Mikrobiyal ekoloji - Microbial ecology

"Çevresel mikrobiyoloji" buraya yönlendirir. Dergi için bkz. Çevresel Mikrobiyoloji (dergi).
Harika plaka sayımı anomalisi. Kültivasyon yoluyla elde edilen hücre sayıları, doğrudan mikroskop altında gözlemlenenden daha düşük büyüklük sıralarındadır. Bunun nedeni, mikrobiyologların, çevreye bağlı olarak, mevcut laboratuvar tekniklerini kullanarak, doğal olarak oluşan mikropların yalnızca küçük bir kısmını yetiştirebilmeleridir.[1]

Mikrobiyal ekoloji (veya çevresel mikrobiyoloji) ekoloji nın-nin mikroorganizmalar: birbirleriyle ve çevreleriyle olan ilişkileri. Üç ana etki alanları hayatın-Ökaryota, Archaea, ve Bakteri -Hem de virüsler.[2]

Mikroorganizmalar, her yerde bulunmalarıyla tüm biyosfer. Mikrobiyal yaşam, düzenlemede birincil rol oynar biyojeokimyasal en çok bazıları dahil olmak üzere gezegenimizin neredeyse tüm ortamlarındaki sistemler aşırı, şuradan donmuş ortamlar ve asidik göller hidrotermal menfezler en derin okyanusların dibinde ve insan gibi en tanıdık olanların bazıları ince bağırsak.[3][4] Mikrobiyal yaşamın kantitatif büyüklüğünün bir sonucu olarak (şu şekilde hesaplanır: 5.0×1030 hücreler; gözlemlenebilir evrendeki yıldız sayısından daha büyük sekiz büyüklük sırası[5][6]) mikroplar sayesinde biyokütle tek başına önemli bir karbon yutağı.[7] Karbon fiksasyonunun yanı sıra, mikroorganizmaların temel kolektif metabolik süreçleri ( nitrojen fiksasyonu, metan metabolizması, ve kükürt metabolizması ) küresel biyojeokimyasal döngüyü kontrol eder.[8] Mikroorganizmaların üretiminin büyüklüğü ökaryotik yaşamın tamamen yokluğunda bile bu süreçlerin muhtemelen değişmeden devam edeceği şekildedir.[9]

Tarih

Mikroplar on yedinci yüzyıldan beri incelenirken, bu araştırma ekolojik olmaktan çok fizyolojik bir perspektiften yapılmıştır.[10] Örneğin, Louis Pasteur ve müritleri hem karada hem de okyanusta mikrobiyal dağılım sorunuyla ilgileniyorlardı.[11] Martinus Beijerinck icat etti zenginleştirme kültürü temel bir çalışma yöntemi mikroplar çevreden. Sık sık yanlış bir şekilde, mikrobiyal biyocoğrafik "her şey her yerde, ancak çevre seçer" fikriyle Lourens Baas Becking.[12] Sergei Winogradsky anlamaya çalışan ilk araştırmacılardan biriydi mikroorganizmalar tıbbi bağlamın dışında - onu mikrobiyal ekoloji ve çevresel mikrobiyolojinin ilk öğrencileri arasında yapma - keşfetme kemosentez ve geliştirmek Winogradsky sütunu süreç içerisinde.[13]:644

Ancak Beijerinck ve Windogradsky, mikrobiyal değil mikroorganizmaların fizyolojisi üzerine odaklandılar. yetişme ortamı veya ekolojik etkileşimleri.[10] Modern mikrobiyal ekoloji, Robert Hungate ve araştıran iş arkadaşları rumen ekosistem. Rumen çalışması, Hungate'in anaerobik mikropları kültürlemek için teknikler geliştirmesini gerektirdi ve ayrıca mikropların çalışmasına ve türlerin göreceli katkılarını farklılaştıran ekolojik faaliyetlerine nicel bir yaklaşıma öncülük etti. katabolik yollar.[10]

Mikrobiyal ekolojideki ilerleme, yeni teknolojilerin geliştirilmesine bağlanmıştır. Doğadaki biyojeokimyasal işlem hızlarının ölçümü, radyoizotoplar 1950'lerden itibaren. Örneğin, 14CO2 okyanustaki fotosentez oranlarının analizine izin verdi (ref). Bir başka önemli gelişme, O2 gibi kimyasal türlere duyarlı mikroelektrotların geliştirildiği 1980'lerde geldi.[14]. Bu elektrotlar 50–100 μm uzaysal çözünürlüğe sahiptir ve mikrobiyal matlar ve tortulardaki uzaysal ve zamansal biyojeokimyasal dinamiklerin analizine izin vermiştir.

Biyojeokimyasal işlem hızlarının ölçülmesi hangi işlemlerin gerçekleştiğini analiz edebilmesine rağmen, bunlar eksikti çünkü hangi mikropların sorumlu olduğuna dair hiçbir bilgi sağlamadılar. 'Klasik' yetiştirme tekniklerinin, mikropların% 1'inden daha azını doğal bir habitattan kurtardığı uzun zamandır biliniyordu. Bununla birlikte, 1990'lardan başlayarak, bir habitattaki mikropların nispi bolluğunu belirlemek için bir dizi kültivasyondan bağımsız teknik gelişti. Carl Woese ilk olarak, dizinin 16S ribozomal RNA molekül, filogenetik ilişkileri analiz etmek için kullanılabilir. Norm Temposu bu ufuk açıcı fikri aldı ve doğal ortamlarda "kim var" ı analiz etmek için uyguladı. Prosedür, (a) nükleik asitlerin doğrudan bir doğal ortamdan izolasyonunu, (b) küçük alt birim rRNA gen dizilerinin PCR amplifikasyonunu, (c) amplikonların dizilenmesini ve (d) bu dizilerin, saf kültürler ve çevresel DNA[15]. Bu, mikrobiyal habitatlarda mevcut olan çeşitlilik hakkında muazzam bilgiler sağladı. Bununla birlikte, belirli mikropların biyojeokimyasal rollerine nasıl bağlanacağını çözmez. Metagenomik, bir ortamdan geri kazanılan toplam DNA'nın dizilenmesi, biyojeokimyasal potansiyele ilişkin içgörü sağlayabilir[16], buna karşılık metatranscriptomics ve metaproteomik genetik potansiyelin gerçek ifadesini ölçebilir ancak teknik olarak daha zor kalır[17].

Roller

Mikroorganizmalar hepsinin bel kemiğidir ekosistemler ama daha da fazlası, ışığın olmaması nedeniyle fotosentezin yapılamadığı bölgelerde. Bu tür bölgelerde, kemosentetik mikroplar enerji sağlar ve karbon diğer organizmalara. Bu kemotrofik organizmalar, oksijensiz ortamlarda diğer elektron alıcıları solunum için.

Diğer mikroplar ayrıştırıcılar, geri dönüşüm yeteneği ile besinler diğer organizmaların atık ürünlerinden. Bu mikroplar, biyojeokimyasal döngülerde hayati bir rol oynarlar.[18] nitrojen döngüsü, fosfor döngüsü, kükürt döngüsü ve karbon döngüsü hepsi bir şekilde mikroorganizmalara bağlıdır. Örneğin, nitrojen gazı Dünya atmosferinin% 78'ini oluşturan, mikrobiyal süreçle biyolojik olarak mevcut bir forma dönüştürülene kadar çoğu organizma için mevcut değildir. nitrojen fiksasyonu.

Yüksek seviyeden dolayı yatay gen transferi mikrobiyal topluluklar arasında,[19] mikrobiyal ekoloji de çalışmalar için önemlidir evrim.[20]

Ortak yaşam

Mikroplar, özellikle bakteriler sıklıkla simbiyotik ilişkiler (ya pozitif veya olumsuz ) diğer mikroorganizmalar veya daha büyük organizmalar ile. Fiziksel olarak küçük olmasına rağmen, mikroplar arasındaki simbiyotik ilişkiler, ökaryotik süreçler ve evrimleri.[21][22] Mikropların katıldığı simbiyotik ilişki türleri şunları içerir: karşılıklılık, komensalizm, asalaklık,[23] ve amansalizm,[24] ve bu ilişkiler ekosistemi birçok yönden etkiler.

Karşılıklılık

Mikrobiyal ekolojide karşılıklılık, mikrobiyal türler ile insanlar arasındaki, her iki tarafın da fayda sağlamasına izin veren bir ilişkidir.[25] Böyle bir örnek sözdizimi, çapraz besleme olarak da bilinir,[24] olan 'Methanobacterium omelianskii 'klasik bir örnektir[26][27]. Bu konsorsiyum, etanol fermente eden bir organizma ve metanojen. Etanol fermente eden organizma, arkeolojik ortağa H2Metan üretmek ve büyütmek için bu metanojenin ihtiyaç duyduğu.[21][27] Syntrophy'nin, çeşitli fonksiyonel özelliklere sahip mikrobiyal topluluğun hayatta kalmasına, büyümesine ve maksimum miktarda enerji üretmesine yardımcı olabileceği derin yer altı gibi enerji ve besinle sınırlı ortamlarda önemli bir rol oynadığı varsayılmıştır.[28][29] Metanın anaerobik oksidasyonu (AOM), bir şirketin karşılıklı konsorsiyumu tarafından yürütülür. sülfat azaltıcı bakteri ve anaerobik metan oksitleyen arkeon. [30][31] H üretimi için bakteri ortağı tarafından kullanılan reaksiyon2 dır-dir endergonic (ve bu nedenle termodinamik olarak elverişsizdir), ancak, archaeal partner tarafından kullanılan reaksiyona bağlandığında, genel reaksiyon haline gelir ekzergonik.[21] Dolayısıyla, iki organizma, tek başına her iki tür için ölümcül olan bir ortamda büyümelerine ve gelişmelerine izin veren karşılıklı bir ilişki içindedir. Liken simbiyotik bir organizma örneğidir.[27]

Komensalizm

Komensalizm, mikrobiyal dünyada çok yaygındır ve kelimenin tam anlamıyla "aynı masadan yemek yemek" anlamına gelir.[32] Bir mikrobiyal popülasyonun metabolik ürünleri, başka bir mikrobiyal popülasyon tarafından, ilk popülasyon için herhangi bir kazanç veya zarar olmaksızın kullanılır. Aynı kimyasal denkleme oksidasyon veya indirgeme reaksiyonu gerçekleştiren birçok mikrobiyal tür "çifti" vardır. Örneğin, metanojenler CO2'yi düşürerek metan üretir2 CH'ye4metanotroflar metanı tekrar CO'ya okside ederken2. [33]

Amensalizm

Amensalizm (aynı zamanda antagonizm olarak da bilinir), bir türün / organizmanın zarar görürken diğerinin etkilenmeden kaldığı bir tür simbiyotik ilişki türüdür.[25] Mikrobiyal ekolojide yer alan böyle bir ilişkinin bir örneği, mikrobiyal türler arasındadır. Lactobacillus casei ve Pseudomonas taetrolens.[34] Bir ortamda birlikte yaşarken, Pseudomonas taetrolens laktobiyonik asit (ana ürünü) üretiminin inhibe olduğunu ve üretiminin azaldığını gösterir. Lactobacillus casei laktik asit üretimi sırasında.[35] Ancak, Lactobacillus casei davranışında hiçbir farklılık göstermez ve bu tür bir ilişki amensalizm olarak tanımlanabilir.

Mikrobiyal kaynak yönetimi

Biyoteknoloji mikrobiyal ekoloji ile birlikte bir dizi çevresel ve ekonomik zorluklar. Örneğin, moleküler teknikler, örneğin topluluk parmak izi veya metagenomik mikrobiyal topluluklardaki zaman içindeki değişiklikleri izlemek veya bunların biyolojik çeşitlilik. Karbon döngüsünü ayırmak için yönetmek karbon dioksit ve aşırılığı önlemek metanojenez hafifletmede önemlidir küresel ısınma ve beklentileri biyoenerji gelişmesiyle genişletiliyor mikrobiyal yakıt hücreleri. Mikrobiyal kaynak yönetimi, daha ilerici bir tutumu savunur. hastalık, vasıtasıyla biyolojik kontrol ajanları yok etme girişimlerine tercih edilir. Akılar mikrobiyal topluluklar bu alanın potansiyelinin gerçekleşmesi için daha iyi karakterize edilmesi gerekir.[36] Ek olarak, deniz mikrobiyal ortakyaşamlarının değerli bir mevcut ve yeni antimikrobiyal ajan kaynağı olduğu ve bu nedenle evrimsel silahlanma yarışında başka bir araştırma hattı sunduğundan, klinik çıkarımlar da vardır. antibiyotik direnci araştırmacılar için acil bir endişe.[37]

Yapılı çevrede ve insan etkileşiminde

Ana makale: İnsan mikrobiyotası

Mikroplar, evler, ofisler, ticaret merkezleri ve hastaneler dahil tüm alanlarda bulunur. 2016 yılında dergi Mikrobiyom mikrobiyal ekolojiyi inceleyen çeşitli çalışmaların bir koleksiyonunu yayınladı. yapılı çevre.[38]

2006 yılında hastanelerde patojenik bakteriler üzerinde yapılan bir araştırma, bazılarının sadece birkaç gün hayatta kalırken, diğerlerinin aylarca hayatta kalmasıyla, hayatta kalma yeteneklerinin türe göre değiştiğini ortaya koydu.[39]

Evdeki mikropların ömrü de benzer şekilde değişir. Genel olarak bakteri ve virüsler nem oranı yüzde 10'un üzerinde olan ıslak bir ortam gerektirir.[40] E. coli birkaç saatten bir güne kadar hayatta kalabilir.[40] Spor oluşturan bakteriler daha uzun süre hayatta kalabilir. Staphylococcus aureus potansiyel olarak haftalarca hayatta kalmak veya durumunda Bacillus anthracis, yıl.[40]

Evde evcil hayvanlar bakteri taşıyıcısı olabilir; örneğin sürüngenler genellikle salmonella taşıyıcılarıdır.[41]

S. aureus özellikle yaygındır ve insan popülasyonunun yaklaşık% 30'unu asemptomatik olarak kolonileştirir;[42] girişimde bulunmak koloniden arındırmak taşıyıcılar sınırlı başarı elde etti[43] ve genellikle içerir mupirosin burun içinden ve klorheksidin bağırsak ve idrar yolu enfeksiyonlarını ele almak için potansiyel olarak vankomisin ve kotrimoksazol ile birlikte yıkama.[44]

Antimikrobiyaller

Bazı metaller, özellikle bakır ve gümüş, antimikrobiyal özelliklere sahiptir. Kullanma antimikrobiyal bakır alaşımlı dokunmatik yüzeyler bakteri bulaşmasını önlemek için 21. yüzyılda kullanılmaya başlanan bir tekniktir.[45] Gümüş nanopartiküller minik parçacıkların insan sağlığı üzerindeki potansiyel yan etkileri konusunda endişeler ortaya çıkmasına rağmen, bina yüzeylerine ve kumaşlarına da dahil edilmeye başlandı.[46]

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ Hugenholtz, P. (2002). "Genomik çağda prokaryotik çeşitliliği keşfetmek". Genom Biyolojisi. 3 (2): reviews0003.reviews0001. doi:10.1186 / gb-2002-3-2-değerlendirme0003. PMC  139013. PMID  11864374.
  2. ^ Barton, Larry L .; Northup, Diana E. (9 Eylül 2011). Mikrobiyal Ekoloji. Wiley-Blackwell. Oxford: John Wiley & Sons. s. 22. ISBN  978-1-118-01582-7. Alındı 25 Mayıs 2013.
  3. ^ Bowler, Chris; Karl, David M .; Colwell Rita R. (2009). "Fırsat denizinde mikrobiyal oşinografi". Doğa. 459 (7244): 180–4. Bibcode:2009Natur.459..180B. doi:10.1038 / nature08056. PMID  19444203.
  4. ^ Konopka, Allan (2009). "Mikrobiyal topluluk ekolojisi nedir?". ISME Dergisi. 3 (11): 1223–30. doi:10.1038 / ismej.2009.88. PMID  19657372.
  5. ^ Whitman, W. B .; Coleman, DC; Wiebe, WJ (1998). "Prokaryotlar: Görünmeyen çoğunluk". Ulusal Bilimler Akademisi Bildiriler Kitabı. 95 (12): 6578–83. Bibcode:1998PNAS ... 95.6578W. doi:10.1073 / pnas.95.12.6578. JSTOR  44981. PMC  33863. PMID  9618454.
  6. ^ "gözlemlenebilir evrendeki yıldız sayısı - Wolfram | Alpha". Alındı 2011-11-22.
  7. ^ Reddy, K. Ramesh; DeLaune, Ronald D. (15 Temmuz 2004). Sulak Alanların Biyojeokimyası: Bilim ve Uygulamalar. Boca Raton: Taylor ve Francis. s. 116. ISBN  978-0-203-49145-4. Alındı 25 Mayıs 2013.
  8. ^ Delong, Edward F. (2009). "Genomlardan biyomlara mikrobiyal okyanus" (PDF). Doğa. 459 (7244): 200–6. Bibcode:2009Natur.459..200D. doi:10.1038 / nature08059. hdl:1721.1/69838. PMID  19444206.
  9. ^ Lupp Claudia (2009). "Mikrobiyal oşinografi". Doğa. 459 (7244): 179. Bibcode:2009Natur.459..179L. doi:10.1038 / 459179a. PMID  19444202.
  10. ^ a b c Konopka, A. (2009). "Ekoloji, Mikrobiyal". Mikrobiyoloji Ansiklopedisi. s. 91–106. doi:10.1016 / B978-012373944-5.00002-X. ISBN  978-0-12-373944-5.
  11. ^ Adler, Antony; Dücker Erik (2017/04/05). "Pastör Bilimi Denize Çıktığında: Deniz Mikrobiyolojisinin Doğuşu". Biyoloji Tarihi Dergisi. 51 (1): 107–133. doi:10.1007 / s10739-017-9477-8. ISSN  0022-5010. PMID  28382585.
  12. ^ De Wit, Rutger; Bouvier, Thierry (2006). "'Her şey her yerdedir, ancak çevre seçer '; Baas Becking ve Beijerinck gerçekte ne dedi? " Çevresel Mikrobiyoloji. 8 (4): 755–8. doi:10.1111 / j.1462-2920.2006.01017.x. PMID  16584487.
  13. ^ Madigan, Michael T. (2012). Brock mikroorganizma biyolojisi (13. baskı). San Francisco: Benjamin Cummings. ISBN  9780321649638.
  14. ^ Revsbech, Niels Peter; Jørgensen, Bo Barker (1986), Marshall, K.C (ed.), "Mikroelektrotlar: Mikrobiyal Ekolojide Kullanımları", Mikrobiyal Ekolojideki Gelişmeler, Boston, MA: Springer ABD, 9, s. 293–352, doi:10.1007/978-1-4757-0611-6_7, ISBN  978-1-4757-0613-0, alındı 2020-09-21
  15. ^ Hugerth, Luisa W .; Andersson, Anders F. (2017). "Mikrobiyal Topluluk Bileşimini Amplikon Sıralamayla Analiz Etmek: Örneklemeden Hipotez Testine". Mikrobiyolojide Sınırlar. 8. doi:10.3389 / fmicb.2017.01561. ISSN  1664-302X.
  16. ^ Yeni, Felicia N .; Brito, Ilana L. (2020-09-08). "Metagenomik Bize Ne Öğretiyor ve Neler Kaçırılıyor?". Mikrobiyolojinin Yıllık İncelemesi. 74 (1): 117–135. doi:10.1146 / annurev-micro-012520-072314. ISSN  0066-4227.
  17. ^ Shakya, Migun; Lo, Chien-Chi; Zincir, Patrick S.G. (2019). "Metatranscriptomik Analizdeki Gelişmeler ve Zorluklar". Genetikte Sınırlar. 10. doi:10.3389 / fgene.2019.00904. ISSN  1664-8021.
  18. ^ Fenchel, Tom; Blackburn, Henry; King, Gary M. (24 Temmuz 2012). Bakteriyel Biyojeokimya: Mineral Çevriminin Ekofizyolojisi (3 ed.). Boston, Mass .: Academic Press / Elsevier. s. 3. ISBN  978-0-12-415974-7. Alındı 25 Mayıs 2013.
  19. ^ McDaniel, L. D .; Young, E .; Delaney, J .; Ruhnau, F .; Ritchie, K. B .; Paul, J.H. (2010). "Okyanuslarda Yüksek Frekanslı Yatay Gen Transferi". Bilim. 330 (6000): 50. Bibcode:2010Sci ... 330 ... 50 milyon. doi:10.1126 / science.1192243. PMID  20929803.
  20. ^ Smets, Barth F .; Barkay, Tamar (2005). "Yatay gen aktarımı: Bilimsel disiplinlerin kesişim noktasındaki bakış açıları". Doğa İncelemeleri Mikrobiyoloji. 3 (9): 675–8. doi:10.1038 / nrmicro1253. PMID  16145755.
  21. ^ a b c L., Kirchman, David (2012). Mikrobiyal ekolojide süreçler. Oxford: Oxford University Press. ISBN  9780199586936. OCLC  777261246.
  22. ^ López-García, Purificación; Eme, Laura; Moreira, David (2017-12-07). "Ökaryotik evrimde ortak yaşam". Teorik Biyoloji Dergisi. Mitoz hücrelerinin kökeni: Lynn Sagan'ın (Margulis) klasik bir makalesinin 50. yıl dönümü. 434 (Ek C): 20–33. doi:10.1016 / j.jtbi.2017.02.031. PMC  5638015. PMID  28254477.
  23. ^ I., Krasner, Robert (2010). Mikrobiyal zorluk: bilim, hastalık ve halk sağlığı (2. baskı). Sudbury, Mass .: Jones ve Bartlett Publishers. ISBN  978-0763756895. OCLC  317664342.
  24. ^ a b Faust, Karoline; Raes, Jeroen (16 Temmuz 2012). "Mikrobiyal etkileşimler: ağlardan modellere". Doğa Yorumları. Mikrobiyoloji. 10 (8): 538–550. doi:10.1038 / nrmicro2832. PMID  22796884.
  25. ^ a b Sheela., Srivastava (2003). Bakterileri anlamak. Srivastava, P. S. (Prem S.). Dordrecht: Kluwer Academic Publishers. ISBN  978-1402016332. OCLC  53231924.
  26. ^ Bryant, M. P .; Wolin, E. A .; Wolin, M. J .; Wolfe, R. S. (1967). "Methanobacillus omelianskii, iki bakteri türünün simbiyotik birliği". Arşiv için Mikrobiologie. 59 (1–3): 20–31. doi:10.1007 / bf00406313. ISSN  0302-8933. PMID  5602458.
  27. ^ a b c López-García, Purificación; Eme, Laura; Moreira, David (Aralık 2017). "Ökaryotik evrimde ortak yaşam". Teorik Biyoloji Dergisi. Mitoz hücrelerinin kökeni: Lynn Sagan'ın (Margulis) klasik bir makalesinin 50. yıl dönümü. 434 (Ek C): 20–33. doi:10.1016 / j.jtbi.2017.02.031. PMC  5638015. PMID  28254477.
  28. ^ Lau, Maggie C. Y .; Kieft, Thomas L .; Kuloyo, Olukayode; Linage-Alvarez, Borja; van Heerden, Esta; Lindsay, Melody R .; Magnabosco, Cara; Wang, Wei; Wiggins, Jessica B .; Guo, Ling; Perlman, David H. (2016-12-06). "Sintrofiye bağımlı bir oligotrofik derin yüzey altı topluluğunda kükürt kaynaklı ototrofik denitrifikatörler hakimdir". Ulusal Bilimler Akademisi Bildiriler Kitabı. 113 (49): E7927 – E7936. doi:10.1073 / pnas.1612244113. ISSN  0027-8424. PMC  5150411. PMID  27872277.
  29. ^ Schink, Bernhard; Stams, Alfons J.M. (2013), "Prokaryotlar Arasında Sintrofizm", Prokaryotlar, Springer Berlin Heidelberg, s. 471–493, doi:10.1007/978-3-642-30123-0_59, ISBN  9783642301223
  30. ^ Boetius, Antje; Ravenschlag, Katrin; Schubert, Carsten J .; Rickert, Dirk; Widdel, Friedrich; Gieseke, Armin; Amann, Rudolf; Jørgensen, Bo Barker; Witte, Ursula; Pfannkuche, Olaf (Ekim 2000). "Görünüşe göre metanın anaerobik oksidasyonuna aracılık eden bir deniz mikrobiyal konsorsiyumu". Doğa. 407 (6804): 623–626. Bibcode:2000Natur.407..623B. doi:10.1038/35036572. ISSN  0028-0836. PMID  11034209.
  31. ^ Raghoebarsing, Ashna A .; Pol, Arjan; van de Pas-Schoonen, Katinka T .; Smolders, Alfons J. P .; Ettwig, Katharina F .; Rijpstra, W. Irene C .; Schouten, Stefan; Damsté, Jaap S. Sinninghe; Op den Camp, Huub J. M .; Jetten, Mike S. M .; Strous, Marc (Nisan 2006). "Bir mikrobiyal konsorsiyum, anaerobik metan oksidasyonunu denitrifikasyonla birleştirir". Doğa. 440 (7086): 918–921. Bibcode:2006Natur.440..918R. doi:10.1038 / nature04617. hdl:1874/22552. ISSN  0028-0836. PMID  16612380.
  32. ^ Bogitsh, Burton J .; Carter, Clint E .; Oeltmann, Thomas N. (2013), "Simbiyoz ve Parazitlik", İnsan Parazitolojisi, Elsevier, s. 1-13, doi:10.1016 / b978-0-12-415915-0.00001-7, ISBN  9780124159150
  33. ^ Canfield, Donald E .; Erik Kristensen; Bo Thamdrup (2005), "Mikrobiyal Popülasyonların Yapısı ve Büyümesi", Deniz Biyolojisindeki Gelişmeler, Elsevier, s. 23–64, doi:10.1016 / s0065-2881 (05) 48002-5, ISBN  9780120261475
  34. ^ Garcia, Cristina; Rendueles, Manuel; Díaz, Mario (Eylül 2017). "Artık Süt Peynir Altı Suyundan Laktik ve Laktobiyonik Asitlerin Ortak Üretimi için Sinbiyotik Fermantasyon". Biyoteknoloji İlerlemesi. 33 (5): 1250–1256. doi:10.1002 / btpr.2507. PMID  28556559.
  35. ^ I., Krasner, Robert (2010). Mikrobiyal zorluk: bilim, hastalık ve halk sağlığı (2. baskı). Sudbury, Mass .: Jones ve Bartlett Publishers. ISBN  9780763756895. OCLC  317664342.
  36. ^ Verstraete, Willy (2007). "Mikrobiyal ekoloji ve çevresel biyoteknoloji". ISME Dergisi. 1 (1): 4–8. doi:10.1038 / ismej.2007.7. PMID  18043608.
  37. ^ Ott, J. (2005). Deniz Mikrobiyal Tiyotrofik Ektosimbiyozlar. Oşinografi ve Deniz Biyolojisi: Yıllık İnceleme. 42. s. 95–118. ISBN  9780203507810.
  38. ^ "Yapılı Çevrenin Mikrobiyolojisi". www.biomedcentral.com. Alındı 2016-09-18.
  39. ^ Kramer, Axel; Schwebke, Ingeborg; Kampf, Günter (2006-08-16). "Nozokomiyal patojenler cansız yüzeylerde ne kadar süre kalıyor? Sistematik bir inceleme". BMC Bulaşıcı Hastalıklar. 6 (1): 130. doi:10.1186/1471-2334-6-130. PMC  1564025. PMID  16914034.
  40. ^ a b c "Bakteri ve virüs gibi mikroplar, normal oda sıcaklıklarında evdeki yüzeylerde ne kadar süreyle yaşarlar?". Alındı 2016-09-18.
  41. ^ "Salmonella ile Bağlantılı Çiğ Diyetler". 2009-06-09. Alındı 2016-09-18.
  42. ^ Tong SY; Davis JS; Eichenberger E; Hollanda TL; Fowler VG (Temmuz 2015). "Staphylococcus aureus enfeksiyonları: epidemiyoloji, patofizyoloji, klinik belirtiler ve yönetim". Klinik Mikrobiyoloji İncelemeleri. 28 (3): 603–661. doi:10.1128 / CMR.00134-14. PMC  4451395. PMID  26016486.
  43. ^ "S. aureus'un dekolonizasyonunda rol oynayan birçok faktör". www.healio.com. Alındı 2016-09-18.
  44. ^ Buehlmann, M .; Frei, R .; Fenner, L .; Dangel, M .; Fluckiger, U .; Widmer, A.F. (2008-06-01). "Metisiline dirençli Staphylococcus aureus taşıyıcılarının dekolonizasyonu için oldukça etkili rejim" (PDF). Enfeksiyon Kontrolü ve Hastane Epidemiyolojisi. 29 (6): 510–516. doi:10.1086/588201. PMID  18510460.
  45. ^ "Hastanelere geri dönen bakteri ile savaşan süper element: Bakır". Washington Post. Alındı 2016-09-18.
  46. ^ "Gümüş nanopartiküller mikropları öldürür, sağlık sorunlarına neden olur". Alındı 2016-09-18.