Deniz mikroorganizmaları - Marine microorganisms

Denizde mikrobiyal topluluğun rolü karbon döngüsü

Deniz mikroorganizmaları habitatları tarafından şu şekilde tanımlanır: mikroorganizmalar içinde yaşamak deniz ortamı yani tuzlu su bir denizin veya okyanusun veya acı bir kıyı suyu Haliç. Bir mikroorganizma (veya mikrop) herhangi biri mikroskobik yaşayan organizma yani çıplak insan gözünün göremeyeceği kadar küçük, mikroskoba ihtiyaç duyan herhangi bir canlı. Mikroorganizmalar çok çeşitlidir. Onlar yapabilir tek hücreli[1] veya çok hücreli ve hepsini dahil et bakteri ve Archaea ve en Protozoa bazı türlerin yanı sıra mantarlar, yosun ve bazı mikroskobik hayvanlar, örneğin rotiferler ve kopepodlar. Birçok makroskobik hayvanlar ve bitkiler mikroskobik gençlik aşamaları. Bazı mikrobiyologlar ayrıca biyolojik olarak aktif varlıkları da sınıflandırır. virüsler ve viroidler mikroorganizmalar olarak, ancak diğerleri bunları cansız olarak kabul eder.[2][3]

Deniz mikroorganizmalarının çeşitli şekillerde yaklaşık% 70'i oluşturduğu tahmin edilmektedir.[4] veya yaklaşık% 90,[5][6] okyanustaki biyokütlenin oranı. Birlikte ele alındığında denizi oluştururlar mikrobiyom. Milyarlarca yıldan fazla bir süredir bu mikrobiyom, birçok yaşam tarzını ve uyarlamasını geliştirmiş ve küresel bisiklet hemen hemen tüm kimyasal elementlerin.[7] Mikroorganizmalar, besin geri dönüşümü için çok önemlidir. ekosistemler gibi davrandıkları gibi ayrıştırıcılar. Neredeyse hepsinden de sorumludurlar fotosentez okyanusta meydana gelen ve aynı zamanda karbon, azot, fosfor ve diğeri besinler ve eser elementler.[8] Deniz mikroorganizmaları büyük miktarlarda karbonu tutar ve dünyadaki oksijenin çoğunu üretir.

Deniz mikroorganizmalarının küçük bir kısmı patojenik, deniz bitkileri ve hayvanlarında hastalığa ve hatta ölüme neden olur.[9] Ancak deniz mikroorganizmaları geri dönüştürmek büyük kimyasal elementler, her yıl gezegende üretilen tüm organik maddelerin yaklaşık yarısını hem üretiyor hem de tüketiyor. Dünyadaki en büyük çevrenin sakinleri olarak, mikrobiyal deniz sistemleri her küresel sistemde değişiklikleri yönlendirir.

Temmuz 2016'da, bilim adamları bir dizi 355 belirlediklerini bildirdi. genler -den son evrensel ortak ata (LUCA) hepsi hayat deniz mikroorganizmaları dahil gezegende.[10] Çeşitliliğine rağmen, okyanuslardaki mikroskobik yaşam hala tam olarak anlaşılamamıştır. Örneğin, rolü virüsler Deniz ekosistemlerinde 21. yüzyılın başında bile zar zor keşfedildi.[11]

Bir dizi genel bakışın parçası
Deniz yaşamı
Yellow.tang.arp.jpg Deniz yaşamı portalı
Bir dizinin parçası
Plankton
Plankton collage.jpg
Diğer

Genel Bakış

mikrobiyal paspaslar
Mikrobiyal paspaslar Dünyadaki en eski yaşam biçimleridir ve bunun için iyi fosil kanıt. Resim bir siyanobakteriyel -algal mat.
Stromatolitler mikroplar çökeltiyle boğulmaktan kaçınmak için yavaşça yukarı doğru hareket ettikçe mikrobik matlardan oluşur.
Son teknolojik gelişmeler ve bilimsel keşifler önemli olsa da, denizlerimizdeki ve okyanuslarımızdaki mikroorganizmalarla ilgili temel ekolojik soruların tüm seviyelerinde hâlâ büyük bir anlayışa sahip değiliz. Bu temel sorular şunlardır:

1. Orada ne var? Denizlerimizde ve okyanuslarımızda hangi mikroorganizmalar bulunur ve bunlar ne kadar oluşur?
2. Ne yapıyorlar? Bu mikroorganizmaların her biri deniz ortamında hangi işlevleri yerine getirir ve küresel enerji ve madde döngülerine nasıl katkıda bulunurlar?

3. Bir mikroorganizmanın varlığını veya yokluğunu belirleyen faktörler nelerdir ve bunlar biyolojik çeşitliliği ve işlevi nasıl etkiler ve bunun tersi de geçerlidir?

– Avrupa Bilim Vakfı, 2012[12]:14

Ayrıca bakınız: Hücrelerin evrimi

Mikroorganizmalar yaklaşık% 70'ini oluşturur. deniz biyokütlesi.[4] Bir mikroorganizma veya mikrop bir mikroskobik organizma çıplak gözle yeterince tanınamayacak kadar küçük. Pratikte bu, yaklaşık 0.1 mm'den küçük organizmaları içerir.[12]:13

Bu tür organizmalar olabilir tek hücreli[1] veya çok hücreli. Mikroorganizmalar çeşitlidir ve hepsini içerir bakteri ve Archaea, çoğu protistler dahil olmak üzere yosun, Protozoa ve mantar benzeri protistler ve bazı mikroskobik hayvanlar gibi rotiferler. Birçok makroskobik hayvanlar ve bitkiler mikroskobik gençlik aşamaları. Bazı mikrobiyologlar da sınıflandırır virüsler (ve viroidler ) mikroorganizmalar olarak kabul edilir, ancak diğerleri bunları cansız olarak kabul eder.[2][3]

Mikroorganizmalar, besin geri dönüşümü için çok önemlidir. ekosistemler gibi davrandıkları gibi ayrıştırıcılar. Bazı mikroorganizmalar patojenik bitkilerde ve hayvanlarda hastalıklara ve hatta ölüme neden olur.[9] Dünyadaki en büyük çevrenin sakinleri olarak, mikrobiyal deniz sistemleri her küresel sistemde değişiklikleri yönlendirir. Mikroplar neredeyse tüm fotosentez okyanusta meydana gelen ve aynı zamanda karbon, azot, fosfor ve diğeri besinler ve eser elementler.[13]

Deniz mikroorganizmaları    
 

Virüsler Bacteriophage2.png

 
  Prokaryotlar  
 

Bakteri Prokaryote cell.svg

 
 

Archaea     Haloquadratum walsbyi00 (cropped).png

 
 
Ökaryotlar
 

Protistler Diatomee - Diatom (fossile) - Stephanopyxis sp. - 630x (14117161428).jpg

 
 

Mikrofungi   S cerevisiae under DIC microscopy.jpg

 
 

Mikrohayvanlar   SEM image of Milnesium tardigradum in active state - journal.pone.0045682.g001-2.png

 
 
 
Mikroskobik varlıkların göreceli boyutları
İle gösterilen boyut aralığı prokaryotlar (bakteri ve arkeler) ve virüsler diğer organizmalara göre ve biyomoleküller
Deniz mikroorganizmaları içeren deniz spreyi, oluştukları atmosfere yüksek bir şekilde aeroplankton ve dünyaya geri dönmeden önce dünyayı dolaşabilir.
Bir büyütecin altında, bir miktar deniz suyu mikroskobik yaşamla doludur

Mikroskobik yaşam denizaltı çeşitlidir ve hala tam olarak anlaşılamamıştır. virüsler deniz ekosistemlerinde.[14] Deniz virüslerinin çoğu bakteriyofajlar bitkiler ve hayvanlar için zararsız olan, ancak tuzlu su ve tatlı su ekosistemlerinin düzenlenmesi için gerekli olan.[15] Sudaki mikrobiyal topluluklardaki bakterileri enfekte eder ve yok ederler ve bunların en önemli mekanizmasıdır. karbon geri dönüşümü deniz ortamında. Ölü bakteri hücrelerinden salınan organik moleküller, taze bakteri ve alg büyümesini uyarır.[16] Viral aktivite ayrıca biyolojik pompa süreç karbon dır-dir münzevi derin okyanusta.[17]

Hava yoluyla taşınan bir mikroorganizma akışı, gezegeni hava sistemlerinin üzerinde, ancak ticari hava şeritlerinin altında çevreler.[18] Bazı peripatetik mikroorganizmalar karasal toz fırtınalarından süpürülür, ancak çoğu denizdeki mikroorganizmalardan kaynaklanır. Deniz spreyi. 2018'de bilim adamları, gezegendeki her metrekareye her gün yüz milyonlarca virüs ve on milyonlarca bakteri biriktiğini bildirdi.[19][20]

Mikroskobik organizmalar boyunca yaşar biyosfer. Kütlesi prokaryot mikroorganizmalar - bakteri ve arkeler içerir, ancak çekirdekli olmayanlar ökaryot mikroorganizmaları - 0,8 trilyon ton karbon olabilir (toplam biyosferin kitle 1 ile 4 trilyon ton arasında olduğu tahmin edilmektedir).[21] Tek hücreli barofilik deniz mikropları 10.900 m (35.800 ft) derinlikte bulunmuştur. Mariana Çukuru, Dünya okyanuslarındaki en derin nokta.[22][23] Mikroorganizmalar, deniz tabanının 580 m (1.900 ft) altındaki kayaların içinde, kuzeybatı kıyısındaki 2.590 m (8.500 ft) okyanusun altında yaşar. Amerika Birleşik Devletleri,[22][24] Japonya açıklarında deniz tabanının altında 2.400 m (7.900 ft; 1.5 mi).[25] Mikrobiyal yaşamın var olabileceği bilinen en yüksek sıcaklık 122 ° C'dir (252 ° F) (Metanopirüs kandleri ).[26] 2014 yılında bilim adamları, buzulların 800 m (2.600 ft) altında yaşayan mikroorganizmaların varlığını doğruladı. Antarktika.[27][28] Bir araştırmacıya göre, "Mikropları her yerde bulabilirsiniz - koşullara son derece uyarlanabilirler ve bulundukları her yerde hayatta kalırlar."[22] Deniz mikroorganizmaları, "tüm deniz besin ağlarının temelini oluşturur, ana elementleri geri dönüştürür ve her yıl Dünya'da üretilen organik maddenin yaklaşık yarısını üretir ve tüketir".[29][30]

Deniz virüsleri

Deniz ekosisteminde virüs-konak etkileşimleri,
bakteri, fitoplankton ve balıkların viral enfeksiyonu dahil[31]
Ana makale: Deniz virüsleri

Bir virüs Küçük bulaşıcı etken o kopyalar sadece yaşamın içinde hücreler diğerinin organizmalar. Virüsler her türlü yaşam formları, şuradan hayvanlar ve bitkiler -e mikroorganizmalar, dahil olmak üzere bakteri ve Archaea.[32]

Virüsler, enfekte bir hücrenin içinde olmadığında veya bir hücreyi enfekte etme sürecinde olmadığında, bağımsız parçacıklar biçiminde bulunur. Bu viral partiküller, aynı zamanda Virionlar iki veya üç bölümden oluşur: (i) Genetik materyal (genom) her ikisinden de yapılmıştır DNA veya RNA, uzun moleküller genetik bilgi taşıyan; (ii) bir protein ceket aradı kapsid genetik materyali çevreleyen ve koruyan; ve bazı durumlarda (iii) bir zarf nın-nin lipidler bir hücrenin dışındayken protein tabakasını çevreleyen. Bu virüs parçacıklarının şekilleri basitten farklı helezoni ve ikosahedral bazı virüs türleri için, diğerleri için daha karmaşık yapılar oluşturur. Virüs türlerinin çoğunda, bir optik mikroskop. Ortalama virion, ortalamanın yaklaşık yüzde biri büyüklüğündedir. bakteri.

Virüslerin kökenleri evrimsel yaşam tarihi net değil: bazılarında olabilir gelişti itibaren plazmitler - hücreler arasında hareket edebilen DNA parçaları - diğerleri bakterilerden evrimleşmiş olabilir. Evrimde, virüsler önemli bir yatay gen transferi hangi artar genetik çeşitlilik.[33] Virüsler bazıları tarafından bir yaşam formu olarak kabul edilir, çünkü genetik materyal taşırlar, çoğalırlar ve evrim geçirirler. Doğal seçilim. Bununla birlikte, genellikle yaşam olarak sayılması gereken temel özelliklerden (hücre yapısı gibi) yoksundurlar. Bu niteliklerin tamamına değil bazılarına sahip oldukları için, virüsler "yaşamın sınırındaki organizmalar" olarak tanımlanmıştır.[34] ve çoğalıcılar olarak.[35]

Bakteriyofajlar (fajlar)
200.000x büyütmede bir bakteri hücre duvarına bağlanmış birden fazla faj
Bakterilere genomunu enjekte eden faj
Tipik bir diyagramın kuyruklu faj
Bakterilere genomunu enjekte eden faj

Virüsler, yaşamın olduğu her yerde bulunur ve muhtemelen canlı hücreler ilk evrimleştiğinden beri var olmuşlardır.[36] Virüslerin kökeni belirsizdir çünkü fosil oluşturmazlar. moleküler teknikler virüslerin DNA veya RNA'sını karşılaştırmak için kullanılmıştır ve nasıl ortaya çıktıklarını araştırmak için yararlı bir araçtır.[37]

Virüsler artık kadim olarak kabul ediliyor ve yaşamın farklılaşmasından önce kökenleri var. üç alan.[38]

Görüşler, virüslerin bir tür hayat veya canlı organizmalarla etkileşime giren organik yapılar.[39] Bazıları tarafından bir yaşam formu olarak kabul edilirler çünkü genetik materyal taşırlar, kendiliğinden birleşerek kendilerinin birden fazla kopyasını oluşturarak çoğalırlar ve evrim geçirirler. Doğal seçilim. Bununla birlikte, genellikle yaşam sayılması için gerekli görülen hücresel yapı gibi temel özelliklerden yoksundurlar. Bu niteliklerin tümüne sahip olmamakla birlikte bazılarına sahip oldukları için, virüsler çoğalıcı olarak tanımlanmıştır.[40] ve "hayatın kıyısındaki organizmalar" olarak.[34]

Fajlar

Virionlar farklı ailelerin kuyruklu fajlar
Bunlar siyanofajlar, enfekte eden virüsler siyanobakteriler (ölçek çubukları 100 nm gösterir)

Bakteriyofajlar, genellikle sadece aradı fajlarvirüsler parazit bakteri ve arkeler. Deniz fajları parazit deniz bakterileri ve arkeler, örneğin siyanobakteriler.[41] Bunlar, yaygın ve çeşitli bir virüs grubudur ve deniz ortamlarında en bol bulunan biyolojik varlıktır, çünkü konakçıları, bakterileri, tipik olarak denizdeki sayısal olarak baskın hücresel yaşamdır. Genellikle, her mL deniz suyunda yaklaşık 1 milyon ila 10 milyon virüs vardır veya hücresel organizmalardan yaklaşık on kat daha fazla çift sarmallı DNA virüsü vardır.[42][43] ancak deniz suyundaki viral bolluk tahminleri geniş bir aralıkta değişebilir.[44][45] Uzun zamandır, kuyruklu fajlar düzenin Caudovirales organizma sayısı ve çeşitliliği bakımından deniz ekosistemlerine hakim görünüyordu.[41]Bununla birlikte, daha fazla kızgın araştırmanın bir sonucu olarak, kuyruklu olmayan virüsler, çoklu derinliklerde ve okyanus bölgelerinde baskın görünmektedir ve bunu Caudovirales miyovirüs, podovirüs ve sifovirüs aileleri.[46] Ailelere ait fajlar Corticoviridae,[47] Inoviridae,[48] Mikroviridae,[49] ve Autolykiviridae[50][51][52][53]ayrıca çeşitli deniz bakterilerini enfekte ettiği bilinmektedir.

Ayrıca içinde çoğalan arka plan virüsler de vardır. Archaea: Bunlar, alışılmadık ve bazen benzersiz şekillere sahip çift sarmallı DNA virüsleridir.[54][55] Bu virüsler, en ayrıntılı olarak, termofilik arkeler, özellikle siparişler Sulfolobales ve Termoprotealler.[56]

Virüslerin rolü

Mikroorganizmalar, deniz biyokütlesinin yaklaşık% 70'ini oluşturur.[4] Virüslerin her gün bu biyokütlenin% 20'sini öldürdüğü ve okyanuslarda bakteri ve arkelerin olduğundan 15 kat daha fazla virüs olduğu tahmin edilmektedir. Virüsler, zararlıların hızla yok edilmesinden sorumlu ana ajanlardır. alg çiçekleri,[57] bu genellikle diğer deniz yaşamını öldürür.[58]Okyanuslardaki virüslerin sayısı, daha az sayıda konakçı organizmanın bulunduğu, açık denizde ve suyun derinliklerinde azalır.[17]

Virüsler önemli bir doğal araçtır genlerin aktarılması artan farklı türler arasında genetik çeşitlilik ve evrimi yönlendirir.[33] Virüslerin, bakteri, arkeler ve ökaryotların çeşitlenmesinden önce, erken evrimde merkezi bir rol oynadığı düşünülmektedir. son evrensel ortak ata Dünyadaki yaşamın.[59] Virüsler, hala Dünya üzerindeki keşfedilmemiş genetik çeşitliliğin en büyük rezervuarlarından biridir.[17]

Dev virüsler

Dev mimivirüs
Bilinen en büyük virüs, Tupanvirüs, adını Tupã, Guarani yüce yaratılış tanrısı

Virüsler normalde uzunlukları yaklaşık 20 ila 300 nanometre arasında değişir. Bu, yaklaşık 400 nanometreden başlayan bakteri uzunluğu ile karşılaştırılabilir. Ayrıca orada dev virüsler sık sık aranır kızlarıtipik olarak yaklaşık 1000 nanometre (bir mikron) uzunluğundadır. Tüm dev virüsler filum Nükleocytoviricota (NCLDV) ile birlikte Poxvirüsler Bunlardan en büyüğü bilinen Tupanvirüs. Bu dev virüs cinsi, 2018 yılında derin okyanusta ve bir soda gölünde keşfedildi ve toplam uzunluğu 2,3 ​​mikrona kadar ulaşabilir.[60]

Dev virüslerin keşfi ve ardından karakterize edilmesi, evrimsel kökenleri ile ilgili bazı tartışmaları tetikledi. Kökenlerine ilişkin iki ana hipotez, ya küçük virüslerden evrimleştikleri, ev sahibi organizmalardan DNA aldıkları ya da çok karmaşık organizmalardan üreme için kendi kendine yeterli olmayan mevcut biçime evrimleştikleri şeklindedir.[61] Dev virüslerin ne tür karmaşık organizmalardan sapmış olabileceği de bir tartışma konusudur. Bir öneri, başlangıç ​​noktasının aslında dördüncü bir noktayı temsil etmesidir. alan adı hayatın,[62][63] ancak bu büyük ölçüde azaltılmıştır.[64][65]

Prokaryotlar

Ana makale: Deniz prokaryotları

Deniz bakterileri

Pelagibacter ubique, okyanustaki en bol bulunan bakteri, küresel ölçekte önemli bir rol oynar. karbon döngüsü.
Vibrio vulnificus virülan bir bakteri bulundu haliçler ve kıyı bölgeleri boyunca
Yaygın siyanobakterilerin bir türünü gösteren elektron mikrografı Synechococcus. Karboksizomlar çok yüzlü karanlık yapılar olarak görünür.
Ayrıca bakınız: Bakteriyoplankton

Bakteri büyük oluşturmak alan adı nın-nin prokaryotik mikroorganizmalar. Tipik olarak birkaç mikrometre uzunluk olarak, bakterilerin kürelerden çubuklara ve spirallere kadar çeşitli şekilleri vardır. Bakteriler, ortaya çıkan ilk yaşam formları arasındaydı Dünya ve çoğunda mevcuttur habitatlar. Bakteriler toprakta, suda yaşar, asidik kaplıcalar, Radyoaktif atık,[66] ve derin kısımları yerkabuğu. Bakteriler de yaşıyor simbiyotik ve parazit bitkiler ve hayvanlarla ilişkiler.

Bir zamanlar olarak kabul edildi bitkiler sınıfı oluşturan Şizomisetlerbakteriler artık olarak sınıflandırılıyor prokaryotlar. Hayvan hücrelerinin ve diğerlerinin aksine ökaryotlar bakteri hücreleri, bir çekirdek ve nadiren liman zara bağlı organeller. Terim olmasına rağmen bakteri geleneksel olarak tüm prokaryotları içerir, bilimsel sınıflandırma 1990'larda prokaryotların çok farklı iki organizma grubundan oluştuğunun keşfedilmesinden sonra değişti. gelişti eski bir ortak atadan. Bunlar evrimsel alanlar arandı Bakteri ve Archaea.[67]

Modern bakterilerin ataları, tek hücreli mikroorganizmalardı. ilk yaşam biçimleri Yaklaşık 4 milyar yıl önce Dünya'da görünmesi. Yaklaşık 3 milyar yıl boyunca, çoğu organizma mikroskobikti ve bakteri ve arkeler, yaşamın baskın biçimleriydi.[68][69] Bakteriyel olmasına rağmen fosiller gibi var stromatolitler, ayırt edici eksiklikleri morfoloji bakteriyel evrim tarihini incelemek veya belirli bir bakteri türünün köken zamanını tarihlendirmek için kullanılmasını engeller. Bununla birlikte, gen dizileri, bakteriyi yeniden yapılandırmak için kullanılabilir. soyoluş ve bu çalışmalar, bakterilerin ilk önce arkel / ökaryotik soydan ayrıldığını göstermektedir.[70] Bakteriler, aynı zamanda, arkea ve ökaryotların ikinci büyük evrimsel ayrışmasında da rol oynadılar. Burada ökaryotlar, eski bakterilerin endosimbiyotik muhtemelen kendileri ile ilişkili olan ökaryotik hücrelerin ataları ile ilişkiler Archaea.[71][72] Bu, proto-ökaryotik hücrelerin yutmasını içeriyordu. alfaproteobakteriyel ikisinden birini oluşturmak için ortakyöntler mitokondri veya hidrojenozomlar Hala bilinen tüm Eukarya'da bulunan. Daha sonra, zaten mitokondri içeren bazı ökaryotlar da siyanobakteriyel benzeri organizmaları yuttu. Bu oluşumuna yol açtı kloroplastlar yosun ve bitkilerde. Ayrıca daha sonraki endosimbiyotik olaylardan kaynaklanan bazı algler de vardır. Burada ökaryotlar, "ikinci nesil" bir plastide dönüşen ökaryotik bir algı yuttu.[73][74] Bu olarak bilinir ikincil endosimbiyoz.

Pelagibacter ubique ve akrabaları, okyanustaki en bol organizmalar olabilir ve muhtemelen dünyadaki en bol bakteri oldukları iddia edilmiştir. Tüm mikrobiyallerin yaklaşık% 25'ini oluştururlar plankton hücreler ve yaz aylarında ılıman okyanus yüzey suyunda bulunan hücrelerin yaklaşık yarısını oluşturabilirler. Toplam bolluk P. ubique ve akrabaların yaklaşık 2 × 10 olduğu tahmin ediliyor28 mikroplar.[76] Ancak, rapor edildi Doğa Şubat 2013'te bakteriyofaj HTVC010P hangi saldırılar P. ubique, keşfedildi ve "muhtemelen gezegendeki en yaygın organizmadır".[77][78]

Bilinen en büyük bakteri, deniz Thiomargarita namibiensis çıplak gözle görülebilir ve bazen 0,75 mm'ye (750 μm) ulaşır.[79][80]

Deniz arkeaları

Ayrıca bakınız: Deniz prokaryotları
Archaea başlangıçta şu şekilde görüldü: ekstremofiller burada resmedilen sarı arkeler gibi zorlu ortamlarda yaşamak kaplıca, ancak o zamandan beri çok daha geniş bir yelpazede bulundu habitatlar.[81]

Archaea (Yunanca Antik[82]) oluşturmak alan adı ve krallık nın-nin tek hücreli mikroorganizmalar. Bu mikroplar prokaryotlar, sahip olmadıkları anlamına gelir hücre çekirdeği veya başka herhangi bir zara bağlı organeller hücrelerinde.

Archaea başlangıçta olarak sınıflandırıldı bakteri, ancak bu sınıflandırma eski.[83] Archaeal hücreler, onları yaşamın diğer iki alanından ayıran benzersiz özelliklere sahiptir. Bakteri ve Ökaryota. Archaea ayrıca birden fazla tanınan filum. Sınıflandırma zordur çünkü çoğunluğu laboratuvarda izole edilmemiştir ve sadece bunların analizi ile tespit edilmiştir. nükleik asitler çevrelerinden alınan örneklerde.

Arkealar ve bakteriler genellikle boyut ve şekil bakımından benzerdir, ancak birkaç arkeanın düz ve kare şeklindeki hücreleri gibi çok garip şekillere sahip olmasına rağmen. Haloquadratum walsbyi.[84] Bakterilere olan bu morfolojik benzerliğe rağmen, arkealar genler ve birkaç metabolik yollar ökaryotlarla daha yakından ilgili olanlar, özellikle enzimler dahil transkripsiyon ve tercüme. Arka plan biyokimyasının diğer yönleri benzersizdir, örneğin eter lipitleri onların içinde hücre zarları, gibi arkeoller. Archaea, ökaryotlardan daha fazla enerji kaynağı kullanır: bunlar organik bileşikler, şekerler gibi amonyak, metal iyonlar ya da hidrojen gazı. Tuza dayanıklı arkeler ( Haloarchaea ) bir enerji kaynağı olarak güneş ışığını ve diğer archaea türlerini kullanın karbonu düzelt; ancak, bitkilerden farklı olarak ve siyanobakteriler, bilinen hiçbir arke türü ikisini birden yapamaz. Archaea eşeysiz üreme tarafından ikiye bölünerek çoğalma, parçalanma veya tomurcuklanan; bakteri ve ökaryotların aksine, bilinen hiçbir tür oluşmaz sporlar.

Archaea özellikle okyanuslarda sayısızdır ve arkeler plankton gezegendeki en bol organizma gruplarından biri olabilir. Archaea, Dünya'nın yaşamının önemli bir parçasıdır ve her ikisinde de rol oynayabilir. karbon döngüsü ve nitrojen döngüsü. Crenarchaeota (eositler), deniz ortamlarında çok bol olduğu düşünülen ve karbon fiksasyonuna ana katkıda bulunanlardan biri olduğu düşünülen bir arke filumudur.[85]

Ökaryotlar

Parakaryon miyojinensis, olası geçiş formu bir prokaryot ve bir ökaryot arasında
Nuvola apps kaboodle.svg Ökaryotik Hücreler Nereden Geldi? – Mikrokozmosa Yolculuk

Tüm canlı organizmalar şu şekilde gruplandırılabilir: prokaryotlar veya ökaryotlar. Hayat şu şekilde başladı tek hücreli prokaryotlar ve daha sonra daha karmaşık ökaryotlar haline geldi. Prokaryotik hücrelerin aksine, ökaryotik hücreler oldukça düzenlidir. Prokaryotlar bakteri ve arkelerdir, ökaryotlar ise diğer yaşam formlarıdır. protistler bitkiler, mantarlar ve hayvanlar. Protistler genellikle tek hücreli iken bitkiler, mantarlar ve hayvanlar genellikle çok hücreli.

Ökaryotların kökünün arkelerin içinde yattığı çok makul görünüyor; bugünlerde bilinen en yakın akrabalar olabilir Heimdallarchaeota önerilen filum Asgard süperfilum. Bu teori, ilk olarak 1984 yılında önerilen bir senaryonun modern bir versiyonudur. Eosit hipotezi, ne zaman Crenarchaeota (diğer adıyla Eositler), o zamanlar ökaryotların bilinen en yakın arka plan akrabalarıydı. geçiş formu bir prokaryot ve bir ökaryot arasındaki mikroorganizmanın varlığı 2012 yılında Japon bilim adamları tarafından keşfedildi. Parakaryon miyojinensis tipik bir prokaryottan daha büyük, ancak ökaryotta olduğu gibi bir zar içine alınmış nükleer materyal ve varlığı ile benzersiz bir mikroorganizmadır. endosymbionts. Bu, prokaryottan ökaryota bir gelişim aşamasını gösteren, mikroorganizmanın ilk makul evrimsel formu olarak görülüyor.[86][87]

Deniz protistleri

Ana makale: Deniz protistleri

Protistler bitkiler, mantarlar veya hayvanlar olarak sınıflandırılamayan ökaryotlardır. Genellikle tek hücreli ve mikroskobiktirler. Hayat şu şekilde başladı tek hücreli prokaryotlar (bakteri ve arkeler) ve daha sonra daha karmaşık ökaryotlar. Ökaryotlar, bitkiler, hayvanlar, mantarlar ve protistler olarak bilinen daha gelişmiş yaşam formlarıdır. Protist terimi, kesin olarak bitkiler, hayvanlar veya mantarlar olarak sınıflandırılamayan ökaryotlar için bir uygunluk terimi olarak tarihsel olarak kullanılmaya başlandı. Modern kladistiklerin bir parçası değiller çünkü parafiletik (ortak bir atadan yoksun).

Trofik moda göre

Protistler, beslenmelerinin bitki benzeri, hayvan benzeri, mantar benzeri olmasına bağlı olarak genel olarak dört gruba ayrılabilir.[88] veya bunların bir karışımı.[89]

Protistler yiyecekleri nasıl aldıklarına göre
Protistin türüAçıklamaMisalDiğer bazı örnekler
Bitki benzeri
Yosun
(aşağıya bakınız )
Ototrofik Genellikle fotosentez kullanarak diğer organizmaları tüketmeye gerek duymadan kendi yiyeceklerini yapan protistlerPyramimonas sp.jpgYeşil alg, PyramimonasKırmızı ve kahverengi algler, diyatomlar ve bazı Dinoflagellatlar. Bitki benzeri protistler, fitoplanktonun önemli bileşenleridir Aşağıda tartışılmıştır.
Hayvan benzeri
Protozoanlar
Heterotrofik Yiyeceklerini diğer organizmaları (bakteriler, arkeler ve küçük algler) tüketen protistlerHaeckel Spumellaria detail.pngRadyolar protist tarafından çizilen HaeckelForaminiferans ve biraz deniz amip, siliatlar ve kamçılılar.
Mantar benzeri
Balçık kalıpları
ve
balçık ağları
Saprotrofik yiyeceklerini parçalanmış ve çürümüş organizmaların kalıntılarından alan protistlerAplanonet3.jpgDeniz balçık ağları Yalancı ayaklı olmayan amiplerin seyahat edebileceği labirent tüp ağları oluştururDeniz likeni
Mixotrops
Çeşitli
Miksotrofik ve ozmotrofik yiyeceklerini yukarıdakilerin bir kombinasyonundan alan protistlerEuglena mutabilis - 400x - 1 (10388739803) (cropped).jpgEuglena mutabilis fotosentetik kamçılıProtistler arasında, özellikle siliatlar ve dinoflagellatlar arasında birçok deniz miksotropu bulunur.[90]
mikrograf
hücre şeması
Choanoflagellates, tek hücreli "yakalı" kamçılı protestocular, en yakın yaşayan akrabalar olduğu düşünülüyor. hayvanlar.[91]

Protistler, şu anda 18 filum halinde organize edilmiş çok çeşitli organizmalardır, ancak sınıflandırılması kolay değildir.[92][93] Araştırmalar okyanuslarda, derin deniz deliklerinde ve nehir çökeltilerinde yüksek protist çeşitliliğin var olduğunu göstermiştir ve bu da çok sayıda ökaryotik mikrobiyal topluluğun henüz keşfedilmediğini düşündürmektedir.[94][95] Üzerinde çok az araştırma yapıldı miksotrofik protestocular, ancak deniz ortamlarında yapılan son araştırmalar, miksotrofik protestoların protestocuların önemli bir kısmına katkıda bulunduğunu buldu biyokütle.[90] Protistler ökaryot olduklarından, hücrelerinde en az bir tane bulundururlar. çekirdek, Hem de organeller gibi mitokondri ve Golgi organları. Protistler aseksüeldir ancak şu yolla hızla çoğalabilirler: mitoz veya tarafından parçalanma.

Harici video
video simgesi Mikroskobik avcılar öğle yemeğini nasıl alıyor?
video simgesi Euglenoids: Tek hücreli şekil değiştiriciler
video simgesi Protozoalar nasıl dolaşır?

Prokaryot hücrelerinin aksine, ökaryotların hücreleri oldukça düzenlidir. Bitkiler, hayvanlar ve mantarlar genellikle çok hücreli ve tipik olarak makroskobik. Protistlerin çoğu tek hücreli ve mikroskobiktir. Ancak istisnalar var. Bazı tek hücreli deniz protistleri makroskopiktir. Bazı deniz balçık kalıpları, tek hücreli hücreler arasında geçiş yapmayı içeren benzersiz yaşam döngülerine sahiptir. sömürge ve çok hücreli formlar.[98] Diğer deniz protistleri ne tek hücreli ne de mikroskobiktir, örneğin Deniz yosunu.

Protistler, ana hatlardan birine uymayan herhangi bir şeyin taksonomik bir uyumsuzluk çantası olarak tanımlandı. biyolojik krallıklar yerleştirilebilir.[101] Bazı modern yazarlar, protistleri tek hücreli organizmalarla sınırlayarak çok hücreli organizmaları geleneksel protist tanımının dışında tutmayı tercih ediyorlar.[102][103] Bu daha kısıtlı tanım, birçok Kahverengi, çok hücreli kırmızı ve yeşil alg, ve balçık kalıpları.[104]

Lokomosyon tarafından

Protistleri kategorize etmenin bir başka yolu da hareket tarzlarına göredir. Pek çok tek hücreli protist, özellikle tek hücreliler, hareketli ve yapabilir hareket oluşturmak kullanma kamçı, kirpikler veya sahte ayaklılar. Hareket için flagella kullanan hücreler genellikle şu şekilde adlandırılır: kamçılılar kirpikler kullanan hücrelere genellikle siliatlar ve sözde ayak kullanan hücrelere genellikle amip veya amoeboidler. Diğer protistler hareketli değil ve dolayısıyla hiçbir hareket mekanizmasına sahip değildir.

Protistler nasıl hareket ettiklerine göre
Protestocu türüHareket mekanizmasıAçıklamaMisalDiğer örnekler
MotileFlagellatlarLocomotion by flagellum.jpgBir kamçı (Latince kırbaç), bazı protistlerin (bazı bakterilerin yanı sıra) hücre gövdesinden çıkan kirpik benzeri bir eklentidir. Flagellatlar, hareket için ve bazen beslenme ve duyusal olarak birden fazla flagella kullanır. organel.CSIRO ScienceImage 6743 SEM Cryptophyte.jpgKriptofitlerHerşey Dinoflagellatlar ve Nanoflagellatlar (Choanoflagellates, silikoflagellatlar, çoğu yeşil alg )[105][106]
(Diğer protistler bir aşamadan geçer. gametler geçici kamçıya sahip olduklarında - bazıları radyolar, foraminiferans ve Apicomplexa )
KirpiklerLocomotion by cilia.jpgBir kirpik (Latince kirpik) küçük bir kamçıdır. Kirpikler, su yoluyla kendilerine güç sağlamak için yüzlerce sayı olabilen çoklu kirpikler kullanırlar.Stichotricha secunda - 400x (14974779356).jpgTerliksi hayvan bursaria
kirpikleri görmek için tıklayın		Foraminiferans ve biraz deniz amip, siliatlar ve kamçılılar.
Amipler
(amoeboidler)		Locomotion by pseudopod.jpgAmip uzatarak ve geri çekerek şekli değiştirme yeteneğine sahip olmak sahte ayaklılar (Yunanca yanlış ayaklar).[107]
Amoeba proteus from Leidy.jpg
AmipHer büyük protistte bulunur soy. Amipoid hücreler, Protozoanlar ama aynı zamanda yosun ve mantarlar.[108][109]
Hareketli değil
Yok
Diatom - Triceratium favus.jpg
DiatomDiyatomlar, kokolitoforlar ve hareketli olmayan türler Phaeocystis[106] Tek hücreliler arasında parazitik Apicomplexa hareketsizdir.

Flagellatlar bakteri ve protistleri içerir. Bakteriler tarafından kullanılan döner motor modeli, bir modelin protonlarını kullanır. elektrokimyasal gradyan kamçılarını hareket ettirmek için. Dönme momenti bakteri kamçılarında, kamçı tabanı çevresinde protonları yöneten parçacıklar tarafından oluşturulur. Bakterilerde flagella'nın dönme yönü, flagellar motorun çevresi boyunca proton kanallarının işgal edilmesinden gelir.[110]

Kirpikler genellikle diziler halinde yoğun şekilde bir araya getirilmiş yüzlerce ila binlerce kirpikler vardır. Hareket sırasında, tek bir silium yüksek sürtünmeli bir güç darbesi ve ardından düşük sürtünmeli bir kurtarma darbesi kullanarak deforme olur. Tek bir organizma üzerinde bir araya getirilmiş birden fazla kirpikler olduğundan, bunlar bir metakronal ritim. Bu, bir silyumun deformasyonunun, komşusunun deformasyonu ile aynı fazda olduğu ve organizmanın yüzeyi boyunca yayılan deformasyon dalgalarına neden olduğu anlamına gelir. Bu yayılan kirpikler dalgaları, organizmanın kirpikleri koordineli bir şekilde hareket etmek için kullanmasına izin veren şeydir. Kirpikli bir mikroorganizmanın tipik bir örneği, Terliksi hayvan, binlerce kirpikler ile kaplı tek hücreli, kirpikli bir tek hücreli. Kirpikler birlikte dövülerek Terliksi hayvan saniyede 500 mikrometre hızlarda suda ilerlemek için.[111]

Harici video
video simgesi Terliksi Hayvan: Kirpiklerin Beyaz Faresi

Deniz mantarları

Liken denizdeki bir kayanın üzerinde Sıçrama bölgesi. Likenler, bir mantar ve bir alg veya siyanobakteri arasındaki karşılıklı ilişkilerdir.
Bir Deniz salyangozu, Littoraria irrorata liken kaplı. Bu salyangoz çiftlikleri gelgit ascomycetous mantarlar
Ayrıca bakınız: Deniz mantarları, Mikoplankton, ve Mantarların evrimi

1500'den fazla tür mantarlar deniz ortamlarından bilinmektedir.[112] Bunlar asalak Deniz yosunları veya hayvanlar, veya saprobes yosun, mercan, protozoan kistleri, deniz otları ve diğer substratlardan gelen ölü organik maddelerle beslenmek.[113] Birçok türün sporları, alt tabakaya bağlanmayı kolaylaştıran özel eklere sahiptir.[114] Deniz mantarları da bulunabilir. Deniz köpüğü Ve çevresinde hidrotermal okyanus alanları.[115] Çok çeşitli sıradışı ikincil metabolitler deniz mantarları tarafından üretilir.[116]

Mikoplankton vardır saprotropik üyeleri plankton toplulukları deniz ve temiz su ekosistemler.[117][118] Oluşurlar ipliksi Özgür Yaşam mantarlar ve planktonik parçacıklarla ilişkili mayalar veya fitoplankton.[119] Benzer bakterioplankton Bu sucul mantarlar önemli bir rol oynar. heterotrofik mineralleşme ve besin döngüsü.[120] Çoğunlukla mikroskobik olsa da, bazı mikoplanktonlar 20 mm çapa ve 50 mm uzunluğa kadar olabilir.[121]

Tipik bir mililitre deniz suyu yaklaşık 103 10'a kadar4 mantar hücreleri.[122] Kıyı ekosistemlerinde bu sayı daha fazladır ve haliçler karasal topluluklardan gelen besinsel akış nedeniyle. Kıyıların çevresinde ve 1000 metreye kadar olan yüzey sularında daha yüksek mikoplankton çeşitliliği bulunur. dikey profil bu ne kadar bol olduğuna bağlı fitoplankton dır-dir.[123][124] Bu profil, besin mevcudiyetindeki değişiklikler nedeniyle mevsimler arasında değişir.[125] Deniz mantarları, sürekli oksijen yetersizliği olan bir ortamda hayatta kalırlar ve bu nedenle, türbülans ve tarafından üretilen oksijen fotosentetik organizmalar.[126]

Deniz mantarları şu şekilde sınıflandırılabilir:[126]

Likenler vardır karşılıklı bir mantar arasındaki ilişkiler, genellikle bir ascomycete ve bir yosun veya bir siyanobakteri. Deniz ortamlarında birkaç liken bulunur.[127] Çok daha fazlası var Sıçrama bölgesi dalmaya ne kadar toleranslı olduklarına bağlı olarak farklı dikey bölgeleri işgal ettikleri yer.[128] Bazı likenler uzun süre yaşar; türlerden biri 8.600 yıldır.[129] Bununla birlikte, ömürlerinin ölçülmesi zordur çünkü aynı likeni tanımlayan şey kesin değildir.[130] Likenler, aynı liken olarak tanımlanabilen veya tanımlanamayan bir parçayı vejetatif olarak kopararak büyür ve farklı yaşlardaki iki liken birleşerek, aynı liken olup olmadığı konusunu gündeme getirir.[130]

Deniz salyangozu Littoraria irrorata bitkilere zarar verir Spartina yaşadığı deniz bataklıklarında, gelgit ascomycetous mantar sporlarının bitkiyi kolonileştirmesini sağlar. Salyangoz daha sonra mantar gelişimini çimenlerin kendisine tercih eder.[131]

Fosil kayıtlarına göre mantarlar geç tarihlere kadar uzanmaktadır. Proterozoik 900-570 milyon yıl önce çağ. Çin'de 600 milyon yıllık fosil deniz likenleri keşfedildi.[132] Mikoplanktonun karasal mantarlardan evrimleştiği varsayılmıştır. Paleozoik dönem (390 milyon yıl önce).[133]

Deniz mikro hayvanları

Ayrıca bakınız: Mikrohayvan ve İhtiyoplankton
Harici video
video simgesi Gastrotrichs: Dört günlük büyükanneler
video simgesi Rotiferler: Büyüleyici derecede tuhaf ve genellikle görmezden gelinir
video simgesi Tardigrades: Tombul, yanlış anlaşılmış ve ölümsüz değil

Yavrular olarak hayvanlar mikroskobik aşamalardan gelişir. sporlar, yumurtalar ve larvalar. En az bir mikroskobik hayvan grubu, parazit cnidarian Myxozoa, yetişkin formunda tek hücrelidir ve deniz türlerini içerir. Diğer yetişkin deniz mikro hayvanlar çok hücreli. Mikroskobik yetişkin eklembacaklılar tatlı suda daha yaygın olarak bulunur, ancak deniz türleri de vardır. Mikroskobik yetişkin deniz kabuklular biraz ekle kopepodlar, Cladocera ve Tardigradlar (su ayıları). Biraz deniz nematodlar ve rotiferler birçok kişi gibi çıplak gözle tanınamayacak kadar küçük Loricifera yakın zamanda keşfedilenler dahil anaerobik hayatlarını bir yerde geçiren türler anoksik çevre.[134][135] Kopepodlar, ikincil verimlilik ve karbon yutağı Dünya okyanuslarının diğer organizma gruplarından daha fazla.

  • Deniz mikro hayvanları

  • 10.000'den fazla deniz türü kopepodlar, küçük, genellikle mikroskobik kabuklular

  • Darkfield fotoğrafı bir gastrotrich 0,06-3,0 mm uzunluğunda, tortu parçacıkları arasında yaşayan solucan benzeri bir hayvan

  • Zırhlı Pliciloricus enigmaticus yaklaşık 0,2 mm uzunluğunda, deniz çakılları arasındaki boşluklarda yaşar

  • Rotiferler, genellikle 0,1-0,5 mm uzunluğunda, protist gibi görünebilir ancak çok hücreli ve Animalia'ya aittir

  • Tardigrades (su ayıları) yaklaşık 0,5 mm uzunluğunda, bilinen en dayanıklı hayvanlar arasındadır.

Birincil üreticiler

Her iki okyanus da dahil olmak üzere fotosentezin küresel dağılımını gösteren birleşik görüntü fitoplankton ve karasal bitki örtüsü. Koyu kırmızı ve mavi-yeşil, sırasıyla okyanusta ve karada yüksek fotosentetik aktivite gösteren bölgeleri gösterir.
Ana makale: Deniz birincil üretimi
Ayrıca bakınız: Fotosentezin evrimi

Birincil üreticiler bunlar ototrof diğer organizmaları yemek yerine kendi yiyeceklerini yapan organizmalar. Bu, birincil üreticilerin başlangıç ​​noktası haline geldiği anlamına gelir. besin zinciri için heterotrof diğer organizmaları yiyen organizmalar. Bazı birincil denizcilik üreticileri, özelleşmiş bakteri ve arkelerdir. kemotroflar etrafında toplanarak kendi yiyeceklerini yapıyorlar hidrotermal menfezler ve soğuk sızıntılar ve kullanarak kemosentez. Ancak çoğu denizci birincil üretim kullanan organizmalardan gelir fotosentez suda çözünen karbondioksit üzerinde. Bu işlem, suyu dönüştürmek için güneş ışığından enerji kullanır ve karbon dioksit[136]:186–187 hem kimyasal enerji kaynağı olarak hem de hücrelerin yapısal bileşenlerinde kullanılan organik moleküllerin şekeri haline getirilir.[136]:1242 Deniz birincil üreticileri önemlidir, çünkü deniz canlılarının çoğunu üreterek hemen hemen tüm deniz hayvanı yaşamını desteklerler. oksijen ve diğer organizmalara var olmak için ihtiyaç duydukları kimyasal enerjiyi sağlayan yiyecekler.

Başlıca denizcilik birincil üreticileri siyanobakteriler, yosun ve deniz bitkileri. oksijen fotosentezin bir yan ürünü olarak piyasaya sürülen neredeyse tüm canlılar gerçekleştirilecek hücresel solunum. Ek olarak, birincil üreticiler küresel ölçekte etkilidir. karbon ve Su döngüleri. Kıyı bölgelerini stabilize ederler ve deniz hayvanları için habitat sağlayabilir. Dönem bölünme geleneksel olarak yerine kullanılmıştır filum birincil üreticileri tartışırken, ancak Algler, mantarlar ve bitkiler için Uluslararası Adlandırma Kodu artık her iki terimi de eşdeğer olarak kabul etmektedir.[137]

Siyanobakteriler

Siyanobakteriler
A'dan gelen siyanobakteriler mikrobiyal mat. Siyanobakteriler, fotosentez yoluyla oksijeni serbest bırakan ilk organizmalardı
Minik siyanobakteri Proklorokok atmosferik oksijene önemli bir katkıda bulunur
NASA'nın büyük bir görüntüsü Çiçek açmak nın-nin Nodularia Baltık Denizi'nde dönen siyanobakteriler[138]
Harici video
video simgesi Siyanobakteriler dünyayı nasıl ele geçirdi?

Siyanobakteriler, güneş ışığını kimyasal enerjiye dönüştürme yeteneğini geliştiren ilk organizmalardı. Tek hücrelilerden tek hücrelere kadar değişen bir bakteri filumu (bölümü) oluştururlar. ipliksi ve dahil et sömürge türleri. Dünyanın hemen hemen her yerinde bulunurlar: nemli toprakta, hem tatlı su hem de deniz ortamlarında ve hatta Antarktika kayalarında.[139] Özellikle, bazı türler okyanusta yüzen sürüklenen hücreler olarak meydana gelir ve bu nedenle, fitoplankton.

Fotosentez kullanan ilk birincil üreticiler okyanus siyanobakteriler yaklaşık 2,3 milyar yıl önce.[140][141] Moleküler salınım oksijen tarafından siyanobakteriler fotosentezin bir yan ürünü olarak Dünya'nın çevresinde küresel değişikliklere neden oldu. Oksijen o sırada Dünya'daki çoğu yaşam için zehirli olduğu için, bu durum neredeyse yok olmaya yol açtı. oksijene tahammülsüz organizmalar, bir dramatik değişim ana hayvan ve bitki türlerinin evrimini yeniden yönlendirdi.[142]

Minik (0.6 µm ) deniz siyanobakteri Proklorokok 1986'da keşfedilen, bugün okyanus tabanının önemli bir bölümünü oluşturuyor besin zinciri ve açık okyanusun fotosentezinin çoğunu açıklıyor[143] ve Dünya atmosferindeki oksijenin tahmini% 20'si.[144] Muhtemelen dünyadaki en bol cinstir: tek bir mililitre yüzey deniz suyu, 100.000 veya daha fazla hücre içerebilir.[145]

Biyologlar başlangıçta siyanobakteriler yosundu ve "mavi-yeşil alg" olarak anılıyordu. Daha yeni görüş, siyanobakterilerin bir bakteri olduğu ve dolayısıyla aynı şey olmadığıdır. Krallık yosun olarak. Çoğu otorite hepsini dışlar prokaryotlar ve dolayısıyla alg tanımından siyanobakteriler.[146][147]

Yosun

Yosun yaygın ve çeşitli bir fotosentetik grubu için resmi olmayan bir terimdir protistler mutlaka yakından ilişkili değildir ve bu nedenle polifirik. Deniz yosunları altı gruba ayrılabilir: yeşil, kırmızı ve kahverengi algler, öjenofitler, Dinoflagellatlar ve diyatomlar.

Dinoflagellatlar ve diatomlar, deniz yosunlarının önemli bileşenleridir ve aşağıda kendi bölümleri vardır. Euglenophytes sadece birkaç deniz üyesi olan tek hücreli kamçılardan oluşan bir filumdur.

Tüm algler mikroskobik değildir. Yeşil, kırmızı ve kahverengi alglerin hepsi, tanıdık olanı oluşturan çok hücreli makroskopik formlara sahiptir. yosunlar. Yeşil alg gayri resmi bir grup, yaklaşık 8.000 tanınmış tür içerir.[148] Türlerin çoğu hayatlarının çoğunu tek hücreler veya ipliksi hücreler halinde yaşarken, diğerleri koloniler uzun hücre zincirlerinden oluşur veya oldukça farklılaşmış makroskopik deniz yosunlarıdır. Kırmızı algler (tartışmalı) bir filum, yaklaşık 7.000 tanınmış tür içerir,[149] çoğunlukla çok hücreli ve birçok önemli deniz yosunu dahil.[149][150] Kahverengi algler oluşturmak sınıf yaklaşık 2.000 tanınmış tür içeren,[151] çoğunlukla çok hücreli ve birçok deniz yosunu dahil yosun Daha yüksek bitkilerin aksine, yosunların kökleri, gövdeleri veya yaprakları yoktur. Boyuta göre sınıflandırılabilirler mikroalg veya makroalg.

Mikroalg çıplak gözle görülemeyen mikroskobik alg türleridir. Çoğunlukla tek hücreli Bireyler veya zincirler veya gruplar halinde var olan türler, ancak bazıları çok hücreli. Mikroalgler, deniz protistlerinin önemli bileşenleridir yukarıda tartışılan yanı sıra fitoplankton Aşağıda tartışılmıştır. Onlar çok çeşitli. Yaklaşık 50.000 türü tanımlanmış olan 200.000-800.000 türün olduğu tahmin edilmektedir.[152] Türlere bağlı olarak boyutları birkaç mikrometre (µm) ile birkaç yüz mikrometre arasında değişir. Viskoz kuvvetlerin hakim olduğu bir ortama özel olarak uyarlanmıştır.

Kolonyal alg zincirleri

Makroalg daha büyükler çok hücreli ve genellikle adı verilen daha görünür alg türleri yosunlar. Deniz yosunları genellikle sığ kıyı sularında büyür ve burada deniz tabanına bir Dayan. Mikroalgler gibi, makroalgler (deniz yosunları) da şu şekilde kabul edilebilir: deniz protistleri gerçek bitkiler olmadıkları için. Ancak mikroorganizma değillerdir, dolayısıyla bu makalenin kapsamında değildirler.

Tek hücreli organizmalar genellikle mikroskobiktir, milimetrenin onda birinden daha az uzunluktadır. İstisnalar var. Mermaid's wineglass, subtropikal bir cins yeşil alg, is single-celled but remarkably large and complex in form with a single large nucleus, making it a model organism for studying hücre Biyolojisi.[154] Another single-celled algae, Caulerpa taxifolia, has the appearance of a vascular plant including "leaves" arranged neatly up stalks like a fern. Selective breeding in aquariums to produce hardier strains resulted in an accidental release into the Mediterranean where it has become an istilacı türler known colloquially as killer algae.[155]

Deniz mikroplanktonu

Six relatively large variously-shaped organisms with dozens of small light-colored dots all against a dark background. Some of the organisms have antennae that are longer than their bodies.
Plankton are drifting or floating organisms that cannot swim effectively against a current, and include organisms from most areas of life: bakteri, Archaea, yosun, Protozoa ve hayvanlar.
Red, orange, yellow and green represent areas where algal blooms abound. Blue areas represent nutrient-poor zones where phytoplankton exist in lower concentrations.
Ayrıca bakınız: Deniz protistleri
Daha fazla bilgi: Bakteriyoplankton, İhtiyoplankton, Mikoplankton, ve Phycosphere

Plankton (from Greek for wanderers) are a diverse group of organisms that live in the su sütunu of large bodies of water but cannot swim against a current. As a result, they wander or drift with the currents.[156] Plankton are defined by their ekolojik niş, not by any filogenetik veya taksonomik sınıflandırma. They are a crucial source of food for many marine animals, from yem balığı -e balinalar. Plankton can be divided into a plant-like component and an animal component.

Fitoplankton

Phytoplankton – such as this colony of Chaetoceros socialis – naturally gives off red fluorescent light which dissipates excess solar energy they cannot consume through photosynthesis. This glow can be detected by satellites as an indicator of how efficiently ocean phytoplankton is photosynthesising.[157][158]

Fitoplankton are the plant-like components of the plankton community ("phyto" comes from the Greek for bitki). Onlar ototrofik (self-feeding), meaning they generate their own food and do not need to consume other organisms.

Phytoplankton perform three crucial functions: they generate nearly half of the world atmospheric oxygen, they regulate ocean and atmospheric carbon dioxide levels, and they form the base of the marine besin ağı. When conditions are right, çiçek of phytoplankton algae can occur in surface waters. Fitoplanktonlar r-stratejistleri which grow rapidly and can double their population every day. The blooms can become toxic and deplete the water of oxygen. However, phytoplankton numbers are usually kept in check by the phytoplankton exhausting available nutrients and by grazing zooplankton.[159]

Phytoplankton consist mainly of microscopic photosynthetic ökaryotlar which inhabit the upper sunlit layer in all oceans. They need sunlight so they can photosynthesize. Most phytoplankton are single-celled algae, but other phytoplankton are bacteria and some are protistler.[160] Phytoplankton include cyanobacteria (above), diyatomlar, various other types of yosun (red, green, brown, and yellow-green), Dinoflagellatlar, euglenoids, kokolitoforidler, kriptomonadlar, chlorophytes, prasinofitler, ve silikoflagellatlar. They form the base of the birincil üretim that drives the ocean besin ağı, and account for half of the current global primary production, more than the terrestrial forests.[161]

  • Fitoplankton

  • Phytoplankton are the foundation of the ocean food chain

  • They come in many shapes and sizes.

  • Kolonyal fitoplankton

  • The cyanobacterium Proklorokok accounts for much of the ocean's primary production

  • Yeşil siyanobakteriler scum washed up on a rock in California

Diyatomlar

Diatom shapes
Çizimler Haeckel 1904 (detaylar için tıklayın)

Diyatomlar form a (disputed) phylum containing about 100,000 recognised species of mainly unicellular algae. Diatoms generate about 20 percent of the oxygen produced on the planet each year,[96] 6.7 milyar metrik tonun üzerinde silikon her yıl yaşadıkları sulardan,[162] and contribute nearly half of the organic material found in the oceans.

  • Diyatomlar are one of the most common types of phytoplankton

  • They come in many shapes

  • Their protective shells (frustles) are made of silicon

  • Diatom - Triceratium favus.jpg
Diyatomlar
Merkezli
Pennate
Diatoms have a silika shell (hüsran ) with radial (centric) or bilateral (pennate) symmetry

Diatoms are enclosed in protective silica (glass) shells called hüsran. Each frustule is made from two interlocking parts covered with tiny holes through which the diatom exchanges nutrients and wastes.[159] The frustules of dead diatoms drift to the ocean floor where, over millions of years, they can build up as much as half a mile deep.[163]

  • Silicified frustule of a pennate diatom with two overlapping halves

  • Guinardia delicatula, a diatom responsible for alg çiçekleri in the North Sea and the English Channel[164]

  • Fossil diatom

  • There are over 100,000 species of diyatomlar which account for 50% of the ocean's primary production

Merkezli bir diatom frustule yapısı [165]
Harici video
video simgesi Diatoms: Tiny factories you can see from space

Kokolitoforlar

Kokolitoforlar are minute unicellular photosynthetic protists with two flagella for locomotion. Most of them are protected by a shell covered with ornate circular plates or scales called kokolitler. The coccoliths are made from calcium carbonate. The term coccolithophore derives from the Greek for a seed carrying stone, referring to their small size and the coccolith stones they carry. Under the right conditions they bloom, like other phytoplankton, and can turn the ocean milky white.[166]

Kokolitoforlar
...have plates called kokolitler
...extinct fossil
Kokolitoforlar build calcite skeletons important to the marine carbon cycle[167]

Microbial rhodopsin

Model of the energy generating mechanism in marine bacteria
(1) When sunlight strikes a rhodopsin molecule
(2) it changes its configuration so a proton is expelled from the cell
(3) the chemical potential causes the proton to flow back to the cell
(4) thus generating energy
(5) in the form of adenozin trifosfat.[168]
Ana makale: Microbial rhodopsin

Phototrophic metabolism relies on one of three energy-converting pigments: klorofil, bakterioklorofil, ve retina. Retinal is the kromofor içinde bulunan Rodopinler. The significance of chlorophyll in converting light energy has been written about for decades, but phototrophy based on retinal pigments is just beginning to be studied.[169]

Halobakteriler içinde tuz buharlaştırma havuzları coloured purple by bacteriorhodopsin[170]

In 2000 a team of microbiologists led by Edward DeLong made a crucial discovery in the understanding of the marine carbon and energy cycles. They discovered a gene in several species of bacteria[171][172] responsible for production of the protein Rodopsin, previously unheard of in bacteria. These proteins found in the cell membranes are capable of converting light energy to biochemical energy due to a change in configuration of the rhodopsin molecule as sunlight strikes it, causing the pumping of a proton from inside out and a subsequent inflow that generates the energy.[173] The archaeal-like rhodopsins have subsequently been found among different taxa, protists as well as in bacteria and archaea, though they are rare in complex Çok hücreli organizmalar.[174][175][176]

Research in 2019 shows these "sun-snatching bacteria" are more widespread than previously thought and could change how oceans are affected by global warming. "The findings break from the traditional interpretation of marine ecology found in textbooks, which states that nearly all sunlight in the ocean is captured by chlorophyll in algae. Instead, rhodopsin-equipped bacteria function like hybrid cars, powered by organic matter when available — as most bacteria are — and by sunlight when nutrients are scarce."[177][169]

Bir astrobiological conjecture called the Mor Dünya hipotezi which surmises that original life forms on Earth were retinal-based rather than chlorophyll-based, which would have made the Earth appear purple instead of green.[178][179]

Redfield and f- ratios

1930'larda Alfred C. Redfield found similarities between the composition of elements in phytoplankton and the major dissolved nutrients in the deep ocean.[180] Redfield proposed that the ratio of carbon to nitrogen to phosphorus (106:16:1) in the ocean was controlled by the phytoplankton’s requirements, as phytoplankton subsequently release nitrogen and phosphorus as they remineralize. This ratio has become known as the Redfield oranı, and is used as a fundamental principle in describing the stokiyometri of seawater and phytoplankton evolution.[181]

However, the Redfield ratio is not a universal value and can change with things like geographical latitude.[182] Based on allocation of resources, phytoplankton can be classified into three different growth strategies: survivalist, bloomer and generalist. Survivalist phytoplankton has a high N:P ratio (>30) and contains an abundance of resource-acquisition machinery to sustain growth under scarce resources. Bloomer phytoplankton has a low N:P ratio (<10), contains a high proportion of growth machinery and is adapted to exponential growth. Genelci fitoplankton, Redfield oranına benzer N: P'ye sahiptir ve nispeten eşit kaynak edinme ve büyüme makinesi içerir.[181]

f oranı is the fraction of total birincil üretim yakıt alan nitrat (as opposed to that fuelled by other azot Bileşikler gibi amonyum ). The ratio was originally defined by Richard Eppley and Bruce Peterson in one of the first kağıtlar estimating global oceanic production.[183]

Zooplankton

Zooplankton are the animal component of the planktonic community ("zoo" comes from the Greek for hayvan). Onlar heterotrofik (diğer-besleme), yani kendi yiyeceklerini üretemeyecekleri ve bunun yerine diğer bitki veya hayvanları yiyecek olarak tüketmeleri gerektiği anlamına gelir. Bu özellikle fitoplankton yedikleri anlamına gelir.

Zooplankton genellikle fitoplanktondan daha büyüktür, çoğunlukla hala mikroskobiktir ancak bazıları çıplak gözle görülebilir. Birçok Protozoanlar (tek hücreli protistler diğer mikroskobik yaşamı avlayanlar dahil olmak üzere zooplanktonlar zooflagellatlar, foraminiferans, radyolar, biraz Dinoflagellatlar ve deniz mikro hayvanları. Macroscopic zooplankton (not generally covered in this article) include pelagic cnidarians, ktenoforlar, yumuşakçalar, eklembacaklılar ve tunikatlar hem planktonik ok solucanları ve kıl kurtları.

Terliksi hayvan, a predatory kirpik, beslenmek bakteri

Mikrozooplankton: planktonun başlıca otlayıcıları ...

Birçok tür Protozoa (ökaryotlar ) ve bakteri (prokaryotlar ) prey on other microorganisms; the feeding mode is evidently ancient, and evolved many times in both groups.[184][185][186] Among freshwater and marine Zooplankton, whether single-celled or multi-cellular, predatory grazing on fitoplankton and smaller zooplankton is common, and found in many species of nanoflagellates, Dinoflagellatlar, siliatlar, rotiferler, a diverse range of meroplankton animal larvae, and two groups of crustaceans, namely kopepodlar ve Cladocerans.[187]

Radyolar

Radyolar şekiller
Çizimler Haeckel 1904 (detaylar için tıklayın)

Radyolar tek hücreli yırtıcı protistler genellikle silikadan yapılmış ve deliklerle delinmiş ayrıntılı küresel kabuklarla kaplanmıştır. İsimleri "yarıçap" için Latince'den geliyor. Avlarını vücutlarının bir kısmını deliklerden uzatarak yakalarlar. Diatomların silika kırılmalarında olduğu gibi, radyolariyen kabukları da radyolarlar öldüğünde okyanus tabanına batabilir ve okyanus çökeltisinin bir parçası olarak korunur. Bunlar kalır mikrofosiller, geçmiş okyanus koşulları hakkında değerli bilgiler sağlayın.[188]

  • Diyatomlar gibi, radyolarlar da birçok şekilde gelir

  • Ayrıca diyatomlar gibi, radyolar kabuklar da genellikle silikattan yapılır.

  • ancak akantar radyolarların mermileri var stronsiyum sülfat kristaller

  • Küresel radyolar bir kabuğun kesit şematik diyagramı

Turing and radiolarian morphology
Shell of a spherical radiolarian
Shell micrographs
Computer simulations of Turing desenleri on a sphere
closely replicate some radiolarian shell patterns[189]
Harici video
video simgesi Radyolar geometri
video simgesi Ernst Haeckel'in radyolaryan gravürleri

  • Cladococcus abietinus

Foraminiferans

Foraminiferan shapes
Çizimler Haeckel 1904 (detaylar için tıklayın)

Radyolar gibi foraminiferans (foramlar kısaca) tek hücreli yırtıcı protistler, ayrıca içlerinde delikler olan kabuklarla korunuyorlar. İsimleri Latince "delik taşıyıcılar" dan geliyor. Kabukları genellikle testler, odacıklıdır (foramlar büyüdükçe daha fazla oda ekler). Kabuklar genellikle kalsitten yapılır, ancak bazen yapıştırılmış tortu parçacıkları veya Chiton ve (nadiren) silika. Foramların çoğu bentiktir, ancak yaklaşık 40 tür planktiktir.[190] Bilim adamlarının geçmiş ortamlar ve iklimler hakkında çok şey çıkarmasına olanak tanıyan iyi kurulmuş fosil kayıtları ile geniş çapta araştırılırlar.[188]

Foraminiferans
... birden fazla çekirdeğe sahip olabilir
... ve savunma dikenleri
Foraminiferans önemli tek hücreli zooplanktonlardır protistler kalsiyum testleri ile
Harici video
video simgesi foraminiferans
video simgesi Foraminiferal ağlar ve büyüme

A number of forams are miksotrofik (aşağıya bakınız ). Bunlar tek hücreli yosun gibi endosymbionts gibi çeşitli soylardan yeşil alg, kırmızı yosun, altın yosun, diyatomlar, ve Dinoflagellatlar.[190] Mixotrophic foraminiferler özellikle besin açısından fakir okyanus sularında yaygındır.[192] Bazı foramlar kleptoplastik, tutma kloroplastlar yutulan alglerden davranışa fotosentez.[193]

Amip

Kabuklu ve çıplak amip
Testate amip, Cyphoderia sp.
Çıplak amip, Kaos sp.
                  Amip kabuklu olabilir (vasiyetname bırakarak ) veya çıplak
Amoeba engulfing a diatom

Kirpikler

Ciliate shapes
Çizimler Haeckel 1904 (detaylar için tıklayın)

Mixotrophs

Miksotrofik radyolar
Acantharian radyolar konaklar Phaeocystis ortakyaşlar
Beyaz Phaeocystis Sahilde yosun köpüğü yıkama
Ayrıca bakınız: Miksotrofik dinoflagellat

Bir Mixotroph farklı karışımları kullanabilen bir organizmadır enerji ve karbon kaynakları tamamlandıktan sonra süreklilik üzerinde tek bir trofik moda sahip olmak yerine ototrofi bir ucunda heterotrofi diğerinde. Miksotrofların tüm mikroskobik planktonların yarısından fazlasını oluşturduğu tahmin edilmektedir.[195] İki tür ökaryotik miksotrof vardır: kendi kloroplastlar ve olanlar endosymbionts —Ve bunları elde eden diğerleri kleptoplasti veya tüm fototrofik hücreyi köleleştirerek.[196]

Bitkiler ve hayvanlar arasındaki ayrım genellikle çok küçük organizmalarda parçalanır. Olası kombinasyonlar Fotoğraf- ve kemotrofi, lito ve organotrophy, Oto- ve heterotrofi veya bunların diğer kombinasyonları. Mixotrophs ya ökaryotik veya prokaryotik.[197] Farklı çevre koşullarından faydalanabilirler.[198]

Deniz mikrozooplanktonuyla ilgili son çalışmalar, siliat bolluğunun% 30-45'inin miksotrofik ve amip, foram ve radyolarianın% 65'e kadar olduğunu buldu biyokütle miksotrofikti.[90]

Phaeocystis denizin bir parçası olarak bulunan önemli bir alg cinsidir fitoplankton dünya çapında. Bir polimorfik serbest yaşayan hücrelerden büyük kolonilere kadar değişen yaşam döngüsü.[199] Yüzlerce hücrenin bir jel matris içine gömülü olduğu yüzen koloniler oluşturma kabiliyetine sahiptir ve bu sırada boyut olarak büyük ölçüde artabilir. çiçek.[200] Sonuç olarak, Phaeocystis denizciliğe önemli bir katkıda bulunur karbon[201] ve kükürt döngüleri.[202] Phaeocystis türler endosimbiyonlardır akantar radyolar.[203][204]

Mixotrophic plankton that combine phototrophy and heterotrophy – table based on Stoecker et. al., 2017 [205]
General typesAçıklamaMisalDiğer örnekler
BakteriyoplanktonPhotoheterotrophic bakterioplanktonCholera bacteria SEM.jpgVibrio choleraeRoseobacter spp.
Erythrobacter spp.
Gammaproteobacterial clade OM60
Widespread among bacteria and archaea
FitoplanktonAranan constitutive mixotrophs Yazan Mitra et. al., 2016.[206] Phytoplankton that eat: photosynthetic protists with inherited plastitler and the capacity to ingest prey.Ochromonas.pngOchromonas TürlerOchromonas spp.
Prymnesium parvum
Dinoflagellate examples: Fragilidium subglobosum,Heterocapsa Triquetra,Karlodinyum veneficum,Neoceratium Furca,Prorocentrum minimum
ZooplanktonAranan yapıcı olmayan mixotrophs Yazan Mitra et. al., 2016.[206] Fotosentetik olan zooplankton: kloroplast tutulumu yoluyla fototrofi elde eden mikrozooplankton veya metazoan zooplanktona or maintenance of algal endosymbionts.
GenelcilerKloroplastları ve birçok alg taksonundan nadiren diğer organelleri tutan protistlerHalteria.jpgÇoğu oligotrich plastidleri tutan siliatlara
Uzmanlar1. Kloroplastları ve bazen diğer organelleri bir alg türünden veya çok yakından ilişkili alg türlerinden tutan protistlerDinophysis acuminata.jpgDinofiz acuminataDinofiz spp.
Myrionecta rubra
2. Yalnızca bir alg türünün veya çok yakından ilişkili alg türlerinin algal endosmbiyontlarına sahip protistler veya zooplanktonlarNoctiluca scintillans varias.jpgNoctiluca scintillansMetazooplankton alg ile endosymbionts
Çoğu miksotrofik Rhizaria (Acantharea, Polikistin, ve Foraminifer )
Yeşil Noctiluca scintillans
aKloroplast (veya plastid) tutma = tecrit = köleleştirme. Plastidi tutan bazı türler de diğer organelleri ve av sitoplazmasını korur.

Dinoflagellatlar

Ayrıca bakınız: Miksotrofik dinoflagellat ve Yırtıcı dinoflagellat
Dinoflagellate shapes
Unarmored dinoflagellates Kofoid (1921)
Haeckel Peridinea (1904)

Dinoflagellatlar bir parçası yosun grubu ve yaklaşık 2.000 deniz türü ile tek hücreli kamçılardan oluşan bir filum oluşturur.[207] İsim, Yunanca "dinos" anlamından gelmektedir. dönen ve Latince "flagellum" a kırbaç veya kırbaç. Bu, ileri hareket için kullanılan iki kamçı benzeri ataşmana (kamçı) karşılık gelir. Çoğu dinoflagellat kırmızı-kahverengi selüloz zırhla korunur. Diğer fitoplanktonlar gibi, dinoflagellatlar da r-stratejistleri doğru koşullar altında Çiçek açmak ve yarat red tides. Kazılar en bazal kamçılı soy olabilir.[105]

By trophic orientation dinoflagellates cannot be uniformly categorized. Bazı dinoflagellatların fotosentetik, ancak bunların büyük bir kısmı aslında miksotrofik fotosentezi avın yutulmasıyla birleştirerek (fagotrofi ).[208] Bazı türler endosymbionts deniz hayvanları ve diğer protistlerin biyolojisinde önemli bir rol oynar. Mercan resifleri. Diğerleri diğer protozoalardan önce gelir ve birkaç form parazitiktir. Birçok dinoflagellat miksotrofik ve fitoplankton olarak da sınıflandırılabilir.

Toksik dinoflagellat Dinofiz acuta avından kloroplast alır. "It cannot catch the cryptophytes byitself, and instead relies on ingesting ciliates such as the red Myrionecta rubra, which sequester their chloroplasts from aspecific cryptophyte clade (Geminigera/Plagioselmis/Teleaulax)".[205]

  • Gyrodinium, zırhı olmayan birkaç çıplak dinoflagellattan biri

  • Dinoflagellat Protoperidinyum avını yakalamak için büyük bir besleme örtüsünü çıkarır

  • Nassellariyen radyolarlar dinoflagellatlarla simbiyoz içinde olabilirler

  • Dinoflagellat Dinofiz acuta

Bir surf wave at night sparkles with blue light due to the presence of a bioluminescent dinoflagellate, such as Lingulodinium polyedrum
Suggested explanation for glowing seas[209]
Dinoflagellatlar
Zırhlı
Zırhsız
Geleneksel olarak dinoflagellatlar zırhlı veya zırhsız olarak sunulmuştur.

Dinoflagellatlar sıklıkla yaşar ortakyaşam diğer organizmalarla. Birçok nazsellar radyolar evi dinoflagellat ortakyaşlar testleri dahilinde.[210] Nassellar sağlar amonyum ve karbon dioksit dinoflagellat için, dinoflagellat nazsellaryene avlanma ve zararlı istilacılara karşı koruma için yararlı bir mukoza sağlar.[211] Kanıt var DNA Radyolarlarla dinoflagellat simbiyozunun diğer dinoflagellat ortakyaşamlarından bağımsız olarak geliştiğinin analizi foraminifera.[212]

Some dinoflagellates are biyolüminesan. At night, ocean water can light up internally and sparkle with blue light because of these dinoflagellates.[213][214] Bioluminescent dinoflagellates possess Sintilonlar, bireysel sitoplazmik bodies which contain dinoflagellat lusiferaz, the main enzyme involved in the luminescence. The luminescence, sometimes called the phosphorescence of the sea, occurs as brief (0.1 sec) blue flashes or sparks when individual scintillons are stimulated, usually by mechanical disturbances from, for example, a boat or a swimmer or surf.[215]

Marine microfossils

Thickness of marine sediments
Ayrıca bakınız: Deniz biyojeokimyasal döngüleri
Daha fazla bilgi: Calcareous ooze, Biyojenik silika, Radyolarit, Tortul kayaçlar, Mikrofosil, ve Reverse weathering

Sediments at the bottom of the ocean have two main origins, terrigenous and biogenous.

Terrigenous sediments account for about 45% of the total marine sediment, and originate in the erosion of kayalar on land, transported by rivers and land runoff, windborne dust, volcanoes, or grinding by glaciers.

Biogenous sediments account for the other 55% of the total sediment, and originate in the skeletal remains of deniz protistleri (single-celled plankton and benthos microorganisms). Much smaller amounts of precipitated minerals and meteoric dust can also be present. Sızmak, in the context of a marine sediment, does not refer to the consistency of the sediment but to its biological origin. The term ooze was originally used by John Murray, the "father of modern oceanography", who proposed the term radiolarian ooze for the silica deposits of radiolarian shells brought to the surface during the Challenger Expedition.[219] Bir biogenic ooze bir pelajik tortu containing at least 30 percent from the skeletal remains of marine organisms.

Main types of biogenic ooze
tipmineral
formlar		protist
dahil		name of skeletontypical size
(mm)
Silisli sızıntıSiO2
silika
kuvars
bardak
opal
çört		diyatomLyrella hennedy 1600x contrast invertion.jpghüsran0.002 to 0.2[220]Stephanopyxis grunowii.jpgdiyatom mikrofosil from 40 million years ago
radyolarCalocycloma sp. - Radiolarian (32163186535).jpgÖlçek or shell0.1 to 0.2Radiolarian - Heliodiscus umbonatus (Ehr.), Haeckel (28187768550).jpgelaborate silica shell of a radiolarian
Calcareous oozeCaCO3
kalsit
aragonit
kireçtaşı
mermer
tebeşir		foraminiferanForam-globigerina hg.jpgtest or shellunder 1Globigerina.pngKireçlenmiş Ölçek of a planktic foraminiferan. There are about 10,000 living species of foraminiferans[221]
kokolitoforCoccolithus pelagicus 2.jpgkokolitlerunder 0.1[222]CSIRO ScienceImage 7202 SEM Coccolithophorid.jpgCoccolithophores are the largest global source of biogenic calcium carbonate, and significantly contribute to the global carbon cycle.[223] They are the main constituent of chalk deposits such as the Dover'ın beyaz kayalıkları.
Stone dagger of Buz Adam Ötzi sırasında yaşayan Bakır Çağı. The blade is made of çört containing radiolarians, calcispheres, calpionellids and a few sponge spicules. Varlığı calpionellids, which are extinct, was used to date this dagger.[224]
Calcareous microfossils from marine sediment consisting mainly of star-shaped discoaster with a sprinkling of coccoliths
Distribution of sediment types on the seafloor
Within each colored area, the type of material shown is what dominates, although other materials are also likely to be present.
For further information, buraya bakın

Marine microbenthos

Archaea rock - this deep ocean rock harboured worms that consumed methane-eating archaea
Ayrıca bakınız: Seabed § Sediments, biyoturbasyon, ve bioirrigation

Marine microbenthos are microorganisms that live in the bentik bölge of the ocean – that live near or on the seafloor, or within or on surface seafloor sediments. Kelime Benthos comes from Greek, meaning "depth of the sea". Microbenthos, kıta sahanlıklarının deniz tabanında veya çevresinde ve deniz tabanındaki tortularda daha fazla çeşitlilikle daha derin sularda her yerde bulunur. Sığ sularda, deniz çayırları, mercan resifleri ve yosun ormanları özellikle zengin yaşam alanları sağlar. İçinde fotik bölgeler bentik diatomlar, fotosentetik organizmalar olarak hakimdir. İçinde gelgit bölgeleri değiştirme gelgit microbenthos fırsatlarını güçlü bir şekilde kontrol eder.

Hem foraminifer hem de diatomlarda planktonik ve Bentik formlar, yani sürüklenebilirler su sütunu veya okyanusun dibindeki tortu üzerinde yaşayın. Her iki durumda da, mermileri öldükten sonra deniz tabanına düşer. Bu kabuklar yaygın olarak kullanılmaktadır. iklim vekilleri. Kabukların kimyasal bileşimi, kabukların oluştuğu sırada okyanusun kimyasal bileşiminin bir sonucudur. Geçmiş su sıcaklıkları, kararlılık oranlarından da çıkarılabilir. oksijen izotopları Kabuklarda, daha hafif izotoplar daha sıcak suda daha kolay buharlaştığı için kabuklarda daha ağır izotopları bırakır. Geçmiş iklimlerle ilgili bilgiler, ılık suda daha bol olma eğiliminde olduklarından, foramların ve diatomların bolluğundan daha fazla çıkarılabilir.[226]

Ani yok olma olayı 66 milyon yıl önce dinozorları öldüren diğer tüm hayvan ve bitki türlerinin dörtte üçünün neslinin tükenmesine neden oldu. Bununla birlikte, derin deniz bentik foramları sonrasında gelişti. 2020'de araştırmacıların, bu bentik foramların binlerce örneğinin kimyasal bileşimini inceledikleri ve bulgularını Dünya'nın şimdiye kadarki en ayrıntılı iklim kaydını oluşturmak için kullandıkları bildirildi.[227][228]

Biraz endolitler son derece uzun ömürlüdür. 2013'te araştırmacılar, okyanus tabanında, belki de milyonlarca yıllık ve 10.000 yıllık bir nesil süresine sahip endolitlerin kanıtlarını bildirdi.[229] Bunlar yavaşça metabolize oluyorlar ve uykuda değiller. Biraz Aktinobakteriler içinde bulunan Sibirya yarım milyon yaşında olduğu tahmin ediliyor.[230][231][232]

Deniz mikrobiyomları

Daha fazla bilgi: Deniz mikrobiyomları

Simbiyoz ve holobiyontlar

Ana mikrobiyal ortakyaşam türleri
(A) Mikrobiyal etkileşimler, bir veya daha fazla ortak için karşılıklı faydadan zararlıya kadar değişir. Mavi çift başlı oklar, ilişkilerin genellikle çevresel koşullardan etkilenen sınıflandırmalar arasında hareket edebildiğini vurgular. (B) Konak-mikrop ortakyaşamı, ev sahibinin birden çok ve genellikle farklı simbiyotik ilişkilere katıldığı mikrobiyal topluluklar bağlamında düşünülmelidir. (C) Mikrobiyal topluluklar, işbirliğinden (örneğin, sintrofi veya birlikte metabolizma) rekabete kadar değişen çeşitli mikrop-mikrop ortakyaşamlarından etkilenir. Oklar genellikle bir (tek ok başı) veya her iki (çift ok başı) üye için yararlı (mavi) ve zararlı (kırmızı) sonuçları gösterir. Konak-mikrop ortakyaşamlarında olduğu gibi, bu ilişkiler akışkan olarak görülebilir ve çevresel koşullardan etkilenebilir.[233]
Daha fazla bilgi: deniz mikrobik simbiyozu ve Holobiont

Holobiont kavramı başlangıçta şu şekilde tanımlanmıştır: Dr. Lynn Margulis 1991 kitabında Evrimsel İnovasyon Kaynağı Olarak Ortak Yaşam bir topluluğu olarak ev sahibi ve içinde veya çevresinde yaşayan ve birlikte ayrı bir ekolojik birim.[234] Bir holobiont'un bileşenleri bireysel türlerdir veya Biyonts, kombine iken genetik şifre tüm biyontlar arasında hologenom.[235]

Kavram daha sonra bu orijinal tanımdan bu yana gelişti,[236] odak, konakçı ile ilişkili mikrobiyal türlere doğru hareket eder. Böylece holobiont, konağı içerir, virome, mikrobiyom ve hepsi bütünün işlevine bir şekilde katkıda bulunan diğer üyelerdir.[237][238] Bir holobiont tipik olarak bir ökaryot ev sahibi ve hepsi simbiyotik virüsler, bakteri, mantarlar, üzerinde veya içinde yaşayan vb.[239]

Ancak, var tartışma holobiyontların tek evrimsel birimler olarak görülüp görülemeyeceği üzerine.[240]

Resif oluşturan mercanlar, mercanın kendisini de içeren iyi çalışılmış holobiyontlardır (ökaryotik omurgasız sınıf içinde Anthozoa ), fotosentetik Dinoflagellatlar aranan zooxanthellae (Simbiyodinyum ) ve ilgili bakteri ve virüsler.[245] Mercan mikrobiyal toplulukları ve mercan filogenisi için birlikte evrimsel modeller mevcuttur.[246]

Deniz besin ağı

Deniz ihracat üretimi
Daha fazla bilgi: deniz besin ağı

Deniz mikroorganizmaları, deniz besin ağı.

viral şant yol, deniz mikrobiyalini önleyen bir mekanizmadır. partikül organik madde (POM) yukarı geçişten trofik seviyeler onları geri dönüştürerek çözünmüş organik madde (DOM), mikroorganizmalar tarafından kolaylıkla alınabilir.[247] Viral şant, tek bir deniz mikrop türünün mikro çevreye hakim olmasını engelleyerek mikrobiyal ekosistem içinde çeşitliliğin korunmasına yardımcı olur.[248] Viral şant yolu tarafından geri dönüştürülen DOM, diğer ana deniz DOM kaynakları tarafından üretilen miktarla karşılaştırılabilir.[249]

Deniz mikrobiyal döngü
Deniz karbon döngüsünde mantarların rolleri [250]
viral şant yolu akışını kolaylaştırır çözünmüş organik madde (DOM) ve partikül organik madde (POM) deniz besin ağı aracılığıyla
Harici video
video simgesi Planktonun gizli hayatı
Deniz parçacıklarının boyutu ve sınıflandırılması[252]
Simon ve diğerleri, 2002'den uyarlanmıştır.[253]

Niş topluluklar

Antarktika deniz buzunun altındaki alg ve bakteri topluluğu
Siyah sigara içen Yüksek Yükseliş bölümünde Endeavour Hidrotermal Menfezler.
Bakteriler faydalı olabilir. Bu Pompeii solucanı, bir ekstremofil sadece şurada bulundu hidrotermal menfezler koruyucu kapağı vardır simbiyotik bakteri.

Deniz buzu mikrobiyal toplulukları (SIMCO) gruplarına atıfta bulunur mikroorganizmalar içinde ve arayüzlerinde yaşamak Deniz buzu kutuplarda. Yaşadıkları buz matrisi, güçlü dikey tuzluluk, ışık, sıcaklık ve besin gradyanlarına sahiptir. Deniz buzu kimyası en çok tuzlu suyun tuzluluğundan etkilenir. pH ve çözünmüş besin ve gazların konsantrasyonu. salamura Erime sırasında oluşan deniz buzu, deniz buzunda bu mikropların yaşayabileceği gözenekler ve kanallar oluşturur. Bu gradyanların ve dinamik koşulların bir sonucu olarak, bazıları orta ve üst katmanlarda bulunmasına rağmen, buzun alt katmanında daha yüksek miktarda mikrop bulunur.[254]

Hidrotermal menfezler nerede bulunur tektonik plakalar ayrılıyor ve yayılıyor. Bu, okyanustan gelen suyun magma tarafından ısıtıldığı yer kabuğuna girmesine izin verir. Artan basınç ve sıcaklık, suyu bu açıklıklardan geri çekmeye zorlar, çıkış yolunda su, karşılaştığı kayalardan çözünmüş mineralleri ve kimyasalları biriktirir. Havalandırmalar, sıcaklık ve kimyasal bileşim ile karakterize edilebilir. yaygın havalandırma delikleri Genellikle 30 ° C'nin altında berrak, nispeten soğuk su açığa çıkaran beyaz sigara içenler daha sıcak sıcaklıklarda, yaklaşık 200-330 ° C'de süt rengi su yayan siyah sigara içenler yaklaşık 300-400 ° C gibi sıcak sıcaklıklarda biriken sülfit çökeltileriyle koyulaşan su yayar.[255]

Hidrotermal havalandırma mikrobiyal toplulukları hidrotermal menfezlerin etrafındaki kimyasal olarak farklı alanda yaşayan ve çoğalan mikroskobik tek hücreli organizmalardır. Bunlar, içindeki organizmaları içerir mikrobiyal paspaslar, serbest yüzen hücreler ve içindeki bakteriler endosimbiyotik hayvanlarla ilişkiler. Bu derinliklerde güneş ışığı olmadığı için enerji kemosentez simbiyotik bakteri ve arkelerin besin zincirinin altını oluşturduğu ve aşağıdakiler gibi çeşitli organizmaları destekleyebildiği dev tüp solucanları ve Pompeii solucanları. Bu organizmalar, bu hidrotermal havalandırma bölgelerinde salınan kimyasal enerjiyi kullanmak ve elde etmek için bu simbiyotik ilişkiyi kullanır.[256] Kemolitoototrofik bakteriler, karbonu organik formlara sabitlemek için hidrotermal bir havalandırma deliğindeki jeolojik aktiviteden besin ve enerji türetir.

Virüsler ayrıca hidrotermal havalandırma mikrobiyal topluluğunun bir parçasıdır ve bu ekosistemlerdeki mikrobiyal ekoloji üzerindeki etkileri, gelişen bir araştırma alanıdır.[257] Virüsler, okyanustaki en bol yaşamdır ve en büyük genetik çeşitlilik rezervuarını barındırır.[258] Enfeksiyonları genellikle ölümcül olduğundan, önemli bir ölüm kaynağı oluştururlar ve bu nedenle biyolojik oşinografik süreçler üzerinde yaygın bir etkiye sahiptirler. evrim ve biyojeokimyasal döngü okyanusun içinde.[259] Bununla birlikte, havalandırma habitatlarında bulunan virüslerin daha fazla benimsediğini gösteren kanıtlar bulunmuştur. karşılıklı -den parazit içinde bulundukları aşırı ve değişken çevrede hayatta kalabilmek için evrimsel strateji.[260] Derin deniz hidrotermal menfezlerinin yüksek viral üretimi gösteren çok sayıda virüse sahip olduğu bulundu.[261] Diğer deniz ortamlarında olduğu gibi, derin deniz hidrotermal virüsleri bolluğunu ve çeşitliliğini etkiler prokaryotlar ve bu nedenle mikrobiyal biyojeokimyasal döngüyü şu şekilde etkiler: Lysing ev sahiplerinin çoğalmasını sağlar.[262] Bununla birlikte, bir ölüm ve popülasyon kontrolü kaynağı olarak rollerinin aksine, virüslerin, aşırı ortamlarda prokaryotların hayatta kalmasını arttırdığı ve genetik bilgi rezervuarı görevi gördüğü varsayılmıştır. Virosferin, çevresel stresler altında mikroorganizmalarla etkileşimlerinin, bu nedenle konakçı genlerin yayılması yoluyla mikroorganizmanın hayatta kalmasına yardımcı olduğu düşünülmektedir. yatay gen transferi.[263]

Derin biyosfer ve karanlık madde

Çeşitli floresan mikroskopisi pikoplankton okyanusta, laboratuar kültürü girişimlerine direndikleri için çoğu etkili bir şekilde çalışılamaz.
Ayrıca bakınız: derin biyosfer, nadir biyosfer, mikrobiyal karanlık madde, SLiME, ve deniz kriptik etkileşimleri

derin biyosfer bu parçası mı biyosfer yüzeyin ilk birkaç metresinin altında bulunur. 100 ° C'yi aşabilen sıcaklıklarla kıta yüzeyinin en az 5 kilometre altına ve deniz yüzeyinin 10,5 kilometre altına uzanır.

Yüzeyin üstünde yaşayan organizmalar organik madde ve oksijen tüketir. Aşağı indirin, bunlar mevcut değildir, bu nedenle "yenilebilir yiyeceklerden" yararlanırlar (elektron bağışçıları ) çeşitli kimyasal işlemlerle kayalardan salınan hidrojen, metan, indirgenmiş kükürt bileşikleri ve amonyum gibi. "Nefes alırlar" elektron alıcıları nitratlar ve nitritler, manganez ve demir oksitler, oksitlenmiş sülfür bileşikleri ve karbon dioksit gibi.

Daha büyük derinliklerde çok az enerji vardır ve metabolizma yüzeydekinden bir milyon kat daha yavaş olabilir. Hücreler bölünmeden önce binlerce yıl yaşayabilir ve yaşlarının bilinen bir sınırı yoktur. Yeraltı yüzeyin yaklaşık% 90'ını oluşturmaktadır. biyokütle bakteri ve arkelerde ve biyosfer için toplam biyokütlenin% 15'i. Ökaryotlar da, çoğunlukla mikroskobik, ancak bazı çok hücreli yaşam dahil olmak üzere bulunur. Virüsler de mevcuttur ve mikropları enfekte eder.

Tanımlanamayan küresel alg mikroorganizması, mikrobiyal karanlık madde
Yeraltı yaşam ortamları

2018 yılında, Derin Karbon Gözlemevi bunu duyurdu yaşam formları Dünya üzerindeki bakteri ve arkelerin% 70'i dahil olmak üzere toplam 23 milyar ton biyokütle karbon, ulaşmak 4,8 km (3,0 mi) dahil olmak üzere derin yeraltı 2,5 km (1,6 mil) deniz dibinin altında.[264][265][266] 2019'da yüzeyin 7,900 fit (2,400 m) altında yaşayan mikrobiyal organizmalar keşfedildi. nefes alan kükürt ve gibi taşlar yemek pirit düzenli besin kaynağı olarak.[267][268][269] Bu keşif, dünyadaki bilinen en eski suda gerçekleşti.[270]

Organik olarak fakir çökeltilerin derinliklerinde bulunan bu aerobik mikroorganizmalar, yaklaşık 100 milyon yıldır neredeyse askıya alınmış animasyonda.

2020'de araştırmacılar, şimdiye kadarki en uzun yaşayan yaşam formlarının ne olabileceğini bulduklarını bildirdi: aerobik içinde bulunan mikroorganizmalar yarı askıya alınmış animasyon 101,5 milyon yıla kadar. Mikroorganizmalar bulundu organik olarak zayıf çökeltiler 68,9 metre (226 fit) altında Deniz tabanı içinde Güney Pasifik Döngüsü (KMT), "okyanustaki en ölümcül nokta".[271][272]

Bugüne kadar biyologlar yapamadı kültür laboratuvarda mikroorganizmaların büyük çoğunluğu. Bu özellikle bakteriler ve arkeler için geçerlidir ve gerekli büyüme koşullarını sağlamak için bilgi veya beceri eksikliğinden kaynaklanmaktadır.[273][274] Dönem mikrobiyal karanlık madde Bilim adamlarının orada olduğunu bildiği ancak kültür yapamadığı ve bu nedenle özellikleri belirsiz kalan mikroorganizmaları tanımlamak için kullanılmaya başlandı.[273] Mikrobiyal karanlık madde, karanlık madde fizik ve kozmoloji, ancak etkili bir şekilde çalışmadaki zorluk için sözde. Göreceli büyüklüğünü tahmin etmek zordur, ancak kabul edilen brüt tahmin, belirli bir mikrobiyal türlerin yüzde birden az olmasıdır. ekolojik niş kültürlenebilir. Son yıllarda mikrobiyal karanlık maddenin daha fazla deşifre edilmesi için çaba gösteriliyor. genetik şifre DNA çevresel örneklerden sekans[275] ve daha sonra, dizilenmiş genomlarından metabolizmaları hakkında içgörü kazanarak, ekimleri için gerekli bilgiyi teşvik ederek.

Mikrobiyal çeşitlilik

Mikrobiyal türlerin tahminleri, yaşamın üç alanında sayılır
Bakteriler en eski ve en biyolojik çeşitliliğe sahip gruptur, ardından Archaea ve Fungi (en yeni gruplar) gelir. 1998'de, mikrobiyal yaşamın boyutunun farkına varmadan önce, Robert M.May [276] Gezegende 3 milyon canlı organizma türü olduğu tahmin ediliyor. Ancak 2016'da Locey ve Lennon [277] mikroorganizma türlerinin sayısının 1 trilyon kadar yüksek olabileceği tahmin ediliyor.[278]
Hem deniz hem de karasal mikroorganizmalar için geçerli olan bilinen ve tahmin edilen (küçük kutu) ve henüz bilinmeyen (büyük kutu) mikrobiyal çeşitliliğin karşılaştırmalı temsili. Metin kutuları, gezegende var olan mikrobiyal çeşitliliğin bilgisini olumsuz yönde etkileyen faktörlere atıfta bulunmaktadır.[278]

Örnekleme teknikleri

Ayrıca bakınız: niskin şişesi, plankton ağı, video plankton kaydedici, ve sürekli plankton kaydedici
Planktonu boyut sınıflarına ve bolluğa göre örnekleme stratejileri
Mavi arka plan, analiz için yeterli organizma sayısını elde etmek için gereken filtrelenmiş hacmi gösterir.
Organizmalardan numune alınan gerçek hacimler her zaman kaydedilir.[279]

Mikroorganizmaları tanımlama

Yüksek hacimde plankton numuneleri hızla analiz edilebilir
modern görüntüleme tekniklerini kullanarak.[279]
Yüksek hacimli plankton numuneleri de hızlı bir şekilde analiz edilebilir. sıralama teknikleri.[279]
Daha fazla bilgi: mikroskopi, metagenomik, akış sitometrisi, yüksek verimli biyoloji, Sanger sıralaması, mikrobiyal DNA barkodlama, ve yosun DNA barkodlaması

Geleneksel olarak, soyoluş mikroorganizmaların taksonomi çalışmalarına dayanarak kurulmuştur morfoloji. Ancak, gelişmeler moleküler filogenetik türlerin evrimsel ilişkilerinin, türleri gibi daha derin özellikleri analiz ederek kurulmasına izin vermiştir. DNA ve protein diziler, örneğin ribozomal DNA.[280] İçinde bulunanlar gibi kolayca erişilebilir morfolojik özelliklerin eksikliği hayvanlar ve bitkiler, özellikle bakteri ve arkelerin sınıflandırılmasına yönelik erken çabaları engelledi. Bu, hatalı, çarpık ve kafa karıştırıcı sınıflandırmalara neden oldu; Carl Woese, dır-dir Pseudomonas etimolojisi taksonomisine ironik bir şekilde uyan, yani "yanlış birim".[281] Pek çok bakteri taksonu yeniden sınıflandırılmış veya moleküler filogenetik kullanılarak yeniden tanımlanmıştır.

Son gelişmeler moleküler sıralama iyileşmesine izin verdi genomlar yerinde, doğrudan çevresel numunelerden ve kültürleme ihtiyacını ortadan kaldırarak. Bu, örneğin, çeşitlilik bilgisinde hızlı bir genişlemeye yol açmıştır. bakteri filumu. Bu teknikler genom çözümlüdür metagenomik ve tek hücreli genomik.

Barkodlama
Pelagibacter ubique, okyanustaki en yaygın bakteri
Marinomonas arktika, sıfır altı sıcaklıklarda Arktik deniz buzunun içinde büyüyen bir bakteri
Yalnızca görüntüleri kullanarak bu iki mikropu tutarlı bir şekilde ayırmak zor olacaktır. Ancak barkodları birbirine hizalanmışsa ve tabanları renklendirilerek daha net görülebiliyorsa, bu iki mikrop arasında hangi bazların farklı olduğunu görmek kolaylaşır. Bu şekilde milyonlarca farklı mikrop türü ayırt edilebilir.[282]
DNA barkodu hizalama ve karşılaştırma
yukarıda resmedilen iki deniz bakteri türü [282]
Fitoplanktonu incelemek için kullanılan yöntemler
Numuneyi işlemek için üç farklı olasılık, ham numunelerin kullanılması, fiksasyon veya koruma ve filtrasyondur. Mikroskopi ve akış sitometrisi için ham numuneler ya hemen ölçülür ya da sonraki ölçümler için sabitlenmelidir. Moleküler yöntemler, pigment analizi ve moleküler izleyicilerin tespiti genellikle konsantre hücreler gerektirdiğinden, filtre kalıntıları fitoplankton ölçümlerine hizmet eder. İz moleküllerinin moleküler karakterizasyonu ve miktar tayini kullanılarak gerçekleştirilir kromatografi, kütle spektrometrisi, ve nükleer manyetik rezonans spektroskopi.[283]
Harici video
video simgesi Mikroplar aslında hiçbir şeye benzemiyor - Microcosmos ile tanışın
video simgesi Mikroplar Nasıl Tanımlanır - Microcosmos ile tanışın
video simgesi Diferansiyel girişim kontrastı (DIC) - Microcosmos ile tanışın
Mikroorganizmaları tanımlama yöntemleri [284]
Kromojenik ortam Microorganism identification - Phylogenetic classification.pngMikroskopi teknikleri Microorganism identification - Microscopy methods.pngBiyokimyasal teknikler Microorganism identification - Biochemical techniques.pngMoleküler teknikler Microorganism identification - Molecular methods.png
Geleneksel medya
Parlak bir alan
Karanlık alan
SEM
TEM
CLSM
ATM
Ters mikroskopi		Spektrometri
    – FTIR
    – Raman spektrometresi
Kütle spektrometrisi
    – GC
    – LC
    – MALDI-TOF
    – ESI
Elektrokinetik ayırma
Mikroakışkan çip
Uygunluk yöntemleri
- Wickerham kartı
    – API
- BBL Kristal
- Vitek
- Biyolog		PCR
Gerçek zamanlı qPCR
Hızlı PCR
PCR sıralaması
RFLP
PFGE
Ribotipleme
WGS
MALDI-TOF MS



Divergence from a common ancestor.png

Yeni dizileme teknolojileri ve dizi verilerinin birikimi bir paradigma değişikliğine yol açmış, hem mikrobiyal toplulukların daha yüksek organizmalar içindeki ortak yaygınlığını hem de ekosistem sağlığında mikropların kritik rollerini vurgulamıştır.[285] Bu yeni olanaklar devrim yarattı mikrobiyal ekoloji, çünkü genomların ve metagenomların yüksek verimli bir şekilde analizi, bireysel mikroorganizmaların ve doğal yaşam ortamlarındaki tüm toplulukların işlevsel potansiyelini ele almak için etkili yöntemler sağlar.[286][287][288]

Omics verilerini kullanma

Deniz metagenomisinde kullanılan DNA sıralama teknolojileri
Keşif süreci deniz örneklemesini içerir, DNA dizilimi ve bitişik nesil. Daha önce bilinmeyen genler, yollar ve hatta tüm genomlar keşfediliyor. Bu genom düzenleme teknolojileri, özellikle deniz metagenomiklerinde üretim için değerli mikroorganizmaları geri almak ve değiştirmek için kullanılır. Organizmalar yetiştirilebilir veya yetiştirilemez olabilir. Metagenomik işlenemeyen örnekler için özellikle değerli bilgiler sağlıyor.[289]
Daha fazla bilgi: Omik

Omik gayri resmi olarak şubelerine atıfta bulunmak için kullanılan Biyoloji isimleri son ek ile biten -omik, gibi genomik, proteomik, metabolomik, ve glikomikler. Omics, bir organizmanın veya organizmaların yapısına, işlevine ve dinamiklerine dönüşen biyolojik molekül havuzlarını toplu olarak karakterize etmeyi ve ölçmeyi amaçlamaktadır. Örneğin, fonksiyonel genomik belirli bir organizmanın mümkün olduğu kadar çok genin işlevlerini tanımlamayı amaçlar. Farklı birleştirir-omik teknikleri doymuş ile transkriptomik ve proteomik gibi mutant koleksiyonlar.[290][291]

Orijinalin ötesinde birçok omes genetik şifre yararlı hale geldi ve son yıllarda araştırmacı bilim adamları tarafından geniş çapta benimsendi. Son ek -omik bir alanı özetlemek için kolay bir kısaltma sağlayabilir; örneğin, bir interaktomikler çalışma, gen-gen, protein-protein veya protein-ligand etkileşimlerinin büyük ölçekli analizleriyle ilişkili olarak makul bir şekilde tanınabilir. proteomik eğitim için bir terim olarak yerleşmiş proteinler Büyük bir boyutta.

Tek başına kullanılan herhangi bir omik tekniği, bir konakçı mikrobiyomun karmaşıklıklarını yeterince çözemez. Konakçı-mikrobiyom etkileşimlerinin karmaşıklığını tatmin edici bir şekilde çözmek için çoklu'omik 'yaklaşımlara ihtiyaç vardır.[292] Örneğin, metagenomik, metatranscriptomics, metaproteomik ve metabolomik yöntemlerin tümü hakkında bilgi sağlamak için kullanılır metagenom.[293]

Meta-omik veri tabanlı biyojeokimyasal modelleme [294]
Şematik bir kavramsal çerçeve deniz biyojeokimyasal modelleme çevresel, görüntüleme ve meta-omik verilerden.[295] Biyobelirteçleri biyojeokimyasal verilerle birleştirmek için yarı otomatik bir hesaplama hattı şeması oluşturulmuştur [296] klasik biyojeokimyasal modellere dahil edilebilen [297] yeni nesil biyojeokimyasal özellik tabanlı meta-omik modelleri oluşturmak için. Bu tür yeni meta-omik destekli yaklaşımlar, planktonik sistemin karmaşıklığına saygı gösterirken okyanus süreçlerinin izlenmesini ve tahminini geliştirmeyi amaçlamaktadır.[298][299]
Omik verilerini deniz fitoplanktonuyla kullanma [300]
Omik verilerinin deniz fitoplanktonu ile nasıl kullanılabileceğinin bir örneği olarak Yer sistemi bilimi, metatranscriptome dizileri doğal fitoplankton topluluklarından fizyolojik özelliklerin (hücresel konsantrasyonun ribozomlar ve onların rRNA'lar ) çevresel koşullara (sıcaklık) adaptasyonu destekler. Hücresel hücre için belirlenen fizyolojik özelliğin önemini test etmek için mekanik bir fitoplankton hücre modeli kullanıldı. stokiyometri. Özellik temelli bir küresel deniz ekosistemi modelindeki çevresel seçim, daha sonra ortaya çıkan büyüme ve hücresel tahsis stratejilerini, yüzey deniz ortamındaki ışık, besinler ve sıcaklıktaki büyük ölçekli modellerle ilişkilendiriyordu. Hücresel kaynak tahsisi ve stokiyometrinin (N: P oranı) küresel tahminleri, metatranscriptome verilerindeki modellerle tutarlıydı [301] ve deniz planktonu ve organik maddenin temel oranlarındaki enlemsel desenler.[302] Ribozomun üç boyutlu görünümü, rRNA'yı koyu mavi ve koyu kırmızı olarak gösterir. Daha açık renkler temsil eder ribozomal proteinler. Yukarıdaki bantlar, sıcaklığa bağlı bolluğunu gösterir. ökaryotik ribozomal protein S14.[301]


Görmek...

  • Brüwer, J.D. ve Buck-Wiese, H. (2018) "Disiplinler Arasında Evrensel Bir Araç Olarak Yaşam Kitabını Okumak-Omiks". İçinde: YOUMARES 8 - Sınır Ötesi Okyanuslar: Birbirinden Öğrenmek, 73–82. sayfalar. Springer. ISBN  9783319932842.

Antropojenik etkiler

Ayrıca bakınız: Deniz yaşamı üzerindeki insan etkisi
Deniz ve kara biyomlarında mikroorganizmalar ve iklim değişikliği[6]

Deniz ortamlarında mikrobiyal birincil üretim önemli ölçüde katkıda bulunur CO2 tecrit. Deniz mikroorganizmaları ayrıca besin maddelerini geri dönüştürerek deniz besin ağı ve süreç sürümünde CO2 atmosfere. Mikrobiyal biyokütle ve diğer organik maddeler (bitki ve hayvan kalıntıları) milyonlarca yıl içinde fosil yakıtlara dönüştürülür. Aksine, yanan fosil yakıtlar o zamanın küçük bir bölümünde sera gazlarını serbest bırakır. Sonuç olarak, karbon döngüsü dengesiz ve atmosferik CO2 fosil yakıtlar yanmaya devam ettiği sürece seviyeler yükselmeye devam edecek.[6]

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ a b Madigan M; Martinko J, editörler. (2006). Brock Mikroorganizmaların Biyolojisi (13. baskı). Pearson Education. s. 1096. ISBN  978-0-321-73551-5.
  2. ^ a b Rybicki EP (1990). "Yaşamın sınırındaki organizmaların sınıflandırılması veya virüs sistematiği ile ilgili sorunlar". Güney Afrika Bilim Dergisi. 86: 182–6. ISSN  0038-2353.
  3. ^ a b Lwoff A (1956). "Virüs kavramı". Genel Mikrobiyoloji Dergisi. 17 (2): 239–53. doi:10.1099/00221287-17-2-239. PMID  13481308.
  4. ^ a b c Bar-On, YM; Phillips, R; Milo, R (2018). "Dünyadaki biyokütle dağılımı". PNAS. 115 (25): 6506–6511. doi:10.1073 / pnas.1711842115. PMC  6016768. PMID  29784790.
  5. ^ Deniz Yaşamı Sayımı 29 Ekim 2020'de erişildi.
  6. ^ a b c Cavicchioli, Ricardo; Ripple, William J .; Timmis, Kenneth N .; Azam, Farooq; Bakken, Lars R .; Baylis, Matthew; Behrenfeld, Michael J .; Boetius, Antje; Boyd, Philip W .; Sınıf, Aimée T .; Crowther, Thomas W .; Danovaro, Roberto; Foreman, Christine M .; Huisman, Jef; Hutchins, David A .; Jansson, Janet K .; Karl, David M .; Koskella, Britt; Mark Welch, David B .; Martiny, Jennifer B. H .; Moran, Mary Ann; Yetim, Victoria J .; Reay, David S .; Remais, Justin V .; Rich, Virginia I .; Singh, Brajesh K .; Stein, Lisa Y .; Stewart, Frank J .; Sullivan, Matthew B .; et al. (2019). "Bilim insanlarının insanlığa uyarısı: Mikroorganizmalar ve iklim değişikliği". Doğa İncelemeleri Mikrobiyoloji. 17 (9): 569–586. doi:10.1038 / s41579-019-0222-5. PMC  7136171. PMID  31213707. CC-BY icon.svg Materyal, bir altında bulunan bu kaynaktan kopyalandı. Creative Commons Attribution 4.0 Uluslararası Lisansı.
  7. ^ Bolhuis, H. ve Cretoiu, M.S. (2016) "Deniz mikroorganizmalarını bu kadar özel kılan nedir?". In: L.J. Stal ve M.S. Cretoiu (Eds.) Deniz Mikrobiyomu, sayfa 3–20, Springer. ISBN  9783319330006
  8. ^ "Küresel okyanus mikrobiyomunun işlevleri, çevresel değişiklikleri anlamak için anahtar". www.sciencedaily.com. Georgia Üniversitesi. 10 Aralık 2015. Alındı 11 Aralık 2015.
  9. ^ a b 2002 WHO mortalite verileri 20 Ocak 2007 erişildi
  10. ^ Wade, Nicholas (25 Temmuz 2016). "Tüm Yaşayan Şeylerin Atası Luca ile Tanışın". New York Times. Alındı 25 Temmuz 2016.
  11. ^ Suttle, C.A. (2005). "Denizdeki Virüsler". Doğa. 437 (9): 356–361. Bibcode:2005Natur.437..356S. doi:10.1038 / nature04160. PMID  16163346. S2CID  4370363.
  12. ^ a b Glöckner, F.O., Gasol, J.M., McDonough, N., Calewaert, J.B. ve diğerleri. (2012) Deniz mikrobiyal çeşitliliği ve ekosistemin işleyişi ve çevresel değişimdeki rolü. Avrupa Bilim Vakfı, Konum Kağıdı 17. ISBN  978-2-918428-71-8
  13. ^ "Küresel okyanus mikrobiyomunun işlevleri, çevresel değişiklikleri anlamak için anahtar". www.sciencedaily.com. Georgia Üniversitesi. 10 Aralık 2015. Alındı 11 Aralık 2015.
  14. ^ Suttle, C.A. (2005). "Denizdeki Virüsler". Doğa. 437 (9): 356–361. Bibcode:2005Natur.437..356S. doi:10.1038 / nature04160. PMID  16163346. S2CID  4370363.
  15. ^ Shors s. 5
  16. ^ Shors s. 593
  17. ^ a b c Suttle CA. Deniz virüsleri - küresel ekosistemdeki başlıca oyuncular. Doğa İncelemeleri Mikrobiyoloji. 2007;5(10):801–12. doi:10.1038 / nrmicro1750. PMID  17853907.
  18. ^ Yaşayan Bakteriler Dünya'nın Hava Akımlarını Sürüyor Smithsonian Dergisi, 11 Ocak 2016.
  19. ^ Robbins, Jim (13 Nisan 2018). "Her Gün Gökten Trilyonlarca Virüs Düşüyor". New York Times. Alındı 14 Nisan 2018.
  20. ^ Reche, Isabel; D’Orta, Gaetano; Mladenov, Natalie; Winget, Danielle M; Suttle, Curtis A (29 Ocak 2018). "Atmosferik sınır tabakasının üzerinde virüs ve bakteri birikim oranları". ISME Dergisi. 12 (4): 1154–1162. doi:10.1038 / s41396-017-0042-4. PMC  5864199. PMID  29379178.
  21. ^ Personel (2014). "Biyosfer". Aspen Küresel Değişim Enstitüsü. Alındı 10 Kasım 2014.
  22. ^ a b c Choi, Charles Q. (17 Mart 2013). "Mikroplar Dünyanın En Derin Noktasında Gelişiyor". LiveScience. Alındı 17 Mart 2013.
  23. ^ Glud, Ronnie; Wenzhöfer, Frank; Middelboe, Mathias; Oguri, Kazumasa; Turnewitsch, Robert; Canfield, Donald E .; Kitazato, Hiroshi (17 Mart 2013). "Dünyanın en derin okyanus çukurundaki tortularda yüksek oranda mikrobiyal karbon dönüşümü". Doğa Jeolojisi. 6 (4): 284–288. Bibcode:2013NatGe ... 6..284G. doi:10.1038 / ngeo1773.
  24. ^ Oskin, Becky (14 Mart 2013). "Uzay İçi: Okyanus Tabanında Hayat Büyüyor". LiveScience. Alındı 17 Mart 2013.
  25. ^ Morelle, Rebecca (15 Aralık 2014). "Analiz edilen en derin deniz tatbikatıyla keşfedilen mikroplar". BBC haberleri. Alındı 15 Aralık 2014.
  26. ^ Takai K; Nakamura K; Toki T; Tsunogai U; et al. (2008). "122 ° C'de hücre proliferasyonu ve yüksek basınçlı yetiştirme altında hipertermofilik bir metanojen tarafından izotopik olarak ağır CH4 üretimi". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 105 (31): 10949–54. Bibcode:2008PNAS..10510949T. doi:10.1073 / pnas.0712334105. PMC  2490668. PMID  18664583.
  27. ^ Fox, Douglas (20 Ağustos 2014). "Buzun altındaki göller: Antarktika'nın gizli bahçesi". Doğa. 512 (7514): 244–246. Bibcode:2014Natur.512..244F. doi:10.1038 / 512244a. PMID  25143097.
  28. ^ Mack, Eric (20 Ağustos 2014). "Antarktika Buzunun Altında Yaşam Onaylandı; Sırada Uzay mı?". Forbes. Alındı 21 Ağustos 2014.
  29. ^ Armbrust, E.V .; Palumbi, S.R. (2015). "Okyanus biyolojik çeşitliliğinin gizli dünyalarını ortaya çıkarmak". Bilim. 348 (6237): 865–867. doi:10.1126 / science.aaa7378. PMID  25999494. S2CID  36480105.
  30. ^ Azam, F .; Malfatti, F. (2007). "Deniz ekosistemlerinin mikrobiyal yapılanması". Doğa İncelemeleri Mikrobiyoloji. 5 (10): 782–791. doi:10.1038 / nrmicro1747. PMID  17853906. S2CID  10055219.
  31. ^ Middelboe, M .; Brussaard, C. (2017). "Deniz virüsleri: deniz ekosistemlerindeki kilit oyuncular". Virüsler. 9 (10): 302. doi:10.3390 / v9100302. PMC  5691653. PMID  29057790.
  32. ^ Koonin EV, Senkevich TG, Dolja VV. Antik Virüs Dünyası ve hücrelerin evrimi. Biyoloji Doğrudan. 2006;1:29. doi:10.1186/1745-6150-1-29. PMID  16984643.
  33. ^ a b Canchaya C, Fournous G, Chibani-Chennoufi S, Dillmann ML, Brüssow H. Faj, lateral gen transferinin ajanları olarak. Mikrobiyolojide Güncel Görüş. 2003;6(4):417–24. doi:10.1016 / S1369-5274 (03) 00086-9. PMID  12941415.
  34. ^ a b Rybicki, EP. Yaşamın sınırındaki organizmaların sınıflandırılması veya virüs sistematiği ile ilgili sorunlar. Güney Afrika Bilim Dergisi. 1990;86:182–186.
  35. ^ Koonin, E. V .; Starokadomskyy, P. (Ekim 2016). "Virüsler canlı mı? Çoğalıcı paradigması, eski ama yanlış yönlendirilmiş bir soruya kesin ışık tutuyor". Bilim Tarihi ve Felsefesinde Çalışmalar Bölüm C: Biyolojik ve Biyomedikal Bilimler Tarih ve Felsefesinde Çalışmalar. 59: 125–134. doi:10.1016 / j.shpsc.2016.02.016. PMC  5406846. PMID  26965225.
  36. ^ Iyer LM, Balaji S, Koonin EV, Aravind L.Nükleo-sitoplazmik büyük DNA virüslerinin evrimsel genomiği. Virüs Araştırması. 2006;117(1):156–84. doi:10.1016 / j.virusres.2006.01.009. PMID  16494962.
  37. ^ Sanjuán R, Nebot MR, Chirico N, Mansky LM, Belshaw R. Viral mutasyon oranları. Journal of Virology. 2010;84(19):9733–48. doi:10.1128 / JVI.00694-10. PMID  20660197.
  38. ^ Mahy WJ ve Van Regenmortel MHV (editörler). Masa Genel Viroloji Ansiklopedisi. Oxford: Academic Press; 2009. ISBN  0-12-375146-2. s. 28.
  39. ^ Virüsler yaşıyor mu? Çoğalıcı paradigması, eski ama yanlış yönlendirilmiş bir soruya kesin ışık tutuyor. Biyolojik ve Biyomedikal Bilimler Tarihi ve Felsefesi Çalışmaları. 2016. doi:10.1016 / j.shpsc.2016.02.016. PMID  26965225.
  40. ^ Koonin, E. V .; Starokadomskyy, P. (7 Mart 2016). "Virüsler canlı mı? Çoğalıcı paradigması, eski ama yanlış yönlendirilmiş bir soruya kesin ışık tutuyor". Biyolojik ve Biyomedikal Bilimler Tarihi ve Felsefesi Çalışmaları. 59: 125–34. doi:10.1016 / j.shpsc.2016.02.016. PMC  5406846. PMID  26965225.
  41. ^ a b Mann, NH (17 Mayıs 2005). "Fajın Üçüncü Çağı". PLOS Biyoloji. 3 (5): 753–755. doi:10.1371 / journal.pbio.0030182. PMC  1110918. PMID  15884981.
  42. ^ Wommack KE, Colwell RR. Virioplankton: su ekosistemlerindeki virüsler. Mikrobiyoloji ve Moleküler Biyoloji İncelemeleri. 2000;64(1):69–114. doi:10.1128 / MMBR.64.1.69-114.2000. PMID  10704475.
  43. ^ Suttle CA. Denizdeki virüsler. Doğa. 2005;437:356–361. doi:10.1038 / nature04160. PMID  16163346. Bibcode:2005Natur.437..356S.
  44. ^ Bergh O, Børsheim KY, Bratbak G, Heldal M.Suatik ortamlarda bulunan yüksek miktarda virüs. Doğa. 1989;340(6233):467–8. doi:10.1038 / 340467a0. PMID  2755508. Bibcode:1989Natur.340..467B.
  45. ^ Wigington CH, Sonderegger D, Brussaard CPD, Buchan A, Finke JF, Fuhrman JA, Lennon JT, Middelboe M, Suttle CA, Stock C, Wilson WH, Wommack KE, Wilhelm SW, Weitz JS. Deniz virüsü ile mikrobiyal hücre bolluğu arasındaki ilişkinin yeniden incelenmesi. Doğa Mikrobiyolojisi. 2016;1:15024. doi:10.1038 / nmicrobiol.2015.24. PMID  27572161.
  46. ^ Brum JR, Schenck RO, Sullivan MB (Eylül 2013). "Deniz virüslerinin küresel morfolojik analizi, minimum bölgesel varyasyon ve kuyruklu olmayan virüslerin baskınlığını göstermektedir". ISME Dergisi. 7 (9): 1738–51. doi:10.1038 / ismej.2013.67. PMC  3749506. PMID  23635867.
  47. ^ Krupovic M, Bamford DH (2007). "Litik kuyruksuz deniz dsDNA fajı PM2 ile ilgili varsayılan kehanetler, suda yaşayan bakterilerin genomlarında yaygındır". BMC Genomics. 8: 236. doi:10.1186/1471-2164-8-236. PMC  1950889. PMID  17634101.
  48. ^ Xue H, Xu Y, Boucher Y, Polz MF (2012). "Çevresel Vibrio cholerae popülasyonu içinde yeni bir filamentli fajın yüksek frekansı, VCY" ". Uygulamalı ve Çevresel Mikrobiyoloji. 78 (1): 28–33. doi:10.1128 / AEM.06297-11. PMC  3255608. PMID  22020507.
  49. ^ Roux S, Krupovic M, Poulet A, Debroas D, Enault F (2012). "Virom okumalarından toplanan 81 yeni tam genomdan oluşan bir koleksiyon yoluyla Microviridae viral ailesinin evrimi ve çeşitliliği". PLOS ONE. 7 (7): e40418. Bibcode:2012PLoSO ... 740418R. doi:10.1371 / journal.pone.0040418. PMC  3394797. PMID  22808158.
  50. ^ Kauffman, Kathryn M .; Hüseyin, Fatima A .; Yang, Joy; Arevalo, Philip; Brown, Julia M .; Chang, William K .; VanInsberghe, David; Elsherbini, Joseph; Sharma, Radhey S .; Cutler, Michael B .; Kelly, Libusha; Polz, Martin F. (2018). "Deniz bakterilerinin tanınmayan katilleri olarak kuyruklu olmayan dsDNA virüslerinden oluşan büyük bir soy". Doğa. 554 (7690): 118–122. Bibcode:2018Natur.554..118K. doi:10.1038 / nature25474. PMID  29364876. S2CID  4462007.
  51. ^ Bilim Adamları Dünya Okyanuslarında Yeni Bir Virüs Türü Buldu: Autolykiviridae, on: sci-news, 25 Ocak 2018
  52. ^ Okyanusta Daha Önce Görülmemiş Garip DNA'lı Virüsler Keşfedildi, on: bilimuyarmak, 25 Ocak 2018
  53. ^ NCBI: Autolykiviridae (aile) - sınıflandırılmamış dsDNA virüsleri
  54. ^ Lawrence CM, Menon S, Eilers BJ, et al.. Arkael virüslerin yapısal ve fonksiyonel çalışmaları. Biyolojik Kimya Dergisi. 2009;284(19):12599–603. doi:10.1074 / jbc.R800078200. PMID  19158076.
  55. ^ Prangishvili D, Forterre P, Garrett RA. Archaea Virüsleri: birleştirici bir görünüm. Doğa İncelemeleri Mikrobiyoloji. 2006;4(11):837–48. doi:10.1038 / nrmicro1527. PMID  17041631.
  56. ^ Prangishvili D, Garrett RA. Crenarchaeal hipertermofilik virüslerin olağanüstü çeşitli morfotipleri ve genomları. Biyokimya Topluluğu İşlemleri. 2004; 32 (Pt 2): 204–8. doi:10.1042 / BST0320204. PMID  15046572.
  57. ^ Suttle CA. Denizdeki virüsler. Doğa. 2005;437(7057):356–61. doi:10.1038 / nature04160. PMID  16163346. Bibcode:2005Natur.437..356S.
  58. ^ www.cdc.gov. Zararlı Alg Çoğalmaları: Red Tide: Home [Erişim tarihi: 2014-12-19].
  59. ^ Forterre P, Philippe H. Son evrensel ortak ata (LUCA), basit mi yoksa karmaşık mı ?. Biyolojik Bülten. 1999; 196 (3): 373–5; tartışma 375–7. doi:10.2307/1542973. PMID  11536914.
  60. ^ Abrahão, Jônatas; Silva, Lorena; Silva, Ludmila Santos; Khalil, Jacques Yaacoub Bou; Rodrigues, Rodrigo; Arantes, Thalita; Assis, Felipe; Boratto, Paulo; Andrade, Miguel; Kroon, Erna Geessien; Ribeiro, Bergmann; Bergier, Ivan; Seligmann, Herve; Ghigo, Eric; Colson, Philippe; Levasseur, Anthony; Kroemer, Guido; Raoult, Didier; Scola, Bernard La (27 Şubat 2018). "Kuyruklu dev Tupanvirüs, bilinen virosferin en eksiksiz çeviri aygıtına sahiptir". Doğa İletişimi. 9 (1): 749. Bibcode:2018NatCo ... 9..749A. doi:10.1038 / s41467-018-03168-1. PMC  5829246. PMID  29487281.
  61. ^ Bichell RE. "Dev Virüs Genlerinde, Gizemli Kökenleri Hakkında İpuçları". Her şey düşünüldü.
  62. ^ Van Etten JL (Temmuz – Ağustos 2011). "Dev Virüsler". Amerikalı bilim adamı. 99 (4): 304–311. doi:10.1511/2011.91.304.
  63. ^ Legendre M, Arslan D, Abergel C, Claverie JM (Ocak 2012). "Megavirüsün genomiği ve hayatın zor dördüncü alanı". İletişimsel ve Bütünleştirici Biyoloji. 5 (1): 102–6. doi:10.4161 / cib.18624. PMC  3291303. PMID  22482024.
  64. ^ Schulz F, Yutin N, Ivanova NN, Ortega DR, Lee TK, Vierheilig J, Daims H, Horn M, Wagner M, Jensen GJ, Kyrpides NC, Koonin EV, Woyke T (Nisan 2017). "Çeviri sistemi bileşenlerinin genişletilmiş tamamlayıcısı olan dev virüsler" (PDF). Bilim. 356 (6333): 82–85. Bibcode:2017Sci ... 356 ... 82S. doi:10.1126 / science.aal4657. PMID  28386012. S2CID  206655792.
  65. ^ Bäckström D, Yutin N, Jørgensen SL, Dharamshi J, Homa F, Zaremba-Niedwiedzka K, Spang A, Wolf YI, Koonin EV, Ettema TJ (Mart 2019). "Derin Deniz Sedimanlarından Gelen Virüs Genomları Okyanus Megaviromunu Genişletiyor ve Viral Devizmin Bağımsız Kökenlerini Destekliyor". mBio. 10 (2): e02497-02418. doi:10.1128 / mBio.02497-18. PMC  6401483. PMID  30837339.
  66. ^ Fredrickson JK, Zachara JM, Balkwill DL, Kennedy D, Li SM, Kostandarithes HM, Daly MJ, Romine MF, Brockman FJ (2004). "Washington eyaleti, Hanford bölgesindeki yüksek seviyeli nükleer atıkla kirlenmiş vadoz çökeltilerinin jeomikrobiyolojisi". Uygulamalı ve Çevresel Mikrobiyoloji. 70 (7): 4230–41. doi:10.1128 / AEM.70.7.4230-4241.2004. PMC  444790. PMID  15240306.
  67. ^ Woese CR, Kandler O, Wheelis ML (1990). "Doğal bir organizma sistemine doğru: Archaea, Bacteria ve Eucarya alanları için öneri". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 87 (12): 4576–9. Bibcode:1990PNAS ... 87.4576W. doi:10.1073 / pnas.87.12.4576. PMC  54159. PMID  2112744.
  68. ^ Schopf JW (1994). "Farklı hızlar, farklı kaderler: tempo ve evrim modu Prekambriyen'den Fanerozoik'e değişti". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 91 (15): 6735–42. Bibcode:1994PNAS ... 91.6735S. doi:10.1073 / pnas.91.15.6735. PMC  44277. PMID  8041691.
  69. ^ DeLong EF, Pace NR (2001). "Bakteri ve arkelerin çevresel çeşitliliği". Sistematik Biyoloji. 50 (4): 470–8. CiteSeerX  10.1.1.321.8828. doi:10.1080/106351501750435040. PMID  12116647.
  70. ^ Brown JR, Doolittle WF (1997). "Archaea ve prokaryottan ökaryota geçiş". Mikrobiyoloji ve Moleküler Biyoloji İncelemeleri. 61 (4): 456–502. doi:10.1128/.61.4.456-502.1997. PMC  232621. PMID  9409149.
  71. ^ Dyall, Sabrina D .; Brown, Mark T .; Johnson, Patricia J. (9 Nisan 2004). "Antik İstilalar: Endosymbiontlardan Organellere". Bilim. 304 (5668): 253–257. Bibcode:2004Sci ... 304..253D. doi:10.1126 / science.1094884. ISSN  0036-8075. PMID  15073369. S2CID  19424594.
  72. ^ Poole AM, Penny D (2007). "Ökaryotların kökenine ilişkin hipotezlerin değerlendirilmesi". BioEssays. 29 (1): 74–84. doi:10.1002 / bies.20516. PMID  17187354. S2CID  36026766.
  73. ^ Lang BF, Gri MW, Burger G (1999). "Mitokondriyal genom evrimi ve ökaryotların kökeni". Genetik Yıllık İnceleme. 33: 351–97. doi:10.1146 / annurev.genet.33.1.351. PMID  10690412.
  74. ^ McFadden GI (1999). "Endosymbiosis ve bitki hücresinin evrimi". Bitki Biyolojisinde Güncel Görüş. 2 (6): 513–9. doi:10.1016 / S1369-5266 (99) 00025-4. PMID  10607659.
  75. ^ Patrick J. Keeling (2004). "Plastidlerin ve ev sahiplerinin çeşitliliği ve evrimsel tarihi". Amerikan Botanik Dergisi. 91 (10): 1481–1493. doi:10.3732 / ajb.91.10.1481. PMID  21652304.
  76. ^ "Candidatus Pelagibacter Ubique." Avrupa Biyoinformatik Enstitüsü. Avrupa Biyoinformatik Enstitüsü, 2011. Web. 08 Ocak 2012. http://www.ebi.ac.uk/2can/genomes/bacteria/Candidatus_Pelagibacter_ubique.html Arşivlendi 1 Aralık 2008, Wayback Makinesi
  77. ^ "Bit pazarı: Yeni keşfedilen bir virüs, gezegendeki en bol organizma olabilir". Ekonomist. 16 Şubat 2013. Alındı 16 Şubat 2013.
  78. ^ Zhao, Y .; Temperton, B .; Thrash, J. C .; Schwalbach, M. S .; Vergin, K. L .; Landry, Z. C .; Ellisman, M .; Deerinck, T .; Sullivan, M. B .; Giovannoni, S. J. (2013). "Okyanusta bol miktarda SAR11 virüsü". Doğa. 494 (7437): 357–360. Bibcode:2013Natur.494..357Z. doi:10.1038 / nature11921. PMID  23407494. S2CID  4348619.
  79. ^ "En büyük Bakteri: Bilim adamı, Afrika kıyılarında yeni bakteriyel yaşam formlarını keşfediyor", Max Planck Deniz Mikrobiyolojisi Enstitüsü, 8 Nisan 1999, arşivlendi orijinal 20 Ocak 2010'da
  80. ^ İsimlendirmede Duran Prokaryotik isimlerin listesi - Cins Thiomargarita
  81. ^ Bang C, Schmitz RA (2015). "İnsan yüzeyleriyle ilişkili arkeler: hafife alınmamalıdır". FEMS Mikrobiyoloji İncelemeleri. 39 (5): 631–48. doi:10.1093 / femsre / fuv010. PMID  25907112.
  82. ^ Archaea Çevrimiçi Etimoloji Sözlüğü. Alındı ​​Agustos 17 2016.
  83. ^ Pace NR (Mayıs 2006). "Değişim zamanı". Doğa. 441 (7091): 289. Bibcode:2006Natur.441..289P. doi:10.1038 / 441289a. PMID  16710401. S2CID  4431143.
  84. ^ Stoeckenius W (1 Ekim 1981). "Walsby'nin kare bakterisi: ortogonal bir prokaryotun ince yapısı". Bakteriyoloji Dergisi. 148 (1): 352–60. doi:10.1128 / JB.148.1.352-360.1981. PMC  216199. PMID  7287626.
  85. ^ Madigan M ve Martinko J (Ed.) (2005). Brock Mikroorganizmaların Biyolojisi (11. baskı). Prentice Hall. ISBN  978-0-13-144329-7.CS1 bakimi: ek metin: yazarlar listesi (bağlantı)
  86. ^ "Derin deniz mikroorganizmaları ve ökaryotik hücrenin kökeni" (PDF). Alındı 24 Ekim 2017.
  87. ^ Yamaguchi, Masashi; et al. (1 Aralık 2012). "Prokaryot veya ökaryot mu? Derin denizden eşsiz bir mikroorganizma". Journal of Electron Mikroskobu. 61 (6): 423–431. doi:10.1093 / jmicro / dfs062. PMID  23024290.
  88. ^ Whittaker, R.H .; Margulis, L. (1978). "Protist sınıflandırması ve organizmaların krallıkları". Biyosistemler. 10 (1–2): 3–18. doi:10.1016/0303-2647(78)90023-0. PMID  418827.
  89. ^ Arıza, E; F değil; Benoiston, AS; Labadie, K; Bittner, L; Ayata, SD (2019). "Miksotrofik protistler, küresel okyanusta farklı biyocoğrafyalar sergiliyor". ISME Dergisi. 13 (4): 1072–1083. doi:10.1038 / s41396-018-0340-5. PMC  6461780. PMID  30643201.
  90. ^ a b c Leles, S.G .; Mitra, A .; Flynn, K.J .; Stoecker, D.K .; Hansen, P.J .; Calbet, A .; McManus, G.B .; Sanders, R.W .; Caron, D.A .; F değil.; Hallegraeff, G.M. (2017). "Edinilmiş fototrofinin farklı biçimlerine sahip okyanus protistleri, zıt biyocoğrafyalar ve bolluk sergiliyor". Kraliyet Topluluğu B Bildirileri: Biyolojik Bilimler. 284 (1860): 20170664. doi:10.1098 / rspb.2017.0664. PMC  5563798. PMID  28768886.
  91. ^ Budd, Graham E; Jensen, Sören (2017). "Hayvanların kökeni ve erken safra evrimi için bir 'Savana' hipotezi". Biyolojik İncelemeler. 92 (1): 446–473. doi:10.1111 / brv.12239. PMID  26588818.
  92. ^ Cavalier-Smith T (Aralık 1993). "Krallık protozoası ve 18 şubesi". Mikrobiyolojik İncelemeler. 57 (4): 953–94. doi:10.1128 / mmbr.57.4.953-994.1993. PMC  372943. PMID  8302218.
  93. ^ Corliss JO (1992). "Protestocular için ayrı bir isimlendirme kodu olmalı mı?" BioSystems. 28 (1–3): 1–14. doi:10.1016 / 0303-2647 (92) 90003-H. PMID  1292654.
  94. ^ Slapeta J, Moreira D, López-García P (2005). "Protist çeşitliliğin kapsamı: tatlı su ökaryotlarının moleküler ekolojisinden içgörüler". Kraliyet Topluluğu B Bildirileri: Biyolojik Bilimler. 272 (1576): 2073–81. doi:10.1098 / rspb.2005.3195. PMC  1559898. PMID  16191619.
  95. ^ Moreira D, López-García P (2002). "Mikrobiyal ökaryotların moleküler ekolojisi gizli bir dünyayı ortaya çıkarıyor" (PDF). Mikrobiyolojideki Eğilimler. 10 (1): 31–8. doi:10.1016 / S0966-842X (01) 02257-0. PMID  11755083.
  96. ^ a b Soluduğunuz Hava? Bunu Bir Diatom Yaptı
  97. ^ "Diatomlar hakkında daha fazla bilgi". California Üniversitesi Paleontoloji Müzesi. Arşivlenen orijinal 4 Ekim 2012'de. Alındı 11 Ekim 2019.
  98. ^ Devreotes P (1989). "Dictyostelium discoideum: gelişimdeki hücre-hücre etkileşimleri için bir model sistem". Bilim. 245 (4922): 1054–8. Bibcode:1989Sci ... 245.1054D. doi:10.1126 / science.2672337. PMID  2672337.
  99. ^ Matz, Mikhail V .; Tamara M. Frank; N. Justin Marshall; Edith A. Widder; Sonke Johnsen (9 Aralık 2008). "Dev Derin Deniz Protisti Bilateryan Benzeri İzler Üretiyor" (PDF). Güncel Biyoloji. Elsevier Ltd. 18 (23): 1849–1854. doi:10.1016 / j.cub.2008.10.028. PMID  19026540. S2CID  8819675.
  100. ^ Gooday, A. J .; Aranda da Silva, A .; Pawlowski, J. (1 Aralık 2011). "Nazaré Kanyonu'ndan Xenophyophores (Rhizaria, Foraminifera) (Portekiz sınırı, NE Atlantic)". Derin Deniz Araştırmaları Bölüm II: Oşinografide Topikal Çalışmalar. Portekiz'in Batısındaki Denizaltı Kanyonlarının Jeolojisi, Jeokimyası ve Biyolojisi. 58 (23–24): 2401–2419. Bibcode:2011DSRII..58.2401G. doi:10.1016 / j.dsr2.2011.04.005.
  101. ^ Neil A C, Reece J B, Simon E J (2004) Fizyoloji ile temel biyoloji Pearson / Benjamin Cummings, Sayfa 291. ISBN  9780805375039
  102. ^ O'Malley MA, Simpson AG, Roger AJ (2012). "Evrimsel protistoloji ışığında diğer ökaryotlar". Biyoloji ve Felsefe. 28 (2): 299–330. doi:10.1007 / s10539-012-9354-y. S2CID  85406712.
  103. ^ Adl SM, Simpson AG, Farmer MA, Andersen RA, Anderson OR, Barta JR, Bowser SS, Brugerolle G, Fensome RA, Fredericq S, James TY, Karpov S, Kugrens P, Krug J, Lane CE, Lewis LA, Lodge J , Lynn DH, Mann DG, McCourt RM, Mendoza L, Moestrup O, Mozley-Standridge SE, Nerad TA, Shearer CA, Smirnov AV, Spiegel FW, Taylor MF (2005). "Protistlerin taksonomisine vurgu yaparak ökaryotların yeni üst düzey sınıflandırması". Ökaryotik Mikrobiyoloji Dergisi. 52 (5): 399–451. doi:10.1111 / j.1550-7408.2005.00053.x. PMID  16248873. S2CID  8060916.
  104. ^ Margulis L, Chapman MJ (19 Mart 2009). Krallıklar ve Etki Alanları: Yeryüzündeki Yaşam Grupları İçin Resimli Bir Kılavuz. Akademik Basın. ISBN  9780080920146.
  105. ^ a b Dawson, Scott C; Paredez, Alexander R (2013). "Alternatif hücre iskeleti manzaraları: bazal kazı protistlerinde hücre iskeleti yeniliği ve evrim". Hücre Biyolojisinde Güncel Görüş. 25 (1): 134–141. doi:10.1016 / j.ceb.2012.11.005. PMC  4927265. PMID  23312067.
  106. ^ a b Atkinson, A .; Polimene, L .; Fileman, E.S .; Widdicombe, C.E .; McEvoy, A.J .; Smyth, T.J .; Djeghri, N .; Sailley, S.F .; Cornwell, L.E. (2018). ""Yorum Yap. Katmanlı bir şelf denizinde plankton mevsimselliğini ne yönlendirir? Bazı rakip ve tamamlayıcı teoriler "]" (PDF). Limnoloji ve Oşinografi. 63 (6): 2877–2884. Bibcode:2018LimOc..63.2877A. doi:10.1002 / lno.11036.
  107. ^ Singleton, Paul (2006). Mikrobiyoloji ve Moleküler Biyoloji Sözlüğü, 3. Baskı, revize edildi. Chichester, İngiltere: John Wiley & Sons. s. 32. ISBN  978-0-470-03545-0.
  108. ^ David J. Patterson. "Amipler: Pseudopodia Kullanarak Hareket Eden ve Beslenen Protistler". Hayat Ağacı web projesi.
  109. ^ "Amipler". Edinburgh Üniversitesi. Arşivlenen orijinal 10 Haziran 2009.
  110. ^ Brady, Richard M. (1993). "Bakteriyel kamçı motorda tork ve anahtarlama. Elektrostatik bir model". Biyofizik Dergisi. 64 (4): 961–973. Bibcode:1993BpJ .... 64..961B. doi:10.1016 / S0006-3495 (93) 81462-0. PMC  1262414. PMID  7684268.
  111. ^ Lauga, Eric; Thomas R Powers (25 Ağustos 2009). "Yüzme mikroorganizmalarının hidrodinamiği". Fizikte İlerleme Raporları. 72 (9): 096601. arXiv:0812.2887. Bibcode:2009RPPh ... 72i6601L. doi:10.1088/0034-4885/72/9/096601. S2CID  3932471.
  112. ^ Hyde, K.D .; E.B.J. Jones; E. Leaño; S.B. İşaret; A.D. Poonyth; L.L.P. Vrijmoed (1998). "Deniz ekosistemlerinde mantarların rolü". Biyoçeşitlilik ve Koruma. 7 (9): 1147–1161. doi:10.1023 / A: 1008823515157. S2CID  22264931.
  113. ^ Kirk, P.M., Cannon, P.F., Minter, D.W. ve Stalpers, J. "Dictionary of the Fungi". Edn 10. CABI, 2008
  114. ^ Hyde, K.D .; E.B.J. Jones (1989). "Deniz mantarlarında spor tutunması". Botanica Marina. 32 (3): 205–218. doi:10.1515 / botm.1989.32.3.205. S2CID  84879817.
  115. ^ Le Calvez T, Burgaud G, Mahé S, Barbier G, Vandenkoornhuyse P (Ekim 2009). "Derin deniz hidrotermal ekosistemlerinde mantar çeşitliliği". Uygulamalı ve Çevresel Mikrobiyoloji. 75 (20): 6415–21. doi:10.1128 / AEM.00653-09. PMC  2765129. PMID  19633124.
  116. ^ San Martin, A .; S. Orejanera; C. Gallardo; M. Silva; J. Becerra; R. Reinoso; M.C. Chamy; K. Vergara; J. Rovirosa (2008). "Deniz mantarı Geotrichum sp'den steroidler". Şili Kimya Derneği Dergisi. 53 (1): 1377–1378. doi:10.4067 / S0717-97072008000100011.
  117. ^ Jones, E.B.G., Hyde, K.D. ve Pang, K.-L., eds. (2014). Tatlı su mantarları: ve mantar benzeri organizmalar. Berlin / Boston: De Gruyter.
  118. ^ Jones, E.B.G .; Pang, K.-L., eds. (2012). Deniz Mantarları ve Mantar Benzeri Organizmalar. Deniz ve Tatlı Su Botanikliği. Berlin, Boston: De Gruyter (Ağustos 2012'de yayınlandı). doi:10.1515/9783110264067. ISBN  978-3-11-026406-7. Alındı 3 Eylül 2015.
  119. ^ Wang, Xin; Singh, Purnima; Gao, Zheng; Zhang, Xiaobo; Johnson, Zackary I .; Wang, Guangyi (2014). "Batı Pasifik Sıcak Havuzunda Planktonik Mantarların Dağılımı ve Çeşitliliği". PLOS ONE. 9 (7): e101523. Bibcode:2014PLoSO ... 9j1523W. doi:10.1371 / journal.pone.0101523.s001. PMC  4081592. PMID  24992154.
  120. ^ Wang, G .; Wang, X .; Liu, X .; Li, Q. (2012). "Okyanustaki planktonik mantarların çeşitliliği ve biyojeokimyasal işlevi". Raghukumar, C. (ed.). Deniz mantarlarının biyolojisi. Berlin, Heidelberg: Springer-Verlag. s. 71–88. doi:10.1007/978-3-642-23342-5. ISBN  978-3-642-23341-8. S2CID  39378040. Alındı 3 Eylül 2015.
  121. ^ Lanet olsun, Samir; Raghukumar, Chandralata (11 Kasım 2007). "Derin Deniz Sedimanlarında Mantarlar ve Makro Birleşme". Mikrobiyal Ekoloji. 56 (1): 168–177. doi:10.1007 / s00248-007-9334-y. ISSN  0095-3628. PMID  17994287. S2CID  21288251.
  122. ^ Kubanek, Julia; Jensen, Paul R .; Keifer, Paul A .; Sullards, M. Cameron; Collins, Dwight O .; Fenical, William (10 Haziran 2003). "Mikrobiyal saldırıya karşı deniz yosunu direnci: Deniz mantarlarına karşı hedeflenmiş bir kimyasal savunma". Ulusal Bilimler Akademisi Bildiriler Kitabı. 100 (12): 6916–6921. Bibcode:2003PNAS..100.6916K. doi:10.1073 / pnas.1131855100. ISSN  0027-8424. PMC  165804. PMID  12756301.
  123. ^ a b Gao, Zheng; Johnson, Zackary I .; Wang, Guangyi (30 July 2009). "Molecular characterization of the spatial diversity and novel lineages of mycoplankton in Hawaiian coastal waters". ISME Dergisi. 4 (1): 111–120. doi:10.1038/ismej.2009.87. ISSN  1751-7362. PMID  19641535.
  124. ^ Panzer, Katrin; Yilmaz, Pelin; Weiß, Michael; Reich, Lothar; Richter, Michael; Wiese, Jutta; Schmaljohann, Rolf; Labes, Antje; Imhoff, Johannes F. (30 July 2015). "Identification of Habitat-Specific Biomes of Aquatic Fungal Communities Using a Comprehensive Nearly Full-Length 18S rRNA Dataset Enriched with Contextual Data". PLOS ONE. 10 (7): e0134377. Bibcode:2015PLoSO..1034377P. doi:10.1371/journal.pone.0134377. PMC  4520555. PMID  26226014.
  125. ^ Gutierrez, Marcelo H; Pantoja, Silvio; Quinones, Renato a and Gonzalez, Rodrigo R. First record of flamentous fungi in the coastal upwelling ecosystem off central Chile. Gayana (Concepc.) [internet üzerinden]. 2010, vol.74, n.1, pp. 66-73. ISSN  0717-6538.
  126. ^ a b Sridhar, K.R. (2009). "10. Aquatic fungi – Are they planktonic?". Plankton Dynamics of Indian Waters. Jaipur, India: Pratiksha Publications. pp. 133–148.
  127. ^ Species of Higher Marine Fungi Arşivlendi 22 April 2013 at the Wayback Makinesi Mississippi Üniversitesi. Retrieved 2012-02-05.
  128. ^ Freshwater and marine lichen-forming fungi Retrieved 2012-02-06.
  129. ^ "Likenler". National Park Service, US Department of the Interior, Government of the United States. 22 Mayıs 2016. Alındı 4 Nisan 2018.
  130. ^ a b "The Earth Life Web, Growth and Development in Lichens". earthlife.net. 14 Şubat 2020.
  131. ^ Silliman B. R. & S. Y. Newell (2003). "Fungal farming in a snail". PNAS. 100 (26): 15643–15648. Bibcode:2003PNAS..10015643S. doi:10.1073/pnas.2535227100. PMC  307621. PMID  14657360.
  132. ^ Yuan X, Xiao S (2005). "Lichen-Like Symbiosis 600 Million Years Ago". Bilim. 308 (5724): 1017–1020. Bibcode:2005Sci...308.1017Y. doi:10.1126/science.1111347. PMID  15890881. S2CID  27083645.
  133. ^ Jones, E. B. Gareth; Pang, Ka-Lai (31 August 2012). Marine Fungi: and Fungal-like Organisms. Walter de Gruyter. ISBN  9783110264067.
  134. ^ Janet Fang (6 April 2010). "Animals thrive without oxygen at sea bottom". Doğa. 464 (7290): 825. doi:10.1038/464825b. PMID  20376121.
  135. ^ "Briny deep basin may be home to animals thriving without oxygen". Bilim Haberleri. 23 September 2013.
  136. ^ a b Campbell, Neil A .; Reece, Jane B .; Urry, Lisa Andrea; Cain, Michael L .; Wasserman, Steven Alexander; Minorsky, Peter V .; Jackson, Robert Bradley (2008). Biyoloji (8 ed.). San Francisco: Pearson – Benjamin Cummings. ISBN  978-0-321-54325-7.
  137. ^ McNeill, J .; ve diğerleri, eds. (2012). International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants (Melbourne Code), Adopted by the Eighteenth International Botanical Congress Melbourne, Australia, July 2011 (elektronik ed.). Uluslararası Bitki Taksonomisi Derneği. Alındı 14 Mayıs 2017.
  138. ^ Changes in oxygen concentrations in our ocean can disrupt fundamental biological cycles Phys.org, 25 November 2019.
  139. ^ Walsh PJ, Smith S, Fleming L, Solo-Gabriele H, Gerwick WH, eds. (2 Eylül 2011). "Cyanobacteria and cyanobacterial toxins". Oceans and Human Health: Risks and Remedies from the Seas. Akademik Basın. pp. 271–296. ISBN  978-0-08-087782-2.
  140. ^ "The Rise of Oxygen - Astrobiology Magazine". Astrobiology Dergisi. 30 Temmuz 2003. Alındı 6 Nisan 2016.
  141. ^ Flannery, D. T.; R.M. Walter (2012). "Archean tufted microbial mats and the Great Oxidation Event: new insights into an ancient problem". Avustralya Yer Bilimleri Dergisi. 59 (1): 1–11. Bibcode:2012AuJES..59....1F. doi:10.1080/08120099.2011.607849. S2CID  53618061.
  142. ^ Rothschild, Lynn (September 2003). "Understand the evolutionary mechanisms and environmental limits of life". NASA. Arşivlenen orijinal 11 Mart 2012 tarihinde. Alındı 13 Temmuz 2009.
  143. ^ Nadis S (December 2003). "The cells that rule the seas" (PDF). Bilimsel amerikalı. 289 (6): 52–3. Bibcode:2003SciAm.289f..52N. doi:10.1038/scientificamerican1203-52. PMID  14631732. Arşivlenen orijinal (PDF) 19 Nisan 2014. Alındı 2 Haziran 2019.
  144. ^ "The Most Important Microbe You've Never Heard Of". npr.org.
  145. ^ Flombaum, P.; Gallegos, J. L.; Gordillo, R. A.; Rincon, J.; Zabala, L. L.; Jiao, N.; Karl, D. M.; Li, W. K. W.; Lomas, M. W.; Veneziano, D.; Vera, C. S.; Vrugt, J. A.; Martiny, A. C. (2013). "Present and future global distributions of the marine Cyanobacteria Prochlorococcus and Synechococcus". Ulusal Bilimler Akademisi Bildiriler Kitabı. 110 (24): 9824–9829. Bibcode:2013PNAS..110.9824F. doi:10.1073/pnas.1307701110. PMC  3683724. PMID  23703908.
  146. ^ Nabors, Murray W. (2004). Introduction to Botany. San Francisco, CA: Pearson Education, Inc. ISBN  978-0-8053-4416-5.
  147. ^ Allaby, M., ed. (1992). "Algae". The Concise Dictionary of Botany. Oxford: Oxford University Press.
  148. ^ Guiry MD (Ekim 2012). "How many species of algae are there?". Journal of Phycology. 48 (5): 1057–63. doi:10.1111/j.1529-8817.2012.01222.x. PMID  27011267. S2CID  30911529.
  149. ^ a b Guiry, M.D .; Guiry, G.M. (2016). "Algaebase". www.algaebase.org. Alındı 20 Kasım 2016.
  150. ^ D. Thomas (2002). Yosunlar. Life Series. Doğal Tarih Müzesi, Londra. ISBN  978-0-565-09175-0.
  151. ^ Hoek, Christiaan; den Hoeck, Hoeck Van; Mann, David; Jahns, H.M. (1995). Algae : an introduction to phycology. Cambridge University Press. s. 166. ISBN  9780521316873. OCLC  443576944.
  152. ^ Starckx, Senne (31 October 2012) A place in the sun - Algae is the crop of the future, according to researchers in Geel Flanders Today, Retrieved 8 December 2012
  153. ^ Duval, B.; Margulis, L. (1995). "The microbial community of Ophrydium versatile colonies: endosymbionts, residents, and tenants". Ortak yaşam. 18: 181–210. PMID  11539474.
  154. ^ Mandoli, DF (1998). "Elaboration of Body Plan and Phase Change during Development of Acetabularia: How Is the Complex Architecture of a Giant Unicell Built?". Bitki Fizyolojisi ve Bitki Moleküler Biyolojisinin Yıllık İncelemesi. 49: 173–198. doi:10.1146 / annurev.arplant.49.1.173. PMID  15012232. S2CID  6241264.
  155. ^ Pierre Madl; Maricela Yip (2004). "Literature Review of Caulerpa taxifolia". BUFUS-Info. 19 (31).
  156. ^ Lalli, C.; Parsons, T. (1993). Biological Oceanography: An Introduction. Butterworth-Heinemann. ISBN  0-7506-3384-0.
  157. ^ Eerie red glow traces ocean plant health NASA Science, 28 Mayıs 2009.
  158. ^ Behrenfeld, M.J.; Westberry, T.K.; Boss, E.S.; O'Malley, R.T.; Siegel, D.A.; Wiggert, J.D.; Franz, B.A.; McLain, C.R.; Feldman, G.C.; Doney, S.C.; Moore, J.K. (2009). "Satellite-detected fluorescence reveals global physiology of ocean phytoplankton". Biyojeoloji. 6 (5): 779–794. Bibcode:2009BGeo....6..779B. doi:10.5194/bg-6-779-2009.
  159. ^ a b Wassilieff, Maggy (2006) "Plankton - Plant plankton", Te Ara - Yeni Zelanda Ansiklopedisi. Erişim: 2 Kasım 2019.
  160. ^ Lindsey, R., Scott, M. ve Simmon, R. (2010) "Fitoplankton nedir". NASA Dünya Gözlemevi.
  161. ^ Field, C. B.; Behrenfeld, M. J.; Randerson, J. T .; Falwoski, P. G. (1998). "Primary production of the biosphere: Integrating terrestrial and oceanic components". Bilim. 281 (5374): 237–240. Bibcode:1998Sci...281..237F. doi:10.1126/science.281.5374.237. PMID  9657713.
  162. ^ Treguer, P.; Nelson, D. M.; Van Bennekom, A. J.; Demaster, D. J.; Leynaert, A.; Queguiner, B. (1995). "The Silica Balance in the World Ocean: A Reestimate". Bilim. 268 (5209): 375–9. Bibcode:1995Sci...268..375T. doi:10.1126/science.268.5209.375. PMID  17746543. S2CID  5672525.
  163. ^ "King's College London - Lake Megachad". www.kcl.ac.uk. Alındı 5 Mayıs 2018.
  164. ^ Arsenieff, L.; Simon, N.; Rigaut-Jalabert, F.; Le Gall, F.; Chaffron, S.; Corre, E.; Com, E.; Bigeard, E.; Baudoux, A.C. (2018). "First Viruses Infecting the Marine Diatom Guinardia delicatula". Mikrobiyolojide Sınırlar. 9: 3235. doi:10.3389/fmicb.2018.03235. PMC  6334475. PMID  30687251.
  165. ^ Zhang, D .; Wang, Y .; Cai, J.; Pan, J.; Jiang, X .; Jiang, Y. (2012). "Bio-manufacturing technology based on diatom micro- and nanostructure". Çin Bilim Bülteni. 57 (30): 3836–3849. Bibcode:2012ChSBu..57.3836Z. doi:10.1007/s11434-012-5410-x.
  166. ^ Wassilieff, Maggy (2006) "A coccolithophore", Te Ara - Yeni Zelanda Ansiklopedisi. Erişim: 2 Kasım 2019.
  167. ^ Rost, B. and Riebesell, U. (2004) "Coccolithophores and the biological pump: responses to environmental changes". İçinde: Coccolithophores: From Molecular Processes to Global Impact, pages 99–125, Springer. ISBN  9783662062784.
  168. ^ DeLong, E.F.; Beja, O. (2010). "The light-driven proton pump proteorhodopsin enhances bacterial survival during tough times". PLOS Biyoloji. 8 (4): e1000359. doi:10.1371/journal.pbio.1000359. PMC  2860490. PMID  20436957. e1000359.
  169. ^ a b Gómez-Consarnau, L.; Raven, J.A.; Levine, N.M.; Cutter, L.S.; Wang, D .; Seegers, B.; Arístegui, J.; Fuhrman, J.A.; Gasol, J.M.; Sañudo-Wilhelmy, S.A. (2019). "Microbial rhodopsins are major contributors to the solar energy captured in the sea". Bilim Gelişmeleri. 5 (8): eaaw8855. Bibcode:2019SciA....5.8855G. doi:10.1126/sciadv.aaw8855. PMC  6685716. PMID  31457093.
  170. ^ Oren, Aharon (2002). "Molecular ecology of extremely halophilic Archaea and Bacteria". FEMS Mikrobiyoloji Ekolojisi. 39 (1): 1–7. doi:10.1111/j.1574-6941.2002.tb00900.x. ISSN  0168-6496. PMID  19709178.
  171. ^ Béja, O.; Aravind, L.; Koonin, E.V.; Suzuki, M.T.; Hadd, A.; Nguyen, L.P.; Jovanovich, S.B.; Gates, C.M.; Feldman, R.A.; Spudich, J.L.; Spudich, E.N. (2000). "Bacterial rhodopsin: evidence for a new type of phototrophy in the sea". Bilim. 289 (5486): 1902–1906. Bibcode:2000Sci...289.1902B. doi:10.1126/science.289.5486.1902. PMID  10988064. S2CID  1461255.
  172. ^ "Interviews with Fellows: Ed Delong". Amerikan Mikrobiyoloji Akademisi. Arşivlenen orijinal 7 Ağustos 2016. Alındı 2 Temmuz 2016.
  173. ^ Bacteria with Batteries, Popular Science, January 2001, Page 55.
  174. ^ Béja, O.; Aravind, L.; Koonin, E.V.; Suzuki, M.T.; Hadd, A.; Nguyen, L.P.; Jovanovich, S.B.; Gates, C.M.; Feldman, R.A.; Spudich, J.L.; Spudich, E.N. (2000). "Bacterial rhodopsin: evidence for a new type of phototrophy in the sea". Bilim. 289 (5486): 1902–1906. Bibcode:2000Sci...289.1902B. doi:10.1126/science.289.5486.1902. PMID  10988064.
  175. ^ Boeuf, Dominique; Audic, Stéphane; Brillet-Guéguen, Loraine; Caron, Christophe; Jeanthon, Christian (2015). "MicRhoDE: a curated database for the analysis of microbial rhodopsin diversity and evolution". Veri tabanı. 2015: bav080. doi:10.1093/database/bav080. ISSN  1758-0463. PMC  4539915. PMID  26286928.
  176. ^ Yawo, Hiromu; Kandori, Hideki; Koizumi, Amane (5 June 2015). Optogenetics: Light-Sensing Proteins and Their Applications. Springer. s. 3–4. ISBN  978-4-431-55516-2. Alındı 30 Eylül 2015.
  177. ^ A tiny marine microbe could play a big role in climate change Güney Kaliforniya Üniversitesi, Press Room, 8 August 2019.
  178. ^ DasSarma, Shiladitya; Schwieterman, Edward W. (11 October 2018). "Early evolution of purple retinal pigments on Earth and implications for exoplanet biosignatures". Uluslararası Astrobiyoloji Dergisi: 1–10. arXiv:1810.05150. Bibcode:2018arXiv181005150D. doi:10.1017/S1473550418000423. ISSN  1473-5504. S2CID  119341330.
  179. ^ Sparks, William B .; DasSarma, S.; Reid, I. N. (December 2006). "Evolutionary Competition Between Primitive Photosynthetic Systems: Existence of an early purple Earth?". Amerikan Astronomi Derneği Toplantısı Özetleri. 38: 901. Bibcode:2006AAS...209.0605S.
  180. ^ Redfield, Alfred C. (1934). "Deniz Suyundaki Organik Türevlerin Oranları ve Plankton Bileşimi ile İlişkileri Üzerine". Johnstone, James; Daniel, Richard Jellicoe (editörler). James Johnstone Memorial Cilt. Liverpool: Liverpool Üniversitesi Yayınları. s. 176–92. OCLC  13993674.
  181. ^ a b Arrigo Kevin R. (2005). "Deniz mikroorganizmaları ve küresel besin döngüleri". Doğa. 437 (7057): 349–55. Bibcode:2005 Natur.437..349A. doi:10.1038 / nature04159. PMID  16163345. S2CID  62781480.
  182. ^ Martiny, A.C.; Pham, C.T.; Primeau, F.W.; Vrugt, J.A.; Moore, J.K.; Levin, S.A.; Lomas, M.W. (2013). "Strong latitudinal patterns in the elemental ratios of marine plankton and organic matter". Doğa Jeolojisi. 6 (4): 279–283. Bibcode:2013NatGe...6..279M. doi:10.1038/ngeo1757.
  183. ^ Eppley, R.W.; Peterson, B.J. (1979). "Particulate organic matter flux and planktonic new production in the deep ocean". Doğa. 282 (5740): 677–680. Bibcode:1979Natur.282..677E. doi:10.1038/282677a0. S2CID  42385900.
  184. ^ Velicer, Gregory J.; Mendes-Soares, Helena (2007). "Bacterial predators" (PDF). Hücre. 19 (2): R55–R56. doi:10.1016/j.cub.2008.10.043. PMID  19174136. S2CID  5432036.
  185. ^ Stevens, Alison N. P. (2010). "Predation, Herbivory, and Parasitism". Doğa Eğitimi Bilgisi. 3 (10): 36.
  186. ^ Jurkevitch, Edouard; Davidov, Yaacov (2006). "Phylogenetic Diversity and Evolution of Predatory Prokaryotes". Yırtıcı Prokaryotlar. Springer. pp.11 –56. doi:10.1007/7171_052. ISBN  978-3-540-38577-6.
  187. ^ Hansen, Per Juel; Bjørnsen, Peter Koefoed; Hansen, Benni Winding (1997). "Zooplankton grazing and growth: Scaling within the 2-2,-μm body size range". Limnoloji ve Oşinografi. 42 (4): 687–704. doi:10.4319/lo.1997.42.4.0687. summarizes findings from many authors.
  188. ^ a b Wassilieff, Maggy (2006) "Plankton - Hayvan planktonu", Te Ara - Yeni Zelanda Ansiklopedisi. Erişim: 2 Kasım 2019.
  189. ^ Varea, C.; Aragon, J.L.; Barrio, R.A. (1999). "Turing patterns on a sphere". Fiziksel İnceleme E. 60 (4): 4588–92. Bibcode:1999PhRvE..60.4588V. doi:10.1103/PhysRevE.60.4588. PMID  11970318.
  190. ^ a b Hemleben, C .; Anderson, O.R .; Spindler, M. (1989). Modern Planktonik Foraminifer. Springer-Verlag. ISBN  978-3-540-96815-3.
  191. ^ Foraminifera: Çalışma Tarihi, University College London. Erişim: 18 Kasım 2019.
  192. ^ Mikrobiyal Ekolojideki Gelişmeler, Cilt 11
  193. ^ Bernhard, J. M .; Bowser, S.M. (1999). "Dysoxic sedimentlerin Bentik Foraminiferleri: kloroplast sekestrasyonu ve fonksiyonel morfoloji". Yer Bilimi Yorumları. 46 (1): 149–165. Bibcode:1999 ESRv ... 46..149B. doi:10.1016 / S0012-8252 (99) 00017-3.
  194. ^ Dierssen, Heidi; McManus, George B.; Chlus, Adam; Qiu, Dajun; Gao, Bo-Cai; Lin, Senjie (2015). "Space station image captures a red tide ciliate bloom at high spectral and spatial resolution". Ulusal Bilimler Akademisi Bildiriler Kitabı. 112 (48): 14783–14787. Bibcode:2015PNAS..11214783D. doi:10.1073/pnas.1512538112. PMC  4672822. PMID  26627232.
  195. ^ Mixotroph'lara dikkat edin - tüm ekosistemleri 'birkaç saat içinde' yok edebilirler
  196. ^ Mikroskobik vücut kapkaççıları okyanuslarımızı istila ediyor - Phys.org
  197. ^ Eiler A (Aralık 2006). "Yukarı Okyanusta Miksotrofik Bakterilerin Her Yerde Olduğuna Dair Kanıt: Sonuçlar ve Sonuçlar". Appl Environ Microbiol. 72 (12): 7431–7. doi:10.1128 / AEM.01559-06. PMC  1694265. PMID  17028233.
  198. ^ Katechakis A, Stibor H (Temmuz 2006). "Mixotroph Ochromonas tuberculata besin koşullarına bağlı olarak uzman fago- ve fototrof plankton topluluklarını istila edebilir ve bastırabilir ". Oekoloji. 148 (4): 692–701. Bibcode:2006Oecol.148..692K. doi:10.1007 / s00442-006-0413-4. PMID  16568278. S2CID  22837754.
  199. ^ Schoemann, Véronique; Becquevort, Sylvie; Stefels, Jacqueline; Rousseau, Véronique; Lancelot, Christiane (1 January 2005). "Phaeocystis küresel okyanusta çiçek açar ve kontrol mekanizmaları: bir inceleme". Deniz Araştırmaları Dergisi. Demir Kaynakları ve Okyanus Besin Maddeleri - Küresel Çevre Simülasyonlarının Gelişimi. 53 (1–2): 43–66. Bibcode:2005JSR .... 53 ... 43S. CiteSeerX  10.1.1.319.9563. doi:10.1016 / j.seares.2004.01.008.
  200. ^ "Phaeocystis antarctica genom dizileme projesi ana sayfasına hoş geldiniz".
  201. ^ DiTullio, G.R .; Grebmeier, J. M .; Arrigo, K. R .; Lizotte, M. P .; Robinson, D. H .; Leventer, A .; Barry, J. P .; VanWoert, M. L .; Dunbar, R.B. (2000). "Phaeocystis antarctica'nın hızlı ve erken ihracatı, Antarktika'daki Ross Denizi'nde çiçek açar." Doğa. 404 (6778): 595–598. doi:10.1038/35007061. PMID  10766240. S2CID  4409009.
  202. ^ J, Stefels; L, Dijkhuizen; WWC, Gieskes (20 July 1995). "Hollanda kıyılarında bir bahar fitoplanktonunda çiçek açan DMSP-liyaz aktivitesi, Phaeocystis sp. Bolluğuna bağlı olarak" (PDF). Deniz Ekolojisi İlerleme Serisi. 123: 235–243. Bibcode:1995MEPS..123..235S. doi:10.3354 / meps123235.
  203. ^ Decelle, Johan; Simó, Rafel; Galí, Martí; Vargas, Colomban de; Colin, Sébastien; Desdevises, Yves; Bittner, Lucie; Probert, Ian; Not, Fabrice (30 October 2012). "Açık okyanus planktonunda orijinal bir simbiyoz modu". Ulusal Bilimler Akademisi Bildiriler Kitabı. 109 (44): 18000–18005. Bibcode:2012PNAS..10918000D. doi:10.1073 / pnas.1212303109. ISSN  0027-8424. PMC  3497740. PMID  23071304.
  204. ^ Mars Brisbin, Margaret; Grossmann, Mary M .; Mesrop, Lisa Y .; Mitarai, Satoshi (2018). "Ana bilgisayar içi Symbiont Çeşitliliği ve Photosymbiotic Acantharea'da (Clade F) Genişletilmiş Symbiont Bakımı". Mikrobiyolojide Sınırlar. 9: 1998. doi:10.3389 / fmicb.2018.01998. ISSN  1664-302X. PMC  6120437. PMID  30210473.
  205. ^ a b Stoecker, D.K .; Hansen, P.J .; Caron, D.A .; Mitra, A. (2017). "Mixotrophy in the marine plankton". Deniz Bilimi Yıllık İncelemesi. 9: 311–335. Bibcode:2017 SİLAHLARI .... 9..311S. doi:10.1146 / annurev-marine-010816-060617. PMID  27483121.
  206. ^ a b Mitra, A; Flynn, KJ; Tillmann, U; Raven, J; Caron, D; et al. (2016). "Enerji ve besin edinimi için mekanizmalar üzerinde planktonik protist fonksiyonel grupların tanımlanması; çeşitli mixotrofik stratejilerin dahil edilmesi". Protist. 167 (2): 106–20. doi:10.1016 / j.protis.2016.01.003. PMID  26927496.
  207. ^ Gómez F (2012). "Canlı dinoflagellatların (Dinoflagellata, Alveolata) bir kontrol listesi ve sınıflandırması" (PDF). CICIMAR Océanides. 27 (1): 65–140. Arşivlenen orijinal (PDF) 27 Kasım 2013.
  208. ^ Stoecker DK (1999). "Dinoflagellatlar arasında miksotropi". Ökaryotik Mikrobiyoloji Dergisi. 46 (4): 397–401. doi:10.1111 / j.1550-7408.1999.tb04619.x. S2CID  83885629.
  209. ^ Suggested Explanation for Glowing Seas--Including Currently Glowing California Seas Ulusal Bilim Vakfı, 18 October 2011.
  210. ^ Boltovskoy, Demetrio; Anderson, O. Roger; Correa, Nancy M. (2017). Protistlerin El Kitabı. Springer, Cham. sayfa 731–763. doi:10.1007/978-3-319-28149-0_19. ISBN  9783319281476.
  211. ^ Anderson, O.R. (1983). Radyolarya. Springer Science & Business Media.
  212. ^ Gast, R. J .; Caron, D. A. (1 November 1996). "Planktonik foraminifer ve radyolaryadan simbiyotik dinoflagellatların moleküler filogenisi". Moleküler Biyoloji ve Evrim. 13 (9): 1192–1197. doi:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a025684. ISSN  0737-4038. PMID  8896371.
  213. ^ Castro P, Huber ME (2010). Deniz Biyolojisi (8. baskı). McGraw Hill. s. 95. ISBN  978-0071113021.
  214. ^ Hastings JW (1996). "Biyolüminesan reaksiyonların kimyası ve renkleri: bir inceleme". Gen. 173 (1 Özellik No): 5–11. doi:10.1016/0378-1119(95)00676-1. PMID  8707056.
  215. ^ Haddock SH, Moline MA, Case JF (2009). "Bioluminescence in the sea". Deniz Bilimi Yıllık İncelemesi. 2: 443–93. Bibcode:2010ARMS....2..443H. doi:10.1146/annurev-marine-120308-081028. PMID  21141672. S2CID  3872860.
  216. ^ "Protozoa Solungaçları ve Deriyi Bulaştırıyor". Merck Veteriner El Kitabı. Arşivlenen orijinal 3 Mart 2016 tarihinde. Alındı 4 Kasım 2019.
  217. ^ Marka, Larry E .; Campbell, Lisa; Bresnan, Eileen (2012). "Karenia: Toksik bir cinsin biyolojisi ve ekolojisi ". Zararlı Algler. 14: 156–178. doi:10.1016 / j.hal.2011.10.020.
  218. ^ Buskey, E.J. (1995). "Growth and bioluminescence of Noctiluca scintillans on varying algal diets". Plankton Araştırma Dergisi. 17 (1): 29–40. doi:10.1093/plankt/17.1.29.
  219. ^ Thomson, Charles Wyville (2014) Meydan Okuyucunun Yolculuğu: Atlantik Cambridge University Press, page235. ISBN  9781108074759.
  220. ^ Grethe R. Hasle; Erik E. Syvertsen; Karen A. Steidinger; Karl Tangen (25 January 1996). "Marine Diatoms". In Carmelo R. Tomas (ed.). Identifying Marine Diatoms and Dinoflagellates. Akademik Basın. pp. 5–385. ISBN  978-0-08-053441-1. Alındı 13 Kasım 2013.
  221. ^ Ald, S.M.; et al. (2007). "Diversity, Nomenclature, and Taxonomy of Protists" (PDF). Syst. Biol. 56 (4): 684–689. doi:10.1080/10635150701494127. PMID  17661235. Arşivlenen orijinal (PDF) 31 Mart 2011 tarihinde. Alındı 11 Ekim 2019.
  222. ^ Moheimani, N.R .; Webb, J.P .; Borowitzka, M.A. (2012), "Biyoremediasyon ve kokolitoforid alglerin diğer potansiyel uygulamaları: Bir inceleme. Kokolitoforid alglerin biyolojik iyileştirme ve diğer potansiyel uygulamaları: Bir inceleme", Alg Araştırması, 1 (2): 120–133, doi:10.1016 / j.algal.2012.06.002
  223. ^ Taylor, A.R .; Chrachri, A .; Wheeler, G .; Goddard, H .; Brownlee, C. (2011). "Kokolitoforların kalsifiye edilmesinde pH homeostazının altında yatan voltaj kapılı H + kanalı". PLOS Biyoloji. 9 (6): e1001085. doi:10.1371 / journal.pbio.1001085. PMC  3119654. PMID  21713028.
  224. ^ Wierer, U .; Arrighi, S .; Bertola, S .; Kaufmann, G .; Baumgarten, B .; Pedrotti, A .; Pernter, P .; Pelegrin, J. (2018). "Buz Adam'ın litik araç takımı: Hammadde, teknoloji, tipoloji ve kullanım". PLOS ONE. 13 (6): e0198292. Bibcode:2018PLoSO..1398292W. doi:10.1371 / journal.pone.0198292. PMC  6010222. PMID  29924811.
  225. ^ a b Haq B.U. ve Boersma A. (Ed.) (1998) Deniz Mikropaleontolojisine Giriş Elsevier. ISBN  9780080534961
  226. ^ Bruckner, Monica (2020) "Paleoklimatoloji: Geçmiş İklimleri Nasıl Çıkarabiliriz?" SERC, Carleton Koleji. 23 Temmuz 2020'de değiştirildi. 10 Eylül 2020'de alındı.
  227. ^ Yeni epik iklim rekoru gösteriyor ki, Dünya 50 milyon yıldır görülmeyen 'Sera' durumuna doğru hareket ediyor LiveScience, 10 Eylül 2020.
  228. ^ Westerhold, T., Marwan, N., Drury, AJ, Liebrand, D., Agnini, C., Anagnostou, E., Barnet, JS, Bohaty, SM, Vleeschouwer, D., Florindo, F. ve Frederichs, T . (2020) "Dünyanın iklimi ve son 66 Milyon Yıldaki öngörülebilirliğinin astronomik olarak tarihli bir kaydı". Bilim, 369(6509): 1383–1387. doi:10.1126 / science.aba6853.
  229. ^ Bob Yirka 29 Ağu 2013
  230. ^ Sussman: En Eski Bitkiler, Gardiyan, 2 Mayıs 2010
  231. ^ "Arşivlenmiş kopya". Arşivlenen orijinal 13 Temmuz 2018. Alındı 13 Temmuz 2018.CS1 Maint: başlık olarak arşivlenmiş kopya (bağlantı)
  232. ^ Willerslev, Eske; Froese, Duane; Gilichinsky, David; Rønn, Regin; Bunce, Michael; Zuber, Maria T .; Gilbert, M. Thomas P .; Marka, Tina; Munch, Kasper; Nielsen, Rasmus; Mastepanov, Mikhail; Christensen, Torben R .; Hebsgaard, Martin B .; Johnson, Sarah Stewart (4 Eylül 2007). "Eski bakteriler DNA onarımına dair kanıtlar gösterir". Ulusal Bilimler Akademisi Bildiriler Kitabı. 104 (36): 14401–14405. Bibcode:2007PNAS..10414401J. doi:10.1073 / pnas.0706787104. PMC  1958816. PMID  17728401.
  233. ^ Egan, S., Fukatsu, T. ve Francino, M.P., 2020. Mikrobiyom Çağında Mikrobiyal Simbiyoz Araştırmalarında Fırsatlar ve Zorluklar. Mikrobiyolojide Sınırlar, 11. doi:10.3389 / fmicb.2020.01150. CC-BY icon.svg Materyal, bir altında bulunan bu kaynaktan kopyalandı. Creative Commons Attribution 4.0 Uluslararası Lisansı.
  234. ^ Margulis, Lynn; Fester, René (1991). Evrimsel İnovasyon Kaynağı Olarak Ortak Yaşam. MIT Basın. ISBN  9780262132695.
  235. ^ Bordenstein, Seth R .; Theis Kevin R. (2015). "Mikrobiyom Işığında Ev Sahibi Biyoloji: Holobiyontların ve Hologenomların On İlkesi". PLOS Biol. 13 (8): e1002226. doi:10.1371 / journal.pbio.1002226. ISSN  1545-7885. PMC  4540581. PMID  26284777.
  236. ^ Theis, K.R., Dheilly, N.M., Klassen, J.L., Brucker, R.M., Baines, J.F., Bosch, T.C., Cryan, J.F., Gilbert, S.F., Goodnight, C.J., Lloyd, E.A. ve Sapp, J. (2016) "Hologenom kavramını doğru anlamak: konakçılar ve mikrobiyomları için eko-evrimsel bir çerçeve". Msystems, 1(2). doi:10.1128 / mSystems.00028-16. CC-BY icon.svg Materyal, bir altında bulunan bu kaynaktan kopyalandı. Creative Commons Attribution 4.0 Uluslararası Lisansı.
  237. ^ Bulgarelli, D., Schlaeppi, K., Spaepen, S., Van Themaat, E.V.L. ve Schulze-Lefert, P. (2013) "Bitkilerin bakteriyel mikrobiyotalarının yapısı ve işlevleri". Bitki biyolojisinin yıllık incelemesi, 64: 807–838. doi:10.1146 / annurev-arplant-050312-120106.
  238. ^ Vandenkoornhuyse, Philippe; Quaiser, Achim; Duhamel, Marie; Le Van, Amandine; Dufresne, Alexis (1 Haziran 2015). "Holobiont bitkisinin mikrobiyomunun önemi". Yeni Fitolog. 206 (4): 1196–1206. doi:10.1111 / nph.13312. ISSN  1469-8137. PMID  25655016.
  239. ^ Sánchez-Cañizares, C., Jorrín, B., Poole, P.S. ve Tkacz, A. (2017) "Holobiont'u Anlamak: bitkilerin ve mikrobiyomlarının birbirine bağımlılığı". Mikrobiyolojide Güncel Görüş, 38: 188–196. doi:10.1016 / j.mib.2017.07.001.
  240. ^ Douglas, A.E. ve Werren, J.H. (2016) "Hologenomdaki delikler: ev sahibi-mikrop ortakyaşamlarının neden holobiyontlar olmadığı". MBio, 7(2). doi:10.1128 / mBio.02099-15.
  241. ^ Thompson, J.R., Rivera, H.E., Closek, C.J. ve Medina, M. (2015) "Mercan holobionunda mikroplar: evrim, gelişim ve ekolojik etkileşimler yoluyla ortaklar". Hücresel ve enfeksiyon mikrobiyolojisindeki sınırlar, 4: 176. doi:10.3389 / fcimb.2014.00176.
  242. ^ Pita, L., Rix, L., Slaby, B.M., Franke, A. ve Hentschel, U. (2018) "Değişen bir okyanustaki sünger holobiont: mikroplardan ekosistemlere". Mikrobiyom, 6(1): 46. doi:10.1186 / s40168-018-0428-1. CC-BY icon.svg Materyal, bir altında bulunan bu kaynaktan kopyalandı. Creative Commons Attribution 4.0 Uluslararası Lisansı.
  243. ^ Ugarelli, K., Chakrabarti, S., Laas, P. and Stingl, U. (2017) "The seagrass holobiont and its microbiome". Mikroorganizmalar, 5(4): 81. doi:10.3390 / mikroorganizmalar5040081. CC-BY icon.svg Materyal, bir altında bulunan bu kaynaktan kopyalandı. Creative Commons Attribution 4.0 Uluslararası Lisansı.
  244. ^ Cavalcanti, G.S., Shukla, P., Morris, M., Ribeiro, B., Foley, M., Doane, M.P., Thompson, C.C., Edwards, M.S., Dinsdale, E.A. ve Thompson, F.L. (2018) "Değişen okyanusta Rodolit holobiyontları: konakçı-mikrop etkileşimleri, okyanus asitlenmesi altında koralin yosun direncine aracılık eder". BMC Genomics, 19(1): 1–13. doi:10.1186 / s12864-018-5064-4. CC-BY icon.svg Materyal, bir altında bulunan bu kaynaktan kopyalandı. Creative Commons Attribution 4.0 Uluslararası Lisansı.
  245. ^ Knowlton, N. ve Rohwer, F. (2003) "Mercan resiflerinde çok türlü mikrobiyal mutualizmler: bir habitat olarak konakçı". Amerikan Doğa Uzmanı, 162(S4): S51-S62. doi:10.1086/378684.
  246. ^ Pollock, F. Joseph; McMinds, Ryan; Smith, Styles; Bourne, David G .; Willis, Bette L .; Medine, Mónica; Thurber, Rebecca Vega; Zaneveld, Jesse R. (22 Kasım 2018). "Mercan ile ilişkili bakteriler filozimbiyoz ve kofilojeni gösterir". Doğa İletişimi. 9 (1): 1–13. doi:10.1038 / s41467-018-07275-x. ISSN  2041-1723. PMID  30467310.
  247. ^ Wilhelm, Steven W .; Suttle, Curtis A. (1999). "Denizdeki Virüsler ve Besin Döngüleri". BioScience. 49 (10): 781–788. doi:10.2307/1313569. ISSN  1525-3244. JSTOR  1313569.
  248. ^ Weinbauer, Markus G .; et al. (2007). "Viral parçalanma ve protistan otlatmanın bakteriyel biyokütle, üretim ve çeşitlilik üzerindeki sinerjik ve antagonistik etkileri". Çevresel Mikrobiyoloji. 9 (3): 777–788. doi:10.1111 / j.1462-2920.2006.01200.x. PMID  17298376.
  249. ^ Robinson, Carol ve Nagappa Ramaiah. "Mikrobiyal heterotrofik metabolik hızlar, mikrobiyal karbon pompasını kısıtlar." Amerikan Bilim İlerleme Derneği, 2011.
  250. ^ Gutierrez, MH; Jara, AM; Pantoja, S (2016). "Mantar parazitleri, Şili'nin merkezindeki Humboldt akıntı sisteminin yükselen ekosistemindeki deniz diyatomlarını enfekte eder". Environ Microbiol. 18 (5): 1646–1653. doi:10.1111/1462-2920.13257. hdl:10533/148260. PMID  26914416.
  251. ^ Deniz karı nedir? NOAA Ulusal Okyanus Hizmeti. Güncelleme: 06/25/18.
  252. ^ Monroy, P., Hernández-García, E., Rossi, V. and López, C. (2017) "Okyanus akışında biyojenik parçacıkların dinamik batışının modellenmesi". Jeofizikte Doğrusal Olmayan Süreçler, 24(2): 293–305. doi:10.5194 / npg-24-293-2017. CC-BY icon.svg Materyal, bir altında bulunan bu kaynaktan kopyalandı. Creative Commons Attribution 3.0 Uluslararası Lisansı.
  253. ^ Simon, M., Grossart, H., Schweitzer, B. ve Ploug, H. (2002) "Sucul ekosistemlerde organik agregaların mikrobiyal ekolojisi". Sucul mikrobiyal ekoloji, 28: 175–211. doi:10.3354 / ame028175.
  254. ^ Boetius, Antje; Anesio, Alexandre M .; Deming, Jody W .; Mikucki, Jill A .; Rapp, Josephine Z. (1 Kasım 2015). "Kriyosferin mikrobiyal ekolojisi: deniz buzu ve buzul habitatları". Doğa İncelemeleri Mikrobiyoloji. 13 (11): 677–690. doi:10.1038 / nrmicro3522. PMID  26344407. S2CID  20798336.
  255. ^ Lutz, Richard A .; Kennish, Michael J. (1993). "Derin deniz hidrotermal menfez topluluklarının ekolojisi: Bir inceleme". Jeofizik İncelemeleri. 31 (3): 211. Bibcode:1993RvGeo.31..211L. doi:10.1029 / 93rg01280. ISSN  8755-1209.
  256. ^ Kádár, Enikõ; Costa, Valentina; Santos, Ricardo S .; Powell, Jonathan J. (Temmuz 2006). "Havalandırmalı çift kabuklu Bathymodiolus azoricus ve ilişkili organizmalarda (endosymbiont bakteriler ve bir parazit polychaete) Orta Atlantik Sırtı'nın jeokimyasal olarak farklı havalandırma deliklerinde mikro esaslı metallerin doku bölümlenmesi". Deniz Araştırmaları Dergisi. 56 (1): 45–52. Bibcode:2006JSR .... 56 ... 45K. doi:10.1016 / j.seares.2006.01.002. ISSN  1385-1101.
  257. ^ Anderson, Rika E .; Brazelton, William J .; Baross, John A. (2011). "Derin yeraltı biyosferinin genetik yapısı virüslerden etkileniyor mu?". Mikrobiyolojide Sınırlar. 2: 219. doi:10.3389 / fmicb.2011.00219. ISSN  1664-302X. PMC  3211056. PMID  22084639.
  258. ^ Suttle, Curtis A. (Eylül 2005). "Denizdeki virüsler". Doğa. 437 (7057): 356–361. Bibcode:2005Natur.437..356S. doi:10.1038 / nature04160. ISSN  0028-0836. PMID  16163346. S2CID  4370363.
  259. ^ Suttle, Curtis A. (Ekim 2007). "Deniz virüsleri - küresel ekosistemin başlıca oyuncuları". Doğa İncelemeleri Mikrobiyoloji. 5 (10): 801–812. doi:10.1038 / nrmicro1750. ISSN  1740-1526. PMID  17853907. S2CID  4658457.
  260. ^ Anderson, Rika E .; Sogin, Mitchell L .; Baross, John A. (3 Ekim 2014). "Hidrotermal Havalandırma Ekosistemlerinde Virüsler, Bakteriler ve Arkelerin Evrimsel Stratejileri Metagenomiklerle Açığa Çıktı". PLOS ONE. 9 (10): e109696. Bibcode:2014PLoSO ... 9j9696A. doi:10.1371 / journal.pone.0109696. ISSN  1932-6203. PMC  4184897. PMID  25279954.
  261. ^ Ortmann, Alice C .; Suttle, Curtis A. (Ağustos 2005). "Derin deniz hidrotermal havalandırma sistemindeki yüksek virüs bolluğu, viral aracılı mikrobiyal ölüm oranını gösterir". Derin Deniz Araştırmaları Bölüm I: Oşinografik Araştırma Makaleleri. 52 (8): 1515–1527. Bibcode:2005DSRI ... 52.1515O. doi:10.1016 / j.dsr.2005.04.002. ISSN  0967-0637.
  262. ^ Breitbart, Mya (15 Ocak 2012). "Deniz Virüsleri: Doğruluk mu Cesaret mi". Deniz Bilimi Yıllık İncelemesi. 4 (1): 425–448. Bibcode:2012 SİLAHLAR .... 4..425B. doi:10.1146 / annurev-marine-120709-142805. ISSN  1941-1405. PMID  22457982.
  263. ^ Goldenfeld, Nigel; Woese, Carl (Ocak 2007). "Biyolojinin bir sonraki devrimi". Doğa. 445 (7126): 369. arXiv:q-bio / 0702015. Bibcode:2007Natur.445..369G. doi:10.1038 / 445369a. ISSN  0028-0836. PMID  17251963. S2CID  10737747.
  264. ^ Deep Carbon Observatory (10 Aralık 2018). "Derin Dünya'daki yaşam 15 ila 23 milyar ton karbona karşılık geliyor - bu, insanlardan yüzlerce kat fazla". EurekAlert!. Alındı 11 Aralık 2018.
  265. ^ Dockrill, Peter (11 Aralık 2018). "Bilim Adamları, Dünya Yüzeyinin Altında Gizli Büyük Bir Yaşam Biyosferini Ortaya Çıkarıyor". Bilim Uyarısı. Alındı 11 Aralık 2018.
  266. ^ Gabbatiss, Josh (11 Aralık 2018). "Devasa 'derin yaşam' çalışması, Dünya yüzeyinin çok altında yaşayan milyarlarca ton mikrop ortaya çıkardı". Bağımsız. Alındı 11 Aralık 2018.
  267. ^ Lollar, Garnet S .; Warr, Oliver; Söylemek, Jon; Osburn, Magdalena R .; Sherwood Lollar, Barbara (2019). "'Suyu Takip Edin ': Mikrobiyal İncelemelerde Hidrojeokimyasal Kısıtlamalar Kidd Creek Derin Akışkan ve Derin Yaşam Gözlemevi'nde Yüzeyin 2.4 km Altında ". Jeomikrobiyoloji Dergisi. 36: 859–872. doi:10.1080/01490451.2019.1641770. S2CID  199636268.
  268. ^ Dünyanın En Eski Yeraltı Suyu, Su-Kaya Kimyası Yoluyla Yaşamı Destekler, 29 Temmuz 2019, deepcarbon.net.
  269. ^ Bir madenin derinliklerinde bulunan garip yaşam formları, geniş 'yeraltı Galapagos'u', Corey S. Powell, 7 Eylül 2019, nbcnews.com.
  270. ^ Kanada Kalkanının Derinliklerinde Bulunan Dünyadaki En Eski Su, 14 Aralık 2016, Maggie Romuld
  271. ^ Wu, Katherine J. (28 Temmuz 2020). "Bu Mikroplar Deniz Tabanının Altında 100 Milyon Yıl Hayatta Kalmış Olabilir - Soğuk, sıkışık ve besin bakımından fakir evlerinden kurtarılan bakteriler laboratuvarda uyandı ve büyüdü". Alındı 31 Temmuz 2020.
  272. ^ Morono, Yuki; et al. (28 Temmuz 2020). "Aerobik mikrobiyal yaşam 101,5 milyon yıl kadar eski olan oksik deniz çökeltisinde devam ediyor". Doğa İletişimi. 11 (3626): 3626. doi:10.1038 / s41467-020-17330-1. PMC  7387439. PMID  32724059.
  273. ^ a b Filee, J .; Tetart, F .; Suttle, C A .; Krisch, H.M. (2005). "Deniz T4 tipi bakteriyofajlar, biyosferin karanlık maddesinin her yerde bulunan bir bileşeni". Ulusal Bilimler Akademisi Bildiriler Kitabı. 102 (35): 12471–12476. Bibcode:2005PNAS..10212471F. doi:10.1073 / pnas.0503404102. ISSN  0027-8424. PMC  1194919. PMID  16116082.
  274. ^ Knoxville'deki Tennessee Üniversitesi (25 Eylül 2018). "Çalışma: Mikrobiyal karanlık madde Dünya'nın çevresine hakim". Eurekalert!. Alındı 26 Eylül 2018.
  275. ^ Hedlund, Brian P .; Dodsworth, Jeremy A .; Murugapiran, Senthil K .; Rinke, Christian; Woyke Tanja (2014). "Tek hücreli genomiklerin ve metagenomiklerin ortaya çıkan ekstremofil görüşüne etkisi" mikrobiyal karanlık madde"". Aşırılıkseverler. 18 (5): 865–875. doi:10.1007 / s00792-014-0664-7. ISSN  1431-0651. PMID  25113821. S2CID  16888890.
  276. ^ May, R.M. (1988). "Yeryüzünde kaç tür var?" Bilim. 241 (4872): 1441–1449. Bibcode:1988Sci ... 241.1441M. doi:10.1126 / science.241.4872.1441. PMID  17790039. S2CID  34992724.
  277. ^ Locey, K.J .; Lennon, J.T. (2016). "Ölçeklendirme yasaları küresel mikrobiyal çeşitliliği öngörüyor". Ulusal Bilimler Akademisi Bildiriler Kitabı. 113 (21): 5970–5975. Bibcode:2016PNAS..113.5970L. doi:10.1073 / pnas.1521291113. PMC  4889364. PMID  27140646.
  278. ^ a b Vitorino, L.C .; Bessa, L.A. (2018). "Mikrobiyal çeşitlilik: tahmin edilen ile bilinen arasındaki boşluk". Çeşitlilik. 10 (2): 46. doi:10.3390 / d10020046. CC-BY icon.svg Materyal, bir altında bulunan bu kaynaktan kopyalandı. Creative Commons Attribution 4.0 Uluslararası Lisansı.
  279. ^ a b c Karsenti, E .; Acinas, S.G .; Bork, P .; Bowler, C .; De Vargas, C .; Raes, J .; Sullivan, M .; Arendt, D .; Benzoni, F .; Claverie, J.M .; İzler, M. (2011). "Deniz eko-sistemleri biyolojisine bütüncül bir yaklaşım". PLOS Biyoloji. 9 (10): e1001177. doi:10.1371 / journal.pbio.1001177. PMC  3196472. PMID  22028628.
  280. ^ Olsen GJ, Woese CR, Overbeek R (1994). "(Evrimsel) değişim rüzgarları: mikrobiyolojiye yeni yaşam soluyor". Bakteriyoloji Dergisi. 176 (1): 1–6. doi:10.2172/205047. PMC  205007. PMID  8282683.
  281. ^ Woese, CR (1987). "Bakteriyel evrim". Mikrobiyolojik İncelemeler. 51 (2): 221–71. doi:10.1128 / MMBR.51.2.221-271.1987. PMC  373105. PMID  2439888.
  282. ^ a b Collins, R. Eric (2019) Küçük ve Güçlü - Mikrobiyal Yaşam NOAA: Okyanus Keşfi ve Araştırması, Alaska Körfezi Seamounts 2019 Expedition. Bu makale, bu kaynaktan alınan metni içermektedir. kamu malı.
  283. ^ Käse L, Geuer JK. (2018) "Deniz İklimi Değişikliğine Fitoplankton Tepkileri - Giriş". Jungblut S., Liebich V., Bode M. (Eds) içinde YOUMARES 8 - Sınırların Ötesinde Okyanuslar: Birbirinden Öğrenmek, sayfalar 55–72, Springer. doi:10.1007/978-3-319-93284-2_5. CC-BY icon.svg Materyal, bir altında bulunan bu kaynaktan kopyalandı. Creative Commons Attribution 4.0 Uluslararası Lisansı.
  284. ^ Franco-Duarte, R .; Černáková, L .; Kadam, S .; Kaushik, K .; Salehi, B .; Bevilacqua, A .; Corbo, M.R .; Antolak, H .; Dybka-Stępień, K .; Leszczewicz, M .; Relison Tintino, S. (2019). "Geçmişten Günümüze Mikroorganizmaları Tanımlamaya Yönelik Kimyasal ve Biyolojik Yöntemlerdeki Gelişmeler". Mikroorganizmalar. 7 (5): 130. doi:10.3390 / mikroorganizmalar7050130. PMC  6560418. PMID  31086084. CC-BY icon.svg Materyal, bir altında bulunan bu kaynaktan kopyalandı. Creative Commons Attribution 4.0 Uluslararası Lisansı.
  285. ^ Lozupone, C.A., Stombaugh, J.I., Gordon, J.I., Jansson, J.K. ve Knight, R. (2012) "İnsan bağırsağı mikrobiyotasının çeşitliliği, kararlılığı ve esnekliği". Doğa, 489(7415): 220–230. doi:10.1038 / nature11550.
  286. ^ Venter, J.C., Remington, K., Heidelberg, J.F., Halpern, A.L., Rusch, D., Eisen, J.A., Wu, D., Paulsen, I., Nelson, K.E., Nelson, W. and Fouts, D.E. (2004) "Sargasso Denizi'nin çevresel genom av tüfeği sıralaması". Bilim, 304(5667): 66–74. doi:10.1126 / bilim.1093857.
  287. ^ Liu, L., Li, Y., Li, S., Hu, N., He, Y., Pong, R., Lin, D., Lu, L. ve Law, M. (2012) "Karşılaştırma yeni nesil sıralama sistemleri ". BioMed Research International, 2012: 251364. doi:10.1155/2012/251364.
  288. ^ Berg, Gabriele; Daria Rybakova, Doreen Fischer, Tomislav Cernava, Marie-Christine Champomier Vergès, Trevor Charles, Xiaoyulong Chen, Luca Cocolin, Kellye Eversole, Gema Herrero Corral, Maria Kazou, Linda Kinkel, Lene Lange, Nelson Lima, Alexander Loy, James A. Macklin Emmanuelle Maguin, Tim Mauchline, Ryan McClure, Birgit Mitter, Matthew Ryan, Inga Sarand, Hauke ​​Smidt, Bettina Schelkle, Hugo Roume, G. Seghal Kiran, Joseph Selvin, Rafael Soares Correa de Souza, Leo van Overbeek, Brajesh K. Singh , Michael Wagner, Aaron Walsh, Angela Sessitsch ve Michael Schloter (2020) "Mikrobiyom tanımı yeniden ziyaret edildi: eski kavramlar ve yeni zorluklar". Mikrobiyom, 8(103): 1–22. doi:10.1186 / s40168-020-00875-0. CC-BY icon.svg Materyal, bir altında bulunan bu kaynaktan kopyalandı. Creative Commons Attribution 4.0 Uluslararası Lisansı.
  289. ^ Kodzius, R .; Gojobori, T. (2015). "Biyolojik inceleme için kaynak olarak deniz metagenomiği". Deniz Genomiği. 24: 21–30. doi:10.1016 / j.margen.2015.07.001. PMID  26204808. CC-BY icon.svg Materyal, bir altında bulunan bu kaynaktan kopyalandı. Creative Commons Attribution 4.0 Uluslararası Lisansı.
  290. ^ Holtorf, Hauke; Guitton, Marie-Christine; Reski, Ralf (2002). "Bitki fonksiyonel genomikleri". Naturwissenschaften. 89 (6): 235–249. doi:10.1007 / s00114-002-0321-3. PMID  12146788. S2CID  7768096.
  291. ^ Cain, A.K., Barquist, L., Goodman, A.L., Paulsen, I.T., Parkhill, J. ve van Opijnen, T. (2020) "Transpozon ekleme dizilemesinde on yıllık ilerleme". Doğa İncelemeleri Genetik, 21: 526–540. doi:10.1038 / s41576-020-0244-x.
  292. ^ Zhang, W., Li, F. ve Nie, L. (2010) "Mikrobiyal biyoloji için çoklu 'omik' analizini entegre etmek: uygulama ve metodolojiler". Mikrobiyoloji, 156(2): 287–301. doi:10.1099 / mic.0.034793-0.
  293. ^ Singh, R.P. ve Kothari, R. (2017) "Omik çağı ve barındıran mikrobiyomlar". İçinde: Singh RP, Kothari R, Koringa PG ve Singh SP (Ed.) Konak-Mikrobiyom Etkileşimlerini Anlama - Omics Yaklaşımı, sayfa 3–12, Springer. ISBN  9789811050503. doi:10.1007/978-981-10-5050-3_1
  294. ^ Capotondi, A., Jacox, M., Bowler, C., Kavanaugh, M., Lehodey, P., Barrie, D., Brodie, S., Chaffron, S., Cheng, W., Dias, DF, Eveillard , D. ve 20 kişi daha (2019) "Küresel okyanustan bölgesel ve kıyı sistemlerine, deniz ekosistemlerinin modellemesini ve tahminini destekleyen gözlemsel ihtiyaçlar". Deniz Bilimlerinde Sınırlar, 6: 623. doi:10.3389 / fmars.2019.00623. CC-BY icon.svg Materyal, bir altında bulunan bu kaynaktan kopyalandı. Creative Commons Attribution 4.0 Uluslararası Lisansı.
  295. ^ Sunagawa, S., Coelho, L. P., Chaffron, S., Kultima, J. R., Labadie, K., Salazar, G., vd. (2015). "Okyanus planktonu. Küresel okyanus mikrobiyomunun yapısı ve işlevi". Bilim, 348: 1261359. doi:10.1126 / science.1261359.
  296. ^ Guidi, L., Chaffron, S., Bittner, L., Eveillard, D., Larhlimi, A., Roux, S., vd. (2016). "Plankton ağları oligotrofik okyanusta karbon ihracatını yönlendiriyor". Doğa, 532: 465–470. doi:10.1038 / nature16942.
  297. ^ Guyennon, A., Baklouti, M., Diaz, F., Palmieri, J., Beuvier, J., Lebaupin-Brossier, C., vd. (2015). "3-D modellemeden Akdeniz'deki organik karbon ihracatına yeni bakış açıları". Biyojeoloji, 11: 425–442. doi:10.5194 / bg-12-7025-2015.
  298. ^ Louca, S., Parfrey, L. W. ve Doebeli, M. (2016). Küresel okyanus mikrobiyomunda "ayırma işlevi ve taksonomi". Bilim, 353: 1272–1277. doi:10.1126 / science.aaf4507.
  299. ^ Coles, V. J., Stukel, M.R., Brooks, M.T., Burd, A., Crump, B. C., Moran, M. A., vd. (2017). "Okyanus biyojeokimyası, ortaya çıkan özellik temelli genomiklerle modellendi". Bilim, 358: 1149–1154. doi:10.1126 / science.aan5712.
  300. ^ Mock, T., Daines, S.J., Geider, R., Collins, S., Metodiev, M., Millar, A.J., Moulton, V. ve Lenton, T.M. (2016) "Çevresel değişimin deniz mikroplarını nasıl etkilediğini daha iyi anlamak için omik ve yer sistemi bilimi arasındaki boşluğu doldurmak". Küresel Değişim Biyolojisi, 22(1): 61–75. doi:10.1111 / gcb.12983. CC-BY icon.svg Materyal, bir altında bulunan bu kaynaktan kopyalandı. Creative Commons Attribution 4.0 Uluslararası Lisansı.
  301. ^ a b Toseland A, Daines SJ ve Clark JR ve diğerleri. (2013) "Sıcaklığın deniz fitoplankton kaynak tahsisi ve metabolizması üzerindeki etkisi". Doğa İklim Değişikliği, 3: 979– 984. doi:10.1038 / nclimate1989.
  302. ^ Martiny AC, Pham CTA, Primeau FW, Vrugt JA, Moore JK, Levin SA ve Lomas MW (2013) "Deniz planktonu ve organik maddenin temel oranlarında güçlü enlemsel modeller". Doğa Jeolojisi, 6: 279–283. doi:10.1038 / ngeo1757.

Genel referanslar