Prasinophyceae - Prasinophyceae - Wikipedia

Prasinophyceae
Pyramimonas sp color.jpg
Pyramimonas sp.
bilimsel sınıflandırma
Krallık:
Viridiplantae
Bölünme:
Chlorophyta
Sınıf:
Prasinophyceae

Emirler[1]

Prasinofitler (dahil Tetrafitina ) veya klorofit tek hücreli bir sınıftır yeşil alg.[açıklama gerekli ][2] Prasinofitler esas olarak denizi içerir planktonik türlerin yanı sıra bazı tatlı su temsilcileri.[2][3] Prasinofitler morfolojik olarak çeşitlidir. kamçılılar bir ila sekiz flagella ve hareketsiz (kokoid) tek hücreli. Pek çok türün hücreleri organik vücut pullarıyla kaplıdır; diğerleri çıplak.[3] İyi çalışılmış cinsler şunları içerir: Ostreococcus, en küçük olarak kabul edilir (yaklaşık 0,95 μm ) Özgür Yaşam ökaryot,[4] ve Mikromonalar her ikisi de dünya çapında deniz sularında bulunur. Prasinofitler, tek bir kloroplast ve tek mitokondri. genomlar diğer ökaryotlara kıyasla nispeten küçüktür (yaklaşık 12 Mbp Ostreococcus[5][6] ve 21 Mbp için Mikromonalar[7]).

Bazı yazarlar prasinofitleri bir polifirik farklı sınıflardan yeşil alglerin gruplanması. Tetraphytina, Prasinofitlerde ortaya çıktıkça, yakın zamanda yazarlar onu dahil ederek monofiletik ve klorofit ile eşdeğer hale getirdi.[8][9]

Ekoloji

Micromonas pusilla

Fotosentetik gen dizisi çeşitliliği üzerine bir çalışma (rbcL) içinde Meksika körfezi Prasinofitlerin özellikle Yüzey Altı Klorofil Maksimum (SCM)[10] ve birkaç farklı ekotip Ostreococcus ortamda tespit edildi.[11] Bu ekotiplerin, ışık yoğunluklarına adaptasyonları ile çevrede ayırt edildiği düşünülüyordu. O. lucimarinus yüksek ışıklı bir ortamdan izole edildi[12] ve Kuzey Pasifik Okyanusu kıyılarında yıl boyunca gözlemlendi.[13] RCC141 düşük ışık olarak kabul edildi çünkü alt kısımdan izole edildi. öfotik bölge. Bu suşların veya ekotiplerin daha sonra farklı habitatlarda (açık okyanus veya mezotrofik) yaşadıkları gösterildi ve dağılımları ışığın mevcudiyetiyle bağlantılı görünmüyor.[14] O. tauri bir kıyı lagününden izole edilmiştir ve hafif çok değerlikli görünmektedir. Genetik veriler, tespit edilen farklı ekotipler arasında farklı moleküler farklılıkların var olduğunu göstermektedir.[15]

Prasinofitler, cinse ait büyük çift sarmallı DNA virüsleri tarafından enfeksiyona maruz kalırlar. Prasinovirüs ailede Phycodnaviridae,[16][17][18] yanı sıra Reovirüs.[19] Tahminlere göre% 2 ila% 10 Micromonas pusilla popülasyon virüsler tarafından her gün parçalanmaktadır.[20]

Filogeni

Son araştırmalar, prasinofitlerin doğal bir grup olmadığı konusunda hemfikir parafiletik.[3][21][22][23] Chlorophyta'yı oluşturan gruplar arasındaki ilişkiler tam olarak çözülmedi. kladogram Leliaert ve ark. 2011[3] ve Silar 2016'ya göre bazı değişiklikler,[24] Leliaert 2016[25] ve Lopes dos Santos ve ark. 2017[26] aşağıda gösterilmiştir. mavi gölgeli gruplar Prasinophyceae'ye geleneksel olarak yerleştirilmiş veya yerleştirilmiştir[2]). Türler Mezostigma Viride üyesi olduğu gösterildi Streptophyta veya bazal Yeşil algler. Diğerleri şu üyedir Chlorophyta.

Yeşil alg
Chlorophyta /
Palmophyllophyceae
 

Prasinococcales ("prasinophyte clade VI")

 
 

Palmofililer

 
 
 
 
 

Pyramimonadophyceae ("prasinofit sınıfı I")

 
Mamiellophyceae
 

Monomastigales

 
 
 

Dolichomastigales

 
 

Mamiellales

 
 
("prasinophyte clade II")
 
 
Nefroselmidophyceae

Nefroselmidales ("prasinofit sınıf III")

 
 
 

?Pycnococcaceae ("prasinophyte clade V")

 
 

Picocystophyceae ("prasinophyte clade VII C")

 
 
 

Chloropicophyceae ("prasinophyte clade VII A / B")

 
Tetrafitina
 

Pedinophyceae

 
Klorofitin
 

Chlorodendrophyceae ("prasinophyte clade IV")

 
 
 

Trebouxiophyceae

 
 
 

Ulvophyceae

 
 

Chlorophyceae

 
 
 
 
 
 
 
 
 
Prasinophyta
Streptophyta
 
 

Chlorokybophyceae

 
 

Mesostigmatophyceae

 
 
 
 

Klebsormidiophyceae

 
 
 

Charophyceae

 
 
 

Zygnematophyceae

 
 

Coleochaetophyceae

 
 

Kara bitkileri

 
 
 
 
 
 

Referanslar

  1. ^ Guiry, M.D. ve Guiry, G.M. (2007). "Sınıf: Prasinophyceae taksonomi tarayıcısı". AlgaeBase sürüm 4.2 Dünya çapında elektronik yayın, İrlanda Ulusal Üniversitesi, Galway. Alındı 2007-09-23.
  2. ^ a b c Sym, S. D. ve Pienaar, R. N. 1993. Prasinophyceae sınıfı. Round, F. E. ve Chapman, D.J. (editörler) Farmasötik Araştırmada İlerleme, Cilt. 9. Biopress Ltd., Bristol, s. 281-376.
  3. ^ a b c d Leliaert F, Verbruggen H, Zechman FW (Eylül 2011). "Derinlere: yeşil bitki filogenisinin temelinde yeni keşifler". BioEssays. 33 (9): 683–92. doi:10.1002 / bies.201100035. PMID  21744372.
  4. ^ Courties C, Vaquer A, Troussellier M, Lautier J, Chrétiennot-Dinet MJ, Neveux J, et al. (1994). "En küçük ökaryotik organizma". Doğa. 370 (6487): 255. Bibcode:1994Natur.370..255C. doi:10.1038 / 370255a0.
  5. ^ Derelle E, Ferraz C, Rombauts S, Rouzé P, Worden AZ, Robbens S, Partensky F, Degroeve S, Echeynié S, Cooke R, Saeys Y, Wuyts J, Jabbari K, Bowler C, Panaud O, Piégu B, Ball SG , Ral JP, Bouget FY, Piganeau G, De Baets B, Picard A, Delseny M, Demaille J, Van de Peer Y, Moreau H (Ağustos 2006). "En küçük serbest yaşayan ökaryot Ostreococcus tauri'nin genom analizi birçok benzersiz özelliği ortaya çıkarıyor". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 103 (31): 11647–52. Bibcode:2006PNAS..10311647D. doi:10.1073 / pnas.0604795103. PMC  1544224. PMID  16868079.
  6. ^ Palenik B, Grimwood J, Aerts A, Rouzé P, Salamov A, Putnam N, ve diğerleri. (Mayıs 2007). "Küçük ökaryot Ostreococcus, plankton türleşmesi paradoksuna ilişkin genomik içgörüler sağlıyor". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 104 (18): 7705–10. Bibcode:2007PNAS..104.7705P. doi:10.1073 / pnas.0611046104. PMC  1863510. PMID  17460045.
  7. ^ Worden AZ, Lee JH, Mock T, Rouzé P, Simmons MP, Aerts AL, vd. (Nisan 2009). "Deniz pikoökaryotlarının mikromonalarının genomları tarafından ortaya çıkan yeşil evrim ve dinamik adaptasyonlar". Bilim. 324 (5924): 268–72. Bibcode:2009Sci ... 324..268W. doi:10.1126 / science.1167222. PMID  19359590.
  8. ^ Tevatia R, Oyler GA (2018-01-02). "Viridiplantae'de DDB1 bağlayıcı WD40'ın (DWD) evrimi". PLOS ONE. 13 (1): e0190282. Bibcode:2018PLoSO..1390282T. doi:10.1371 / journal.pone.0190282. PMC  5749748. PMID  29293590.
  9. ^ Rockwell NC, Martin SS, Li FW, Mathews S, Lagarias JC (Mayıs 2017). "Streptofit alg fitokromlarının fikosiyanobilin kromoforu HY2 tarafından sentezlenir". Yeni Fitolog. 214 (3): 1145–1157. doi:10.1111 / nph.14422. PMC  5388591. PMID  28106912.
  10. ^ Wawrik B, Paul JH, Campbell L, Griffin D, Houchin L, Fuentes-Ortega A, Müller-Karger F (2003). "Meksika Körfezi'ndeki Bir Kıyı Bulutu ile İlişkili Fitoplankton Topluluğunun Dikey Yapısı". Deniz Ekolojisi İlerleme Serisi. 251: 87–101. Bibcode:2003MEPS..251 ... 87W. doi:10.3354 / meps251087.
  11. ^ Guillou L, Eikrem W, Chrétiennot-Dinet MJ, Le Gall F, Massana R, Romari K, Pedrós-Alió C, Vaulot D (Haziran 2004). "Çevresel numunelerin doğrudan nükleer SSU rDNA sekanslaması ile değerlendirilen pikoplanktonik prasinofitlerin çeşitliliği ve okyanus ve kıyı deniz ekosistemlerinden elde edilen yeni izolatlar". Protist. 155 (2): 193–214. doi:10.1078/143446104774199592. PMID  15305796.
  12. ^ Worden AZ, Nolan JK, Palenik B (2004). "Deniz pikofitoplankton dinamiklerinin ve ekolojisinin değerlendirilmesi: Ökaryotik bileşenin önemi". Limnoloji ve Oşinografi. 49 (1): 168–179. Bibcode:2004LimOc..49..168W. doi:10.4319 / lo.2004.49.1.0168.
  13. ^ Worden AZ (2006). "Pasifik Okyanusu'nun kıyı sularındaki Picoeukaryote çeşitliliği" (PDF). Sucul Mikrobiyal Ekoloji. 43 (2): 165–175. doi:10.3354 / ame043165.
  14. ^ Demir-Hilton E, Sudek S, Cuvelier ML, Gentemann CL, Zehr JP, Worden AZ (Temmuz 2011). "Fotosentetik picoeukaryote Ostreococcus'un farklı sınıflarının küresel dağılım modelleri". ISME Dergisi. 5 (7): 1095–107. doi:10.1038 / ismej.2010.209. PMC  3146286. PMID  21289652.
  15. ^ Rodríguez F, Derelle E, Guillou L, Le Gall F, Vaulot D, Moreau H (Haziran 2005). "Deniz pikoökaryot Ostreococcus'ta (Chlorophyta, Prasinophyceae) ekotip çeşitliliği". Çevresel Mikrobiyoloji. 7 (6): 853–9. doi:10.1111 / j.1462-2920.2005.00758.x. PMID  15892704.
  16. ^ Mayer JA, Taylor FJ (1979). "Deniz nanoflagellatını parçalayan bir virüs," Micromonas pusilla"". Doğa. 281 (5729): 299–301. Bibcode:1979Natur.281..299M. doi:10.1038 / 281299a0.
  17. ^ Cottrell MT, Suttle CA (1991). "Kozmopolit, ökaryotik bir deniz fitoplankterinin parçalanmasına neden olan virüslerde geniş yayılma ve klonal varyasyon," Micromonas pusilla"". Deniz Ekolojisi İlerleme Serisi. 78: 1–9. Bibcode:1991MEPS ... 78 .... 1C. doi:10.3354 / meps078001.
  18. ^ Bellec L, Grimsley N, Derelle E, Moreau H, Desdevises Y (Nisan 2010). "Ostreococcus tauri virüslerinin iki farklı ortamda bolluğu, uzamsal dağılımı ve genetik çeşitliliği". Çevresel Mikrobiyoloji Raporları. 2 (2): 313–21. doi:10.1111 / j.1758-2229.2010.00138.x. PMID  23766083.
  19. ^ Attoui H, Jaafar FM, Belhouchet M, de Micco P, de Lamballerie X, Brussaard CP (Mayıs 2006). "Micromonas pusilla reovirüs: yeni bir önerilen cinse (Mimoreovirüs) atanan Reoviridae ailesinin yeni bir üyesi". Genel Viroloji Dergisi. 87 (Pt 5): 1375–83. doi:10.1099 / vir.0.81584-0. PMID  16603541.
  20. ^ Cottrell MT, Suttle CA (1995-06-01). "Fotosentetik deniz pikoflagellatını enfekte eden litik virüs dinamikleri" Micromonas pusilla"". Limnoloji ve Oşinografi. 40 (4): 730–739. Bibcode:1995 LimitOc..40..730C. CiteSeerX  10.1.1.517.2324. doi:10.4319 / lo.1995.40.4.0730. ISSN  1939-5590.
  21. ^ Lewis LA, McCourt RM (Ekim 2004). "Yeşil algler ve kara bitkilerinin kökeni". Amerikan Botanik Dergisi. 91 (10): 1535–56. doi:10.3732 / ajb.91.10.1535. PMID  21652308.
  22. ^ Becker B, Marin B (Mayıs 2009). "Streptofit algleri ve embriyofitlerin kökeni". Botanik Yıllıkları. 103 (7): 999–1004. doi:10.1093 / aob / mcp044. PMC  2707909. PMID  19273476.
  23. ^ Marin B (Eylül 2012). "Chlorellales veya bağımsız sınıfta iç içe geçmiş? Filogeni ve Pedinophyceae (Viridiplantae) sınıflandırması, tam nükleer ve plastid kodlu rRNA operonlarının moleküler filogenetik analizleri ile ortaya çıkarıldı". Protist. 163 (5): 778–805. doi:10.1016 / j.protis.2011.11.004. PMID  22192529.
  24. ^ Benzer Philippe (2016), "Protistes Ökaryotlar: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Ökaryotlar", HAL Arşivleri-ouvertes: 1–462
  25. ^ Leliaert F, Tronholm A, Lemieux C, Turmel M, DePriest MS, Bhattacharya D, Karol KG, Fredericq S, Zechman FW, Lopez-Bautista JM (Mayıs 2016). "Chloroplast filogenomik analizleri, Chlorophyta, Palmophyllophyceae sınıfının en derin dallanan soyunu ortaya çıkarır. Nov". Bilimsel Raporlar. 6 (1): 25367. Bibcode:2016NatSR ... 625367L. doi:10.1038 / srep25367. PMC  4860620. PMID  27157793.
  26. ^ Lopes Dos Santos A, Pollina T, Gourvil P, Corre E, Marie D, Garrido JL, Rodríguez F, Noël MH, Vaulot D, Eikrem W (Ekim 2017). "Chloropicophyceae, picophytoplanktonik prasinofitlerin yeni bir sınıfı". Bilimsel Raporlar. 7 (1): 14019. Bibcode:2017NatSR ... 714019L. doi:10.1038 / s41598-017-12412-5. PMC  5656628. PMID  29070840.

Dış bağlantılar