STAXI RNA motifi - STAXI RNA motif - Wikipedia
| STAXI RNA | |
|---|---|
 STAXI RNA'ların konsensüs sekonder yapısı | |
| Tanımlayıcılar | |
| Sembol | STAXI |
| Rfam | RF01728 |
| Diğer veri | |
| RNA tip | sRNA |
| Alan (lar) | Enterobakteriyeller |
| PDB yapılar | PDBe |
Ssbp, Topoizomeraz, Kısıtlama Önleme, XerDC Integrase RNA motifi (STAXI RNA motifi) korunmuştur RNA benzeri yapı kullanılarak tanımlandı biyoinformatik.[1] STAXI RNA'ları, genler kodlama proteinler ile etkileşime giren DNA (Ssbp, topoizomeraz, XerDC bütünleştirmek ) veya bu tür proteinlerle ilişkilidir (kısıtlama önleme inhibe eden proteinler Kısıtlama enzimleri ). Bu gözlem, STAXI motifinin örneklerinin tek iplikli DNA molekülleri olarak işlev görme olasılığını artırdı, belki de DNA kopyalama veya DNA onarımı. Öte yandan, STAXI motifleri genellikle kararlı UNCG'ye uyan terminal döngüleri içerir. tetraloop, ancak bu tetraloop'un (TNCG) DNA versiyonu özellikle kararlı değildir. STAXI motifi, basit bir pseudoknot iki veya daha fazla kez tekrarlanan yapı (diyagrama bakınız).
Aynı çalışmada, aşağıdakiler dahil bir dizi başka RNA da tanımlanmıştır:
- Bacteroidales-1 RNA motifi
- Chlorobi-1 RNA motifi
- JUMPstart RNA motifi
- Lactis-plazmid RNA motifi
- Ocean-V RNA motifi
- potC RNA motifi
- psaA RNA motifi
- TwoAYGGAY RNA motifi
- ykkC-yxkD lideri
Referanslar
- ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J, vd. (Mart 2010). "Karşılaştırmalı genomik, bakteriler, arkeler ve bunların metagenomlarından 104 aday yapılandırılmış RNA ortaya koyuyor". Genom Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC 2864571. PMID 20230605.
Dış bağlantılar
 | Bu moleküler veya hücre Biyolojisi makale bir Taslak. Wikipedia'ya şu şekilde yardım edebilirsiniz: genişletmek. |