PAN alanı - PAN domain

PAN_1
PDB 1hky EBI.jpg
eimeria tenella'dan bir tava modülünün çözüm yapısı
Tanımlayıcılar
SembolPAN_1
PfamPF00024
Pfam klanCL0168
InterProIPR003014
PROSITEPDOC00376
SCOP21bht / Dürbün / SUPFAM

TAVA etki alanları çok yönlülüğü yerine getiren önemli işlevsel çok yönlülüğe sahip biyolojik arabuluculuk yoluyla roller protein-protein ve protein-karbonhidrat etkileşimleri.[1] Bu alanlar bir saç tokası halkası benzer yapı, içinde bulunanlara benzer düğümler ama farklı bir modelle Disülfür bağları.

Üyelerin N-terminal alanlarının plazminojen /hepatosit büyüme faktörü ailenin elma alanları plazma prekallikrein /pıhtılaşma faktörü XI aile ve çeşitli alanlar nematod proteinler aynı modül üst ailesine, PAN modülüne aittir.[1] PAN alanı bir korunmuş üç disülfür köprüsünün çekirdeği. Ailenin bazı üyelerinde ek bir dördüncü disülfür köprüsü vardır. N- ve C-terminali alan adı.

Apple alanı ve diğer PAN alanı örnekleri 7'den oluşur β-iplikçikleri kıvrımlı bir antiparalele dönüşen çarşaf beşik α-sarmal. İki disülfür bağı, sarmalı merkezi β4 ve β5 iplikçiklerine kilitlerken, üçüncüsü, alanın N ve C terminallerini bağlar. Elma alanında, β4-β5 döngüsü ve β5-β6 geçiş döngüsü, α-heliksinden yaprağın karşı tarafında küçük bir cep oluşturur.[2]

Doğal plazminojende PAN alanı beş Kringle alanlar.[3] PAN alanı ve kringle arasındaki etkileşimler, doğal plazminojenin kuaterner kompleksinin stabilize edilmesinde kritik bir rol oynar;

Referanslar

  1. ^ a b Tordai H, Bányai L, Patthy L (Kasım 1999). "PAN modülü: plazminojen ve hepatosit büyüme faktörünün N-terminal bölgeleri, prekallikrein ailesinin elma alanları ve çok sayıda nematod proteininde bulunan yeni bir alan ile homologdur". FEBS Lett. 461 (1–2): 63–7. doi:10.1016 / s0014-5793 (99) 01416-7. PMID  10561497. S2CID  29929643.
  2. ^ Emsley J, McEwan PA, Gailani D (Nisan 2010). "XI faktörünün yapısı ve işlevi". Kan. 115 (13): 2569–77. doi:10.1182 / kan-2009-09-199182. PMC  4828079. PMID  20110423.
  3. ^ Xue Y, Bodin C, Olsson K (2012). "Doğal plazminojenin kristal yapısı, aktivasyona dirençli kompakt bir yapı ortaya çıkarır". J Thromb Haemost. 10 (7): 1385–96. doi:10.1111 / j.1538-7836.2012.04765.x. PMID  22540246.
Bu makale kamu malı metinleri içermektedir Pfam ve InterPro: IPR003014