PİKART - PYCARD - Wikipedia

PİKART
Protein PYCARD PDB 1ucp.png
Mevcut yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Takma adlarPİKART, ASC, CARD5, TMS, TMS-1, TMS1, PYD ve CARD alanlarını içeren
Harici kimliklerOMIM: 606838 MGI: 1931465 HomoloGene: 8307 GeneCard'lar: PİKART
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 16 (insan)
Chr.Kromozom 16 (insan)[1]
Kromozom 16 (insan)
PYCARD için genomik konum
PYCARD için genomik konum
Grup16p11.2Başlat31,201,486 bp[1]
Son31,203,450 bp[1]
RNA ifadesi Desen
PBB GE PYCARD 221666 s fs.png'de
Daha fazla referans ifade verisi
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_145183
NM_013258
NM_145182

NM_023258

RefSeq (protein)

NP_037390
NP_660183

NP_075747

Konum (UCSC)Chr 16: 31,2 - 31,2 MbTarih 7: 127.99 - 127.99 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

PYCARD, genellikle şöyle anılır ASC (CARD içeren Apoptozla ilişkili benek benzeri protein), bir protein insanlarda kodlanır PİKART gen.[5] Esas olarak çekirdek nın-nin monositler ve makrofajlar. Patojen enfeksiyonu durumunda ise hızla sitoplazma perinükleer uzay endoplazmik retikulum ve mitokondri ve aktivasyonunda anahtar bir adaptör proteindir. iltihaplı [6].

Tam uzunlukta ASC'nin NMR yapısı: PDB ID 2KN6 [1][7]

Fonksiyon

Bu gen, iki protein-protein etkileşim alanından oluşan bir adaptör proteini kodlar: a N terminali PYRIN-PAAD-DAPIN alanı (PYD ) ve a C terminali caspase-recruitment alan adı (KART ). PYD ve CARD alanları, enflamatuar ve inflamatuarlarda büyük sinyal komplekslerinin birleşmesine aracılık eden altı sarmallı demet ölüm alanı katlama süper ailesinin üyeleridir. apoptotik aktivasyonu yoluyla sinyal yolları kaspaz. Normal hücrelerde bu protein, sitoplazma; bununla birlikte, apoptoz geçiren hücrelerde, nükleer periferinin yakınında top benzeri kümeler oluşturur.

PYCARD dört farklı izoformlar. Genellikle kanonik PYCARD olarak anılan izoform 1 ve izoform 2, aktifleştirici izoformlardır. Birlikte yerelleştiriyorlar nükleotid oligomerizasyon alanı benzeri reseptörler (NLR'ler) ve kaspaz-1. İzoform 1'den farklı olarak, izoform 2 doğrudan IL-1β işleme yönetmeliği. İzoform 3, inhibe edici bir izoformdur, böylece yalnızca kaspaz-1 ile birlikte lokalize olur, ancak NLR'ler ile birlikte lokalize olmaz. Isoform 4, NLR sinyallemesinde bir adaptör protein olarak hareket edemez ve rolü belirsiz kalır[6].

Etkileşimler

PYCARD'ın etkileşim ile MEFV.[8]

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000103490 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000030793 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ "Entrez Gene: PYCARD PYD ve CARD alanı içeren". Alındı 18 Eylül 2010.
  6. ^ a b Dunn, JH; Fujita, M (2015). "PYCARD (PYD ve CARD alan adı içerir)". Onkoloji ve Hematolojide Genetik ve Sitogenetik Atlası (4). doi:10.4267/2042/56440. hdl:2042/56440. ISSN  1768-3262.
  7. ^ Alba, Eva de (2009-11-20). "Bir CARD (ASC) İçeren Apoptozla İlişkili Speck Benzeri Proteinin Yapısı ve Alanlar Arası Dinamikleri". Biyolojik Kimya Dergisi. 284 (47): 32932–32941. doi:10.1074 / jbc.M109.024273. ISSN  0021-9258. PMC  2781708. PMID  19759015.
  8. ^ Richards N, Schaner P, Diaz A, Stuckey J, Shelden E, Wadhwa A, Gumucio DL (Ekim 2001). "Pirin ve apoptotik benek proteini (ASC) arasındaki etkileşim, ASC kaynaklı apoptozu modüle eder". J. Biol. Kimya. 276 (42): 39320–9. doi:10.1074 / jbc.M104730200. PMID  11498534.

daha fazla okuma