JARID1B - JARID1B

KDM5B
Mevcut yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Takma adlarKDM5B, CT31, JARID1B, PLU-1, PLU1, PPP1R98, PUT1, RBBP2H1A, RBP2-H1, lizin demetilaz 5B, MRT65
Harici kimliklerOMIM: 605393 MGI: 1922855 HomoloGene: 48448 GeneCard'lar: KDM5B
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 1 (insan)
Chr.Kromozom 1 (insan)[1]
Kromozom 1 (insan)
KDM5B için genomik konum
KDM5B için genomik konum
Grup1q32.1Başlat202,724,495 bp[1]
Son202,808,487 bp[1]
RNA ifadesi Desen
PBB GE JARID1B 201549 x fs.png'de

PBB GE JARID1B 201547 fs.png'de

PBB GE JARID1B 201548 s fs.png'de
Daha fazla referans ifade verisi
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001314042
NM_006618
NM_001347591

NM_152895

RefSeq (protein)

NP_001300971
NP_001334520
NP_006609

NP_690855

Konum (UCSC)Chr 1: 202.72 - 202.81 MbChr 1: 134,56 - 134,64 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

Lizine özgü demetilaz 5B Ayrıca şöyle bilinir histon demetilaz JARID1B bir demetilaz enzim insanlarda kodlanır KDM5B gen.[5][6][7] JARID1B, alfa-ketoglutarat bağımlı hidroksilaz üst aile.

Fonksiyon

Jarid1B (KDM5B veya PLU1 olarak da bilinir), JHDM genleri ailesindedir. Bunlar histon 3'ün 4 pozisyonundaki tri- ve di-metillenmiş lizinlerin demetilasyonundan sorumludur (H3K4me3 ve H3K4me2). Jarid1B, KDM5 alt ailesinin bir parçası olan çok alanlı bir enzimdir. Jarid1 ailesinin tamamı, H3K4 histon demetilaz aktivitesine sahip bir protein ailesidir.[8]

Jarid1B, prostat, meme ve cilt kanserinin gelişiminde rol oynamıştır ve ayrıca melanom bakımı ile ilişkilendirilmiştir. Üretilen nakavt fareler (Jarid1b - / -) yenidoğan yaşamında yaşayabilir. Bu fareler erken ölüm fenotipi, dişi farelerde doğurganlığın azalması, vücut ağırlığında azalma ve meme bezi gelişiminde bozulma sergiler. Aynı zamanda, serum östrojen seviyelerini düşürmek için hareket etti ve ergenliğin erken aşamalarında meme epitel hücresi çoğalmasının azalmasına neden oldu. Bu Jarid1b - / - fareleri, FOXA1 ve östrojen reseptörü α gibi anne gelişiminin birçok düzenleyicisinden büyük ölçüde etkilenmiş gibi görünmektedir.[9] Bununla birlikte, diğerleri, bir Jarid1B nakavt embriyolarının, solunum sistemindeki başarısızlık nedeniyle genellikle yenidoğan ölümcüllüğüne sahip olduğunu göstermiştir. Nakavt embriyoların, düzensiz kraniyal sinirler, artan ekzensefali vakaları ve göz gelişimindeki kusurlar dahil olmak üzere birkaç farklı nöral kusurlara sahip olduğu da görülmüştür.[10]

Etkileşimler

JARID1B'nin gösterdiği etkileşim ile FOXG1[11] ve PAX9.[11]

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000117139 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000042207 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ Lahoud MH, Ristevski S, Venter DJ, Jermiin LS, Bertoncello I, Zavarsek S, Hasthorpe S, Drago J, de Kretser D, Hertzog PJ, Kola I (Ağustos 2001). "Yeni bir ARID sınıfı DNA bağlayıcı protein olan Desrt'in gen hedeflemesi, büyüme geriliğine ve üreme organlarının anormal gelişimine neden olur". Genom Araştırması. 11 (8): 1327–34. doi:10.1101 / gr.168801. PMID  11483573.
  6. ^ Zhu L, Hu J, Lin D, Whitson R, Itakura K, Chen Y (Ağustos 2001). "Mrf-2 DNA bağlanma alanının dinamikleri ve DNA ile kompleks". Biyokimya. 40 (31): 9142–50. doi:10.1021 / bi010476a. PMID  11478881.
  7. ^ "Entrez Gene: JARID1B jumonji, AT zengin etkileşimli alan 1B".
  8. ^ Kristensen LH, Nielsen AL, Helgstrand C, Lees M, Cloos P, Kastrup JS, Helin K, Olsen L, Gajhede M (Haziran 2012). "KDM5B / Jarid1B / PLU1 tarafından H3K4me3 demetilasyon çalışmaları, in vitro olarak güçlü substrat tanıma ortaya koyar ve 2,4-piridin-dikarboksilik asidi bir in vitro ve hücre inhibitörü olarak tanımlar". FEBS Dergisi. 279 (11): 1905–14. doi:10.1111 / j.1742-4658.2012.08567.x. PMID  22420752.
  9. ^ Zou MR, Cao J, Liu Z, Huh SJ, Polyak K, Yan Q (Haziran 2014). "Histon demetilaz jumonji AT açısından zengin etkileşimli alan 1B (JARID1B), temel gelişimsel ve soy spesifikasyon genlerini düzenleyerek meme bezi gelişimini kontrol eder". Biyolojik Kimya Dergisi. 289 (25): 17620–33. doi:10.1074 / jbc.M114.570853. PMC  4067197. PMID  24802759.
  10. ^ Albert M, Schmitz SU, Kooistra SM, Malatesta M, Morales Torres C, Rekling JC, Johansen JV, Abarrategui I, Helin K (Nisan 2013). "Histon demetilaz Jarid1b, gelişimsel genleri anormal H3K4me3'ten koruyarak sadık fare gelişimi sağlar". PLOS Genetiği. 9 (4): e1003461. doi:10.1371 / journal.pgen.1003461. PMC  3630093. PMID  23637629.
  11. ^ a b Tan K, Shaw AL, Madsen B, Jensen K, Taylor-Papadimitriou J, Freemont PS (Haziran 2003). "İnsan PLU-1, transkripsiyon baskılama özelliklerine sahiptir ve gelişimsel transkripsiyon faktörleri BF-1 ve PAX9 ile etkileşir". Biyolojik Kimya Dergisi. 278 (23): 20507–13. doi:10.1074 / jbc.M301994200. PMID  12657635.

daha fazla okuma

Dış bağlantılar

Bu makale, Birleşik Devletler Ulusal Tıp Kütüphanesi içinde olan kamu malı.