Ekpoma virüsü - Ekpoma virus
| Ekpoma virüsleri | |
|---|---|
bilimsel sınıflandırma | |
| (rütbesiz): | Virüs |
| Diyar: | Riboviria |
| Krallık: | Orthornavirae |
| Şube: | Negarnaviricota |
| Sınıf: | Monjiviricetes |
| Sipariş: | Mononegavirales |
| Aile: | Rhabdoviridae |
| Cins: | Tibrovirüs |
| Dahil edilen gruplar[1] | |
| Cladistically dahil ancak geleneksel olarak hariç tutulmuş taksonlar[1] | |
Ekpoma virüsleri, dahil olmak üzere Ekpoma 1 tibrovirüs (EKV-1) ve Ekpoma 2 tibrovirüs (EKV-2), yetim virüsler herhangi bir hastalıkla ilişkili değildir. Onlar negatif anlamlı RNA virüsleri ve üyeleri rabdovirüs aile. Her iki virüs de 2015 yılında Türkiye'de yaşayan iki sağlıklı kadından alınan kan örneklerinde keşfedildi. Ekpoma, Nijerya.[2] EKV-2 yaygın görünmektedir ve Ekpoma'da ve çevresinde yaşayan insanların ~% 45'i daha önce maruz kalmıştır.[2] Her iki virüs de çok geniş hücresel tropizme ve çok çeşitli insan kanserini enfekte etme yeteneğine sahiptir. hücre hatları.[3] Hiçbir virüs izole edilmedi, bu da araştırmayı engelliyor.
Keşif
EKV-1 ve EKV-2, plazma sırasıyla 45 yaşında bir kadından ve 19 yaşında bir kadından örnekler. Her iki kadın da herhangi bir hastalık belirtisi göstermedi ve 2015 raporuna göre, numuneler kontrol olarak daha büyük bir metagenomik ders çalışma. Virüsler kullanılarak tanımlandı Yeni nesil sıralama.
Klinik Hastalık
EKV-1 ve EKV-2, herhangi bir hastalıkla ilişkisi olmayan öksüz virüslerdir. 2015 raporuna göre EKV-1 ile enfekte kadın, numunesinin alınmasını takip eden haftalarda veya aylarda herhangi bir hastalık dönemini hatırlayamadı. EKV-2 ile enfekte kadın, numune alımından birkaç hafta sonra ortaya çıkan ateşi hatırladı. Teşhis edildi ve tedavi edildi sıtma.
Viremia
titreler nın-nin Viremia kadınlarda gözlenen 45.000 RNA kopya / mL plazma (EKV-2) ile 4.5 milyon RNA kopya / mL plazma (EKV-1) arasında değişmektedir.
Yaygınlık
Araştırmacılar enzim bağlantılı bir immünosorbent testi kullandı (ELISA ) tespit etmek için antikorlar tanıyan nükleokapsid EKV-1/2 proteini. Ekpoma ve çevresinde yaşayan insanların% 5'inin EKV-1'e ve% 45'inin EKV-2'ye maruz kaldığını bildirdiler.
Aktarma
doğal rezervuar ve EKV-1/2 için iletim modu bilinmemektedir. Doğal rezervuara göre ve vektör diğeri için tibrovirüsler araştırmacılar varsaydı ki ısıran midges virüsleri insanlara aktarabilir.[4]
Genetik şifre
Yayınlanan genomlar EKV-1 ve EKV-2 tam değil. Bununla birlikte, mevcut diziye bağlı olarak, genom tipik beş açık okuma çerçeveleri tüm rabdovirüslerde (N, P, M, G ve L) mevcuttur. Virüsler ayrıca, bilinmeyen işlevin üç açık okuma çerçevesini (U1, U2 ve U3) içerir. U3'ün bir viroporin diğer viroporinlere sekans benzerliğine dayanır.[5]
Genetik ıraksama
EKV-1 ve EKV-2 güneybatı Nijerya'daki aynı köyde keşfedilmiş olsalar da, sadece% 33 genel homolojiyi paylaşıyorlar. amino asit seviyesi.
İki virüs arasındaki dikkate değer bir fark, virüsün uzunluğundadır. fosfoprotein (P). EKV-1 fosfoprotein, EKV-2 fosfoproteinden 115 daha fazla amino asit içerir.
Ayrıca, zarf glikoprotein. EKV-1 ve EKV-2 zarf glikoproteinleri, amino asit seviyesinde sadece% 27 özdeştir.
Çoğaltma
EKV-1 ve EKV-2 hücresel reseptörler tanımlanmadı. Bununla birlikte, EKV-1 ve EKV-2 tropizmi kullanılarak incelenmiştir. rekombinant veziküler stomatit virüsü EKV-1 veya EKV-2 glikoproteinlerini ifade eden (VSV). EKV-1 ve EKV-2 glikoproteinlerini ifade eden VSV parçacıkları, doğal VSV glikoproteininden daha iyi performans gösterir. Bu parçacıklar, çok çeşitli insan ve insan dışı hücrelere girebilir.[3]
Parçacık girişinden sonraki çoğaltma yaşam döngüsündeki adımlar açıklığa kavuşturulmamıştır.
Referanslar
- ^ a b "Virüs Taksonomisi: 2018b Sürümü" (html). Uluslararası Virüs Taksonomisi Komitesi (ICTV). Mart 2019. Alındı 3 Şubat 2020.
- ^ a b Stremlau MH, Andersen KG, Folarin OA, vd. Batı Afrika'dan sağlıklı bireylerin kanında yeni rabdovirüslerin keşfi. PLoS Negl Trop Dis. 2015; 9 (3): e0003631. Yayınlandı 2015 Mart 17. Doi: 10.1371 / journal.pntd.0003631
- ^ a b Caì Y, Yú S, Jangra RK, ve diğerleri. İnsan, İnsan Olmayan Primat ve Yarasa Hücreleri, Tibrovirüs Partikül Hücresi Girişine Genel Olarak Duyarlıdır. Ön Mikrobiyol. 2019; 10: 856. Yayınlanan 2019 Nisan 26. doi: 10.3389 / fmicb.2019.00856
- ^ Gubala A, Davis S, Weir R, Melville L, Cowled C, Boyle D. Tibrogargan ve Coastal Plains rabdovirüsleri: genomik karakterizasyon, yeni genlerin evrimi ve Avustralya çiftlik hayvanlarında seroprevalans J Gen Virol. 2011; 92 (Pt 9): 2160–2170. doi: 10.1099 / vir.0.026120-0
- ^ Walker PJ, Firth C, Widen SG, vd. Rabdoviridae'de genom boyutunun ve karmaşıklığının evrimi. PLoS Pathog. 2015; 11 (2): e1004664. 13 Şubat 2015 tarihinde yayınlandı. Doi: 10.1371 / journal.ppat.1004664