişim
  4. ^ "UCSF Sleuths, Kaybolan Bal Arılarının Gizemindeki Şüphelileri Tespit Eder".
  5. ^ Ulusal Bilimler Akademisi Üyeleri ve Yabancı Ortaklar Seçildi Ulusal Bilimler Akademisi'nden Haberler, Ulusal Bilimler Akademisi, 3 Mayıs 2016, arşivlendi orijinal 6 Mayıs 2016, alındı 2016-05-14.
  6. ^ Kalantar, Katrina L; Carvalho, Tiago; de Bourcy, Charles F.A; Dimitrov, Boris; Dingle, Greg; Egger, Rebecca; Han, Julie; Holmes, Olivia B; Juan, Yun-Fang; Kral Ryan; Kislyuk, Andrey (Ekim 2020). "IDseq — Metagenomik patojen tespiti ve izlemesi için açık kaynaklı bulut tabanlı bir ardışık düzen ve analiz hizmeti". GigaScience. 9 (10). doi:10.1093 / gigascience / giaa111. ISSN  2047-217X.
  7. ^ "Yoksul Ülkelerde Gizemli Hastalıkların Dibine İnmenin Daha Basit Bir Yolu". Atlantik Okyanusu. 16 Ekim 2018. Alındı 27 Kasım 2018.

Dış bağlantılar