Roseobacter - Roseobacter

Roseobacter
Roseobacter strain HIMB11.jpg
Roseobacter HIMB11 suşu [1]
bilimsel sınıflandırma
Alan adı:
Bakteri
Şube:
Proteobakteriler
Sınıf:
Alfaproteobakteriler
Sipariş:
Rhodobacterales
Aile:
Rhodobacteraceae
Cins:
Roseobacter
Türler
Eş anlamlı
  • Roseobacter Shiba 1991 emend. Martens vd. 2006

İçinde taksonomi, Roseobacter bir cins of Rhodobacteraceae. Roseobacter soyu, Alphaproteobacteria sınıfının {alpha} -3 alt sınıfına girer. İlk tür açıklamaları, üyeleri tanımlayan 1991'de ortaya çıktı. Roseobacter litoralis ve Roseobacter denitrificansdeniz yosunlarından izole edilmiş pembe pigmentli bakterioklorofil üreten suşlar. Roseobacter soyunun üyelerinin oynadığı rol deniz biyojeokimyasal döngüleri ve iklim değişikliği fazla tahmin edilemez. Gül karakterleri kıyıların% 25'ini oluşturuyor deniz bakterileri ve bu soyun üyeleri, deniz ortamındaki toplam karbonun önemli bir bölümünü işler.[2] Roseobacter sınıfı küresel karbon, kükürt döngüsünde önemli bir rol oynar. Ayrıca aromatik bileşikleri degrade edebilir, eser metali alabilir ve simbiyotik ilişki oluşturabilir. Roseobacter cinsi uygulama açısından biyoaktif bileşikler üretir, su ürünleri yetiştiriciliğinde, çekirdek algılamada yaygın olarak kullanılmaktadır.

Açıklama

Roseobacter, okyanustaki en bol ve çok yönlü mikroorganizmalardan biridir. Kıyıdan açık okyanuslara ve deniz buzundan deniz tabanına kadar farklı deniz habitatlarında çeşitlilik gösterirler. Deniz topluluklarının yaklaşık% 25'ini oluştururlar. Alg çiçekleri sırasında prokaryotik topluluğun% 20-30'u Roseobacter'dir.[3]

Roseobacter sınıfının üyeleri çeşitli görüntüler sergiliyor fizyolojiler ve genellikle deniz fitoplanktonları, omurgasızlar ve omurgalılar ile ya serbest yaşayan, partikül ilişkili ya da ortak ilişkiler içinde olduğu bulunmuştur.[4] Roseobacter, yaşam şekillerinde fitoplankton ile benzerdir. Her ikisi de yüzeyi kolonize eder, demiri temizler ve biyoaktif ikincil metabolitler üretir.[3]

Ortak Kümeler

Tablo 1. Tablo, yaygın Roseobacter kümelerini ve bunların yaşam alanlarını ve dağılımını göstermektedir[4].
İsimHabitatDağıtım
OCT kümesi% 90 yedeksiz klon kutup bölgesindendir% 55 klon dizisi ；% 45 izolat dizisi
CHAB-I-5 kümesiYedeksiz klonun% 56'sı kıyı deniz suyundan geliyor% 100 klon dizileri
DC5-80-3 kümesi% 79'u planktonik habitatlardan (yüzey ve derin su)% 86 klon dizileri
RGALL kümesiÖkaryotik deniz organizmalarıyla simbiyotik ilişki% 68 ekili suşlar
OBULB ve SPON kümeler% 32 oranında yedeksiz klon kıyı deniz suyundan;

Yedeksiz klonun% 29'u deniz tabanı ortamlarından geliyor

% 70 klon dizileri
NAC11-7 kümesi% 60 oranında yedeksiz klon, kıyıya yakın deniz suyundan geliyor% 88 klon dizisi
DG1128 kümesiMakroalg ve fitoplanktondan
AS-21 kümesiKıyıdaki deniz suyundan veya tortudan
TM1040 kümesi
AS-26 kümesi
ANT9093 kümesiKutup denizi buzundan, süngerlerinden, tortularından,

Genomik özellikler

Boyut

Şimdiye kadar analiz edilen Roseobacterlerin çoğu büyük genomlara sahiptir: 3.5Mbp'den 5.0Mbp'ye kadar. Bulunan en küçük, 3.06 Mbp ile Loktanella vestfoldensis SKA53 genomudur. Roseovarius sp. 5.4 Mbp ile HTCC2601. Jannaschia sp. CCS1, Silicibacter pomeroyi DSS-3 ve Silicibacter sp. Ortolog olmayan genlerin fraksiyonu olan TM1040, genomların 1 / 3'ünü oluşturur.

Plazmidler

Plazmidler Roseobacterlerde yaygın olarak görülür. Plazmitlerin boyutu 4,3 ile 821,7 Kb arasındadır. Genom içeriğinin% 20'sini oluşturabilirler. Ekolojik olarak ilgili genler, plazmitlerde kodlanmış olarak bulunabilir. Genom plastisitesi Muhtemelen eşlenik plazmitlerin sayısının yüksek olmasıyla desteklenen Roseobacterlerin çeşitliliğini ve uyarlanabilirliğini açıklamak için bir neden olabilir.

Roseobacterler için yaygın olan plazmidler doğrusal konformasyonu sergileyebilir. Bazı suşlarda, genom içeriğinde büyük oranda plazmid taşınmaktadır. Plazmitin hareketliliği suşlarda henüz incelenmemiş olsa da, Roseobacter'in fizyolojik çeşitliliğine katkıda bulunabilir.

Genom çalışmasının önemi

Roseobacter cinsi organizmaların genomlarının karşılaştırılması ve analizi önemlidir çünkü yatay gen transferi ve özel adaptasyon süreçleri. Roseobacter popülasyonu, farklı habitat türleri ile dünya çapında yaygın bir şekilde dağıldığından, Roseobacter sınıfının başarısı, yalnızca tek bir popülasyonun araştırılmasıyla açıklanamaz. Bu nedenle, bu sınıfın neden bu kadar bol olduğunu anlamanın anahtarı, tüm soydaki organizmaların genetik ve metabolik çeşitliliğini incelemektir.[5]

Ekoloji

Roseobacter soyu çoğunlukla deniz ortamında bulunur. Roseobacter'in çeşitli türlerinin her birinin kendi ekolojik nişleri vardır. Kıyı bölgelerindeki ve açık okyanuslardaki çok sayıda ekosistemden birkaç izolat ele geçirilmiştir.[5] Gül karakterleri, bakteri topluluklarının önemli bir parçasıdır. fitoplankton, makroalg ve birkaç deniz hayvanı. Gibi farklı yaşam tarzları karşılıklı ve patojenik önerilmiştir. Soyun üyeleri, ılıman ve kutup okyanuslarının her tarafına yayılmıştır ve ayrıca deniz buzu ekosistemlerinde de dikkate değerdir. Kıyı çökeltileri içinde geniş, derin pelajik okyanus ve derin deniz sedimanları. Roseobacter soyu, çok sayıda deniz ekosisteminde refahları ile ilişkilendirilebilecek çok çeşitli metabolik yeterlilik ve düzenleyici devrelere sahiptir.[6]

Evrim

Rosebacter nesli, deniz suyunda veya kıyı çökeltilerinde serbestçe yaşayan kıyı bölgelerinde bulunabilir. Bu kıyı ekosistemlerinde, Rosebacter soyu fitoplankton, makro algler ve hem karşılıklı hem de patojenik yaşam tarzları yaşayan çeşitli deniz hayvanları ile etkileşime girer. Rosebacter nesli ayrıca derin pelajik okyanusta, derin deniz çökeltilerinde ve hatta kutup okyanusunda oldukça bol miktarda bulunabilir. Çeşitli deniz habitatlarında bol bulunmalarının nedeni, çeşitli metabolik yeteneklere ve düzenleyici devrelere sahip olmalarıdır.

Ekili Gül Karakterleri

Roseobacter atasının yaklaşık 260 milyon yıl öncesine dayandığı tahmin edilmektedir. Bir ağ geçirdiler genom indirgeme büyük bir ortak ata genomundan ve ardından iki genom yeniliği ve genişleme bölümünden yanal gen transferi (LGT).[6]

İlk tahmin edilen genom genişleme bölümünün yaklaşık 250 milyon yıl önce olduğu tahmin ediliyordu. Genom genişlemesinin büyük olasılıkla dinoflagellatlar ve kokcolitoforidler gibi ökaryotik fitoplankton gruplarının yükselişinin sağladığı yeni ekolojik habitatlardan kaynaklandığı öne sürüldü.[6] Bu teori, modern gül karakterlerinin soylarının, fikosfer bu iki fitoplankton grubundan. Roseobacter soyunun atasındaki hareketlilik ve kemotaksi ile ilgili genler, reseobacter'in bu fitoplanktonları algılamasına ve ona doğru yüzmesine potansiyel olarak izin verirdi. Daha sonra Roseobacter'in bazı soylarının da diatomlarla ilişkili olduğu bulundu. Tüm dinoflagellatlar, kokcolitoforidler ve diatomlar kırmızı plastid kökenli fitoplanktonlardır ve kırmızı plastid radyasyonu ile Roseobacter genomu yeniliğinin çakışması, uyarlanabilir evrimle tutarlıdır.[6] Bununla birlikte, genom değişikliğinin mekanizması hala tanımlanmamıştır. Genom değişikliğinin ya çevresel değişimden önce meydana gelen değişimin ya da çevresel değişimin daha sonra seçici olarak tercih edilen yanal gen transfer olayının izlediği pozitif seleksiyonun hakim olduğu iki teori öne sürülmüştür.

İkinci genom yeniliğinin daha yeni olduğuna inanılıyor. Azaltılmış genomlara sahip bazal soyun, her iki genom yeniliklerinden kaçtığı ve doğrudan ortak atadan modernize edildiği tahmin ediliyor.[6] Bu nedenle, Roseobacter'lerin tamamı genom yeniliğinden geçen soyların torunları değildir. Roseobacter'in eşzamanlı olarak rekabet etmesine yardımcı olmak için gen kazanımlarının, transkripsiyonel genler, onarım genleri ve savunma mekanizması genleri gibi genlerin lehine göründüğü öne sürüldü mikrobiyal parçacıklar ve canlı yüzeylerdeki popülasyonlar. Deniz ortamında.

Yetiştirilmemiş Gül Karakterleri

De novo montajı derin dizilişten metagenomlar ve tek hücreli genom dizileme kabul edilemez düzeyde yanlış pozitif sonuçlar üretmeden yetiştirilmemiş Roseobacters üzerinde çalışmak için en iyi iki yoldur. Ve kültürlenmiş gül karakterlerine odaklanan genomik analizlerin, soyun ekolojisi hakkındaki görüşümüzü potansiyel olarak önyargılı hale getirebileceği bulundu. Yakın zamanda yapılan bir çalışmada, Kuzey Pasifik, Güney Atlantik ve Maine Körfezi'nin yüzey sularından ekilmemiş dört gül karakteri elde edildi. Bu sınıf, yüzey okyanus sularından alınan örneklerde Roseobacter sekanslarının% 35'ini temsil ediyor gibi görünmektedir. Bu Roseobacters düşük G + C içeriğine, azaltılmış kodlamayan DNA yüzdesine sahiptir ve aerodinamik genomlara sahip oldukları tahmin edilmektedir.

Çeşitlilik

Roseobacter nesli, geniş metabolik yetenekleri nedeniyle birçok deniz habitatında başarı gösterir. Muazzam var genomik ve fizyolojik farklı boyut, gen içeriğine atıfta bulunan ana sınıflar boyunca çeşitlilik, GC içeriği, ekolojik strateji ve trofik strateji. Çeşitlilik, okyanusal temel döngülerde bakteri soylarının oynadığı roller ve denizlerle olan bağlantıları nedeniyle ekolojide bir etki yaratır. ökaryotlar.[6] Roseobacter soyu, belirli kıyı bölgelerindeki bakteri hücrelerinin% 20'sini ve açık okyanus yüzey sularında% 3 ila 5'ini temsil eder.[7]

Büyük ölçüde genişleyen miktarlarda cins ve Türler kladdaki nitelendirmeler, bu organizmaların fizyolojik ve genetik çeşitliliğini gösterir. Yeni unvanları suşlar sadece şuna göre 16 sn rRNA gen dizileri artan zorluğa neden olur. Bazı türlerin bir cinse dahil olduğu kabul edilir, ancak diğerleri farklı özelliklerin iki türün ayrı tutulmasına neden olması gerektiğini savunur. Roseobacter sınıfında birkaç demet klon ve tanımlanmamış suş belirlenmiştir. Bu sınıf potansiyel için dikkate değer genetik şifre yakından ilişkili suşların korelasyonları.[5]

Fonksiyonlar

Roseobacter sınıfının üyeleri ekosistemde önemli bir rol oynar.[4]

Küresel karbon / kükürt döngüsü

Gül karakterleri küresel karbon, kükürt döngüsü ve iklim için çok önemlidir. Toplam mikrobiyal topluluk içindeki büyük oranı nedeniyle, roseobacter cinsi küresel CO2 fiksasyonuna önemli katkı sağlar. Önceki araştırmalar, Roseobacter sınıfında bazı üyelerin Aerobik adlı bir gruba ait olduğunu gösteriyor. Anoksijenik Fototroflar (AAP'ler), diğer üyeler fototrofik değildir. AAP'ler, fotosentez için oksijene ihtiyaç duyan, ancak onu üretmeyen bilinen tek organizmadır. Fototrofik olmayan üyeler CO oksidasyonu için kullanılabilirken, AAP'ler, Roseobacters aracılığıyla enerji üretebildiğinden CO2 fiksasyonu gerçekleştirebilir. aerobik anoksijenik fotosentez.[8] Roseobacter, deniz yosunları tarafından bol miktarda üretilen bir organik kükürt bileşiği olan dimetilsülfoniopropiyonatı (DMSP) parçalama yeteneğine sahiptir. Alglerin bozulması yoluyla osmolitler ayrıca iklime uygun gazı da üretebilirler dimetil sülfür (DMS).[9]

Aromatik bileşik bozunması

Roseobacter bozulabilir aromatik bileşikler ve birincil büyüme substratları olarak aromatik bileşikleri kullanabilir. Önceki araştırmalar, roseobacter'in lignin ile ilgili bileşikleri aynı şekilde bozduğunu bulmuştur. Roseobacter izolatlarında, halka bölünme dioksijenazlarının ve β-ketoadipat yolağının ilişkili genlerinin varlığı, aromatik bileşik bozunmasının ekolojisi üzerine yapılan karşılaştırmalı çalışmalar için önemli olabilir.[10]

Metal alımını izleme

Roseobacter clade alımları eser metal. Genel olarak, daha büyük Roseobacter genomları daha fazla eser metal alım çok yönlülüğüne ve daha fazla plastisiteye sahiptir, bu da filogenetik olarak benzer genomların büyük ölçüde farklı yeteneklere sahip olmasına yol açabilir. [11]Roseobacter türlerinin hem organik olarak karmaşık hem de inorganik metallerinin edinilmesi, çok çeşitli yollardan geçebilir, bu da roseobacterlerin deniz ortamında bir dizi eser metal nişlere uyum sağlayabildiğini ve işgal edebildiğini gösterir. Ayrıca, eser metal kaynaklarının mevcudiyetinin Roseobacter genom çeşitlendirmesini etkileyebileceği anlamına gelir. Roseobacter sınıfının bazı üyeleri için, eser metal düzeneği aynı zamanda değerli bir ekolojik stratejidir.[11]

Simbiyotik ve patojenik ilişkiler

Roseobacter sınıfı simbiyotik ve patojenik ilişkiler kurabilir.[12] Roseobacter türleri, çeşitli ökaryotik deniz organizmalarıyla simbiyotik ilişkiler oluşturabilir. Roseobacter filotipleri, kırmızı deniz yosunu türlerinde tanımlanmıştır. Prionit.[13] Ek olarak, Roseobacters ile yakın ilişkiler geliştirebilir Pfiesteria, bu dinoflagellatların içinde veya bunlara bağlı bulundukları yer.[14]

Patojenik ilişki, çok az araştırmaya sahip olmasına ve simbiyotik ilişkiden çok daha az yaygın olmasına rağmen, Roseobacter suşlarında da bulunmuştur. Örneğin, roseobacter soyu üyeleri ve filotiplerin, Doğu istiridyesinde juvenil istiridye hastalığının ve skleraktin mercanlarında siyah bant hastalığının nedenlerinden biri olduğu belirtilmiştir.[4]

Başvurular

Biyoaktif bileşikler

Roseobacter sınıfı çeşitli türlerde üretebilir biyoaktif bileşikler. Alg büyümesini destekleyicileri içeren bu bileşikler (örn. Oksinler ) ve yosun öldürücü bileşikler (yani, roseobacticides).[15] Ayrıca antimikrobiyal bileşikler, toksinler ve yosun öldürücü bileşikler de vardır. Bu bileşikler, farmasötik veya diğer endüstriyel uygulamalar için kullanılma potansiyeline sahiptir. Ek olarak, roseobacterin genom madenciliği ile, roseobacter'in, yeni biyoaktif bileşiklerin (örneğin yeni antibiyotikler) kaynağı olarak kullanılabilecek diğer bileşikleri de üretebildiğine inanılıyordu.

Larvikültür

Yavru ve yetişkin balıklar olgun bir bağışıklık sistemine sahipken ve aşılanabilirken, deniz balıklarının ve omurgasızların larvaları bakteriyel enfeksiyonlara yatkındır. Roseobacter sınıfından (alfa-proteobakteriler) deniz bakterileri, bakteriyel hastalıkları önlemek için antibiyotik kullanımına bir alternatif sağlamak için probiyotik bakteri olarak potansiyel göstermiştir.[16] Roseobactor, balıklar ve omurgasız larvaları arasında kullanılabileceği gibi, balıklara veya canlı yemlerine zarar vermeden balık patojenik bakterileri de antagonize etmek için de kullanılabilir.[17] Roseobacter, okyanusal bakteri-plankton topluluklarının% 15 ila 20'sini oluşturan bu kadar yüksek bolluğa sahip olduğundan, bunlar gibi biyo-jeomühendislik faaliyetleri için sentetik biyoloji şasisinin kurulması için kullanılabilirler. biyoremediasyon okyanus atık plastiği.[18]

Çekirdek algılama

Çoğu bakterinin kimyasal iletişim sistemleri vardır. Bunlar arasında, çekirdek algılama (QS), bakterilerin yayılabilir sinyaller aracılığıyla kendi popülasyon yoğunluklarını algılayıp algıladıkları bir süreçtir. Roseobacter sınıfının üyelerinde, Asil-homoserin lakton (AHL) tabanlı yetersayı algılama yaygındır: mevcut roseobakteriyel genomların% 80'inden fazlası en az bir luxI homologu kodlar.[19] Bu, ilgili deniz ortamlarına uyum sağlamada QS kontrollü düzenleyici yolların oynadığı önemli rolü göstermektedir. Tüm mevcut roseobacterial AHL tabanlı QS arasında en iyi çalışılan üç tanesi: Phaeobacter DSM17395'i inhibe eder, deniz süngeri symbiont Ruegeria sp. KLH11 ve dinoflagellate symbiont Dinoroseobacter shibae.[19] Bununla birlikte, QS mekanizmalarının ekolojik rolünü daha iyi anlamak için, QS ve daha çok çeşitlilikteki gül karakterlerinde sinyal verme süreci hakkında daha fazla araştırma yapılması gerekmektedir.[19]

Referanslar

  1. ^ Durham, BP, Grote, J., Whittaker, KA, Bender, SJ, Luo, H., Grim, SL, Brown, JM, Casey, JR, Dron, A., Florez-Leiva, L. ve Krupke, A. (2014) "Deniz alfaproteobakteriyel suşu HIMB11'in taslak genom dizisi, içinde benzersiz bir soyun ilk yetiştirilmiş temsilcisi Roseobacter klad, alışılmadık derecede küçük bir genoma sahip ". Genomik bilimlerde standartlar, 9(3): 632. doi:10.4056 / sigs.4998989.
  2. ^ Bakın NCBI Roseobacter'deki web sayfası. Verilerin çıkarılması "NCBI taksonomi kaynakları". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi. Alındı 2007-03-19.
  3. ^ a b Bentzon-Tilia M, Gram L (2017). Biyolojik inceleme. Biyoçeşitlilik ve Korumada Konular. Springer, Cham. s. 137–166. doi:10.1007/978-3-319-47935-4_7. ISBN  978-3-319-47933-0.
  4. ^ a b c d Buchan A, González JM, Moran MA (Ekim 2005). "Deniz roseobacter soyuna genel bakış". Uygulamalı ve Çevresel Mikrobiyoloji. 71 (10): 5665–77. doi:10.1128 / AEM.71.10.5665-5677.2005. PMC  1265941. PMID  16204474.
  5. ^ a b c Brinkhoff T, Giebel HA, Simon M (Haziran 2008). "Roseobacter sınıfının çeşitliliği, ekolojisi ve genomiği: kısa bir genel bakış". Mikrobiyoloji Arşivleri. 189 (6): 531–9. doi:10.1007 / s00203-008-0353-y. PMID  18253713.
  6. ^ a b c d e f Luo H, Moran MA (Aralık 2014). "Deniz Roseobacter sınıfının evrimsel ekolojisi". Mikrobiyoloji ve Moleküler Biyoloji İncelemeleri. 78 (4): 573–87. doi:10.1128 / MMBR.00020-14. PMC  4248658. PMID  25428935.
  7. ^ Moran MA, Belas R, Schell MA, González JM, Sun F, Sun S, Binder BJ, Edmonds J, Ye W, Orcutt B, Howard EC, Meile C, Palefsky W, Goesmann A, Ren Q, Paulsen I, Ulrich LE , Thompson LS, Saunders E, Buchan A (Temmuz 2007). "Deniz gülü karakterlerinin ekolojik genomiği". Uygulamalı ve Çevresel Mikrobiyoloji. 73 (14): 4559–69. doi:10.1128 / AEM.02580-06. PMC  1932822. PMID  17526795.
  8. ^ Moran MA, González JM, Kiene RP (Temmuz 2003). "Bir Bakteriyel Taksonun Denizdeki Kükürt Çevrimine Bağlanması: Marine Roseobacter Grubu Çalışmaları". Jeomikrobiyoloji Dergisi. 20 (4): 375–388. doi:10.1080/01490450303901.
  9. ^ Wagner-Döbler I, Biebl H (2006). Deniz Roseobacter soyunun "çevresel biyolojisi". Mikrobiyolojinin Yıllık İncelemesi. 60: 255–80. doi:10.1146 / annurev.micro.60.080805.142115. hdl:10033/15373. PMID  16719716.
  10. ^ Buchan A, Collier LS, Neidle EL, Moran MA (Kasım 2000). "Ekolojik olarak önemli deniz Roseobacter soyunda anahtar aromatik halka parçalayan enzim, protokatekat 3,4-dioksijenaz". Uygulamalı ve Çevresel Mikrobiyoloji. 66 (11): 4662–72. doi:10.1128 / AEM.66.11.4662-4672.2000. PMC  92364. PMID  11055908.
  11. ^ a b Hogle SL, Thrash JC, Dupont CL, Barbeau KA (Ocak 2016). "Karşıt Trofik Stratejilerle Deniz Heterotrofik Bakteriyoplankton Tarafından Metal Alımı". Uygulamalı ve Çevresel Mikrobiyoloji. 82 (5): 1613–24. doi:10.1128 / AEM.03128-15. PMC  4771312. PMID  26729720.
  12. ^ Piekarski T, Buchholz I, Drepper T, Schobert M, Wagner-Doebler I, Tielen P, Jahn D (Aralık 2009). "Roseobacter cinsi bakterilerin araştırılması için genetik araçlar". BMC Mikrobiyoloji. 9: 265. doi:10.1186/1471-2180-9-265. PMC  2811117. PMID  20021642.
  13. ^ Ashen JB, Goff LJ (Temmuz 2000). "Bir grup deniz yosunu-bakteri ortakyaşamında tür özgüllüğü ve birlikte evrimi için moleküler ve ekolojik kanıtlar". Uygulamalı ve Çevresel Mikrobiyoloji. 66 (7): 3024–30. doi:10.1128 / AEM.66.7.3024-3030.2000. PMC  92106. PMID  10877801.
  14. ^ Alavi M, Miller T, Erlandson K, Schneider R, Belas R (2001-06-01). "Pfiesteria benzeri dinoflagellat kültürleriyle ilişkili bakteri topluluğu". Çevresel Mikrobiyoloji. 3 (6): 380–396. doi:10.1046 / j.1462-2920.2001.00207.x. PMID  11472503.
  15. ^ Bentzon-Tilia M, Gram L (2017). Biyolojik inceleme. Biyoçeşitlilik ve Korumada Konular. Springer, Cham. s. 137–166. doi:10.1007/978-3-319-47935-4_7. ISBN  978-3-319-47933-0.
  16. ^ D'Alvise P (2013). Roseobacter sınıfından deniz bakterilerinin su kültürü uygulaması ve ekofizyolojisi. DTU Food.
  17. ^ Sonnenschein EC, Nielsen KF, D'Alvise P, Porsby CH, Melchiorsen J, Heilmann J, Kalatzis PG, López-Pérez M, Bunk B, Spröer C, Middelboe M, Gram L (Şubat 2017). "Roseobacter türü Ruegeria mobilis'in küresel oluşumu ve heterojenliği". ISME Dergisi. 11 (2): 569–583. doi:10.1038 / ismej.2016.111. PMC  5270555. PMID  27552638.
  18. ^ Borg Y, Grigonyte AM, Boeing P, Wolfenden B, Smith P, Beaufoy W, Rose S, Ratisai T, Zaikin A, Nesbeth DN (2016-07-07). "Roseobacter cinsi bakterileri biyojeomühendislik için sentetik biyoloji şasisi olarak kurmak için açık kaynaklı yaklaşımlar". PeerJ. 4: e2031. doi:10.7717 / peerj.2031. PMC  4941783. PMID  27441104.
  19. ^ a b c Zan J, Liu Y, Fuqua C, Hill RT (Ocak 2014). "Roseobacter sınıfında açil-homoserin lakton çekirdek algılama". Uluslararası Moleküler Bilimler Dergisi. 15 (1): 654–69. doi:10.3390 / ijms15010654. PMC  3907830. PMID  24402124.

daha fazla okuma

Dış bağlantılar