NDUFV2 - NDUFV2

NDUFV2
Tanımlayıcılar
Takma adlarNDUFV2, CI-24k, NADH: ubikinon oksidoredüktaz çekirdek alt birimi V2, MC1DN7
Harici kimliklerOMIM: 600532 MGI: 1920150 HomoloGene: 10884 GeneCard'lar: NDUFV2
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 18 (insan)
Chr.Kromozom 18 (insan)[1]
Kromozom 18 (insan)
NDUFV2 için genomik konum
NDUFV2 için genomik konum
Grup18p11.22Başlat9,102,630 bp[1]
Son9,134,345 bp[1]
RNA ifadesi Desen
PBB GE NDUFV2 202941, fs.png'de
Daha fazla referans ifade verisi
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez

4729

72900

Topluluk

ENSG00000178127

ENSMUSG00000024099

UniProt

P19404

Q9D6J6

RefSeq (mRNA)

NM_021074

NM_001278415
NM_028388

RefSeq (protein)

NP_066552

NP_001265344
NP_082664

Konum (UCSC)Chr 18: 9,1 - 9,13 MbChr 17: 66.08 - 66.1 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

NADH dehidrojenaz [ubikinon] flavoprotein 2, mitokondriyal (NDUFV2) bir enzim insanlarda kodlanır NDUFV2 gen.[5][6] Kodlanmış protein, NDUFV2, karmaşık I'in bir alt birimidir. mitokondriyal solunum zinciri üzerinde bulunan iç mitokondriyal zar ve dahil oksidatif fosforilasyon. Mutasyonlar bu gende yer almaktadır Parkinson hastalığı, bipolar bozukluk, şizofreni ve erken başlangıçlı bir vakada bulundu hipertrofik kardiyomiyopati ve ensefalopati.[7]

Yapısı

NDUFV2 üzerinde bulunur p kol nın-nin kromozom 18 11.22 konumunda ve 9 Eksonlar.[7] NDUFV2 gen, 249'dan oluşan 27.4 kDa protein üretir. amino asitler.[8][9] Bu gen tarafından kodlanan protein olan NDUFV2, kompleks I 24 kDa alt birim ailesinin bir üyesidir. İçerir kofaktör bir için bağlayıcı site 2Fe-2S kümesi ve bir transit peptid alan adı. Protein 2 turdan oluşur, 3 beta dizileri ve 7 alfa sarmalları.[10][11] Yazılı olmayan sözde gen Bu lokusun bulunduğu yer kromozom 19.[7]

Fonksiyon

NADH-ubikinon oksidoredüktaz mitokondriyal solunum zincirinin kompleksi (kompleks I), elektronların transferini katalize eder. NADH -e ubikinon ve en az 43 alt birimden oluşur. Karmaşık yer almaktadır iç mitokondriyal zar. Bu gen, kompleks I'in 24 kDa alt birimini kodlar ve elektron transferi.[7] NDUFV2 bir oksidoredüktaz ve enzimin flavoprotein-sülfür (FP) parçasının bir bileşeni.[12] Montaj ve kataliz için gerekli olduğu düşünülmektedir.[10][11]

Katalitik aktivite

NADH + ubikinon + 5 H + (Giriş) = NAD + + ubiquinol + 4 H + (Çıkış).

NADH + alıcı = NAD + + azaltılmış alıcı.[10][11]

Klinik önemi

Mutasyonlar içinde NDUFV2 gen ile ilişkilidir Mitokondriyal Kompleks I Eksiklik olan otozomal resesif. Bu eksiklik, en yaygın enzimatik kusurdur. oksidatif fosforilasyon bozukluklar.[13][14] Mitokondriyal kompleks I eksikliği aşırı genetik heterojenlik ve mutasyondan kaynaklanabilir nükleer kodlu genler veya içinde mitokondriyal kodlu genler. Bariz yok genotip-fenotip korelasyonları ve klinik veya biyokimyasal sunumdan altta yatan temelin çıkarımı imkansız değilse de zordur.[15] Bununla birlikte, vakaların çoğuna nükleer kodlanmış genlerdeki mutasyonlar neden olur.[16][17] Ölümcül yenidoğan hastalığından yetişkin başlangıcına kadar çok çeşitli klinik bozukluklara neden olur. nörodejeneratif bozukluklar. Fenotipler Dahil etmek makrosefali ilerici ile lökodistrofi, spesifik olmayan ensefalopati, hipertrofik kardiyomiyopati, miyopati, karaciğer hastalığı, Leigh sendromu, Leber kalıtsal optik nöropati ve bazı biçimleri Parkinson hastalığı.[18]

Etkileşimler

NDUFV2'nin 102 ikili sisteme sahip olduğu gösterilmiştir protein-protein etkileşimleri 80 ortak karmaşık etkileşim dahil. NDUFV2, HSCB, CCNC, GOLM1, FAM114A2, CRMP1, KAT5, SP110.[19]

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000178127 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000024099 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ Emahazion T, Beskow A, Gyllensten U, Brookes AJ (Kasım 1998). "İnsan elektron taşıma zincirinin 15 kompleks I geninin Intron tabanlı radyasyon hibrit haritalaması". Sitogenetik ve Hücre Genetiği. 82 (1–2): 115–9. doi:10.1159/000015082. PMID  9763677. S2CID  46818955.
  6. ^ de Coo R, Buddiger P, Smeets H, Geurts van Kessel A, Morgan-Hughes J, Weghuis DO, Overhauser J, van Oost B (Nisan 1995). "Aktif insan mitokondriyal NADH'nin moleküler klonlaması ve karakterizasyonu: ubikinon oksidoredüktaz 24-kDa geni (NDUFV2) ve psödojeni". Genomik. 26 (3): 461–6. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80163-G. PMID  7607668.
  7. ^ a b c d "Entrez Geni: NDUFV2 NADH dehidrojenaz (ubikinon) flavoprotein 2, 24kDa". Bu makale, bu kaynaktan alınan metni içermektedir. kamu malı.
  8. ^ Yao, Daniel. "Kardiyak Organellar Protein Atlas Bilgi Bankası (COPaKB) —— Protein Bilgileri". amino.heartproteome.org. Alındı 2018-08-27.
  9. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (Ekim 2013). "Kardiyak proteom biyolojisi ve tıbbın uzmanlaşmış bir bilgi bankası tarafından entegrasyonu". Dolaşım Araştırması. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  10. ^ a b c "NDUFV2 - NADH dehidrojenaz [ubikinon] flavoprotein 2, mitokondriyal öncü - Homo sapiens (İnsan) - NDUFV2 geni ve proteini". www.uniprot.org. Alındı 2018-08-27. Bu makale, aşağıdaki metinleri içermektedir. 4.0 TARAFINDAN CC lisans.
  11. ^ a b c "UniProt: evrensel protein bilgi tabanı". Nükleik Asit Araştırması. 45 (D1): D158 – D169. Ocak 2017. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC  5210571. PMID  27899622.
  12. ^ Murray J, Zhang B, Taylor SW, Oglesbee D, Fahy E, Marusich MF, Ghosh SS, Capaldi RA (Nisan 2003). "Hızlı tek adımlı immüno saflaştırma ile elde edilen insan NADH dehidrojenazının alt birim bileşimi". Biyolojik Kimya Dergisi. 278 (16): 13619–22. doi:10.1074 / jbc.C300064200. PMID  12611891.
  13. ^ Kirby DM, Salemi R, Sugiana C, Ohtake A, Parry L, Bell KM, Kirk EP, Boneh A, Taylor RW, Dahl HH, Ryan MT, Thorburn DR (Eylül 2004). "NDUFS6 mutasyonları, ölümcül neonatal mitokondriyal kompleks I eksikliğinin yeni bir nedenidir". Klinik Araştırma Dergisi. 114 (6): 837–45. doi:10.1172 / JCI20683. PMC  516258. PMID  15372108.
  14. ^ McFarland R, Kirby DM, Fowler KJ, Ohtake A, Ryan MT, Amor DJ, Fletcher JM, Dixon JW, Collins FA, Turnbull DM, Taylor RW, Thorburn DR (Ocak 2004). "İnfantil mitokondriyal ensefalopati ve kompleks I eksikliğinin bir nedeni olarak mitokondriyal ND3 genindeki de novo mutasyonlar". Nöroloji Yıllıkları. 55 (1): 58–64. doi:10.1002 / ana.10787. PMID  14705112. S2CID  21076359.
  15. ^ Haack TB, Haberberger B, Frisch EM, Wieland T, Iuso A, Gorza M, Strecker V, Graf E, Mayr JA, Herberg U, Hennermann JB, Klopstock T, Kuhn KA, Ahting U, Sperl W, Wilichowski E, Hoffmann GF , Tesarova M, Hansikova H, Zeman J, Plecko B, Zeviani M, Wittig I, Strom TM, Schuelke M, Freisinger P, Meitinger T, Prokisch H (Nisan 2012). "Mitokondriyal kompleks I eksikliğinde ekzom dizileme kullanılarak moleküler tanı" (PDF). Tıbbi Genetik Dergisi. 49 (4): 277–83. doi:10.1136 / jmedgenet-2012-100846. PMID  22499348. S2CID  3177674.
  16. ^ Loeffen JL, Smeitink JA, Trijbels JM, Janssen AJ, Triepels RH, Sengers RC, van den Heuvel LP (2000). "Çocuklarda izole kompleks I eksikliği: klinik, biyokimyasal ve genetik yönler". İnsan Mutasyonu. 15 (2): 123–34. doi:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (200002) 15: 2 <123 :: AID-HUMU1> 3.0.CO; 2-P. PMID  10649489.
  17. ^ Triepels RH, Van Den Heuvel LP, Trijbels JM, Smeitink JA (2001). "Solunum zinciri kompleksi I eksikliği". Amerikan Tıbbi Genetik Dergisi. 106 (1): 37–45. doi:10.1002 / ajmg.1397. PMID  11579423.
  18. ^ Robinson BH (Mayıs 1998). "İnsan kompleksi I eksikliği: klinik spektrum ve kusurun patojenitesinde serbest oksijen radikallerinin rolü". Biochimica et Biophysica Açta (BBA) - Bioenergetics. 1364 (2): 271–86. doi:10.1016 / s0005-2728 (98) 00033-4. PMID  9593934.
  19. ^ "NDUFV2 arama terimi için 102 ikili etkileşim bulundu". IntAct Moleküler Etkileşim Veritabanı. EMBL-EBI. Alındı 2018-08-27.

daha fazla okuma

  • Pilkington SJ, Walker JE (Nisan 1989). "Mitokondriyal NADH-ubikinon redüktaz: sığır ve insan 24-kDa alt biriminin ithal öncülerinin tamamlayıcı DNA dizileri". Biyokimya. 28 (8): 3257–64. doi:10.1021 / bi00434a021. PMID  2500970.
  • Hattori N, Suzuki H, Wang Y, Minoshima S, Shimizu N, Yoshino H, Kurashima R, Tanaka M, Ozawa T, Mizuno Y (Kasım 1995). "Mitokondriyal solunum zincirinde kompleks I'in 24 kDa demir-kükürt alt birimi için insan nükleer geninin (NDUFV2) yapısal organizasyonu ve kromozomal lokalizasyonu". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi. 216 (3): 771–7. doi:10.1006 / bbrc.1995.2688. PMID  7488192.
  • Hattori N, Yoshino H, Tanaka M, Suzuki H, Mizuno Y (Nisan 1998). "Mitokondriyal kompleks I'in 24 kDa alt birim genindeki (NDUFV2) genotip ve Parkinson hastalığına duyarlılık". Genomik. 49 (1): 52–8. doi:10.1006 / geno.1997.5192. PMID  9570948.
  • Loeffen JL, Triepels RH, van den Heuvel LP, Schuelke M, Buskens CA, Smeets RJ, Trijbels JM, Smeitink JA (Aralık 1998). "NADH'nin nükleer kodlu sekiz alt biriminin cDNA'sı: ubikinon oksidoredüktaz: insan kompleksi I cDNA karakterizasyonu tamamlandı". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi. 253 (2): 415–22. doi:10.1006 / bbrc.1998.9786. PMID  9878551.
  • Bénit P, Beugnot R, Chretien D, Giurgea I, De Lonlay-Debeney P, Issartel JP, Corral-Debrinski M, Kerscher S, Rustin P, Rötig A, Munnich A (Haziran 2003). "Mitokondriyal kompleks I'in mutant NDUFV2 alt birimi erken başlangıçlı hipertrofik kardiyomiyopati ve ensefalopatiye neden olur". İnsan Mutasyonu. 21 (6): 582–6. doi:10.1002 / humu.10225. PMID  12754703. S2CID  19514743.
  • Washizuka S, Kakiuchi C, Mori K, Kunugi H, Tajima O, Akiyama T, Nanko S, Kato T (Temmuz 2003). "18p11'de mitokondriyal kompleks I alt birim gen NDUFV2'nin bipolar bozuklukla ilişkisi". Amerikan Tıbbi Genetik Dergisi. Bölüm B, Nöropsikiyatrik Genetik. 120 milyar (1): 72–8. doi:10.1002 / ajmg.b.20041. PMID  12815743. S2CID  10851458.
  • Washizuka S, Iwamoto K, Kazuno AA, Kakiuchi C, Mori K, Kametani M, Yamada K, Kunugi H, Tajima O, Akiyama T, Nanko S, Yoshikawa T, Kato T (Ekim 2004). "Japonlarda bipolar bozuklukla 18p11'de mitokondriyal kompleks I alt birim gen NDUFV2 ve Ulusal Ruh Sağlığı Enstitüsü soy ağacı". Biyolojik Psikiyatri. 56 (7): 483–9. doi:10.1016 / j.biopsych.2004.07.004. PMID  15450783. S2CID  35140676.
  • Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (Eylül 2005). "Bir insan protein-protein etkileşim ağı: proteomu açıklama için bir kaynak". Hücre. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.
  • Washizuka S, Kametani M, Sasaki T, Tochigi M, Umekage T, Kohda K, Kato T (Nisan 2006). "Japon popülasyonunda şizofreni ile 18p11'de mitokondriyal kompleks I alt birim gen NDUFV2'nin ilişkisi". Amerikan Tıbbi Genetik Dergisi. Bölüm B, Nöropsikiyatrik Genetik. 141B (3): 301–4. doi:10.1002 / ajmg.b.30285. PMID  16508936. S2CID  34154064.

Bu makale, Birleşik Devletler Ulusal Tıp Kütüphanesi içinde olan kamu malı.