SGCG - SGCG

SGCG
Tanımlayıcılar
Takma adlarSGCG, A4, DAGA4, DMDA, DMDA1, LGMD2C, MAM, SCARMD2, SCG3, TYPE, 35DAG, gamma-SG, sarkoglikan gamma, LGMDR5
Harici kimliklerOMIM: 608896 MGI: 1346524 HomoloGene: 194 GeneCard'lar: SGCG
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 13 (insan)
Chr.Kromozom 13 (insan)[1]
Kromozom 13 (insan)
SGCG için genomik konum
SGCG için genomik konum
Grup13q12.12Başlat23,180,952 bp[1]
Son23,325,165 bp[1]
RNA ifadesi Desen
PBB GE SGCG 207302 fs.png'de
Daha fazla referans ifade verisi
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_000231
NM_001378244
NM_001378245
NM_001378246

NM_011892

RefSeq (protein)

NP_000222
NP_001365173
NP_001365174
NP_001365175

NP_036022

Konum (UCSC)Tarih 13: 23.18 - 23.33 MbChr 14: 61.22 - 61.26 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

Gama-sarkoglikan bir protein insanlarda kodlanır SGCG gen.[5][6] Α ila δ-sarkoglikanlar, ağırlıklı olarak (β) veya yalnızca (α, γ ve δ) çizgili kas.[7] Bir mutasyon herhangi birinde sarkoglikan genler, muhtemelen sarkoglikan kompleksinin dengesizleşmesine bağlı olarak, diğer sarkoglikan proteinlerinde ikincil bir eksikliğe yol açabilir.[8] Α ila δ genlerinde hastalığa neden olan mutasyonlar, distrofin ile ilişkili protein (DAP) kompleksi kas hücresi zar.[9] DAP kompleksinin transmembran bileşenleri, hücre iskeleti için hücre dışı matris yetişkin olarak kas lifleri,[10] ve kas hücresi zarının bütünlüğünün korunması için gereklidir.[11]

Fonksiyon

Gama-sarkoglikan, çeşitli sarkolemmal transmembran glikoproteinlerden biridir. distrofin, muhtemelen zara bağlı hücre iskeleti ile hücre dışı matris arasında bir bağlantı sağlamak için. Proteindeki kusurlar, özellikle erken başlangıçlı otozomal resesif kas distrofisine yol açabilir. uzuv-kuşak kas distrofisi, 2C (LGMD2C) yazın.[6]

Yapısı

Gen

İnsan SGCG geni eşlemeleri kromozom 13 q12'de 100 kb DNA'yı kapsar ve 8 Eksonlar.[12]

Protein

Gama-sarkoglikan bir tip II'dir transmembran protein ve 291'den oluşur amino asitler. Hücre içi 35 amino aside sahiptir N-terminal bölgesi, 25 amino asitlik tek bir transmembran alanı ve 231 amino asit ekstra hücresel C-terminali.[8]

Klinik önemi

Sarkoglikanopatiler otozomal resesif uzuv kuşak kas distrofileri Dört sarkoglikan geninin herhangi birindeki mutasyonların neden olduğu (LGMD'ler): α (LGMD2D), β (LGMD2E), γ (LGMD2C) ve δ (LGMD2F).[7] Şiddetli çocukluk çağı otozomal resesif kas distrofisi (SCARMD), γ-sarkoglikan genindeki mikro uydu belirteçleri ile ayrılan ilerleyici bir kas kaybı bozukluğudur. Γ-sarkoglikan genindeki mutasyonlar ilk olarak Mağrip Kuzey Afrika ülkeleri,[13] γ-sarkoglikanopatinin normalden daha yüksek bir insidansa sahip olduğu. Şiddetli bir fenotipe neden olan yaygın bir mutasyon, Δ-521T, hem Mağrip popülasyonunda hem de diğer ülkelerde meydana gelir.[12] Bir Cys283Tyr mutasyonu, Çingene şiddetli bir fenotipe ve hafif bir fenotipe neden olan bir Leu193Ser mutasyonuna neden olan popülasyon.[5][14]

Etkileşimler

SGCG'nin etkileşim ile FLNC.[15][16]

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl sürüm 89: ENSG00000102683 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000035296 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ a b Piccolo F, Jeanpierre M, Leturcq F, Dodé C, Azibi K, Toutain A, Merlini L, Jarre L, Navarro C, Krishnamoorthy R, Tomé FM, Urtizberea JA, Beckmann JS, Campbell KP, Kaplan JC (Aralık 1996). "Çingenelerin gamma-sarkoglikan genindeki kurucu bir mutasyon, muhtemelen Hindistan dışına göçlerinden önce gerçekleşiyor". İnsan Moleküler Genetiği. 5 (12): 2019–22. doi:10.1093 / hmg / 5.12.2019. PMID  8968757.
  6. ^ a b "Entrez Geni: SGCG sarkoglikan, gama (35kDa distrofinle ilişkili glikoprotein)".
  7. ^ a b Noguchi S, McNally EM, Ben Othmane K, Hagiwara Y, Mizuno Y, Yoshida M, Yamamoto H, Bönnemann CG, Gussoni E, Denton PH, Kyriakides T, Middleton L, Hentati F, Ben Hamida M, Nonaka I, Vance JM, Kunkel LM, Ozawa E (Kasım 1995). "Kromozom 13 kas distrofisinde distrofin ile ilişkili protein gama-sarkoglikandaki mutasyonlar". Bilim. 270 (5237): 819–22. doi:10.1126 / science.270.5237.819. PMID  7481775.
  8. ^ a b Nowak KJ, Walsh P, Jacob RL, Johnsen RD, Peverall J, McNally EM, Wilton SD, Kakulas BA, Laing NG (Şubat 2000). "Yeni bir yanlış anlam mutasyonu ve büyük bir delesyonun neden olduğu şiddetli gama-sarkoglikanopati". Nöromüsküler Bozukluklar. 10 (2): 100–7. doi:10.1016 / s0960-8966 (99) 00063-2. PMID  10714584.
  9. ^ Vainzof M, Passos-Bueno MR, Canovas M, Moreira ES, Pavanello RC, Marie SK, Anderson LV, Bonnemann CG, McNally EM, Nigro V, Kunkel LM, Zatz M (Aralık 1996). "Altı otozomal resesif uzuv-kuşağı kas distrofisinde sarkoglikan kompleksi". İnsan Moleküler Genetiği. 5 (12): 1963–9. doi:10.1093 / hmg / 5.12.1963. PMID  8968750.
  10. ^ Ettinger AJ, Feng G, Sanes JR (Aralık 1997). "epsilon-Sarcoglycan, uzuv-kuşağı kas distrofisi 2D'de mutasyona uğramış genin geniş bir şekilde ifade edilen homologu". Biyolojik Kimya Dergisi. 272 (51): 32534–8. doi:10.1074 / jbc.272.51.32534. PMID  9405466.
  11. ^ Holt KH, Campbell KP (Aralık 1998). "Sarkoglikan kompleksinin birleşmesi. Musküler distrofi için içgörüler". Biyolojik Kimya Dergisi. 273 (52): 34667–70. doi:10.1074 / jbc.273.52.34667. PMID  9856984.
  12. ^ a b McNally EM, Duggan D, Gorospe JR, Bönnemann CG, Fanin M, Pegoraro E, Lidov HG, Noguchi S, Ozawa E, Finkel RS, Cruse RP, Angelini C, Kunkel LM, Hoffman EP (Kasım 1996). "Gama-sarkoglikanın karboksil terminalini bozan mutasyonlar, kas distrofisine neden olur". İnsan Moleküler Genetiği. 5 (11): 1841–7. doi:10.1093 / hmg / 5.11.1841. PMID  8923014.
  13. ^ el Kerch F, Sefiani A, Azibi K, Boutaleb N, Yahyaoui M, Bentahila A, Vinet MC, Leturcq F, Bachner L, Beckmann J (Nisan 1994). "Fas'ta şiddetli çocukluk çağı otozomal resesif kas distrofisi olan ailelerin bağlantı analizi, hastalığın Kuzey Afrika'daki genetik homojenliğini gösteriyor". Tıbbi Genetik Dergisi. 31 (4): 342–3. doi:10.1136 / jmg.31.4.342. PMC  1049813. PMID  8071965.
  14. ^ van der Kooi AJ, de Visser M, van Meegen M, Ginjaar HB, van Essen AJ, Jennekens FG, Jongen PJ, Leschot NJ, Bolhuis PA (Haziran 1998). "Çocukluk çağında başlayan, yavaş ilerleyen uzuv kuşağı kas distrofisine neden olan yeni bir gama-sarkoglikan mutasyonu". Nöromüsküler Bozukluklar. 8 (5): 305–8. doi:10.1016 / s0960-8966 (98) 00040-6. PMID  9673983.
  15. ^ Guyon JR, Kudryashova E, Potts A, Dalkilic I, Brosius MA, Thompson TG, Beckmann JS, Kunkel LM, Spencer MJ (Ekim 2003). "Calpain 3, filamin C'yi ayırır ve gama- ve delta-sarkoglikanlarla etkileşime girme yeteneğini düzenler". Kas Siniri. 28 (4): 472–83. doi:10.1002 / mus.10465. PMID  14506720.
  16. ^ Thompson TG, Chan YM, Hack AA, Brosius M, Rajala M, Lidov HG, McNally EM, Watkins S, Kunkel LM (Ocak 2000). "Filamin 2 (FLN2): Kas-spesifik bir sarkoglikan etkileşimli protein". J. Hücre Biol. 148 (1): 115–26. doi:10.1083 / jcb.148.1.115. PMC  3207142. PMID  10629222.

daha fazla okuma

Dış bağlantılar