Kringle alanı - Kringle domain
 Sığır parçası protrombin kalsiyum ile kompleks ve lizofosfatidilserin. Protein, alfa-sarmal aracılığıyla zar ile birleşir GLA alanı. Bitişik kringle alanı beta yapısaldır (sarı). | |||||||||
| Tanımlayıcılar | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sembol | Kringle | ||||||||
| Pfam | PF00051 | ||||||||
| InterPro | IPR000001 | ||||||||
| AKILLI | KR | ||||||||
| PROSITE | PDOC00020 | ||||||||
| SCOP2 | 1pk4 / Dürbün / SUPFAM | ||||||||
| OPM üst ailesi | 115 | ||||||||
| OPM proteini | 1s8p | ||||||||
| CDD | cd00108 | ||||||||
| |||||||||
Kringle Etki Alanları özerk protein alanları o büyük döngüler 3 disülfür bağı ile stabilize edilmiştir. Bunlar önemli protein - kanla protein etkileşimleri pıhtılaşma faktörler. İsim Kringle bu yapıların benzediği İskandinav hamur işlerinden geliyor.
Kringle alanları bulundu plazminojen, hepatosit büyüme faktörleri, protrombin, ve apolipoprotein (a).
Kringles her yerde bulunur kanın pıhtılaşması ve fibrinolitik proteinler. Kringle alanlarının bağlanma aracılarında (örneğin, zarlar, diğer proteinler veya fosfolipidler) ve proteolitik aktivitenin düzenlenmesinde rol oynadığına inanılmaktadır.[1][2][3] Kringle alanları[4][5][6] konformasyonu bir dizi hidrojen bağı ve küçük anti-paralel beta-yaprak parçaları ile tanımlanan üçlü döngü, 3-disülfid köprü yapısı ile karakterize edilir. MEROPS peptidaz ailesi S1A'ya ait serin proteazlar olan protrombin ve ürokinaz tipi plazminojenaktivatör dahil olmak üzere bazı plazma proteinlerinde değişen sayıda kopyada bulunurlar.
Bu alanı içeren insan proteinleri
ATF; F12; F2; HABP2; HGF; HGFAC; KREMEN1; KREMEN2;LPA; LPAL2; MST1; PIK3IP1; PLAT; PLAU; PLG; PRSS12; ROR1; ROR2;
Referanslar
- ^ Fujikawa K, McMullen BA (1985). "İnsan alfa faktörü XIIa'nın ağır zincirinin amino asit dizisi (aktive Hageman faktörü)". J. Biol. Kimya. 260 (9): 5328–5341. PMID 3886654.
- ^ Patthy L, Trexler M, Banyai L, Varadi A, Vali Z (1984). "Kringles: protein bağlanması için özelleşmiş modüller. Fibronektinin jelatin bağlayıcı bölgesinin proteazların kringle yapıları ile homolojisi". FEBS Lett. 171 (1): 131–136. doi:10.1016/0014-5793(84)80473-1. PMID 6373375. S2CID 12669742.
- ^ Atkinson RA, Williams RJ (1990). "1H nükleer manyetik rezonans spektroskopisi ve mesafe geometrisi ile insan plazminojeninden kringle 4 alanının çözüm yapısı". J. Mol. Biol. 212 (3): 541–552. doi:10.1016 / 0022-2836 (90) 90330-O. PMID 2157850.
- ^ Castellino FJ, Beals JM (1987). "İnsan plazminojeni, protrombin, doku plazminojen aktivatörü, ürokinaz ve pıhtılaşma faktörü XII'nin kringle alanları arasındaki genetik ilişkiler". J. Mol. Evol. 26 (4): 358–369. doi:10.1007 / BF02101155. PMID 3131537. S2CID 22249781.
- ^ Patthy L (1985). "Modüllerden birleştirilerek kan pıhtılaşması ve fibrinolizin proteazlarının gelişimi". Hücre. 41 (3): 657–663. doi:10.1016 / S0092-8674 (85) 80046-5. PMID 3891096. S2CID 32104232.
- ^ Takahashi K, Ikeo K, Gojobori T (1991). "İnsan ve maymun apolipoproteinindeki (a) sayısız kringle'ın evrimsel kökeni". FEBS Lett. 287 (1): 146–148. doi:10.1016/0014-5793(91)80036-3. PMID 1879523. S2CID 13366195.