Sıralı hayvan genomlarının listesi - List of sequenced animal genomes

Bu sıralı hayvan genomlarının listesi tam genom dizilerinin bir araya getirildiği, açıklandığı ve yayınlandığı hayvan türlerini içerir. Büyük ölçüde eksiksiz taslak genomlar dahildir, ancak kısmi genom dizileri veya yalnızca organel dizileri dahil değildir.

Bu liste eksik; yardım edebilirsin eksik öğeleri eklemek ile güvenilir kaynaklar.

Porifera

Ctenophora

Placozoa

Cnidaria

Döterostomi

Hemikordatlar

Ekinodermler

Tunikatlar

Cephalochordates

Siklostomlar

Kıkırdaklı balık

Kemikli balık

Amfibiler

Sürüngenler

Kuş

Memeliler

Protostomia

Haşarat

Kabuklular

Şeliserler

Hangi Arachnids:

Myriapoda

Tardigrades

Yumuşakçalar

Platyhelmintler

Nematodlar

Annelids

Brakiyopoda

Rotifera

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ Srivastava M, Simakov O, Chapman J, Fahey B, Gauthier ME, Mitros T, ve diğerleri. (Ağustos 2010). "Amphimedon queenslandica genomu ve hayvan karmaşıklığının evrimi". Doğa. 466 (7307): 720–6. Bibcode:2010Natur.466..720S. doi:10.1038 / nature09201. PMC  3130542. PMID  20686567.
  2. ^ a b Ryu T, Seridi L, Moitinho-Silva L, Oates M, Liew YJ, Mavromatis C, ve diğerleri. (Şubat 2016). "Farklı mikrobiyomlara sahip iki deniz süngerinin hologenom analizi". BMC Genomics. 17 (1): 158. doi:10.1186 / s12864-016-2501-0. PMC  4772301. PMID  26926518.
  3. ^ Kenny N, Francis, W, vd. (Temmuz 2020). "Tatlı su süngeri Ephydatia muelleri'nin kromozom düzeyinde bir araya gelmesiyle hayvan genomik evriminin izini sürmek". Doğa İletişimi. 11 (1): 720–6. Bibcode:2020NatCo..11.3676K. doi:10.1038 / s41467-020-17397-w. PMC  7385117. PMID  32719321.
  4. ^ Ulusal İnsan Genomu Araştırma Enstitüsü (2012). "NHGRI Mnemiopsis Genom Projesi". Alındı 2013-02-05.
  5. ^ Ryan JF, Pang K, Schnitzler CE, Nguyen AD, Moreland RT, Simmons DK, vd. (Aralık 2013). "Ctenophore Mnemiopsis leidyi'nin genomu ve hücre tipi evrimine etkileri". Bilim. 342 (6164): 1242592. doi:10.1126 / science.1242592. PMC  3920664. PMID  24337300.
  6. ^ Moroz LL, Kocot KM, Citarella MR, Dosung S, Norekian TP, Povolotskaya IS, ve diğerleri. (Haziran 2014). "Ctenophore genomu ve sinir sistemlerinin evrimsel kökenleri". Doğa. 510 (7503): 109–14. Bibcode:2014Natur.510..109M. doi:10.1038 / nature13400. PMC  4337882. PMID  24847885.
  7. ^ Srivastava M, Begovic E, Chapman J, Putnam NH, Hellsten U, Kawashima T, ve diğerleri. (Ağustos 2008). "Trichoplax genomu ve placozoanların doğası". Doğa. 454 (7207): 955–60. Bibcode:2008Natur.454..955S. doi:10.1038 / nature07191. PMID  18719581. S2CID  4415492.
  8. ^ Eitel M, Francis WR, Varoqueaux F, Daraspe J, Osigus HJ, Krebs S, ve diğerleri. (Temmuz 2018). "Karşılaştırmalı genomik ve placozoan türlerinin doğası". PLOS Biyolojisi. 16 (7): e2005359. doi:10.1371 / journal.pbio.2005359. PMC  6067683. PMID  30063702.
  9. ^ Chapman JA, Kirkness EF, Simakov O, Hampson SE, Mitros T, Weinmaier T, vd. (Mart 2010). "Hydra'nın dinamik genomu". Doğa. 464 (7288): 592–6. Bibcode:2010Natur.464..592C. doi:10.1038 / nature08830. PMC  4479502. PMID  20228792.
  10. ^ Putnam NH, Srivastava M, Hellsten U, Dirks B, Chapman J, Salamov A, vd. (Temmuz 2007). "Deniz anemon genomu, atalara ait ömetazoan gen repertuarını ve genomik organizasyonu ortaya çıkarır". Bilim. 317 (5834): 86–94. Bibcode:2007Sci ... 317 ... 86P. doi:10.1126 / science.1139158. PMID  17615350. S2CID  9868191.
  11. ^ Baumgarten S, Simakov O, Esherick LY, Liew YJ, Lehnert EM, Michell CT, ve diğerleri. (Eylül 2015). "Mercan simbiyozu için bir deniz anemon modeli olan Aiptasia genomu". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 112 (38): 11893–8. Bibcode:2015PNAS..11211893B. doi:10.1073 / pnas.1513318112. PMC  4586855. PMID  26324906.
  12. ^ Shinzato C, Shoguchi E, Kawashima T, Hamada M, Hisata K, Tanaka M, vd. (Temmuz 2011). "Çevresel değişime mercan tepkilerini anlamak için Acropora digitifera genomunu kullanma". Doğa. 476 (7360): 320–3. Bibcode:2011Natur.476..320S. doi:10.1038 / nature10249. PMID  21785439. S2CID  4364757.
  13. ^ Jiang J (2017). "Renilla muelleri genomu". resifgenomik.
  14. ^ Jiang JB, Quattrini AM, Francis WR, Ryan JF, Rodríguez E, McFadden CS (Nisan 2019). "Hercai menekşe (Renilla muelleri) genomunun hibrit de novo topluluğu". GigaScience. 8 (4). doi:10.1093 / gigascience / giz026. PMC  6446218. PMID  30942866.
  15. ^ Voolstra CR, Li Y, Liew YJ, Baumgarten S, Zoccola D, Flot JF, ve diğerleri. (Aralık 2017). "Stylophora pistillata ve Acropora digitifera'nın genomlarının karşılaştırmalı analizi, mercan türleri arasındaki kapsamlı farklılıklar için kanıt sağlıyor". Bilimsel Raporlar. 7 (1): 17583. Bibcode:2017NatSR ... 717583V. doi:10.1038 / s41598-017-17484-x. PMC  5730576. PMID  29242500.
  16. ^ Altın DA, Katsuki T, Li Y, Yan X, Regulski M, Ibberson D, ve diğerleri. (Ocak 2019). "Aurelia denizanasının genomu ve hayvan karmaşıklığının evrimi" (PDF). Doğa Ekolojisi ve Evrimi. 3 (1): 96–104. doi:10.1038 / s41559-018-0719-8. PMID  30510179. S2CID  54437176.
  17. ^ Leclère L, Horin C, Chevalier S, Lapébie P, Dru P, Peron S, ve diğerleri. (Mayıs 2019). "Clytia hemisphaerica denizanasının genomu ve cnidarian yaşam döngüsünün evrimi". Doğa Ekolojisi ve Evrimi. 3 (5): 801–810. doi:10.1038 / s41559-019-0833-2. PMID  30858591. S2CID  73728941.
  18. ^ Kurnaz R, Bay RA, Gillette P, Baker AC, Traylor-Knowles, ve diğerleri. (2018). "Pocillopora damicornis genomunun karşılaştırmalı analizi, mercan evriminde bağışıklık sisteminin rolünü vurgulamaktadır". Bilimsel Raporlar. 8 (1): 16134. Bibcode:2018NatSR ... 816134C. doi:10.1038 / s41598-018-34459-8. PMC  6208414. PMID  30382153.
  19. ^ Prada C, Hanna B, Budd AF, Woodley CM, Schmutz J, Grimwood J, Iglesias-Prieto R, Pandolfi JM, Levitan D, Johnson KG, DiGiorgio M, ve diğerleri. (2016). "Nesli Tükenmelerden Sonra 2016 Boş Nişler Modern Mercanların Nüfus Büyüklüğünü Arttırıyor". Güncel Biyoloji. 1 (26): 3190–3194. doi:10.1016 / j.cub.2016.09.039. PMID  27866895. S2CID  188206.
  20. ^ Kim HM, Weber JA, Lee N, Park SG, Cho YS, Bhak Y, ve diğerleri. (Mart 2019). "Dev Nomura'nın denizanasının genomu, aktif avlanmanın erken evrimine ışık tutuyor". BMC Biyoloji. 17 (1): 28. doi:10.1186 / s12915-019-0643-7. PMC  6441219. PMID  30925871.
  21. ^ Li Y, Gao L, Pan Y, Tian M, Li Y, He C, ve diğerleri. (Nisan 2020). "Rhopilema esculentum denizanasının kromozom düzeyinde referans genomu". GigaScience. 9 (4). doi:10.1093 / gigascience / giaa036. PMC  7172023. PMID  32315029.
  22. ^ a b c Ohdera A, Ames CL, Dikow RB, Kayal E, Chiodin M, Busby B, vd. (Temmuz 2019). "Kutu, saplı ve baş aşağı mı? Çeşitli denizanalarından (Cnidaria, Acraspeda) genomların taslağı: Alatina alata (Cubozoa), Calvadosia cruxmelitensis (Staurozoa) ve Cassiopea xamachana (Scyphozoa)". GigaScience. 8 (7). doi:10.1093 / gigascience / giz069. PMC  6599738. PMID  31257419.
  23. ^ Jeon Y, Park SG, Lee N, Weber JA, Kim HS, Hwang SJ, ve diğerleri. (Mart 2019). "Bir Octocoral, Dendronephthya gigantea'nın Taslak Genomu". Genom Biyolojisi ve Evrim. 11 (3): 949–953. doi:10.1093 / gbe / evz043. PMC  6447388. PMID  30825304.
  24. ^ Cooke, Ira; Ying, Hua; Forêt, Sylvain; Bongaerts, Pim; Strugnell, Jan M .; Simakov, Oleg; Zhang, Jia; Field, Matt A .; Rodriguez-Lanetty, Mauricio; Bell, Sara C .; Bourne, David G. (2020-11-01). "Mercan holobionundaki genomik imzalar, Holosen iklim değişikliği ve resiflere özgü ortakyaşamlar tarafından yönlendirilen konakçı adaptasyonlarını ortaya koymaktadır". Bilim Gelişmeleri. 6 (48): eabc6318. doi:10.1126 / sciadv.abc6318. ISSN  2375-2548. PMID  33246955 Kontrol | pmid = değer (Yardım). S2CID  227179581.
  25. ^ a b Simakov O, Kawashima T, Marlétaz F, Jenkins J, Koyanagi R, Mitros T, ve diğerleri. (Kasım 2015). "Hemikordat genomları ve döteryum kökenleri". Doğa. 527 (7579): 459–65. Bibcode:2015Natur.527..459S. doi:10.1038 / nature16150. PMC  4729200. PMID  26580012.
  26. ^ Baughman KW, McDougall C, Cummins SF, Hall M, Degnan BM, Satoh N, Shoguchi E (Aralık 2014). "Ekinoderm, Acanthaster planci'de Hox ve ParaHox kümelerinin genomik organizasyonu". Yaratılış. 52 (12): 952–8. doi:10.1002 / dvg.22840. PMID  25394327. S2CID  32809575.
  27. ^ Jo J, Oh J, Lee HG, Hong HH, Lee SG, Cheon S ve diğerleri. (Ocak 2017). "Deniz hıyarı Apostichopus japonicus'un taslak genomu ve renk çeşitleri arasında genetik polimorfizm". GigaScience. 6 (1): 1–6. doi:10.1093 / gigascience / giw006. PMC  5437941. PMID  28369350.
  28. ^ Sodergren E, Weinstock GM, Davidson EH, Cameron RA, Gibbs RA, Angerer RC, ve diğerleri. (Kasım 2006). "Deniz kestanesi Strongylocentrotus purpuratus'un genomu". Bilim. 314 (5801): 941–52. Bibcode:2006Sci ... 314..941S. doi:10.1126 / science.1133609. PMC  3159423. PMID  17095691.
  29. ^ Dehal P, Satou Y, Campbell RK, Chapman J, Degnan B, De Tomaso A, vd. (Aralık 2002). "Ciona intestinalis'in taslak genomu: kordalı ve omurgalıların kökenlerine ilişkin bilgiler". Bilim. 298 (5601): 2157–67. Bibcode:2002Sci ... 298.2157D. doi:10.1126 / science.1080049. PMID  12481130. S2CID  15987281.
  30. ^ Küçük KS, Brudno M, Hill MM, Sidow A (2007). "Oldukça polimorfik Ciona savignyi genomunun bir haplom hizalaması ve referans dizisi". Genom Biyolojisi. 8 (3): R41. doi:10.1186 / gb-2007-8-3-r41. PMC  1868934. PMID  17374142.
  31. ^ Seo HC, Kube M, Edvardsen RB, Jensen MF, Beck A, Spriet E, ve diğerleri. (Aralık 2001). "Deniz akoratı Oikopleura dioica'da minyatür genom". Bilim. 294 (5551): 2506. doi:10.1126 / science.294.5551.2506. PMID  11752568.
  32. ^ Putnam NH, Butts T, Ferrier DE, Furlong RF, Hellsten U, Kawashima T, ve diğerleri. (Haziran 2008). "Amphioxus genomu ve kordat karyotipinin evrimi". Doğa. 453 (7198): 1064–71. Bibcode:2008Natur.453.1064P. doi:10.1038 / nature06967. PMID  18563158. S2CID  4418548.
  33. ^ Libants S, Carr K, Wu H, Teeter JH, Chung-Davidson YW, Zhang Z, Wilkerson C, Li W (Temmuz 2009). "Deniz taşıtları Petromyzon marinus genomu, omurgalı soyundaki birkaç kemosensör reseptör ailesinin erken kökenini ortaya koyuyor". BMC Evrimsel Biyoloji. 9: 180. doi:10.1186/1471-2148-9-180. PMC  2728731. PMID  19646260.
  34. ^ Smith JJ, Kuraku S, Holt C, Sauka-Spengler T, Jiang N, Campbell MS, vd. (Nisan 2013). "Deniz taşıtının (Petromyzon marinus) genomunun sıralanması, omurgalıların evrimine ilişkin bilgiler sağlar". Doğa Genetiği. 45 (4): 415–21, 421e1-2. doi:10.1038 / ng.2568. PMC  3709584. PMID  23435085.
  35. ^ Venkatesh B, Kirkness EF, Loh YH, Halpern AL, Lee AP, Johnson J, vd. (Nisan 2007). "Fil köpekbalığı (Callorhinchus milii) genomunun anket sıralaması ve karşılaştırmalı analizi". PLOS Biyolojisi. 5 (4): e101. doi:10.1371 / journal.pbio.0050101. PMC  1845163. PMID  17407382.
  36. ^ TD, Petit RA, Joseph SJ, Alam MT, Weil MR, Ahmad M ve diğerlerini okuyun. (Temmuz 2017). "Dünyanın en büyük balığı olan balina köpekbalığının genomunun taslak sıralaması ve montajı: Rhincodon typus Smith 1828". BMC Genomics. 18 (1): 532. doi:10.1186 / s12864-017-3926-9. PMC  5513125. PMID  28709399.
  37. ^ Marra NJ, Stanhope MJ, Jue NK, Wang M, Sun Q, Pavinski Bitar P, ve diğerleri. (Şubat 2019). "Beyaz köpekbalığı genomu, yara iyileşmesi ve genom stabilitesinin korunması ile ilişkili eski elasmobranch adaptasyonlarını ortaya koyuyor". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 116 (10): 4446–4455. doi:10.1073 / pnas.1819778116. PMC  6410855. PMID  30782839.
  38. ^ a b Hara Y, Yamaguchi K, Onimaru K, Kadota M, Koyanagi M, Keeley SD, ve diğerleri. (Kasım 2018). "Köpekbalığı genomları, elasmobranch evrimi ve omurgalıların kökeni hakkında bilgi sağlar". Doğa Ekolojisi ve Evrimi. 2 (11): 1761–1771. doi:10.1038 / s41559-018-0673-5. PMID  30297745. S2CID  52944566.
  39. ^ Fan G, Chan J, Ma K, Yang B, Zhang H, Yang X, ve diğerleri. (Kasım 2018). "Siyamla savaşan balık Betta splendens'in kromozom düzeyinde referans genomu, saldırganlık çalışmaları için bir model tür". GigaScience. 7 (11). doi:10.1093 / gigascience / giy087. PMC  6251983. PMID  30010754.
  40. ^ a b c d e f g h ben j Fan, Guangyi; Şarkı, Yue; Yang, Liandong; Huang, Xiaoyun; Zhang, Suyu; Zhang, Mengqi; Yang, Xianwei; Chang, Yue; Zhang, He; Li, Yongxin; Liu, Shanshan (2020-08-01). "10.000 Balık Genomu Projesi'nin (Fish10K) ilk veri açıklaması ve duyurusu". GigaScience. 9 (8). doi:10.1093 / gigascience / giaa080. PMC  7433795. PMID  32810278.
  41. ^ Guangyi, Fan; Yue, Şarkı; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; O Zhang (2020), Öpüşen gurami, Helostoma temminkii'nin genomik verileri, GigaScience Veritabanı, doi:10.5524/102190, alındı 2020-08-19
  42. ^ Kasahara M, Naruse K, Sasaki S, Nakatani Y, Qu W, Ahsan B, vd. (Haziran 2007). "Medaka genomu taslağı ve omurgalıların genom evrimine dair içgörüler". Doğa. 447 (7145): 714–9. Bibcode:2007Natur.447..714K. doi:10.1038 / nature05846. PMID  17554307. S2CID  4419559.
  43. ^ Kış, Sven; Prost, Stefan; Raad, Jordi de; Coimbra, Raphael T. F .; Kurt, Magnus; Nebenführ, Marcel; Düzenlendi, Annika; Kurzawe, Melina; Papapostolou, Ramona; Tessien, Jade; Bludau, Julian (2020). "Bentik ilişkili Syngnathiformes türünün kromozom düzeyinde genom topluluğu: ortak dragonet, Callionymus lyra". Gigabayt. 2020: 1–10. doi:10.46471 / gigabyte.6.
  44. ^ Xiao Y, Xiao Z, Ma D, Liu J, Li J (Mart 2019). "Kesikli bıçak çenesinin genom dizisi Oplegnathus fasciatus (Temminck & Schlegel, 1844): Oplegnathidae ailesindeki ilk kromozom düzeyinde çekiş genomu". GigaScience. 8 (3). doi:10.1093 / gigascience / giz013. PMC  6423371. PMID  30715332.
  45. ^ McGaugh SE, Gross JB, Aken B, Blin M, Borowsky R, Chalopin D, vd. (Ekim 2014). "Mağara balığı genomu, göz kaybı için aday genleri ortaya koyuyor". Doğa İletişimi. 5 (1): 5307. Bibcode:2014NatCo ... 5.5307M. doi:10.1038 / ncomms6307. PMC  4218959. PMID  25329095.
  46. ^ a b Conte MA, Joshi R, Moore EC, Nandamuri SP, Gammerdinger WJ, Roberts RB, ve diğerleri. (Nisan 2019). "Kromozom ölçeğindeki topluluklar, Afrika çiklit genomlarının yapısal evrimini ortaya koyuyor". GigaScience. 8 (4). doi:10.1093 / gigascience / giz030. PMC  6447674. PMID  30942871.
  47. ^ Í Kongsstovu S, Dahl HA, Gislason H, Í Homrum E, Jacobsen JA, Flicek P, Mikalsen SO (Nisan 2020). "Atlantik ringa balığı Clupea harengus genomundaki erkek heterogametik cinsiyet belirleme bölgelerinin belirlenmesi". Balık Biyolojisi Dergisi. 97 (1): 190–201. doi:10.1111 / jfb.14349. PMC  7115899. PMID  32293027. S2CID  215774454.
  48. ^ Xu G, Bian C, Nie Z, Li J, Wang Y, Xu D, vd. (Ocak 2020). "Çin konik kuyruklu hamsinin (Coilia nasus) kromozom seviyesindeki bir genom topluluğunun genomu ve popülasyon dizilimi, göçmen adaptasyonuna dair yeni bilgiler sağlar". GigaScience. 9 (1). doi:10.1093 / gigascience / giz157. PMC  6939831. PMID  31895412.
  49. ^ Louro B, De Moro G, Garcia C, Cox CJ, Veríssimo A, Sabatino SJ, ve diğerleri. (Mayıs 2019). "Avrupa sardalyasının (Sardina pilchardus) haplotip çözülmüş taslak genomu". GigaScience. 8 (5). doi:10.1093 / gigascience / giz059. PMC  6528745. PMID  31112613.
  50. ^ Amemiya CT, Alföldi J, Lee AP, Fan S, Philippe H, Maccallum I, ve diğerleri. (Nisan 2013). "Afrika coelacanth genomu, tetrapodların evrimine ışık tutuyor". Doğa. 496 (7445): 311–6. Bibcode:2013Natur.496..311A. doi:10.1038 / nature12027. PMC  3633110. PMID  23598338.
  51. ^ Topluluk girişi
  52. ^ Jiang W, Qiu Y, Pan X, Zhang Y, Wang X, Lv Y, vd. (2018). "Anabarilius grahami (Regan) ve Evrimsel ve Genetik Uygulamaları". Genetikte Sınırlar. 9: 614. doi:10.3389 / fgene.2018.00614. PMC  6288284. PMID  30564274.
  53. ^ "Ensembl genom tarayıcısı 59: Danio rerio - Açıklama - Ensembl Zebrafish'i ara". Ensembl.org. Alındı 2010-08-27.
  54. ^ a b van Kruistum H, van den Heuvel J, Travis J, Kraaijeveld K, Zwaan BJ, Groenen MA, vd. (Temmuz 2019). "Canlı taşıyan balıkların genomu Heterandria formosa, plasental balığın evriminde korunmuş omurgalı genlerinin rolüne işaret eder". BMC Evrimsel Biyoloji. 19 (1): 156. doi:10.1186 / s12862-019-1484-2. PMC  6660938. PMID  31349784.
  55. ^ Liu HP, Xiao SJ, Wu N, Wang D, Liu YC, Zhou CW, ve diğerleri. (Şubat 2019). "Oxygymnocypris stewartii genomunun sekansı ve de novo montajı". Bilimsel Veriler. 6: 190009. Bibcode:2019NatSD ... 690009L. doi:10.1038 / sdata.2019.9. PMC  6362891. PMID  30720802.
  56. ^ Liu H, Chen C, Gao Z, Min J, Gu Y, Jian J, vd. (Temmuz 2017). "Künt burunlu çipura (Megalobrama amblycephala) taslak genomu, kaslar arası kemiğin gelişimini ve otçul beslenmeye adaptasyonu ortaya koymaktadır". GigaScience. 6 (7): 1–13. doi:10.1093 / gigascience / gix039. PMC  5570040. PMID  28535200.
  57. ^ Guangyi, Fan; Yue, Şarkı; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; O, Zhang; Yongxin, Li; Shanshan, Liu; Lili, Yu; Jeffery, Chu; Inge, Seim; Chenguang, Feng; Thomas, Yakın J .; Çubuk, Kanat A .; Wen, Wang; Kun, Wang; Jing, Wang; Xun, Xu; Huanming, Yang; Xin, Liu; Nansheng, Chen; Shunping, O (2020). "GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102192 - Pembe acı, Rhodeus ocellatus'un genomik verileri". GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102192. Alıntı dergisi gerektirir | günlük = (Yardım)
  58. ^ Guangyi, Fan; Yue, Şarkı; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; O, Zhang; Yongxin, Li; Shanshan, Liu; Lili, Yu; Jeffery, Chu; Inge, Seim; Chenguang, Feng; Thomas, Yakın J .; Çubuk, Kanat A .; Wen, Wang; Kun, Wang; Jing, Wang; Xun, Xu; Huanming, Yang; Xin, Liu; Nansheng, Chen; Shunping, O (2020). "GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102191 - Pseudobrama simoni'nin genomik verileri". GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102191. Alıntı dergisi gerektirir | günlük = (Yardım)
  59. ^ a b c d Johnson, Lisa K; Sahasrabudhe, Ruta; Gill, James Anthony; Roach, Jennifer L; Froenicke, Lutz; Brown, C Titus; Whitehead, Andrew (2020-06-01). "Dört Kuzey Amerika Fundulus killifish türü için Oxford Nanopore Technology ve Illumina platformlarından dizileme okumalarını kullanan taslak genom derlemeleri". GigaScience. 9 (6). doi:10.1093 / gigascience / giaa067. ISSN  2047-217X. PMC  7301629. PMID  32556169.
  60. ^ Shao, Feng; Ludwig, Arne; Mao, Yang; Liu, Ni; Peng, Zuogang (2020-08-01). "Batı sivrisinek balıklarının (Gambusia affinis) kromozom düzeyinde genom topluluğu". GigaScience. 9 (8). doi:10.1093 / gigascience / giaa092. ISSN  2047-217X. PMC  7450667. PMID  32852039.
  61. ^ Schartl M, Walter RB, Shen Y, Garcia T, Catchen J, Amores A, vd. (Mayıs 2013). "Platyfish genomu, Xiphophorus maculatus, evrimsel adaptasyon ve çeşitli karmaşık özellikler hakkında bilgi sağlar". Doğa Genetiği. 45 (5): 567–72. doi:10.1038 / ng.2604. PMC  3677569. PMID  23542700.
  62. ^ Harel I, Benayoun BA, Machado B, Singh PP, Hu CK, Pech MF, Valenzano DR, Zhang E, Sharp SC, Artandi SE, Brunet A (Şubat 2015). "Doğal olarak kısa ömürlü bir omurgalıda yaşlanmanın ve hastalıkların hızlı keşfi için bir platform". Hücre. 160 (5): 1013–1026. doi:10.1016 / j.cell.2015.01.038. PMC  4344913. PMID  25684364.
  63. ^ Reichwald K, Petzold A, Koch P, Downie BR, Hartmann N, Pietsch S, ve diğerleri. (Aralık 2015). "Kısa Ömürlü Balığın Genomundan Cinsiyet Kromozomu Evrimi ve Yaşlanmaya İlişkin Bilgiler". Hücre. 163 (6): 1527–38. doi:10.1016 / j.cell.2015.10.071. PMID  26638077. S2CID  16423362.
  64. ^ Valenzano DR, Benayoun BA, Singh PP, Zhang E, Etter PD, Hu CK, Clément-Ziza M, Willemsen D, Cui R, Harel I, Machado BE, Yee MC, Sharp SC, Bustamante CD, Beyer A, Johnson EA, Brunet A (Aralık 2015). "Afrika Turkuaz Killifish Genomu Yaşam Süresinin Evrimi ve Genetik Mimarisi Hakkında Bilgi Sağlıyor". Hücre. 163 (6): 1539–54. doi:10.1016 / j.cell.2015.11.008. PMC  4684691. PMID  26638078.
  65. ^ Rondeau EB, Minkley DR, Leong JS, Messmer AM, Jantzen JR, von Schalburg KR, ve diğerleri. (2014). "Kuzey turna balığı (Esox lucius) genomu ve bağlantı haritası: Salmonid kardeş grubu ile Neoteleostei arasında açığa çıkan korunmuş sentez". PLOS ONE. 9 (7): e102089. Bibcode:2014PLoSO ... 9j2089R. doi:10.1371 / journal.pone.0102089. PMC  4113312. PMID  25069045.
  66. ^ Topluluk Ön girişi[kalıcı ölü bağlantı ]
  67. ^ Jones FC, Grabherr MG, Chan YF, Russell P, Mauceli E, Johnson J, vd. (Nisan 2012). "Üç dikenli dikenli köpeklerde adaptif evrimin genomik temeli". Doğa. 484 (7392): 55–61. Bibcode:2012Natur.484 ... 55.. doi:10.1038 / nature10944. PMC  3322419. PMID  22481358.
  68. ^ Guangyi, Fan; Yue, Şarkı; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; O Zhang (2020), Mermer kaya balığı, Oxyeleotris marmorata'nın genomik verileri, GigaScience Veritabanı, doi:10.5524/102185, alındı 2020-08-19
  69. ^ Gallant JR, Traeger LL, Volkening JD, Moffett H, Chen PH, Novina CD, vd. (Haziran 2014). "İnsan dışı genetik. Elektrik organlarının yakınsak evriminin genomik temeli". Bilim. 344 (6191): 1522–5. doi:10.1126 / science.1254432. PMC  5541775. PMID  24970089.
  70. ^ "Benekli gar". Topluluk. Alındı 11 Eylül 2014.
  71. ^ Liu K, Xu D, Li J, Bian C, Duan J, Zhou Y, vd. (Nisan 2017). "Çin açık kafalı buz balığı, Protosalanx hyalocranius'un tüm genom dizilimi". GigaScience. 6 (4): 1–6. doi:10.1093 / gigascience / giw012. PMC  5530312. PMID  28327943.
  72. ^ Guangyi, Fan; Yue, Şarkı; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; O Zhang (2020), Afrika kemik dili, Heterotis niloticus'un genom verileri, GigaScience Veritabanı, doi:10.5524/102184, alındı 2020-08-19
  73. ^ Bian, Chao; Hu, Yinchang; Ravi, Vydianathan; Kuznetsova, Inna S .; Shen, Xueyan; Mu, Xidong; Sun, Ying; Sen, Xinxin; Li, Jia; Li, Xiaofeng; Qiu Ying (2016-04-19). "Asya arowana (Scleropages formosus) genomu, teleostların erken bir soyunun evrimine yeni bakış açıları sağlıyor". Bilimsel Raporlar. 6 (1): 24501. Bibcode:2016NatSR ... 624501B. doi:10.1038 / srep24501. ISSN  2045-2322. PMC  4835728. PMID  27089831.
  74. ^ Guangyi, Fan; Yue, Şarkı; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; O, Zhang; Yongxin, Li; Shanshan, Liu; Lili, Yu; Jeffery, Chu; Inge, Seim; Chenguang, Feng; Thomas, Yakın J .; Çubuk, Kanat A .; Wen, Wang; Kun, Wang; Jing, Wang; Xun, Xu; Huanming, Yang; Xin, Liu; Nansheng, Chen; Shunping, O (2020). "GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102187 - Kavun kelebek balığı Chaetodon trifasciatus'un genomik verileri". GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102187. Alıntı dergisi gerektirir | günlük = (Yardım)
  75. ^ Xu J, Bian C, Chen K, Liu G, Jiang Y, Luo Q, ve diğerleri. (Nisan 2017). "Kuzey yılanbaşının taslak genomu, Channa argus". GigaScience. 6 (4): 1–5. doi:10.1093 / gigascience / gix011. PMC  5530311. PMID  28327946.
  76. ^ Guangyi, Fan; Yue, Şarkı; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; O Zhang (2020), Bakır bantlı kelebek balığı, Chelmon rostratus'un genomik verileri, GigaScience Veritabanı, doi:10.5524/102189, alındı 2020-08-19
  77. ^ a b Chen L, Lu Y, Li W, Ren Y, Yu M, Jiang S, vd. (Nisan 2019). "Antarktika diş balığı ve Patagonya robalo genomlarının ortaya çıkardığı donmakta olan Güney Okyanusu'nda kolonileşmenin genomik temeli". GigaScience. 8 (4). doi:10.1093 / gigascience / giz016. PMC  6457430. PMID  30715292.
  78. ^ Wu C, Zhang D, Kan M, Lv Z, Zhu A, Su Y, ve diğerleri. (Kasım 2014). "Büyük sarı şarlatanların taslak genomu, iyi gelişmiş doğuştan gelen bağışıklığı ortaya koyuyor". Doğa İletişimi. 5: 5227. Bibcode:2014NatCo ... 5.5227W. doi:10.1038 / ncomms6227. PMC  4263168. PMID  25407894.
  79. ^ Norrell AE, Jones KL, Saillant EA (2020-04-29). "Model olmayan bir deniz teleostu, kızıl balığı (Lutjanus campechanus, Lutjanidae) için genomik kaynakların geliştirilmesi ve karakterizasyonu: Yüksek yoğunluklu bir bağlantı haritasının oluşturulması, genom bölgelerinin sabitlenmesi ve karşılaştırmalı genomik analiz". PLOS ONE. 15 (4): e0232402. Bibcode:2020PLoSO..1532402N. doi:10.1371 / journal.pone.0232402. PMC  7190162. PMID  32348345.
  80. ^ Guangyi, Fan; Yue, Şarkı; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; O, Zhang; Yongxin, Li; Shanshan, Liu; Lili, Yu; Jeffery, Chu; Inge, Seim; Chenguang, Feng; Thomas, Yakın J .; Çubuk, Kanat A .; Wen, Wang; Kun, Wang; Jing, Wang; Xun, Xu; Huanming, Yang; Xin, Liu; Nansheng, Chen; Shunping, O (2020). "GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102188 - Büyük boynuzlu tek boynuzlu at balığı Naso vlamingii'nin genomik verileri". GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102188. Alıntı dergisi gerektirir | günlük = (Yardım)
  81. ^ Ahn DH, Shin SC, Kim BM, Kang S, Kim JH, Ahn I, Park J, Park H (Ağustos 2017). "Antarktika yusufçuklarının taslak genomu, Parachaenichthys charcoti". GigaScience. 6 (8): 1–6. doi:10.1093 / gigascience / gix060. PMC  5597851. PMID  28873966.
  82. ^ Sarropoulou E, Sundaram AY, Kaitetzidou E, Kotoulas G, Gilfillan GD, Papandroulakis N, vd. (Aralık 2017). "Daha büyük amberjack Seriola dumerili'de tam genom araştırması ve gen ifadesinin dinamikleri". GigaScience. 6 (12): 1–13. doi:10.1093 / gigascience / gix108. PMC  5751066. PMID  29126158.
  83. ^ Xu S, Xiao S, Zhu S, Zeng X, Luo J, Liu J, ve diğerleri. (Eylül 2018). "Sillaginidae balıkları için ilk referans genomu olan Çin sillagosunun (Sillago sinica) taslak genom topluluğu". GigaScience. 7 (9). doi:10.1093 / gigascience / giy108. PMC  6143730. PMID  30202912.
  84. ^ Lu, Liang; Zhao, Jinliang; Li, Chenhong (2020-03-01). "Büyük Gözlü Mandarin Balığının (Siniperca knerii) Yüksek Kaliteli Genom Toplama ve Ek Açıklamaları". G3: Genler, Genomlar, Genetik. 10 (3): 877–880. doi:10.1534 / g3.119.400930. ISSN  2160-1836. PMC  7056987. PMID  31953307.
  85. ^ Pauletto M, Manousaki T, Ferraresso S, Babbucci M, Tsakogiannis A, Louro B, vd. (2018-08-17). "Sparus aurata, sıralı bir hermafrodit balığındaki cinsiyete dayalı genlerin evrimsel dinamiklerini ortaya koyuyor". İletişim Biyolojisi. 1 (1): 119. doi:10.1038 / s42003-018-0122-7. PMC  6123679. PMID  30271999.
  86. ^ Lien S, Koop BF, Sandve SR, Miller JR, Kent MP, Nome T, vd. (Mayıs 2016). "Atlantik somon genomu, yeniden çoğalmaya ilişkin bilgiler sağlar". Doğa. 533 (7602): 200–5. Bibcode:2016Natur.533..200L. doi:10.1038 / nature17164. PMID  27088604. S2CID  4398298.
  87. ^ Berthelot C, Brunet F, Chalopin D, Juanchich A, Bernard M, Noël B, vd. (Nisan 2014). "Gökkuşağı alabalığı genomu, omurgalılarda tüm genom kopyalanmasından sonra evrime yeni bakış açıları sağlar". Doğa İletişimi. 5: 3657. Bibcode:2014NatCo ... 5.3657B. doi:10.1038 / ncomms4657. PMC  4071752. PMID  24755649.
  88. ^ Christensen KA, Leong JS, Sakhrani D, Biagi CA, Minkley DR, Withler RE, ve diğerleri. (2018-04-05). "Chinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha) genome and transcriptome". PLOS ONE. 13 (4): e0195461. Bibcode:2018PLoSO..1395461C. doi:10.1371/journal.pone.0195461. PMC  5886536. PMID  29621340.
  89. ^ Narum SR, Di Genova A, Micheletti SJ, Maass A (July 2018). "Genomic variation underlying complex life-history traits revealed by genome sequencing in Chinook salmon". Bildiriler. Biyolojik Bilimler. 285 (1883): 20180935. doi:10.1098/rspb.2018.0935. PMC  6083255. PMID  30051839.
  90. ^ He Y, Chang Y, Bao L, Yu M, Li R, Niu J, et al. (Mayıs 2019). "A chromosome-level genome of black rockfish, Sebastes schlegelii, provides insights into the evolution of live birth" (PDF). Moleküler Ekoloji Kaynakları. 0 (5): 1309–1321. doi:10.1111/1755-0998.13034. PMID  31077549. S2CID  149454779.
  91. ^ Liu Z, Liu S, Yao J, Bao L, Zhang J, Li Y, et al. (Haziran 2016). "The channel catfish genome sequence provides insights into the evolution of scale formation in teleosts". Doğa İletişimi. 7: 11757. Bibcode:2016NatCo...711757L. doi:10.1038/ncomms11757. PMC  4895719. PMID  27249958.
  92. ^ Ozerov, Mikhail Yu; Flajšhans, Martin; Noreikiene, Kristina; Vasemägi, Anti; Gross, Riho (2020-11-01). "Draft Genome Assembly of the Freshwater Apex Predator Wels Catfish (Silurus glanis) Using Linked-Read Sequencing". G3: Genes, Genomes, Genetics. 10 (11): 3897–3906. doi:10.1534/g3.120.401711. ISSN  2160-1836. PMID  32917720. S2CID  221636677.
  93. ^ Guangyi, Fan; Yue, Song; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; He, Zhang; Yongxin, Li; Shanshan, Liu; Lili, Yu; Jeffery, Chu; Inge, Seim; Chenguang, Feng; Thomas, Near J.; Rod, Wing A.; Wen, Wang; Kun, Wang; Jing, Wang; Xun, Xu; Huanming, Yang; Xin, Liu; Nansheng, Chen; Shunping, He (2020). "GigaDB Dataset - DOI 10.5524/102186 - Genomic data of the Siamese tigerfish, Datnioides pulcher". GigaScience Database. doi:10.5524/102186. Alıntı dergisi gerektirir | günlük = (Yardım)
  94. ^ Sun, Shuai; Wang, Yue; Zeng, Wenhong; Du, Xiao; Li, Lei; Hong, Xiaoning; Huang, Xiaoyun; Zhang, He; Zhang, Mengqi; Fan, Guangyi; Liu, Xin (2020-05-18). "The genome of Mekong tiger perch ( Datnioides undecimradiatus ) provides insights into the phylogenetic position of Lobotiformes and biological conservation". Bilimsel Raporlar. 10 (1): 8164. Bibcode:2020NatSR..10.8164S. doi:10.1038/s41598-020-64398-2. ISSN  2045-2322. PMC  7235238. PMID  32424221. S2CID  218670972.
  95. ^ Guangyi, Fan; Yue, Song; Liandong, Yang; Xiaoyun, Huang; Suyu, Zhang; Mengqi, Zhang; Xianwei, Yang; Yue, Chang; He, Zhang; Yongxin, Li; Shanshan, Liu; Lili, Yu; Jeffery, Chu; Inge, Seim; Chenguang, Feng; Thomas, Near J.; Rod, Wing A.; Wen, Wang; Kun, Wang; Jing, Wang; Xun, Xu; Huanming, Yang; Xin, Liu; Nansheng, Chen; Shunping, He (2020). "GigaDB Dataset - DOI 10.5524/102183 - Genome data of the long-spine porcupinefish, Diodon holocanthus". GigaScience Database. doi:10.5524/102183. Alıntı dergisi gerektirir | günlük = (Yardım)
  96. ^ Pan H, Yu H, Ravi V, Li C, Lee AP, Lian MM, et al. (Eylül 2016). "The genome of the largest bony fish, ocean sunfish (Mola mola), provides insights into its fast growth rate". GigaScience. 5 (1): 36. doi:10.1186/s13742-016-0144-3. PMC  5016917. PMID  27609345.
  97. ^ "Fourth Genome Assembly". Fugu Genome Project. International Fugu Genome Consortium. Arşivlenen orijinal 2010-01-31 tarihinde.
  98. ^ Aparicio S, Chapman J, Stupka E, Putnam N, Chia JM, Dehal P, et al. (Ağustos 2002). "Whole-genome shotgun assembly and analysis of the genome of Fugu rubripes". Bilim. 297 (5585): 1301–10. Bibcode:2002Sci...297.1301A. doi:10.1126/science.1072104. PMID  12142439. S2CID  10310355.
  99. ^ Jaillon O, Aury JM, Brunet F, Petit JL, Stange-Thomann N, Mauceli E, et al. (Ekim 2004). "Genome duplication in the teleost fish Tetraodon nigroviridis reveals the early vertebrate proto-karyotype". Doğa. 431 (7011): 946–57. Bibcode:2004Natur.431..946J. doi:10.1038/nature03025. PMID  15496914. S2CID  4414316.
  100. ^ Nowoshilow S, Schloissnig S, Fei JF, Dahl A, Pang AW, Pippel M, et al. (Şubat 2018). "The axolotl genome and the evolution of key tissue formation regulators". Doğa. 554 (7690): 50–55. Bibcode:2018Natur.554...50N. doi:10.1038/nature25458. PMID  29364872.
  101. ^ Li J, Yu H, Wang W, Fu C, Zhang W, Han F, Wu H (December 2019). "Genomic and transcriptomic insights into molecular basis of sexually dimorphic nuptial spines in Leptobrachium leishanense". Doğa İletişimi. 10 (1): 5551. Bibcode:2019NatCo..10.5551L. doi:10.1038/s41467-019-13531-5. PMC  6895153. PMID  31804492.
  102. ^ Li, Qiye; Guo, Qunfei; Zhou, Yang; Tan, Huishuang; Bertozzi, Terry; Zhu, Yuanzhen; Li, Ji; Donnellan, Stephen; Zhang, Guojie. "A draft genome assembly of the eastern banjo frog Limnodynastes dumerilii dumerilii (Anura: Limnodynastidae)". gigabytejournal.com. Alındı 2020-11-17.
  103. ^ Sun YB, Xiong ZJ, Xiang XY, Liu SP, Zhou WW, Tu XL, et al. (March 2015). "Whole-genome sequence of the Tibetan frog Nanorana parkeri and the comparative evolution of tetrapod genomes". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 112 (11): E1257-62. Bibcode:2015PNAS..112E1257S. doi:10.1073/pnas.1501764112. PMC  4371989. PMID  25733869.
  104. ^ Rogers RL, Zhou L, Chu C, Márquez R, Corl A, Linderoth T, et al. (December 2018). "Genomic Takeover by Transposable Elements in the Strawberry Poison Frog". Moleküler Biyoloji ve Evrim. 35 (12): 2913–2927. doi:10.1093/molbev/msy185. PMC  6278860. PMID  30517748.
  105. ^ Denton, Robert D.; Kudra, Randal S.; Malcom, Jacob W.; Preez, Louis Du; Malone, John H. (2018-11-20). "The African Bullfrog (Pyxicephalus adspersus) genome unites the two ancestral ingredients for making vertebrate sex chromosomes". bioRxiv: 329847. doi:10.1101/329847. S2CID  90800869.
  106. ^ Hammond SA, Warren RL, Vandervalk BP, Kucuk E, Khan H, Gibb EA, Pandoh P, Kirk H, Zhao Y, Jones M, Mungall AJ, Coope R, Pleasance S, Moore RA, Holt RA, Round JM, Ohora S, Walle BV, Veldhoen N, Helbing CC, Birol I (November 2017). "The North American bullfrog draft genome provides insight into hormonal regulation of long noncoding RNA". Doğa İletişimi. 8 (1): 1433. Bibcode:2017NatCo...8.1433H. doi:10.1038/s41467-017-01316-7. PMC  5681567. PMID  29127278.
  107. ^ Edwards RJ, Tuipulotu DE, Amos TG, O'Meally D, Richardson MF, Russell TL, et al. (Ağustos 2018). "Draft genome assembly of the invasive cane toad, Rhinella marina". GigaScience. 7 (9). doi:10.1093/gigascience/giy095. PMC  6145236. PMID  30101298.
  108. ^ Li Y, Ren Y, Zhang D, Jiang H, Wang Z, Li X, Rao D (September 2019). "Chromosome-level assembly of the mustache toad genome using third-generation DNA sequencing and Hi-C analysis". GigaScience. 8 (9). doi:10.1093/gigascience/giz114. PMC  6755253. PMID  31544214.
  109. ^ Hellsten U, Harland RM, Gilchrist MJ, Hendrix D, Jurka J, Kapitonov V, et al. (Nisan 2010). "The genome of the Western clawed frog Xenopus tropicalis". Bilim. 328 (5978): 633–6. Bibcode:2010Sci...328..633H. doi:10.1126/science.1183670. PMC  2994648. PMID  20431018.
  110. ^ a b c St John JA, Braun EL, Isberg SR, Miles LG, Chong AY, Gongora J, et al. (Ocak 2012). "Sequencing three crocodilian genomes to illuminate the evolution of archosaurs and amniotes". Genom Biyolojisi. 13 (1): 415. doi:10.1186/gb-2012-13-1-415. PMC  3334581. PMID  22293439.
  111. ^ Wan QH, Pan SK, Hu L, Zhu Y, Xu PW, Xia JQ, et al. (Eylül 2013). "Genome analysis and signature discovery for diving and sensory properties of the endangered Chinese alligator". Hücre Araştırması. 23 (9): 1091–105. doi:10.1038/cr.2013.104. PMC  3760627. PMID  23917531.
  112. ^ Wan QH, Pan SK, Hu L, Zhu Y, Xu PW, Xia JQ, et al. (28 Mart 2014). "Genomic data of the Chinese alligator (Timsah sinensis)". GigaScience Database. doi:10.5524/100077. | bölüm = yok sayıldı (Yardım)
  113. ^ Gemmell, Neil J.; Rutherford, Kim; Prost, Stefan; Tollis, Marc; Winter, David; Macey, J. Robert; Adelson, David L.; Suh, Alexander; Bertozzi, Terry; Grau, José H.; Organ, Chris (2020-08-20). "The tuatara genome reveals ancient features of amniote evolution". Doğa. 584 (7821): 403–409. doi:10.1038/s41586-020-2561-9. ISSN  1476-4687. PMC  7116210. PMID  32760000.
  114. ^ Alföldi J, Di Palma F, Grabherr M, Williams C, Kong L, Mauceli E, et al. (Ağustos 2011). "The genome of the green anole lizard and a comparative analysis with birds and mammals". Doğa. 477 (7366): 587–91. Bibcode:2011Natur.477..587A. doi:10.1038/nature10390. PMC  3184186. PMID  21881562.
  115. ^ Song B, Cheng S, Sun Y, Zhong X, Jin J, Guan R, Murphy RW, Che J, Zhang Y, Liu X (2015). "A genome draft of the legless anguid lizard, Ophisaurus gracilis". GigaScience. 4: 17. doi:10.1186/s13742-015-0056-7. PMC  4391233. PMID  25859342.
  116. ^ a b c d Kishida T, Go Y, Tatsumoto S, Tatsumi K, Kuraku S, Toda M (2019). "Loss of olfaction in sea snakes provides new perspectives on the aquatic adaptation of amniotes". Kraliyet Topluluğu B Bildirileri: Biyolojik Bilimler. 286 (1910): 20191828. doi:10.1098/rspb.2019.1828. PMC  6742997. PMID  31506057.
  117. ^ Xiong Z, Li F, Li Q, Zhou L, Gamble T, Zheng J, et al. (Ekim 2016). "Draft genome of the leopard gecko, Eublepharis macularius". GigaScience. 5 (1): 47. doi:10.1186/s13742-016-0151-4. PMC  5080775. PMID  27784328.
  118. ^ Vonk FJ, Casewell NR, Henkel CV, Heimberg AM, Jansen HJ, McCleary RJ, et al. (Aralık 2013). "The king cobra genome reveals dynamic gene evolution and adaptation in the snake venom system". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 110 (51): 20651–6. Bibcode:2013PNAS..11020651V. doi:10.1073/pnas.1314702110. PMC  3870661. PMID  24297900.
  119. ^ Ullate-Agote A, Milinkovitch MC, Tzika AC (2015-07-02). "The genome sequence of the corn snake (Pantherophis guttatus), a valuable resource for EvoDevo studies in squamates". Uluslararası Gelişimsel Biyoloji Dergisi. 58 (10–12): 881–8. doi:10.1387/ijdb.150060at. PMID  26154328.
  120. ^ Georges A, Li Q, Lian J, O'Meally D, Deakin J, Wang Z, et al. (2015-12-01). "High-coverage sequencing and annotated assembly of the genome of the Australian dragon lizard Pogona vitticeps". GigaScience. 4 (1): 45. doi:10.1186/s13742-015-0085-2. PMC  4585809. PMID  26421146.
  121. ^ Castoe TA, de Koning AP, Hall KT, Card DC, Schield DR, Fujita MK, et al. (Aralık 2013). "The Burmese python genome reveals the molecular basis for extreme adaptation in snakes". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 110 (51): 20645–50. Bibcode:2013PNAS..11020645C. doi:10.1073/pnas.1314475110. PMC  3870669. PMID  24297902.
  122. ^ Roscito JG, Sameith K, Pippel M, Francoijs KJ, Winkler S, Dahl A, et al. (December 2018). "The genome of the tegu lizard Salvator merianae: combining Illumina, PacBio, and optical mapping data to generate a highly contiguous assembly". GigaScience. 7 (12). doi:10.1093/gigascience/giy141. PMC  6304105. PMID  30481296.
  123. ^ Gao J, Li Q, Wang Z, Zhou Y, Martelli P, Li F, et al. (Temmuz 2017). "Sequencing, de novo assembling, and annotating the genome of the endangered Chinese crocodile lizard Shinisaurus crocodilurus". GigaScience. 6 (7): 1–6. doi:10.1093/gigascience/gix041. PMC  5569961. PMID  28595343.
  124. ^ a b Wang Z, Pascual-Anaya J, Zadissa A, Li W, Niimura Y, Huang Z, et al. (June 2013). "The draft genomes of soft-shell turtle and green sea turtle yield insights into the development and evolution of the turtle-specific body plan". Doğa Genetiği. 45 (6): 701–706. doi:10.1038/ng.2615. PMC  4000948. PMID  23624526.
  125. ^ Shaffer HB, Minx P, Warren DE, Shedlock AM, Thomson RC, Valenzuela N, et al. (Mart 2013). "The western painted turtle genome, a model for the evolution of extreme physiological adaptations in a slowly evolving lineage". Genom Biyolojisi. 14 (3): R28. doi:10.1186/gb-2013-14-3-r28. PMC  4054807. PMID  23537068.
  126. ^ Cao D, Wang M, Ge Y, Gong S (May 2019). "Draft genome of the big-headed turtle Platysternon megacephalum". Bilimsel Veriler. 6 (1): 60. Bibcode:2019NatSD...6...60C. doi:10.1038/s41597-019-0067-9. PMC  6522511. PMID  31097710.
  127. ^ a b c d e f g h ben j k l m n Ö p q r s t sen v w x y z aa ab AC reklam ae af ag Ah ai aj ak al am bir ao ap aq Jarvis ED, Mirarab S, Aberer AJ, Li B, Houde P, Li C, et al. (Aralık 2014). "Bütün genom analizleri, modern kuşların hayat ağacındaki ilk dalları çözüyor". Bilim. 346 (6215): 1320–31. Bibcode:2014Sci ... 346.1320J. doi:10.1126 / science.1253451. PMC  4405904. PMID  25504713.
  128. ^ "Golden Eagle Genome Sequenced".
  129. ^ Huang Y, Li Y, Burt DW, Chen H, Zhang Y, Qian W, et al. (July 2013). "The duck genome and transcriptome provide insight into an avian influenza virus reservoir species". Doğa Genetiği. 45 (7): 776–783. doi:10.1038/ng.2657. PMC  4003391. PMID  23749191.
  130. ^ Le Duc, Diana; Renaud, Gabriel; Krishnan, Arunkumar; Almén, Markus Sällman; Huynen, Leon; Prohaska, Sonja J.; Ongyerth, Matthias; Bitarello, Bárbara D.; Schiöth, Helgi B.; Hofreiter, Michael; Stadler, Peter F. (2015-07-23). "Kiwi genome provides insights into evolution of a nocturnal lifestyle". Genom Biyolojisi. 16 (1): 147. doi:10.1186/s13059-015-0711-4. ISSN  1465-6906. PMC  4511969. PMID  26201466.
  131. ^ a b c d Galla SJ, Forsdick NJ, Brown L, Hoeppner MP, Knapp M, Maloney RF, et al. (December 2018). "Reference Genomes from Distantly Related Species Can Be Used for Discovery of Single Nucleotide Polymorphisms to Inform Conservation Management". Genler. 10 (1): 9. doi:10.3390/genes10010009. PMC  6356778. PMID  30583569.
  132. ^ Li S, Li B, Cheng C, Xiong Z, Liu Q, Lai J, et al. (2014-12-11). "Genomic signatures of near-extinction and rebirth of the crested ibis and other endangered bird species". Genom Biyolojisi. 15 (12): 557. doi:10.1186/s13059-014-0557-1. PMC  4290368. PMID  25496777.
  133. ^ a b Zhan X, Pan S, Wang J, Dixon A, He J, Muller MG, et al. (Mayıs 2013). "Peregrine and saker falcon genome sequences provide insights into evolution of a predatory lifestyle". Doğa Genetiği. 45 (5): 563–6. doi:10.1038/ng.2588. PMID  23525076. S2CID  10858993.
  134. ^ Zhou, Chuang; Tu, Hongmei; Yu, Haoran; Zheng, Shuai; Dai, Bo; Price, Megan; Wu, Yongjie; Yang, Nan; Yue, Bisong; Meng, Yang (September 5, 2019). "The Draft Genome of the Endangered Sichuan Partridge (Arborophila rufipectus) with Evolutionary Implications". Genler. 10 (9): 677. doi:10.3390/genes10090677. ISSN  2073-4425. PMC  6770966. PMID  31491910.
  135. ^ International Chicken Genome Sequencing Consortium. (Aralık 2004). "Sequence and comparative analysis of the chicken genome provide unique perspectives on vertebrate evolution". Doğa. 432 (7018): 695–716. Bibcode:2004Natur.432..695C. doi:10.1038/nature03154. PMID  15592404. S2CID  4405203.
  136. ^ Dalloul RA, Long JA, Zimin AV, Aslam L, Beal K, Blomberg L, et al. (Eylül 2010). "Multi-platform next-generation sequencing of the domestic turkey (Meleagris gallopavo): genome assembly and analysis". PLOS Biyolojisi. 8 (9): e10000475. doi:10.1371/journal.pbio.1000475. PMC  2935454. PMID  20838655.
  137. ^ Vignal, Alain; Boitard, Simon; Thébault, Noémie; Dayo, Guiguigbaza-Kossigan; Yapi-Gnaore, Valentine; Youssao Abdou Karim, Issaka; Berthouly-Salazar, Cécile; Pálinkás-Bodzsár, Nóra; Guémené, Daniel; Thibaud-Nissen, Francoise; Warren, Wesley C. (July 2019). "A guinea fowl genome assembly provides new evidence on evolution following domestication and selection in galliformes". Moleküler Ekoloji Kaynakları. 19 (4): 997–1014. doi:10.1111/1755-0998.13017. ISSN  1755-0998. PMC  6579635. PMID  30945415.
  138. ^ Jaiswal SK, Gupta A, Saxena R (5 May 2018). "Genome Sequence of Indian Peacock Reveals the Peculiar Case of a Glittering Bird". bioRxiv. doi:10.1101/315457. S2CID  196632443.
  139. ^ Liu, Yang; Liu, Simin; Zhang, Nan; Chen, De; Que, Pinjia; Liu, Naijia; Höglund, Jacob; Zhang, Zhengwang; Wang, Biao (2019-12-01). "Genome Assembly of the Common Pheasant Phasianus colchicus: A Model for Speciation and Ecological Genomics". Genom Biyolojisi ve Evrim. 11 (12): 3326–3331. doi:10.1093/gbe/evz249. PMC  7145668. PMID  31713630.
  140. ^ Lee CY, Hsieh PH, Chiang LM, Chattopadhyay A, Li KY, Lee YF, et al. (Mayıs 2018). "Whole-genome de novo sequencing reveals unique genes that contributed to the adaptive evolution of the Mikado pheasant". GigaScience. 7 (5). doi:10.1093/gigascience/giy044. PMC  5941149. PMID  29722814.
  141. ^ Wang B, Ekblom R, Bunikis I, Siitari H, Höglund J (March 2014). "Whole genome sequencing of the black grouse (Tetrao tetrix): reference guided assembly suggests faster-Z and MHC evolution". BMC Genomics. 15: 180. doi:10.1186/1471-2164-15-180. PMC  4022176. PMID  24602261.
  142. ^ Sutton JT, Helmkampf M, Steiner CC, Bellinger MR, Korlach J, Hall R, et al. (Ağustos 2018). "A High-Quality, Long-Read De Novo Genome Assembly to Aid Conservation of Hawaii's Last Remaining Crow Species". Genler. 9 (8): 393. doi:10.3390/genes9080393. PMC  6115840. PMID  30071683.
  143. ^ Gan HM, Falk S, Morales HE, Austin CM, Sunnucks P, Pavlova A (September 2019). "Genomic evidence of neo-sex chromosomes in the eastern yellow robin". GigaScience. 8 (9). doi:10.1093/gigascience/giz111. PMC  6736294. PMID  31494668.
  144. ^ a b Ellegren H, Smeds L, Burri R, Olason PI, Backström N, Kawakami T, et al. (Kasım 2012). "The genomic landscape of species divergence in Ficedula flycatchers". Doğa. 491 (7426): 756–60. Bibcode:2012Natur.491..756E. doi:10.1038/nature11584. PMID  23103876. S2CID  4414084.
  145. ^ Formenti G, Chiara M, Poveda L, Francoijs KJ, Bonisoli-Alquati A, Canova L, et al. (Ocak 2019). "SMRT uzun okumaları ve Doğrudan Etiket ve Leke optik haritaları, Avrupa ahır yutması (Hirundo rustica rustica) için yüksek kaliteli bir genom topluluğunun oluşturulmasına izin verir". GigaScience. 8 (1). doi:10.1093 / gigascience / giy142. PMC  6324554. PMID  30496513.
  146. ^ Colquitt BM, Mets DG, Brainard MS (Mart 2018). "Bengal ispinozunun taslak genom topluluğu, Lonchura striata domestica, motor beceri değişkenliği ve öğrenme modeli". GigaScience. 7 (3): 1–6. doi:10.1093 / gigascience / giy008. PMC  5861438. PMID  29618046.
  147. ^ Alexander S, Bent P, Brett BW, Eleftheria P, Ellie AE, Gregg TW, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - Cennet kuşu Lycocorax pyrrhopterus'un genom verileri. gigadb.org. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102158. Alındı 2019-06-14.
  148. ^ a b c d Prost S, Armstrong EE, Nylander J, Thomas GW, Suh A, Petersen B, vd. (Mayıs 2019). "Karşılaştırmalı analizler, cennet kuşlarının evriminde potansiyel olarak yer alan genomik özellikleri tanımlar". GigaScience. 8 (5). doi:10.1093 / gigascience / giz003. PMC  6497032. PMID  30689847.
  149. ^ de Villemereuil, Pierre; Rutschmann, Alexis; Lee, Kate D .; Ewen, John G .; Brekke, Patricia; Santure, Anna W. (2019-03-04). "Tehdit Altındaki Yolcu Kuşunda Küçük Uyarlanabilir Potansiyel". Güncel Biyoloji. 29 (5): 889-894.e3. doi:10.1016 / j.cub.2019.01.072. ISSN  0960-9822. PMID  30799244. S2CID  72334429.
  150. ^ Alexander S, Bent P, Brett BW, Eleftheria P, Ellie AE, Gregg TW, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - Cennet kuşunun genom verileri, Paradisaea rubra. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102160.
  151. ^ Alexander S, Bent P, Brett BW, Eleftheria P, Ellie AE, Gregg TW, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - Cennet kuşunun genom verileri, Pteridophora alberti. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102161.
  152. ^ Alexander S, Bent P, Brett BW, Eleftheria P, Ellie AE, Gregg TW, ve diğerleri. (2019). "Genomik". Cennet kuşunun genom verileri, Ptiloris paradiseus. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102159.
  153. ^ Warren WC, Clayton DF, Ellegren H, Arnold AP, Hillier LW, Künstner A, ve diğerleri. (Nisan 2010). "Bir ötücü kuşun genomu". Doğa. 464 (7289): 757–62. Bibcode:2010Natur.464..757W. doi:10.1038 / nature08819. PMC  3187626. PMID  20360741.
  154. ^ a b Kolchanova S, Kliver S, Komissarov A, Dobrinin P, Tamazian G, Grigorev K, vd. (Ocak 2019). "Birbiriyle Yakın Akraba Olan Üç Karayip Amazonunun Genomları Türlerin Tarihi ve Korunması Hakkında Bilgi Sağlıyor". Genler. 10 (1): 54. doi:10.3390 / genes10010054. PMC  6356210. PMID  30654561.
  155. ^ Oleksyk TK, Pombert JF, Siu D, Mazo-Vargas A, Ramos B, Guiblet W, ve diğerleri. (Eylül 2012). "Yerel olarak finanse edilen bir Porto Riko papağanı (Amazona vittata) genom dizileme projesi, kuş verilerini artırıyor ve genç araştırmacı eğitimini ilerletiyor". GigaScience. 1 (1): 14. doi:10.1186 / 2047-217X-1-14. PMC  3626513. PMID  23587420.
  156. ^ Seabury CM, Dowd SE, Seabury PM, Raudsepp T, Brightsmith DJ, Liboriussen P, ve diğerleri. (2013-05-08). "Scarlet Macaw (Ara macao) için çok platformlu taslak de novo genom derlemesi ve karşılaştırmalı analiz". PLOS ONE. 8 (5): e62415. Bibcode:2013PLoSO ... 862415S. doi:10.1371 / journal.pone.0062415. PMC  3648530. PMID  23667475.
  157. ^ Galla SJ, Moraga R, Brown L, Cleland S, Hoeppner MP, Maloney RF, Richardson A, Slater L, Santure AW, Steeves TE (2020). "Nesli tükenmekte olan iki kuşta eşleştirme kararlarını bilgilendirmek için soyağacı, genetik ve genomik akrabalık tahminlerinin karşılaştırması: Dünya çapında koruma ıslah programları için çıkarımlar". Evrimsel Uygulamalar. 13 (5): 991–1008. doi:10.1111 / eva.12916. PMC  7232769. PMID  32431748.
  158. ^ a b c d e f g h ben j k l m n Ö p q r s Pan H, Cole TL, Bi X, Fang M, Zhou C, Yang Z, ve diğerleri. (Eylül 2019). "Penguenlerin evrimini aydınlatmak için yüksek kapsamlı genomlar". GigaScience. 8 (9). doi:10.1093 / gigascience / giz117. PMC  6904868. PMID  31531675.
  159. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102182 - Kral pengueninden (Aptenodytes patagonicus) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102182.
  160. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102170 - Batı rockhopper pengueninden (Eudyptes chrysocome) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102170.
  161. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102165 - Macaroni pengueninden (Eudyptes chrysolophus chrysolophus) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102165.
  162. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102164 - Kraliyet pengueninden (Eudyptes chrysolophus schlegeli) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102164.
  163. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102169 - Doğu rockhopper pengueninden (Eudyptes filholi) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102169.
  164. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Seti - DOI 10.5524 / 102171 - Kuzey rockhopper pengueninden (Eudyptes moseleyi) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102171.
  165. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102166 - Fiordland tepeli penguenden (Eudyptes pachyrhynchus) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102166.
  166. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102167 - Snares tepeli penguenden (Eudyptes robustus) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102167.
  167. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102168 - Dik tepeli penguenden (Eudyptes sclateri) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102168.
  168. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Seti - DOI 10.5524 / 102177 - Beyaz yüzlü penguenden (Eudyptula minor albosignata) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102177.
  169. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102178 - Küçük mavi penguenden (Eudyptula minor minor) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102178.
  170. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102179 - Peri pengueninden (Eudyptula novaehollandiae) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102179.
  171. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102172 - Sarı gözlü penguenden genomik veriler (Megadyptes antipodes antipodes). GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102172.
  172. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102181 - Chinstrap pengueninden (Pygoscelis antarctica) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102181.
  173. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102180 - Gentoo pengueninden (Pygoscelis papua) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102180.
  174. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102176 - Humboldt pengueninden (Spheniscus humboldti) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102176.
  175. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102173 - Macellan pengueninden (Spheniscus magellanicus) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102173.
  176. ^ Alan DT, Andrew RH, McKinlay B, Charles-André B, Chengran Z, Daniel KT, ve diğerleri. (2019). "Genomik". GigaDB Veri Kümesi - DOI 10.5524 / 102175 - Galápagos pengueninden (Spheniscus mendiculus) genomik veriler. GigaScience Veritabanı. doi:10.5524/102175.
  177. ^ a b Hanna ZR, Henderson JB, Wall JD, Emerling CA, Fuchs J, Runckel C, ve diğerleri. (Ekim 2017). "Kuzey Benekli Baykuş (Strix occidentalis caurina) Genomu: Çubuklu Baykuş (Strix varia) ile Diverjans ve Işıkla İlişkili Genlerin Karakterizasyonu". Genom Biyolojisi ve Evrim. 9 (10): 2522–2545. doi:10.1093 / gbe / evx158. PMC  5629816. PMID  28992302.
  178. ^ a b c d Burga A, Wang W, Ben-David E, Wolf PC, Ramey AM, Verdugo C, Lyons K, Parker PG, Kruglyak L (Haziran 2017). "Galapagos karabatağındaki uçuş kaybının evriminin genetik imzası". Bilim. 356 (6341): eaal3345. doi:10.1126 / science.aal3345. PMC  5567675. PMID  28572335.
  179. ^ Warren WC, Hillier LW, Marshall Graves JA, Birney E, Ponting CP, Grützner F, et al. (Mayıs 2008). "Ornitorenklerin genom analizi, evrimin eşsiz izlerini ortaya koyuyor". Doğa. 453 (7192): 175–83. Bibcode:2008Natur.453..175W. doi:10.1038 / nature06936. PMC  2803040. PMID  18464734.
  180. ^ Mikkelsen TS, Wakefield MJ, Aken B, Amemiya CT, Chang JL, Duke S, ve diğerleri. (Mayıs 2007). "Keseli Monodelphis domestica'nın genomu, kodlamayan dizilerde yeniliği ortaya koyuyor". Doğa. 447 (7141): 167–77. Bibcode:2007Natur.447..167M. doi:10.1038 / nature05805. PMID  17495919. S2CID  4337232.
  181. ^ Brandies, Parice A .; Tang, Simon; Johnson, Robert S. P .; Hogg, Carolyn J .; Sevgili Katherine (2020). "İlk Antechinus referans genomu, semelparite ve yaşa bağlı nöropatolojilerin genetik temelini araştırmak için bir kaynak sağlar". Gigabayt. 2020: 1–22. doi:10.46471 / gigabyte.7. Alındı 2020-11-17.
  182. ^ Topluluk girişi
  183. ^ Feigin CY, Newton AH, Doronina L, Schmitz J, Hipsley CA, Mitchell KJ, ve diğerleri. (Ocak 2018). "Tazmanya kaplanının genomu, soyu tükenmiş bir keseli etoburun evrimi ve demografisi hakkında fikir veriyor." Doğa Ekolojisi ve Evrimi. 2 (1): 182–192. doi:10.1038 / s41559-017-0417-y. PMID  29230027. S2CID  4630578.
  184. ^ Renfree MB, Papenfuss AT, Deakin JE, Lindsay J, Heider T, Belov K, ve diğerleri. (Ağustos 2011). "Avustralya kanguru Macropus eugenii'nin genom dizisi, memelilerin üremesinin ve gelişiminin evrimi hakkında bilgi sağlar". Genom Biyolojisi. 12 (8): R81. doi:10.1186 / gb-2011-12-8-r81. PMC  3277949. PMID  21854559.
  185. ^ Davey, M. (10 Nisan 2013). "Avustralyalılar koalanın genetik planının kodunu çözüyor". Yaş. Alındı 25 Haziran 2013.
  186. ^ a b "Memeli Genom Projesi". MIT. Arşivlenen orijinal 2009-01-06 tarihinde. Alındı 2012-05-23.
  187. ^ Grigorev K, Kliver S, Dobrynin P, Komissarov A, Wolfsberger W, Krasheninnikova K, ve diğerleri. (Haziran 2018). "Yenilikçi montaj stratejisi, Hispaniola adasında nesli tükenmekte olan Solenodon paradoksusunun evrimini ve koruma genetiğini anlamaya katkıda bulunur". GigaScience. 7 (6). doi:10.1093 / gigascience / giy025. PMC  6009670. PMID  29718205.
  188. ^ a b c d Parker J, Tsagkogeorga G, Cotton JA, Liu Y, Provero P, Stupka E, Rossiter SJ (Ekim 2013). "Yankılanan memelilerde yakınsak evrimin genom çapında imzaları". Doğa. 502 (7470): 228–31. Bibcode:2013Natur.502..228P. doi:10.1038 / nature12511. PMC  3836225. PMID  24005325.
  189. ^ a b Lindblad-Toh K, Garber M, Zuk O, Lin MF, Parker BJ, Washietl S, vd. (Ekim 2011). "29 memelinin kullanıldığı, insanın evrimsel kısıtlamasının yüksek çözünürlüklü haritası". Doğa. 478 (7370): 476–82. Bibcode:2011Natur.478..476.. doi:10.1038 / nature10530. PMC  3207357. PMID  21993624.
  190. ^ Topluluk girişi
  191. ^ a b c d e Gutiérrez-Guerrero, Yocelyn T .; Ibarra-Laclette, Enrique; Martínez del Río, Carlos; Barrera-Redondo, Josué; Rebollar, Eria A .; Ortega, Jorge; León-Paniagua, Livia; Urrutia, Araxi; Aguirre-Planter, Erika; Eguiarte, Luis E. (2020-06-01). "Yaprak burunlu yarasalarda nektarivori nedeniyle beslenme çeşitliliği ve paralel evrimin genomik sonuçları". GigaScience. 9 (6). doi:10.1093 / gigascience / giaa059. PMC  7276932. PMID  32510151.
  192. ^ Topluluk girişi
  193. ^ Gibbs RA, Rogers J, Katze MG, Bumgarner R, Weinstock GM, Mardis ER, ve diğerleri. (Nisan 2007). "Rhesus makak genomundan evrimsel ve biyomedikal bilgiler". Bilim. 316 (5822): 222–34. Bibcode:2007Sci ... 316..222.. doi:10.1126 / science.1139247. PMID  17431167. S2CID  10535839.
  194. ^ a b Yan G, Zhang G, Fang X, Zhang Y, Li C, Ling F, ve diğerleri. (Ekim 2011). "İki insan olmayan primat hayvan modelinin, cynomolgus ve Çin rhesus makaklarının genom dizilemesi ve karşılaştırması". Doğa Biyoteknolojisi. 29 (11): 1019–23. doi:10.1038 / nbt.1992. PMID  22002653. S2CID  9218360.
  195. ^ Wang L, Wu J, Liu X, Di D, Liang Y, Feng Y, vd. (Ağustos 2019). "Nesli tükenmekte olan altın burunlu maymun (Rhinopithecus roxellana) için yüksek kaliteli bir genom topluluğu". GigaScience. 8 (8). doi:10.1093 / gigascience / giz098. PMC  6705546. PMID  31437279.
  196. ^ Locke DP, Hillier LW, Warren WC, Worley KC, Nazareth LV, Muzny DM, vd. (Ocak 2011). "Orangutan genomlarının karşılaştırmalı ve demografik analizi". Doğa. 469 (7331): 529–33. Bibcode:2011Natur.469..529L. doi:10.1038 / nature09687. PMC  3060778. PMID  21270892.
  197. ^ Scally A, Dutheil JY, Hillier LW, Jordan GE, Goodhead I, Herrero J, vd. (Mart 2012). "Goril genom diziliminden hominid evrimine ilişkin bilgiler". Doğa. 483 (7388): 169–75. Bibcode:2012Natur.483..169S. doi:10.1038 / nature10842. PMC  3303130. PMID  22398555.
  198. ^ McPherson JD, Marra M, Hillier L, Waterston RH, Chinwalla A, Wallis J, vd. (Şubat 2001). "İnsan genomunun fiziksel bir haritası". Doğa. 409 (6822): 934–41. Bibcode:2001Natur.409..934M. doi:10.1038/35057157. PMID  11237014. S2CID  186244510.
  199. ^ Venter JC, Adams MD, Myers EW, Li PW, Mural RJ, Sutton GG, ve diğerleri. (Şubat 2001). "İnsan genomunun dizisi". Bilim. 291 (5507): 1304–51. Bibcode:2001Sci ... 291.1304V. doi:10.1126 / bilim.1058040. PMID  11181995. S2CID  85981305.
  200. ^ "Psst, insan genomu hiçbir zaman tam olarak sıralanmadı". STAT. 2017-06-20. Alındı 2017-10-23.
  201. ^ Green RE, Krause J, Briggs AW, Maricic T, Stenzel U, Kircher M, ve diğerleri. (Mayıs 2010). "Neandertal genomunun taslak dizisi". Bilim. 328 (5979): 710–722. Bibcode:2010Sci ... 328..710G. doi:10.1126 / science.1188021. PMC  5100745. PMID  20448178.
  202. ^ Şempanze Sıralama ve Analiz Konsorsiyumu. (Eylül 2005). "Şempanze genomunun ilk dizisi ve insan genomu ile karşılaştırma". Doğa. 437 (7055): 69–87. Bibcode:2005 Natur. 437 ... 69.. doi:10.1038 / nature04072. PMID  16136131. S2CID  2638825.
  203. ^ Prüfer K, Munch K, Hellmann I, Akagi K, Miller JR, Walenz B, vd. (Haziran 2012). "Bonobo genomunun şempanze ve insan genomları ile karşılaştırılması". Doğa. 486 (7404): 527–31. Bibcode:2012Natur.486..527P. doi:10.1038 / nature11128. PMC  3498939. PMID  22722832.
  204. ^ Topluluk girişi
  205. ^ Worley KC, Warren WC, Rogers J, Locke D, Muzny DM, Mardis ER, ve diğerleri. (Marmoset Genome Sequencing and Analysis Consortium) (Ağustos 2014). "Ortak marmoset genomu, primat biyolojisi ve evrimi hakkında fikir verir". Doğa Genetiği. 46 (8): 850–7. doi:10.1038 / ng.3042. PMC  4138798. PMID  25038751.
  206. ^ Dobrynin P, Liu S, Tamazian G, Xiong Z, Yurchenko AA, Krasheninnikova K, et al. (Aralık 2015). "Afrika çitası Acinonyx jubatus'un genomik mirası". Genom Biyolojisi. 16 (1): 277. doi:10.1186 / s13059-015-0837-4. PMC  4676127. PMID  26653294.
  207. ^ Pontius JU, Mullikin JC, Smith DR, Lindblad-Toh K, Gnerre S, Clamp M, ve diğerleri. (Kasım 2007). "Kedi genomunun ilk dizisi ve karşılaştırmalı analizi". Genom Araştırması. 17 (11): 1675–89. doi:10.1101 / gr.6380007. PMC  2045150. PMID  17975172.
  208. ^ a b c d Cho YS, Hu L, Hou H, Lee H, Xu J, Kwon S, ve diğerleri. (2013). "Kaplan genomu ve aslan ve kar leoparı genomları ile karşılaştırmalı analiz". Doğa İletişimi. 4: 2433. Bibcode:2013NatCo ... 4.2433C. doi:10.1038 / ncomms3433. PMC  3778509. PMID  24045858.
  209. ^ a b Kim S, Cho YS, Kim HM, Chung O, Kim H, Jho S, ve diğerleri. (Ekim 2016). "Etobur, hepçil ve otobur memeli genomlarının yeni bir leopar topluluğu ile karşılaştırılması". Genom Biyolojisi. 17 (1): 211. doi:10.1186 / s13059-016-1071-4. PMC  5090899. PMID  27802837.
  210. ^ Lindblad-Toh K, Wade CM, Mikkelsen TS, Karlsson EK, Jaffe DB, Kamal M, ve diğerleri. (Aralık 2005). "Evcil köpeğin genom dizisi, karşılaştırmalı analizi ve haplotip yapısı". Doğa. 438 (7069): 803–19. Bibcode:2005Natur.438..803L. doi:10.1038 / nature04338. PMID  16341006. S2CID  4338513.
  211. ^ Gopalakrishnan S, Samaniego Castruita JA, Sinding MS, Kuderna LF, Räikkönen J, Petersen B, ve diğerleri. (Haziran 2017). "Kurt referans genom dizisi (Canis lupus lupus) ve bunun Canis spp. Popülasyon genomiği üzerindeki etkileri". BMC Genomics. 18 (1): 495. doi:10.1186 / s12864-017-3883-3. PMC  5492679. PMID  28662691.
  212. ^ Armstrong EE, Taylor RW, Prost S, Blinston P, van der Meer E, Madzikanda H, ve diğerleri. (Şubat 2019). "Afrika yaban köpeği (Lycaon pictus) genomunun bağlantılı okumalar kullanılarak uygun maliyetli bir şekilde birleştirilmesi". GigaScience. 8 (2). doi:10.1093 / gigascience / giy124. PMC  6350039. PMID  30346553.
  213. ^ Li R, Fan W, Tian G, Zhu H, He L, Cai J, ve diğerleri. (Ocak 2010). "Dev panda genomunun sekansı ve de novo topluluğu". Doğa. 463 (7279): 311–7. Bibcode:2010Natur.463..311L. doi:10.1038 / nature08696. PMC  3951497. PMID  20010809.
  214. ^ Taylor GA, Kirk H, Coombe L, Jackman SD, Chu J, Tse K, vd. (Kasım 2018). "Kuzey Amerika Bozayı veya Boz Ayısının Genomu: Ursus arctos ssp. Horribilis". Genler. 9 (12): 598. doi:10.3390 / genes9120598. PMC  6315469. PMID  30513700.
  215. ^ Srivastava A, Kumar Sarsani V, Fiddes I, Sheehan SM, Seger RL, Barter ME, ve diğerleri. (Şubat 2019). "Amerikan kara ayısındaki genom birleşmesi ve gen ekspresyonu, kış uykusuna verilen böbrek yanıtına yeni bakış açıları sağlıyor". DNA Araştırması. 26 (1): 37–44. doi:10.1093 / dnares / dsy036. PMC  6379037. PMID  30395234.
  216. ^ Liu S, Lorenzen ED, Fumagalli M, Li B, Harris K, Xiong Z, ve diğerleri. (Mayıs 2014). "Popülasyon genomiği, kutup ayılarında son türleşmeyi ve hızlı evrimsel adaptasyonu ortaya koyuyor". Hücre. 157 (4): 785–94. doi:10.1016 / j.cell.2014.03.054. PMC  4089990. PMID  24813606.
  217. ^ Li B, Zhang G, Willersleve E, Wang J, Wang J (2011). "Kutup ayısından alınan genomik veriler (Ursus maritimus)". GigaScience. doi:10.5524/100008. Alındı 2019-06-21. | bölüm = yok sayıldı (Yardım)
  218. ^ a b c AD, Liu Y, Thomas GW, Vinař T, Alföldi J, Deng J, vd. (Mart 2015). "Deniz memelilerinin genomlarının yakınsak evrimi". Doğa Genetiği. 47 (3): 272–5. doi:10.1038 / ng.3198. PMC  4644735. PMID  25621460.
  219. ^ Jones SJ, Haulena M, Taylor GA, Chan S, Bilobram S, Warren RL, vd. (Aralık 2017). "Kuzey Deniz Samuru'nun Genomu (Enhydra lutris kenyoni)". Genler. 8 (12): 379. doi:10.3390 / genes8120379. PMC  5748697. PMID  29232880.
  220. ^ Colella JP, Lan T, Schuster SC, Talbot SL, Cook JA, Lindqvist C (2018-05-31). "Mustela erminea, darbeli hibridizasyonun yüksek enlemlerde evrimi etkilediğini buldu". İletişim Biyolojisi. 1 (1): 51. doi:10.1038 / s42003-018-0058-y. PMC  6123727. PMID  30271934.
  221. ^ Peng X, Alföldi J, Gori K, Eisfeld AJ, Tyler SR, Tisoncik-Go J, ve diğerleri. (Aralık 2014). "Gelinciklerin (Mustela putorius furo) taslak genom dizisi, insan solunum yolu hastalıklarının incelenmesini kolaylaştırır". Doğa Biyoteknolojisi. 32 (12): 1250–5. doi:10.1038 / nbt.3079. PMC  4262547. PMID  25402615.
  222. ^ Beichman AC, Koepfli KP, Li G, Murphy W, Dobrynin P, Kilver S, ve diğerleri. (Haziran 2019). "Sucul adaptasyon ve tükenmiş çeşitlilik: su samuru ve dev su samurunun genomlarına derin bir dalış". Moleküler Biyoloji ve Evrim. 36 (12): 2631–2655. doi:10.1093 / molbev / msz101. PMID  31212313.
  223. ^ Dastjerdi A, Robert C, Watson M (2014). "İki Asya fili (Elephas maximus) genomunun düşük kapsamlı sekanslaması". GigaScience. 3: 12. doi:10.1186 / 2047-217X-3-12. PMC  4106201. PMID  25053995.
  224. ^ UCSC tarayıcı girişi
  225. ^ Wade CM, Giulotto E, Sigurdsson S, Zoli M, Gnerre S, Imsland F, ve diğerleri. (Kasım 2009). "Evcil atın genom dizisi, karşılaştırmalı analizi ve popülasyon genetiği". Bilim. 326 (5954): 865–7. Bibcode:2009Sci ... 326..865W. doi:10.1126 / science.1178158. PMC  3785132. PMID  19892987.
  226. ^ Kalbfleisch TS, Rice ES, DePriest MS, Walenz BP, Hestand MS, Vermeesch JR, ve diğerleri. (2018-11-16). "Evcil at için geliştirilmiş referans genom, montaj yakınlığını ve bileşimini artırır". İletişim Biyolojisi. 1 (1): 197. doi:10.1038 / s42003-018-0199-z. PMC  6240028. PMID  30456315.
  227. ^ a b c d e f g h ben j k l m n Ö p q r s t sen v w x y z aa ab AC reklam ae af ag Ah ai aj ak al Chen L, Qiu Q, Jiang Y, Wang K, Lin Z, Li Z, ve diğerleri. (Haziran 2019). "Büyük ölçekli geviş getiren genom dizilimi, onların evrimi ve farklı özellikleri hakkında bilgi sağlar". Bilim. 364 (6446): eaav6202. Bibcode:2019Sci ... 364.6202C. doi:10.1126 / science.aav6202. PMID  31221828. S2CID  195191415.
  228. ^ Keane, Michael; Semeiks, Jeremy; Webb, Andrew E .; Li, Yang I .; Quesada, Víctor; Craig, Thomas; Madsen, Lone Bruhn; van Dam, Sipko; Brawand, David; Marques, Patrícia I .; Michalak, Pawel (2015). "Bowhead Balina Genomundan Uzun Ömrünün Evrimine Dair Bilgiler". Hücre Raporları. 10 (1): 112–122. doi:10.1016 / j.celrep.2014.12.008. PMC  4536333. PMID  25565328.
  229. ^ a b c d e Árnason, Úlfur; Lammers, Fritjof; Kumar, Vikas; Nilsson, Maria A .; Janke, Axel (2018). "Mavi balinanın tüm genom dizilemesi ve diğer rorquals, introgresif gen akışı için imzalar bulur". Bilim Gelişmeleri. 4 (4): eaap9873. Bibcode:2018SciA .... 4.9873A. doi:10.1126 / sciadv.aap9873. ISSN  2375-2548. PMC  5884691. PMID  29632892.
  230. ^ a b c Yim HS, Cho YS, Guang X, Kang SG, Jeong JY, Cha SS, ve diğerleri. (Ocak 2014). "Minke balina genomu ve deniz memelilerinde suda yaşama adaptasyonu". Doğa Genetiği. 46 (1): 88–92. doi:10.1038 / ng.2835. PMC  4079537. PMID  24270359.
  231. ^ Wang K, Wang L, Lenstra JA, Jian J, Yang Y, Hu Q, vd. (Nisan 2017). "Bilgenin genom dizisi (Bison bonasus)". GigaScience. 6 (4): 1–5. doi:10.1093 / gigascience / gix016. PMC  5530314. PMID  28327911.
  232. ^ Dong J, Hu Z, Wu C, Guo H, Zhou B, Lv J, ve diğerleri. (Temmuz 2012). "İlişki analizleri, çok sayıda yeni akciğer kanseri duyarlılığı lokusunu ve bunların Çin popülasyonunda sigara içilmesiyle olan etkileşimlerini tanımlar". Doğa Genetiği. 44 (8): 895–9. doi:10.1038 / ng.2351. PMC  6628171. PMID  22797725.
  233. ^ Canavez FC, Luche DD, Stothard P, Leite KR, Sousa-Canavez JM, Plastow G, ve diğerleri. (2012). "Bos indicus'un genom dizisi ve montajı". Kalıtım Dergisi. 103 (3): 342–8. doi:10.1093 / jhered / esr153. PMID  22315242.
  234. ^ Elsik CG, Tellam RL, Worley KC, Gibbs RA, Muzny DM, Weinstock GM, ve diğerleri. (Nisan 2009). "Taurin sığırlarının genom dizisi: geviş getiren biyolojisine ve evrime açılan bir pencere". Bilim. 324 (5926): 522–8. Bibcode:2009Sci ... 324..522A. doi:10.1126 / science.1169588. PMC  2943200. PMID  19390049.
  235. ^ Williams JL, Iamartino D, Pruitt KD, Sonstegard T, Smith TP, Low WY, vd. (Ekim 2017). "Nehir bufaloları için genom birleştirme ve transkriptom kaynağı, Bubalus bubalis (2n = 50)". GigaScience. 6 (10): 1–6. doi:10.1093 / gigascience / gix088. PMC  5737279. PMID  29048578.
  236. ^ Koepfli KP, Tamazian G, Wildt D, Dobrynin P, Kim C, Frandsen PB, ve diğerleri. (Haziran 2019). "Yerinde Popülasyonlar". G3. 9 (6): 1785–1793. doi:10.1534 / g3.119.400084. PMC  6553546. PMID  31000506.
  237. ^ Farré M, Li Q, Zhou Y, Damas J, Chemnick LG, Kim J, ve diğerleri. (Şubat 2019). "Gemsbok'un (Oryx gazella) kromozom ölçeğine yakın bir genom topluluğu: Kalahari çölünün ikonik bir antilopu". GigaScience. 8 (2). doi:10.1093 / gigascience / giy162. PMC  6351727. PMID  30649288.
  238. ^ Yang Y, Wang Y, Zhao Y, Zhang X, Li R, Chen L, vd. (Aralık 2017). "Marco Polo Koyunun (Ovis ammon polii) taslak genomu". GigaScience. 6 (12): 1–7. doi:10.1093 / gigascience / gix106. PMC  5740985. PMID  29112761.
  239. ^ Zhang C, Chen L, Zhou Y, Wang K, Chemnick LG, Ryder OA, ve diğerleri. (Şubat 2018). "Milu'nun taslak genomu (Elaphurus davidianus)". GigaScience. 7 (2). doi:10.1093 / gigascience / gix130. PMC  5824821. PMID  29267854.
  240. ^ Li Z, Lin Z, Ba H, Chen L, Yang Y, Wang K, ve diğerleri. (Aralık 2017). "Ren geyiğinin (Rangifer tarandus) taslak genomu". GigaScience. 6 (12): 1–5. doi:10.1093 / gigascience / gix102. PMC  5726476. PMID  29099922.
  241. ^ Ming Y, Jian J, Yu X, Wang J, Liu W (Mayıs 2019). "Hint-Pasifik kambur yunusu, Sousa chinensis'in korunması için genom kaynakları". Bilimsel Veriler. 6 (1): 68. Bibcode:2019NatSD ... 6 ... 68M. doi:10.1038 / s41597-019-0078-6. PMC  6531461. PMID  31118413.
  242. ^ Farré M, Li Q, Darolti I, Zhou Y, Damas J, Proskuryakova AA, ve diğerleri. (Ağustos 2019). "Masai zürafasının (Giraffa camelopardalis tippelskirchi) entegre bir kromozom ölçekli genom topluluğu". GigaScience. 8 (8). doi:10.1093 / gigascience / giz090. PMC  6669057. PMID  31367745.
  243. ^ Ip S (12 Aralık 2017). "Beluga balinası genomu ilk kez Vancouver'da sıralandı". Vancouver Sun.
  244. ^ Fan Z, Li W, Jin J, Cui K, Yan C, Peng C, ve diğerleri. (Nisan 2018). "Orman misk geyiğinin (Moschus berezovskii) taslak genom dizisi". GigaScience. 7 (4). doi:10.1093 / gigascience / giy038. PMC  5906906. PMID  29635287.
  245. ^ Fan G, Zhang Y, Liu X, Wang J, Sun Z, Sun S, vd. (Temmuz 2019). "Ekoloji ve evrimi incelemek için bir kaynak olarak bir deniz memelisinin ilk kromozom seviyesindeki genomu". Moleküler Ekoloji Kaynakları. 19 (4): 944–956. doi:10.1111/1755-0998.13003. PMID  30735609. S2CID  73451140.
  246. ^ Groenen MA, Archibald AL, Uenishi H, Tuggle CK, Takeuchi Y, Rothschild MF, vd. (Kasım 2012). "Domuz genomlarının analizi, domuz demografisi ve evrimi hakkında fikir veriyor". Doğa. 491 (7424): 393–8. Bibcode:2012Natur.491..393G. doi:10.1038 / nature11622. PMC  3566564. PMID  23151582.
  247. ^ Herrera-Alvarez S, Karlsson E, Ryder OA, Lindblad-Toh K, Crawford AJ (2018-09-23). "Bir kemirgen devi nasıl yapılır: Dünyanın en büyük kemirgeni olan kapibara'da devliğin genomik temeli ve ödünleşmeleri". bioRxiv  10.1101/424606. doi:10.1101/424606. S2CID  92321538. Alıntı dergisi gerektirir | günlük = (Yardım)
  248. ^ Long AD, Baldwin-Brown J, Tao Y, Cook VJ, Balderrama-Gutierrez G, Crobett-Detig R, Mortazavi R, Barbour AG (Temmuz 2019). "Genomu Peromyscus leucopus, Lyme hastalığı ve diğer ortaya çıkan enfeksiyonlar için doğal konak ". Bilim Gelişmeleri. 5 (7): eaaw6441. Bibcode:2019SciA .... 5.6441L. doi:10.1126 / sciadv.aaw6441. PMC  6656541. PMID  31355335.
  249. ^ Hardin A, Nevonen KA, Eckalbar WL, Carbone L, Ahituv N (Ağu 2019). "Çok eşli fare Mastomys coucha'nın karşılaştırmalı genomik karakterizasyonu". Moleküler Biyoloji ve Evrim. 36 (12): 2805–2812. doi:10.1093 / molbev / msz188. PMC  6878952. PMID  31424545.
  250. ^ Waterston RH, Lindblad-Toh K, Birney E, Rogers J, Abril JF, Agarwal P, ve diğerleri. (Aralık 2002). "Fare genomunun ilk sıralaması ve karşılaştırmalı analizi". Doğa. 420 (6915): 520–62. Bibcode:2002Natur.420..520W. doi:10.1038 / nature01262. PMID  12466850.
  251. ^ Gibbs RA, Weinstock GM, Metzker ML, Muzny DM, Sodergren EJ, Scherer S, ve diğerleri. (Nisan 2004). "Kahverengi Norveç sıçanının genom dizisi, memeli evrimine dair içgörü sağlar". Doğa. 428 (6982): 493–521. Bibcode:2004Natur.428..493G. doi:10.1038 / nature02426. PMID  15057822. S2CID  4415600.
  252. ^ Topluluk girişi
  253. ^ a b Harrison MC, Jongepier E, Robertson HM, Arning N, Bitard-Feildel T, Chao H, ve diğerleri. (Mart 2018). "Hemimetabol genomlar, termit tüm sosyalliğinin moleküler temelini ortaya koyuyor". Doğa Ekolojisi ve Evrimi. 2 (3): 557–566. doi:10.1038 / s41559-017-0459-1. PMC  6482461. PMID  29403074.
  254. ^ Li S, Zhu S, Jia Q, Yuan D, Ren C, Li K, ve diğerleri. (Mart 2018). "Amerikan hamam böceğindeki gelişimsel plastisitenin genomik ve işlevsel manzaraları". Doğa İletişimi. 9 (1): 1008. Bibcode:2018NatCo ... 9.1008L. doi:10.1038 / s41467-018-03281-1. PMC  5861062. PMID  29559629.
  255. ^ Terrapon N, Li C, Robertson HM, Ji L, Meng X, Booth W, ve diğerleri. (Mayıs 2014). "Bir termit genomundaki alternatif sosyal organizasyonun moleküler izleri". Doğa İletişimi. 5: 3636. Bibcode:2014NatCo ... 5.3636T. doi:10.1038 / ncomms4636. PMID  24845553.
  256. ^ Poulsen M, Hu H, Li C, Chen Z, Xu L, Otani S, vd. (Ekim 2014). "Bir mantar yetiştiriciliği termitinde bitki ayrışmasına tamamlayıcı ortak ortak katkılar". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 111 (40): 14500–5. Bibcode:2014PNAS..11114500P. doi:10.1073 / pnas.1319718111. PMC  4209977. PMID  25246537.
  257. ^ Keeling CI, Yuen MM, Liao NY, Docking TR, Chan SK, Taylor GA, ve diğerleri. (Mart 2013). "Dağ çam böceğinin taslak genomu, Dendroctonus ponderosae Hopkins, büyük bir orman zararlısı". Genom Biyolojisi. 14 (3): R27. doi:10.1186 / gb-2013-14-3-r27. PMC  4053930. PMID  23537049.
  258. ^ a b Fallon TR, Lower SE, Chang CH, Bessho-Uehara M, Martin GJ, Bewick AJ, vd. (Ekim 2018). Waterhouse R, Tautz D (editörler). "Ateşböceği genomları, böceklerdeki biyolüminesansın paralel kökenlerini aydınlatıyor". eLife. 7: e36495. doi:10.7554 / eLife.36495. PMC  6191289. PMID  30324905.
  259. ^ Wang K, Li P, Gao Y, Liu C, Wang Q, Yin J, vd. (Nisan 2019). "Beyaz benekli çiçekli mayıs böceğinin (Protaetia brevitarsis) de novo genom topluluğu". GigaScience. 8 (4). doi:10.1093 / gigascience / giz019. PMC  6449472. PMID  30949689.
  260. ^ Richards S, Gibbs RA, Weinstock GM, Brown SJ, Denell R, Beeman RW, ve diğerleri. (Nisan 2008). "Model böceğin genomu ve Tribolium castaneum zararlısı" (PDF). Doğa. 452 (7190): 949–55. Bibcode:2008Natur.452..949R. doi:10.1038 / nature06784. PMID  18362917. S2CID  4402128.
  261. ^ Meng F, Liu Z, Han H, Finkelbergs D, Jiang Y, Zhu M, vd. (Mart 2020). "Aldrichina grahami'nin kromozom düzeyinde genom topluluğu, adli açıdan önemli bir sinek". GigaScience. 9 (3). doi:10.1093 / gigascience / giaa020. PMC  7081965. PMID  32191812.
  262. ^ Drukewitz SH, Bokelmann L, Undheim EA, von Reumont BM (Temmuz 2019). "Sıfırdan toksinler mi? Yırtıcı soyguncu sineğin çeşitli, çok modlu gen kökenleri Dasypogon diadema, çift kanatlı böceklerde dinamik bir zehir evrimine işaret ediyor". GigaScience. 8 (7). doi:10.1093 / gigascience / giz081. PMC  6615979. PMID  31289835.
  263. ^ Kim S, Oh M, Jung W, Park J, Choi HG, Shin SC (Mart 2017). "Antarktika Yarımadası'ndan kanatlı tatarcık, Parochlus steinenii'nin genom dizilimi". GigaScience. 6 (3): 1–8. doi:10.1093 / gigascience / giw009. PMC  5467013. PMID  28327954.
  264. ^ Dikow RB, Frandsen PB, Turcatel M, Dikow T (2017/01/31). "Proctacanthus coquilletti (Insecta: Diptera: Asilidae) ve 16 temsili transkriptom". PeerJ. 5: e2951. doi:10.7717 / peerj.2951. PMC  5289110. PMID  28168115.
  265. ^ Nene V, Wortman JR, Lawson D, Haas B, Kodira C, Tu ZJ, vd. (Haziran 2007). "Aedes aegypti'nin genom dizisi, büyük bir arbovirüs vektörü". Bilim. 316 (5832): 1718–23. Bibcode:2007Sci ... 316.1718N. doi:10.1126 / science.1138878. PMC  2868357. PMID  17510324.
  266. ^ Chen XG, Jiang X, Gu J, Xu M, Wu Y, Deng Y, ve diğerleri. (Kasım 2015). "Asya Kaplan sivrisineği Aedes albopictus'un genom dizisi, biyolojisi, genetiği ve evrimi hakkında içgörüleri ortaya koyuyor". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 112 (44): E5907-15. Bibcode:2015PNAS..112E5907C. doi:10.1073 / pnas.1516410112. PMC  4640774. PMID  26483478.
  267. ^ Holt RA, Subramanian GM, Halpern A, Sutton GG, Charlab R, Nusskern DR, ve diğerleri. (Ekim 2002). "Sıtma sivrisineği Anopheles gambiae'nin genom dizisi". Bilim. 298 (5591): 129–49. Bibcode:2002Sci ... 298..129H. doi:10.1126 / bilim.1076181. PMID  12364791. S2CID  4512225.H
  268. ^ a b Lawniczak MK, Emrich SJ, Holloway AK, Regier AP, Olson M, White B, ve diğerleri. (Ekim 2010). "Yeni başlayan Anopheles gambiae türleri arasında tüm genom dizilerinin ortaya çıkardığı yaygın farklılıklar". Bilim. 330 (6003): 512–4. Bibcode:2010Sci ... 330..512L. doi:10.1126 / science.1195755. PMC  3674514. PMID  20966253.
  269. ^ Zhou D, Zhang D, Ding G, Shi L, Hou Q, Ye Y, ve diğerleri. (Ocak 2014). "Anopheles sinensis'in genom dizisi, sıtma parazitleri için sivrisinek yeterliliğinin genetik temeli hakkında bilgi sağlar". BMC Genomics. 15 (1): 42. doi:10.1186/1471-2164-15-42. PMC  3901762. PMID  24438588.
  270. ^ a b c d e f g h ben j k l m n Ö Neafsey DE, Waterhouse RM, Abai MR, Aganezov SS, Alekseyev MA, Allen JE, ve diğerleri. (Ocak 2015). "Sivrisinek genomiği. Son derece evrim geçirebilen sıtma vektörleri: 16 Anofel sivrisinekinin genomları". Bilim. 347 (6217): 1258522. doi:10.1126 / science.1258522. PMC  4380271. PMID  25554792.
  271. ^ Ghurye J, Koren S, Small ST, Redmond S, Howell P, Phillippy AM, Besansky NJ (Haziran 2019). "Afrika'nın başlıca sıtma vektörü Anopheles funestus'un kromozom ölçeğinde bir birleşimi". GigaScience. 8 (6). doi:10.1093 / gigascience / giz063. PMC  6545970. PMID  31157884.
  272. ^ Arensburger P, Megy K, Waterhouse RM, Abrudan J, Amedeo P, Antelo B, ve diğerleri. (Ekim 2010). "Culex quinquefasciatus dizilimi, sivrisinek karşılaştırmalı genomikleri için bir platform oluşturur". Bilim. 330 (6000): 86–8. Bibcode:2010Sci ... 330 ... 86A. doi:10.1126 / science.1191864. PMC  3740384. PMID  20929810.
  273. ^ Zhou Q, Zhu HM, Huang QF, Zhao L, Zhang GJ, Roy SW, ve diğerleri. (Mart 2012). "Drosophila albomicans'ın taslak genomu ile neo-cinsiyet ve B kromozomu evriminin deşifre edilmesi". BMC Genomics. 13: 109. doi:10.1186/1471-2164-13-109. PMC  3353239. PMID  22439699.
  274. ^ a b c d e f g h ben j Clark AG, Eisen MB, Smith DR, Bergman CM, Oliver B, Markow TA, ve diğerleri. (Kasım 2007). "Drosophila soyoluşunda genlerin ve genomların evrimi". Doğa. 450 (7167): 203–18. Bibcode:2007Natur.450..203C. doi:10.1038 / nature06341. PMID  17994087. S2CID  2416812.
  275. ^ a b c d e f g h "Drosophila modENCODE Projesi BCM-HGSC". Baylor Tıp Fakültesi, İnsan Genomu Dizileme Merkezi.
  276. ^ Adams MD, Celniker SE, Holt RA, Evans CA, Gocayne JD, Amanatides PG, vd. (Mart 2000). "Drosophila melanogaster'in genom dizisi". Bilim. 287 (5461): 2185–95. Bibcode:2000Sci ... 287.2185.. doi:10.1126 / science.287.5461.2185. PMID  10731132.
  277. ^ Hamilton PT, Leong JS, Koop BF, Perlman SJ (Mart 2014). "Drosophila savunma ortak yaşamında transkripsiyonel yanıtlar". Moleküler Ekoloji. 23 (6): 1558–70. doi:10.1111 / mec.12603. PMID  24274471. S2CID  2964885.
  278. ^ Richards S, Liu Y, Bettencourt BR, Hradecky P, Letovsky S, Nielsen R, vd. (Ocak 2005). "Drosophila psödoobscura'nın karşılaştırmalı genom dizilimi: kromozomal, gen ve cis-element evrimi". Genom Araştırması. 15 (1): 1–18. doi:10.1101 / gr.3059305. PMC  540289. PMID  15632085.
  279. ^ "Drosophila santomea genomu - sürüm 1.0". Andolfatto Laboratuvarı. Princeton Üniversitesi.
  280. ^ a b Jiménez-Guri E, Huerta-Cepas J, Cozzuto L, Wotton KR, Kang H, Himmelbauer H, ve diğerleri. (Şubat 2013). "Erken dipteran gelişiminin karşılaştırmalı transkriptomikleri". BMC Genomics. 14: 123. doi:10.1186/1471-2164-14-123. PMC  3616871. PMID  23432914.
  281. ^ Martinson EO, Peyton J, Kelkar YD, Jennings EC, Benoit JB, Werren JH, Denlinger DL (Mayıs 2019). "Sarcophaga bullata". G3. 9 (5): 1313–1320. doi:10.1534 / g3.119.400148. PMC  6505164. PMID  30926723.
  282. ^ Lemke S, Antonopoulos DA, Meyer F, Domanus MH, Schmidt-Ott U (Mayıs 2011). "Gezinme sineği Episyrphus balteatus'un (Syrphidae) embriyonik transkriptomlarındaki BMP sinyal bileşenleri". BMC Genomics. 12: 278. doi:10.1186/1471-2164-12-278. PMC  3224130. PMID  21627820.
  283. ^ International Aphid Genomics Consortium (Şubat 2010). "Acyrthosiphon pisum bezelye yaprak bitinin genom dizisi". PLOS Biyolojisi. 8 (2): e1000313. doi:10.1371 / journal.pbio.1000313. PMC  2826372. PMID  20186266.
  284. ^ Yang P, Yu S, Hao J, Liu W, Zhao Z, Zhu Z, vd. (Eylül 2019). "Çin beyaz balmumu pullu böcek Ericerus pela'nın genom dizisi: ölçek böceklerinin Coccidae ailesi için ilk taslak genomu". GigaScience. 8 (9). doi:10.1093 / gigascience / giz113. PMC  6743827. PMID  31518402.
  285. ^ Zhu J, Jiang F, Wang X, Yang P, Bao Y, Zhao W, ve diğerleri. (Aralık 2017). "Küçük kahverengi bitki zararlısı Laodelphax striatellus'un genom dizisi". GigaScience. 6 (12): 1–12. doi:10.1093 / gigascience / gix109. PMC  5740986. PMID  29136191.
  286. ^ Kingan SB, Urban J, Lambert CC, Baybayan P, Childers AK, Coates B, et al. (Ekim 2019). "PacBio Sequel II sistemi kullanılarak sahada toplanan tek bir fener sineğinden (Lycorma delicatula) yüksek kaliteli bir genom topluluğu". GigaScience. 8 (10). doi:10.1093 / gigascience / giz122. PMC  6791401. PMID  31609423.
  287. ^ Mesquita RD, Vionette-Amaral RJ, Lowenberger C, Rivera-Pomar R, Monteiro FA, Minx P, ve diğerleri. (Aralık 2015). "Chagas hastalığının bir böcek vektörü olan Rhodnius prolixus Genomu, hematofajiye ve parazit enfeksiyonuna benzersiz adaptasyonları ortaya koymaktadır". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 112 (48): 14936–41. Bibcode:2015PNAS..11214936M. doi:10.1073 / pnas.1506226112. PMC  4672799. PMID  26627243.
  288. ^ Chen W, Shakir S, Bigham M, Richter A, Fei Z, Jander G (Nisan 2019). "Mısır yaprak bitinin (Rhopalosiphum maidis Fitch) genom dizisi". GigaScience. 8 (4). doi:10.1093 / gigascience / giz033. PMC  6451198. PMID  30953568.
  289. ^ Chen J, Fan J, Zhang Y, Li Q, Zhang S, Yin H, ve diğerleri. (2019-08-01). "Sitobion miscanthi tane yaprak biti" nin kromozom düzeyinde taslak genomu ". GigaScience. 8 (8). doi:10.1093 / gigascience / giz101. PMC  6701489. PMID  31430367.
  290. ^ Liu Q, Guo Y, Zhang Y, Hu W, Li Y, Zhu D, vd. (Ağustos 2019). "Chagas hastalığı, Triatoma rubrofasciata için böcek vektörü için bir kromozom düzeyinde genom topluluğu". GigaScience. 8 (8). doi:10.1093 / gigascience / giz089. PMC  6699579. PMID  31425588.
  291. ^ Nygaard S, Zhang G, Schiøtt M, Li C, Wurm Y, Hu H, vd. (Ağustos 2011). "Yaprak kesen karınca Acromyrmex echinatior'un genomu, gelişmiş sosyal yaşama ve mantar yetiştiriciliğine anahtar adaptasyonlar önermektedir". Genom Araştırması. 21 (8): 1339–48. doi:10.1101 / gr.121392.111. PMC  3149500. PMID  21719571.
  292. ^ Honeybee Genome Sequencing Consortium (Ekim 2006). "Apis mellifera bal arısı genomundan sosyal böceklere ilişkin bilgiler". Doğa. 443 (7114): 931–49. Bibcode:2006Natur.443..931T. doi:10.1038 / nature05260. PMC  2048586. PMID  17073008.
  293. ^ Suen G, Teiling C, Li L, Holt C, Abouheif E, Bornberg-Bauer E, vd. (Şubat 2011). Copenhaver G (ed.). "Yaprak kesici karınca Atta cephalotların genom dizisi, zorunlu simbiyotik yaşam tarzına dair içgörüleri ortaya koyuyor". PLOS Genetiği. 7 (2): e1002007. doi:10.1371 / journal.pgen.1002007. PMC  3037820. PMID  21347285.
  294. ^ a b Bonasio R, Zhang G, Ye C, Mutti NS, Fang X, Qin N, ve diğerleri. (Ağustos 2010). "Karıncalar Camponotus floridanus ve Harpegnathos saltator'un genomik karşılaştırması". Bilim. 329 (5995): 1068–71. Bibcode:2010Sci ... 329.1068B. doi:10.1126 / science.1192428. PMC  3772619. PMID  20798317.
  295. ^ Oxley PR, Ji L, Fetter-Pruneda I, McKenzie SK, Li C, Hu H, Zhang G, Kronauer DJ (Şubat 2014). "Klonal akıncı karınca Cerapachys biroi'nin genomu". Güncel Biyoloji. 24 (4): 451–8. doi:10.1016 / j.cub.2014.01.018. PMC  3961065. PMID  24508170.
  296. ^ Konorov EA, Nikitin MA, Mikhailov KV, Lysenkov SN, Belenky M, Chang PL, Nuzhdin SV, Scobeyeva VA (Şubat 2017). "Genomik eksaptasyon, Lasius niger'ın kentsel ortamlara adaptasyonunu sağlar". BMC Evrimsel Biyoloji. 17 (Ek 1): 39. doi:10.1186 / s12862-016-0867-x. PMC  5333191. PMID  28251870.
  297. ^ Smith CD, Zimin A, Holt C, Abouheif E, Benton R, Cash E, vd. (Nisan 2011). "Dünya çapında yaygın olan ve istilacı Arjantin karıncasının (Linepithema humile) taslak genomu". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 108 (14): 5673–8. Bibcode:2011PNAS..108.5673S. doi:10.1073 / pnas.1008617108. PMC  3078359. PMID  21282631.
  298. ^ a b c Werren JH, Richards S, Desjardins CA, Niehuis O, Gadau J, Colbourne JK, ve diğerleri. (Ocak 2010). "Üç parazitoid Nasonia türünün genomlarından işlevsel ve evrimsel içgörüler". Bilim. 327 (5963): 343–8. Bibcode:2010Sci ... 327..343.. doi:10.1126 / science.1178028. PMC  2849982. PMID  20075255.
  299. ^ Kapheim KM, Pan H, Li C, Blatti C, Harpur BA, Ioannidis P, ve diğerleri. (Mart 2019). "Nomia melanderi)". G3. 9 (3): 625–634. doi:10.1534 / g3.118.200865. PMC  6404593. PMID  30642875.
  300. ^ Smith CR, Smith CD, Robertson HM, Helmkampf M, Zimin A, Yandell M, vd. (Nisan 2011). "Kırmızı hasat makinesi karınca Pogonomyrmex barbatus'un taslak genomu". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 108 (14): 5667–72. Bibcode:2011PNAS..108.5667S. doi:10.1073 / pnas.1007901108. PMC  3078412. PMID  21282651.
  301. ^ Wurm Y, Wang J, Riba-Grognuz O, Corona M, Nygaard S, Hunt BG, ve diğerleri. (Nisan 2011). "Ateş karıncası Solenopsis invicta'nın genomu". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 108 (14): 5679–84. Bibcode:2011PNAS..108.5679W. doi:10.1073 / pnas.1009690108. PMC  3078418. PMID  21282665.
  302. ^ Kim SR, Kwak W, Kim H, Caetano-Anolles K, Kim KY, Kim SB, ve diğerleri. (Ocak 2018). "Japon meşe ipek güvesi olan Antheraea yamamai'nin genom dizisi: Saturniidae familyasındaki ilk taslak genomu". GigaScience. 7 (1): 1–11. doi:10.1093 / gigascience / gix113. PMC  5774507. PMID  29186418.
  303. ^ Yen, Eugenie C; McCarthy, Shane A; Galarza, Juan A; Generalovic, Tomas N; Pelan, Sarah; Nguyen, Petr; Meier, Joana I; Warren, Ian A; Mappes, Johanna; Durbin, Richard; Jiggins, Chris D (2020-08-01). "Üçlü kümeleme yoluyla ağaç kaplan güvesi (Arctia plantaginis) için haplotip çözülmüş, de novo genom grubu". GigaScience. 9 (8). doi:10.1093 / gigascience / giaa088. ISSN  2047-217X. PMC  7433188. PMID  32808665.
  304. ^ Nowell RW, Elsworth B, Oostra V, Zwaan BJ, Wheat CW, Saastamoinen M, et al. (Temmuz 2017). "Mykalesine kelebeği Bicyclus anynana'nın yüksek kapsamlı taslak genomu". GigaScience. 6 (7): 1–7. doi:10.1093 / gigascience / gix035. PMC  5493746. PMID  28486658.
  305. ^ Mita K, Kasahara M, Sasaki S, Nagayasu Y, Yamada T, Kanamori H, Namiki N, Kitagawa M, Yamashita H, Yasukochi Y, Kadono-Okuda K, Yamamoto K, Ajimura M, Ravikumar G, Shimomura M, Nagamura Y, Shin-I T, Abe H, Shimada T, Morishita S, Sasaki T (Şubat 2004). "İpekböceğinin genom dizisi, Bombyx mori". DNA Araştırması. 11 (1): 27–35. doi:10.1093 / dnares / 11.1.27. PMID  15141943.
  306. ^ Wan F, Yin C, Tang R, Chen M, Wu Q, Huang C, ve diğerleri. (Eylül 2019). "Cydia pomonella'nın kromozom düzeyinde bir genom topluluğu, kimyasal ekoloji ve böcek ilacı direnci hakkında bilgi sağlar". Doğa İletişimi. 10 (1): 4237. Bibcode:2019NatCo..10.4237W. doi:10.1038 / s41467-019-12175-9. PMC  6748993. PMID  31530873.
  307. ^ Zhan S, Merlin C, Boore JL, Reppert SM (Kasım 2011). "Monarch kelebek genomu, uzun mesafeli göç hakkında bilgi veriyor". Hücre. 147 (5): 1171–85. doi:10.1016 / j.cell.2011.09.052. PMC  3225893. PMID  22118469.
  308. ^ Dasmahapatra KK (Temmuz 2012). "Kelebek genomu, türler arasında gelişigüzel taklit adaptasyonlarının değişimini ortaya koyuyor". Doğa. 487 (7405): 94–8. Bibcode:2012Natur.487 ... 94T. doi:10.1038 / nature11041. PMC  3398145. PMID  22722851.
  309. ^ Ahola V, Lehtonen R, Somervuo P, Salmela L, Koskinen P, Rastas P, ve diğerleri. (Eylül 2014). "Glanville fritillary genomu eski bir karyotipi korur ve Lepidoptera'daki seçici kromozomal füzyonları ortaya çıkarır". Doğa İletişimi. 5 (1): 4737. Bibcode:2014NatCo ... 5.4737A. doi:10.1038 / ncomms5737. PMC  4164777. PMID  25189940.
  310. ^ Cong Q, Li W, Borek D, Otwinowski Z, Grishin NV (Şubat 2019). "Bear Giant-Skipper genomu, yucca köklerinin içinde yaşamak için genetik adaptasyonlar önermektedir". Moleküler Genetik ve Genomik. 294 (1): 211–226. doi:10.1007 / s00438-018-1494-6. PMC  6436644. PMID  30293092.
  311. ^ Lu S, Yang J, Dai X, Xie F, He J, Dong Z, ve diğerleri. (Kasım 2019). "Üçüncü nesil DNA dizileme ve Hi-C analizine dayanan Çin tavus kuşu kelebeğinin (Papilio bianor) kromozom düzeyinde referans genomu". GigaScience. 8 (11). doi:10.1093 / gigascience / giz128. PMC  6827417. PMID  31682256.
  312. ^ Shen J, Cong Q, Kinch LN, Borek D, Otwinowski Z, Grishin NV (2016-11-03). "Pieris rapae, dayanıklı bir uzaylı, bir lahana zararlısı ve bir anti-kanser protein kaynağı". F1000Research. 5: 2631. doi:10.12688 / f1000research.9765.1. PMC  5247789. PMID  28163896.
  313. ^ You M, Yue Z, He W, Yang X, Yang G, Xie M, et al. (Şubat 2013). "Bir heterozigot güve genomu, otçulluk ve detoksifikasyon hakkında bilgi sağlar". Doğa Genetiği. 45 (2): 220–5. doi:10.1038 / ng.2524. PMID  23313953. S2CID  645600.
  314. ^ Gouin A, Bretaudeau A, Nam K, Gimenez S, Aury JM, Duvic B, vd. (Eylül 2017). "Farklı konak-bitki aralıklarına sahip oldukça polifagöz lepidopteran zararlılarının (Spodoptera frugiperda, Noctuidae) iki genomu". Bilimsel Raporlar. 7 (1): 11816. Bibcode:2017NatSR ... 711816G. doi:10.1038 / s41598-017-10461-4. PMC  5613006. PMID  28947760.
  315. ^ Kakumani PK, Malhotra P, Mukherjee SK, Bhatnagar RK (Ağustos 2014). "Ordu kurdu, Spodoptera frugiperda'nın taslak genom topluluğu". Genomik. 104 (2): 134–43. doi:10.1016 / j.ygeno.2014.06.005. PMID  24984256.
  316. ^ Sivasankaran K, Mathew P, Anand S, Ceasar SA, Mariapackiam S, Ignacimuthu S (2017). "Meyve delici güve Eudocima phalonia'nın tam mitokondriyal genom dizisi (Linnaeus, 1763) Lepidoptera: Noctuoidea)". Genomik Verileri. 14: 66–81. doi:10.1016 / j.gdata.2017.09.004. PMC  5633087. PMID  29021958.
  317. ^ Wang X, Fang X, Yang P, Jiang X, Jiang F, Zhao D, vd. (14 Ocak 2014). "Çekirge genomu, sürü oluşumu ve uzun mesafeli uçuş hakkında fikir veriyor". Doğa İletişimi. 5 (1): 2957. Bibcode:2014NatCo ... 5,2957 W. doi:10.1038 / ncomms3957. PMC  3896762. PMID  24423660.
  318. ^ Verlinden H, Sterck L, Li J, Li Z, Yssel A, Gansemans Y, vd. (27 Temmuz 2020). "Çöl çekirgesinin ilk taslak genom topluluğu, Schistocerca gregaria". F1000Research. 9: 775. doi:10.12688 / f1000research.25148.1. PMC  7607483. PMID  33163158.
  319. ^ Kirkness EF, Haas BJ, Sun W, Braig HR, Perotti MA, Clark JM, vd. (Temmuz 2010). "İnsan vücudu bitinin genom dizileri ve birincil endosimbiyonu, kalıcı parazitik yaşam tarzına ilişkin içgörüler sağlar". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 107 (27): 12168–73. Bibcode:2010PNAS..10712168K. doi:10.1073 / pnas.1003379107. PMC  2901460. PMID  20566863.
  320. ^ Luo S, Tang M, Frandsen PB, Stewart RJ, Zhou X (Aralık 2018). "Bir su altı mimarının genomu, caddisfly Stenopsyche tienmushanensis Hwang (Insecta: Trichoptera)". GigaScience. 7 (12). doi:10.1093 / gigascience / giy143. PMC  6302954. PMID  30476205.
  321. ^ Jørgensen TS, Petersen B, Petersen HC, Browne PD, Prost S, Stillman JH, ve diğerleri. (Mayıs 2019). "The Genome and mRNA Transcriptome of the Cosmopolitan Calanoid Copepod Acartia tonsa Dana Improve the Understanding of Copepod Genome Size Evolution". Genom Biyolojisi ve Evrim. 11 (5): 1440–1450. doi:10.1093/gbe/evz067. PMC  6526698. PMID  30918947.
  322. ^ "The Daphnia Genomics Consortium". Arşivlenen orijinal 2010-01-09 tarihinde. Alındı 2012-05-23.
  323. ^ "Daphnia pulex v1.0". DOE Joint Genome Institute. Alındı 2009-11-29.
  324. ^ Colbourne JK, Pfrender ME, Gilbert D, Thomas WK, Tucker A, Oakley TH, et al. (Şubat 2011). "The ecoresponsive genome of Daphnia pulex". Bilim. 331 (6017): 555–61. Bibcode:2011Sci...331..555C. doi:10.1126/science.1197761. PMC  3529199. PMID  21292972.
  325. ^ Baldwin-Brown JG, Weeks SC, Long AD (January 2018). "A New Standard for Crustacean Genomes: The Highly Contiguous, Annotated Genome Assembly of the Clam Shrimp Eulimnadia texana Reveals HOX Gene Order and Identifies the Sex Chromosome". Genom Biyolojisi ve Evrim. 10 (1): 143–156. doi:10.1093/gbe/evx280. PMC  5765565. PMID  29294012.
  326. ^ Kenny NJ, Sin YW, Shen X, Zhe Q, Wang W, Chan TF, et al. (Mart 2014). "Genomic sequence and experimental tractability of a new decapod shrimp model, Neocaridina denticulata". Deniz İlaçları. 12 (3): 1419–37. doi:10.3390/md12031419. PMC  3967219. PMID  24619275.
  327. ^ Kao D, Lai AG, Stamataki E, Rosic S, Konstantinides N, Jarvis E, et al. (Kasım 2016). "Parhyale hawaiensis, a model for animal development, regeneration, immunity and lignocellulose digestion". eLife. 5: e20062. doi:10.7554/eLife.20062. PMC  5111886. PMID  27849518.
  328. ^ Tang B, Zhang D, Li H, Jiang S, Zhang H, Xuan F, et al. (Ocak 2020). "Chromosome-level genome assembly reveals the unique genome evolution of the swimming crab (Portunus trituberculatus)". GigaScience. 9 (1). doi:10.1093/gigascience/giz161. PMC  6944217. PMID  31904811.
  329. ^ Gutekunst J, Andriantsoa R, Falckenhayn C, Hanna K, Stein W, Rasamy J, Lyko F (March 2018). "Clonal genome evolution and rapid invasive spread of the marbled crayfish". Doğa Ekolojisi ve Evrimi. 2 (3): 567–573. doi:10.1038/s41559-018-0467-9. PMID  29403072. S2CID  3354026.
  330. ^ Kang S, Ahn DH, Lee JH, Lee SG, Shin SC, Lee J, et al. (Ocak 2017). "The genome of the Antarctic-endemic copepod, Tigriopus kingsejongensis". GigaScience. 6 (1): 1–9. doi:10.1093/gigascience/giw010. PMC  5467011. PMID  28369352.
  331. ^ Nossa CW, Havlak P, Yue JX, Lv J, Vincent KY, Brockmann HJ, et al. (2014). "Joint assembly and genetic mapping of the Atlantic horseshoe crab genome reveals ancient whole genome duplication". GigaScience. 3: 9. doi:10.1186/2047-217X-3-9. PMC  4066314. PMID  24987520.
  332. ^ Shingate P, Ravi V, Prasad A, Tay BH, Garg KM, Chattopadhyay B, et al. (2020). "Chromosome-level assembly of the horseshoe crab genome provides insights into its genome evolution". Doğa İletişimi. 11 (1): 2322. Bibcode:2020NatCo..11.2322S. doi:10.1038/s41467-020-16180-1. PMC  7210998. PMID  32385269.
  333. ^ a b Sanggaard KW, Bechsgaard JS, Fang X, Duan J, Dyrlund TF, Gupta V, et al. (May 2014). "Spider genomes provide insight into composition and evolution of venom and silk". Doğa İletişimi. 5: 3765. Bibcode:2014NatCo...5.3765S. doi:10.1038/ncomms4765. PMC  4273655. PMID  24801114.
  334. ^ Sánchez-Herrero JF, Frías-López C, Escuer P, Hinojosa-Alvarez S, Arnedo MA, Sánchez-Gracia A, Rozas J (August 2019). "The draft genome sequence of the spider Dysdera silvatica (Araneae, Dysderidae): A valuable resource for functional and evolutionary genomic studies in chelicerates". GigaScience. 8 (8). doi:10.1093/gigascience/giz099. PMC  6701490. PMID  31430368.
  335. ^ Gulia-Nuss M, Nuss AB, Meyer JM, Sonenshine DE, Roe RM, Waterhouse RM, et al. (Şubat 2016). "Genomic insights into the Ixodes scapularis tick vector of Lyme disease". Doğa İletişimi. 7: 10507. Bibcode:2016NatCo...710507G. doi:10.1038/ncomms10507. PMC  4748124. PMID  26856261.
  336. ^ Cao Z, Yu Y, Wu Y, Hao P, Di Z, He Y, et al. (2013). "The genome of Mesobuthus martensii reveals a unique adaptation model of arthropods". Doğa İletişimi. 4: 2602. Bibcode:2013NatCo...4.2602C. doi:10.1038/ncomms3602. PMC  3826648. PMID  24129506.
  337. ^ Babb PL, Lahens NF, Correa-Garhwal SM, Nicholson DN, Kim EJ, Hogenesch JB, et al. (Mayıs 2017). "The Nephila clavipes genome highlights the diversity of spider silk genes and their complex expression". Doğa Genetiği. 49 (6): 895–903. doi:10.1038/ng.3852. PMID  28459453. S2CID  1221097.
  338. ^ Schwager EE, Sharma PP, Clarke T, Leite DJ, Wierschin T, Pechmann M, et al. (Temmuz 2017). "The house spider genome reveals an ancient whole-genome duplication during arachnid evolution". BMC Biyoloji. 15 (1): 62. doi:10.1186/s12915-017-0399-x. PMC  5535294. PMID  28756775.
  339. ^ Grbić M, Van Leeuwen T, Clark RM, Rombauts S, Rouzé P, Grbić V, et al. (Kasım 2011). "The genome of Tetranychus urticae reveals herbivorous pest adaptations". Doğa. 479 (7374): 487–92. Bibcode:2011Natur.479..487G. doi:10.1038/nature10640. PMC  4856440. PMID  22113690.
  340. ^ Dong X, Armstrong SD, Xia D, Makepeace BL, Darby AC, Kadowaki T (1 March 2017). "Draft genome of the honey bee ectoparasitic mite, Tropilaelaps mercedesae, is shaped by the parasitic life history". Gigascience. 6 (3): 1–17. doi:10.1093/gigascience/gix008. PMC  5467014. PMID  28327890.
  341. ^ Chipman AD, Ferrier DE, Brena C, Qu J, Hughes DS, Schröder R, et al. (Kasım 2014). "The first myriapod genome sequence reveals conservative arthropod gene content and genome organisation in the centipede Strigamia maritima". PLOS Biyolojisi. 12 (11): e1002005. doi:10.1371/journal.pbio.1002005. PMC  4244043. PMID  25423365.
  342. ^ Boothby TC, Tenlen JR, Smith FW, Wang JR, Patanella KA, Nishimura EO, et al. (Aralık 2015). "Evidence for extensive horizontal gene transfer from the draft genome of a tardigrade". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 112 (52): 15976–81. Bibcode:2015PNAS..11215976B. doi:10.1073/pnas.1510461112. PMC  4702960. PMID  26598659.
  343. ^ Koutsovoulos G, Kumar S, Laetsch DR, Stevens L, Daub J, Conlon C, Maroon H, Thomas F, Aboobaker A, Blaxter M (2015). "The genome of the tardigrade Hypsibius dujardini". bioRxiv  10.1101/033464.
  344. ^ Guo Y, Zhang Y, Liu Q, Huang Y, Mao G, Yue Z, et al. (Ekim 2019). "A chromosomal-level genome assembly for the giant African snail Achatina fulica". GigaScience. 8 (10). doi:10.1093/gigascience/giz124. PMC  6802634. PMID  31634388.
  345. ^ Brejova B, Albertin CB, Silva F, Gardner P, Baril T, Hayward A, et al. (2020-01-01). "A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux". GigaScience. 9 (1). doi:10.1093/gigascience/giz152. PMC  6962438. PMID  31942620.
  346. ^ Li C, Liu X, Liu B, Ma B, Liu F, Liu G, et al. (Nisan 2018). "Draft genome of the Peruvian scallop Argopecten purpuratus". GigaScience. 7 (4). doi:10.1093/gigascience/giy031. PMC  5905365. PMID  29617765.
  347. ^ a b Sun J, Zhang Y, Xu T, Zhang Y, Mu H, Zhang Y, et al. (Nisan 2017). "Adaptation to deep-sea chemosynthetic environments as revealed by mussel genomes". Doğa Ekolojisi ve Evrimi. 1 (5): 121. doi:10.1038/s41559-017-0121. PMID  28812709. S2CID  26405671.
  348. ^ Adema CM, Hillier LW, Jones CS, Loker ES, Knight M, Minx P, et al. (Mayıs 2017). "Whole genome analysis of a schistosomiasis-transmitting freshwater snail". Doğa İletişimi. 8: 15451. Bibcode:2017NatCo...815451A. doi:10.1038/ncomms15451. PMC  5440852. PMID  28508897.
  349. ^ Li Y, Sun X, Hu X, Xun X, Zhang J, Guo X, et al. (Kasım 2017). "Scallop genome reveals molecular adaptations to semi-sessile life and neurotoxins". Doğa İletişimi. 8 (1): 1721. Bibcode:2017NatCo...8.1721L. doi:10.1038/s41467-017-01927-0. PMC  5700196. PMID  29167427.
  350. ^ Zhang G, Fang X, Guo X, Li L, Luo R, Xu F, et al. (Ekim 2012). "The oyster genome reveals stress adaptation and complexity of shell formation". Doğa. 490 (7418): 49–54. Bibcode:2012Natur.490...49Z. doi:10.1038/nature11413. hdl:10722/251007. PMID  22992520. S2CID  52853995.
  351. ^ Calcino AD, Luiz de Oliveira A, Simakov O, Schwaha T, Zieger E, Wollesen T, et al. (Ekim 2019). "The quagga mussel genome and the evolution of freshwater tolerance". DNA Araştırması. 26 (5): 411–422. doi:10.1093/dnares/dsz019. PMC  6796509. PMID  31504356.
  352. ^ Belcaid M, Casaburi G, McAnulty SJ, Schmidbaur H, Suria AM, Moriano-Gutierrez S, et al. (Şubat 2019). "Symbiotic organs shaped by distinct modes of genome evolution in cephalopods". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 116 (8): 3030–3035. doi:10.1073/pnas.1817322116. PMC  6386654. PMID  30635418.
  353. ^ Cai H, Li Q, Fang X, Li J, Curtis NE, Altenburger A, et al. (Şubat 2019). "A draft genome assembly of the solar-powered sea slug Elysia chlorotica". Bilimsel Veriler. 6: 190022. Bibcode:2019NatSD...690022C. doi:10.1038/sdata.2019.22. PMC  6380222. PMID  30778257.
  354. ^ Nam BH, Kwak W, Kim YO, Kim DG, Kong HJ, Kim WJ, et al. (Mayıs 2017). "Genome sequence of pacific abalone (Haliotis discus hannai): the first draft genome in family Haliotidae". GigaScience. 6 (5): 1–8. doi:10.1093/gigascience/gix014. PMC  5439488. PMID  28327967.
  355. ^ Whitelaw, Brooke L; Cooke, Ira R; Finn, Julian; da Fonseca, Rute R; Ritschard, Elena A; Gilbert, M T P; Simakov, Oleg; Strugnell, Jan M (November 2020). "Adaptive venom evolution and toxicity in octopods is driven by extensive novel gene formation, expansion, and loss". GigaScience. 9 (11). doi:10.1093/gigascience/giaa120. ISSN  2047-217X. PMC  7656900. PMID  33175168.
  356. ^ a b c Simakov O, Marletaz F, Cho SJ, Edsinger-Gonzales E, Havlak P, Hellsten U, et al. (January 2013). "Insights into bilaterian evolution from three spiralian genomes". Doğa. 493 (7433): 526–31. Bibcode:2013Natur.493..526S. doi:10.1038/nature11696. PMC  4085046. PMID  23254933.
  357. ^ Uliano-Silva M, Dondero F, Dan Otto T, Costa I, Lima NC, Americo JA, et al. (Şubat 2018). "A hybrid-hierarchical genome assembly strategy to sequence the invasive golden mussel, Limnoperna fortunei". GigaScience. 7 (2). doi:10.1093/gigascience/gix128. PMC  5836269. PMID  29267857.
  358. ^ Murgarella M, Puiu D, Novoa B, Figueras A, Posada D, Canchaya C (2016-03-15). "A First Insight into the Genome of the Filter-Feeder Mussel Mytilus galloprovincialis". PLOS ONE. 11 (3): e0151561. Bibcode:2016PLoSO..1151561M. doi:10.1371/journal.pone.0151561. PMC  4792442. PMID  26977809.
  359. ^ Albertin CB, Simakov O, Mitros T, Wang ZY, Pungor JR, Edsinger-Gonzales E, et al. (Ağustos 2015). "The octopus genome and the evolution of cephalopod neural and morphological novelties". Doğa. 524 (7564): 220–4. Bibcode:2015Natur.524..220A. doi:10.1038/nature14668. PMC  4795812. PMID  26268193.
  360. ^ Kim BM, Kang S, Ahn DH, Jung SH, Rhee H, Yoo JS, et al. (Kasım 2018). "Yaygın uzun kollu ahtapotun genomu Minör Octopus". GigaScience. 7 (11). doi:10.1093 / gigascience / giy119. PMC  6279123. PMID  30256935.
  361. ^ Zarrella I, Herten K, Maes GE, Tai S, Yang M, Seuntjens E, et al. (Nisan 2019). "The survey and reference assisted assembly of the Octopus vulgaris genome". Bilimsel Veriler. 6 (1): 13. Bibcode:2019NatSD...6...13Z. doi:10.1038/s41597-019-0017-6. PMC  6472339. PMID  30931949.
  362. ^ Wang S, Zhang J, Jiao W, Li J, Xun X, Sun Y, et al. (Nisan 2017). "Scallop genome provides insights into evolution of bilaterian karyotype and development". Doğa Ekolojisi ve Evrimi. 1 (5): 120. doi:10.1038/s41559-017-0120. PMID  28812685. S2CID  10331741.
  363. ^ Kenny NJ, McCarthy SA, Dudchenko O, James K, Betteridge E, Corton C, et al. (Mayıs 2020). "The gene-rich genome of the scallop Pecten maximus". GigaScience. 9 (5). doi:10.1093/gigascience/giaa037. PMC  7191990. PMID  32352532.
  364. ^ Takeuchi T, Kawashima T, Koyanagi R, Gyoja F, Tanaka M, Ikuta T, et al. (Nisan 2012). "Draft genome of the pearl oyster Pinctada fucata: a platform for understanding bivalve biology". DNA Araştırması. 19 (2): 117–30. doi:10.1093/dnares/dss005. PMC  3325083. PMID  22315334.
  365. ^ Liu C, Zhang Y, Ren Y, Wang H, Li S, Jiang F, et al. (Eylül 2018). "The genome of the golden apple snail Pomacea canaliculata provides insight into stress tolerance and invasive adaptation". GigaScience. 7 (9). doi:10.1093/gigascience/giy101. PMC  6129957. PMID  30107526.
  366. ^ Mun S, Kim YJ, Markkandan K, Shin W, Oh S, Woo J, et al. (Haziran 2017). "The Whole-Genome and Transcriptome of the Manila Clam (Ruditapes philippinarum)". Genom Biyolojisi ve Evrim. 9 (6): 1487–1498. doi:10.1093/gbe/evx096. PMC  5499747. PMID  28505302.
  367. ^ Powell D, Subramanian S, Suwansa-Ard S, Zhao M, O'Connor W, Raftos D, Elizur A (December 2018). "The genome of the oyster Saccostrea offers insight into the environmental resilience of bivalves". DNA Araştırması. 25 (6): 655–665. doi:10.1093/dnares/dsy032. PMC  6289776. PMID  30295708.
  368. ^ Bai CM, Xin LS, Rosani U, Wu B, Wang QC, Duan XK, et al. (Temmuz 2019). "Chromosomal-level assembly of the blood clam, Scapharca (Anadara) broughtonii, using long sequence reads and Hi-C". GigaScience. 8 (7). doi:10.1093/gigascience/giz067. PMC  6615981. PMID  31289832.
  369. ^ Renaut S, Guerra D, Hoeh WR, Stewart DT, Bogan AE, Ghiselli F, et al. (Temmuz 2018). "Genome Survey of the Freshwater Mussel Venustaconcha ellipsiformis (Bivalvia: Unionida) Using a Hybrid De Novo Assembly Approach". Genom Biyolojisi ve Evrim. 10 (7): 1637–1646. doi:10.1093/gbe/evy117. PMC  6054159. PMID  29878181.
  370. ^ Wang X, Chen W, Huang Y, Sun J, Men J, Liu H, et al. (Ekim 2011). "The draft genome of the carcinogenic human liver fluke Clonorchis sinensis". Genom Biyolojisi. 12 (10): R107. doi:10.1186/gb-2011-12-10-r107. PMC  3333777. PMID  22023798.
  371. ^ a b c d Tsai IJ, Zarowiecki M, Holroyd N, Garciarrubio A, Sánchez-Flores A, Brooks KL, et al. (Nisan 2013). "The genomes of four tapeworm species reveal adaptations to parasitism". Doğa. 496 (7443): 57–63. Bibcode:2013Natur.496...57.. doi:10.1038/nature12031. PMC  3964345. PMID  23485966.
  372. ^ Zheng H, Zhang W, Zhang L, Zhang Z, Li J, Lu G, et al. (Ekim 2013). "The genome of the hydatid tapeworm Echinococcus granulosus". Doğa Genetiği. 45 (10): 1168–75. doi:10.1038/ng.2757. PMID  24013640. S2CID  205347630.
  373. ^ Young ND, Jex AR, Li B, Liu S, Yang L, Xiong Z, et al. (Ocak 2012). "Whole-genome sequence of Schistosoma haematobium". Doğa Genetiği. 44 (2): 221–5. doi:10.1038/ng.1065. hdl:10072/45821. PMID  22246508. S2CID  13309839.
  374. ^ a b Stroehlein AJ, Korhonen PK, Chong TM, Lim YL, Chan KG, Webster B, et al. (Eylül 2019). "High-quality Schistosoma haematobium genome achieved by single-molecule and long-range sequencing". GigaScience. 8 (9). doi:10.1093/gigascience/giz108. PMC  6736295. PMID  31494670.
  375. ^ Schistosoma japonicum Genome Sequencing and Functional Analysis Consortium (July 2009). "The Schistosoma japonicum genome reveals features of host-parasite interplay". Doğa. 460 (7253): 345–51. Bibcode:2009Natur.460..345Z. doi:10.1038/nature08140. PMC  3747554. PMID  19606140.
  376. ^ Berriman M, Haas BJ, LoVerde PT, Wilson RA, Dillon GP, Cerqueira GC, et al. (Temmuz 2009). "The genome of the blood fluke Schistosoma mansoni". Doğa. 460 (7253): 352–8. Bibcode:2009Natur.460..352B. doi:10.1038/nature08160. PMC  2756445. PMID  19606141.
  377. ^ Protasio AV, Tsai IJ, Babbage A, Nichol S, Hunt M, Aslett MA, et al. (Ocak 2012). "A systematically improved high quality genome and transcriptome of the human blood fluke Schistosoma mansoni". PLOS İhmal Edilen Tropikal Hastalıklar. 6 (1): e1455. doi:10.1371/journal.pntd.0001455. PMC  3254664. PMID  22253936.
  378. ^ "Proje". Arşivlenen orijinal 2012-03-08 tarihinde. Alındı 2012-05-23.
  379. ^ "SmedGD".
  380. ^ Schwarz EM, Hu Y, Antoshechkin I, Miller MM, Sternberg PW, Aroian RV (April 2015). "The genome and transcriptome of the zoonotic hookworm Ancylostoma ceylanicum identify infection-specific gene families". Doğa Genetiği. 47 (4): 416–22. doi:10.1038/ng.3237. PMC  4617383. PMID  25730766.
  381. ^ Jex AR, Liu S, Li B, Young ND, Hall RS, Li Y, et al. (Ekim 2011). "Ascaris suum draft genome". Doğa. 479 (7374): 529–33. Bibcode:2011Natur.479..529J. doi:10.1038/nature10553. PMID  22031327. S2CID  205226683.
  382. ^ Ghedin E, Wang S, Spiro D, Caler E, Zhao Q, Crabtree J, et al. (Eylül 2007). "Draft genome of the filarial nematode parasite Brugia malayi". Bilim. 317 (5845): 1756–60. Bibcode:2007Sci ... 317.1756G. doi:10.1126 / science.1145406. PMC  2613796. PMID  17885136.
  383. ^ Kikuchi T, Cotton JA, Dalzell JJ, Hasegawa K, Kanzaki N, McVeigh P, et al. (Eylül 2011). "Genomic insights into the origin of parasitism in the emerging plant pathogen Bursaphelenchus xylophilus". PLOS Patojenleri. 7 (9): e1002219. doi:10.1371/journal.ppat.1002219. PMC  3164644. PMID  21909270.
  384. ^ Mortazavi A, Schwarz EM, Williams B, Schaeffer L, Antoshechkin I, Wold BJ, et al. (Aralık 2010). "Scaffolding a Caenorhabditis nematode genome with RNA-seq". Genom Araştırması. 20 (12): 1740–7. doi:10.1101/gr.111021.110. PMC  2990000. PMID  20980554.
  385. ^ "GSC: Caenorhabditis n. sp. PB2801". Arşivlenen orijinal 18 Ağustos 2007. Alındı 28 Nisan 2007.
  386. ^ "Wormbase". Alındı 4 Eylül 2015.
  387. ^ Stein LD, Bao Z, Blasiar D, Blumenthal T, Brent MR, Chen N, et al. (November 2003). "The genome sequence of Caenorhabditis briggsae: a platform for comparative genomics". PLOS Biyolojisi. 1 (2): E45. doi:10.1371/journal.pbio.0000045. PMC  261899. PMID  14624247.
  388. ^ C. elegans Sequencing Consortium. (Aralık 1998). "Genome sequence of the nematode C. elegans: a platform for investigating biology". Bilim. 282 (5396): 2012–8. Bibcode:1998Sci ... 282.2012.. doi:10.1126 / science.282.5396.2012. PMID  9851916.
  389. ^ "GSC: Caenorhabditis remanei". Arşivlenen orijinal 13 Mart 2007. Alındı 28 Nisan 2007.
  390. ^ Haag ES, Chamberlin H, Coghlan A, Fitch DH, Peters AD, Schulenburg H (March 2007). "Caenorhabditis evolution: if they all look alike, you aren't looking hard enough" (PDF). Genetikte Eğilimler. 23 (3): 101–4. doi:10.1016/j.tig.2007.01.002. PMID  17275130.
  391. ^ Godel C, Kumar S, Koutsovoulos G, Ludin P, Nilsson D, Comandatore F, et al. (Kasım 2012). "The genome of the heartworm, Dirofilaria immitis, reveals drug and vaccine targets". FASEB Dergisi. 26 (11): 4650–61. doi:10.1096/fj.12-205096. PMC  3475251. PMID  22889830.
  392. ^ Cotton JA, Lilley CJ, Jones LM, Kikuchi T, Reid AJ, Thorpe P, et al. (Mart 2014). "The genome and life-stage specific transcriptomes of Globodera pallida elucidate key aspects of plant parasitism by a cyst nematode". Genom Biyolojisi. 15 (3): R43. doi:10.1186/gb-2014-15-3-r43. PMC  4054857. PMID  24580726.
  393. ^ Laing R, Kikuchi T, Martinelli A, Tsai IJ, Beech RN, Redman E, et al. (Ağustos 2013). "The genome and transcriptome of Haemonchus contortus, a key model parasite for drug and vaccine discovery". Genom Biyolojisi. 14 (8): R88. doi:10.1186/gb-2013-14-8-r88. PMC  4054779. PMID  23985316.
  394. ^ Masonbrink R, Maier TR, Muppirala U, Seetharam AS, Lord E, Juvale PS, et al. (9 February 2019). "The genome of the soybean cyst nematode (Heterodera glisinler) reveals complex patterns of duplications involved in the evolution of parasitism genes". BMC Genomics. 20 (1): 119. doi:10.1186/s12864-019-5485-8. PMC  6367775. PMID  30732586.
  395. ^ Bai X, Adams BJ, Ciche TA, Clifton S, Gaugler R, Kim KS, et al. (18 Temmuz 2013). "A lover and a fighter: the genome sequence of an entomopathogenic nematode Heterorhabditis bacteriophora". PLOS ONE. 8 (7): e69618. Bibcode:2013PLoSO...869618B. doi:10.1371/journal.pone.0069618. PMC  3715494. PMID  23874975.
  396. ^ Desjardins CA, Cerqueira GC, Goldberg JM, Dunning Hotopp JC, Haas BJ, Zucker J, et al. (Mayıs 2013). "Genomics of Loa loa, a Wolbachia-free filarial parasite of humans". Doğa Genetiği. 45 (5): 495–500. doi:10.1038/ng.2585. PMC  4238225. PMID  23525074.
  397. ^ Opperman CH, Bird DM, Williamson VM, Rokhsar DS, Burke M, Cohn J, et al. (Eylül 2008). "Sequence and genetic map of Meloidogyne hapla: A compact nematode genome for plant parasitism". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 105 (39): 14802–7. Bibcode:2008PNAS..10514802O. doi:10.1073/pnas.0805946105. PMC  2547418. PMID  18809916.
  398. ^ Abad P, Gouzy J, Aury JM, Castagnone-Sereno P, Danchin EG, Deleury E, et al. (Ağustos 2008). "Genome sequence of the metazoan plant-parasitic nematode Meloidogyne incognita". Doğa Biyoteknolojisi. 26 (8): 909–15. doi:10.1038/nbt.1482. PMID  18660804. S2CID  8836601.
  399. ^ Tang YT, Gao X, Rosa BA, Abubucker S, Hallsworth-Pepin K, Martin J, et al. (Mart 2014). "Genome of the human hookworm Necator americanus". Doğa Genetiği. 46 (3): 261–269. doi:10.1038/ng.2875. PMC  3978129. PMID  24441737.
  400. ^ a b "Filarial worms Database". 2015-06-04. Alındı 5 Haziran 2015.
  401. ^ Dieterich C, Clifton SW, Schuster LN, Chinwalla A, Delehaunty K, Dinkelacker I, et al. (Ekim 2008). "The Pristionchus pacificus genome provides a unique perspective on nematode lifestyle and parasitism". Doğa Genetiği. 40 (10): 1193–8. doi:10.1038/ng.227. PMC  3816844. PMID  18806794.
  402. ^ Schiffer PH, Kroiher M, Kraus C, Koutsovoulos GD, Kumar S, Camps JI, et al. (Aralık 2013). "The genome of Romanomermis culicivorax: revealing fundamental changes in the core developmental genetic toolkit in Nematoda". BMC Genomics. 14 (1): 923. doi:10.1186/1471-2164-14-923. PMC  3890508. PMID  24373391.
  403. ^ Jex AR, Nejsum P, Schwarz EM, Hu L, Young ND, Hall RS, et al. (Temmuz 2014). "Genome and transcriptome of the porcine whipworm Trichuris suis". Doğa Genetiği. 46 (7): 701–6. doi:10.1038/ng.3012. PMC  4105696. PMID  24929829.
  404. ^ a b Foth BJ, Tsai IJ, Reid AJ, Bancroft AJ, Nichol S, Tracey A, et al. (Temmuz 2014). "Whipworm genome and dual-species transcriptome analyses provide molecular insights into an intimate host-parasite interaction". Doğa Genetiği. 46 (7): 693–700. doi:10.1038/ng.3010. PMC  5012510. PMID  24929830.
  405. ^ "JGI: Capitella teleta".
  406. ^ "JGI: Helobdella robusta".
  407. ^ "WhitneyLab: Eisenia fetida".
  408. ^ Zwarycz AS, Nossa CW, Putnam NH, Ryan JF (December 2015). "Timing and Scope of Genomic Expansion within Annelida: Evidence from Homeoboxes in the Genome of the Earthworm Eisenia fetida". Genom Biyolojisi ve Evrim. 8 (1): 271–81. doi:10.1093/gbe/evv243. PMC  4758240. PMID  26659921.
  409. ^ Luo YJ, Takeuchi T, Koyanagi R, Yamada L, Kanda M, Khalturina M, et al. (Eylül 2015). "The Lingula genome provides insights into brachiopod evolution and the origin of phosphate biomineralization". Doğa İletişimi. 6: 8301. Bibcode:2015NatCo...6.8301L. doi:10.1038/ncomms9301. PMC  4595640. PMID  26383154.
  410. ^ Flot JF, Hespeels B, Li X, Noel B, Arkhipova I, Danchin EG, et al. (Ağustos 2013). "Genomic evidence for ameiotic evolution in the bdelloid rotifer Adineta vaga". Doğa. 500 (7463): 453–7. Bibcode:2013Natur.500..453F. doi:10.1038/nature12326. PMID  23873043. S2CID  1706158.